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Previous issue date: 2016-09-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Currently there are seven recognized reproductive stocks (A-G) of humpback whales (Megaptera novaeangliae) in the southern hemisphere. The breeding stock 'A' spreads along the Brazilian coast (between 5 ? and 23 ? S) and the Abrolhos Bank- BA is the main breeding area of the Southwest Atlantic Ocean. During the commercial whaling period (early 20th century) the breeding stock ?A? had reached nearly of 2% of its historical size. Recent researches, using different techniques to study the demographic history, have found different values for recent and historical abundance for this population. The knowledge about population size at specific times and its dynamics during time is very important to draw conservations strategies. Here we sequenced a ddRADseq library of 25
DNA samples extracted from tissues of individuals from the Brazilian humpback whales
population. The data suggests absence of population structure in the population. The analysis with 5145 locus with migrate-n estimated the genetic diversity of the population as 0.00237 in per site, indicating an effective size of approximately 40,000 and a census size ~140,000. The ABC approach (Approximate Bayesian Computation), used to test different demographic scenarios related to the commercial whaling period, supported a constant population scenario (<10 generations) (against scenarios with population changes in this period) corroborating previous studies using microsatellites and a few nuclear loci. The Ne estimated in the constant scenario was similar to that obtained with the migrate-n method. Finally, the skyline plot obtained with the migrate-n suggests an increase in the effective size of more than an order of magnitude extending for hundreds of thousands of generation in the past. This very long time frame suggests that this estimate may actually reflects the population size of a metapopulation covering the entire Southern Hemisphere or even entire species, a hypothesis that needs to be tested with the addition of other populations and appropriate demographic scenarios. / Atualmente s?o reconhecidos sete estoques reprodutivos (A-G) de baleias jubarte (Megaptera novaeangliae) no hemisf?rio sul. O estoque reprodutivo ?A? estende-se ao longo costa brasileira (entre 5? e 23? S) sendo o Banco de Abrolhos-BA a principal ?rea de reprodu??o do oceano atl?ntico sul para a esp?cie. Durante o per?odo de ca?a baleeira comercial (in?cio do s?culo XX) sugere-se que esse estoque tenha sofrido um grande impacto populacional chegando a aproximadamente 2% do seu tamanho original. Pesquisas recentes, utilizando diferentes t?cnicas para estudo da hist?ria demogr?fica, t?m apresentado controv?rsias acerca dos valores de abund?ncia recente e hist?rico para essa popula??o. Para o delineamento de estrat?gias de conserva??o ? de grande import?ncia o conhecimento a diversidade gen?tica e as poss?veis flutua??es populacionais ao longo do tempo e em determinados per?odos. No presente estudo fez-se o sequenciamento de 25 amostras de DNA extra?das de tecido de indiv?duos da popula??o Brasileira de baleias jubarte, atrav?s da constru??o de bibliotecas de ddRADseq e sequenciamento de nova gera??o. Os dados evidenciam a aus?ncia de estrutura??o populacional na popula??o. A an?lise com 5145 locos com o migrate-n estimou a diversidade gen?tica desta popula??o em 0.00237 por s?tio, que indica um tamanho efetivo de aproximadamente 40.000 e tamanho censit?rio de ~140.000. A abordagem de ABC (Approximate Bayesian Computation), usando ~mil locos nucleares, aplicada para testar diferentes cen?rios demogr?ficos relacionados ao per?odo de ca?a apontou para um
cen?rio de popula??o recente (<10 gera??es) constante (contra cen?rios com altera??es populacionais neste per?odo) corroborando estudos pr?vios utilizando microssat?lites e poucos loci nucleares. A estimativa para o Ne no cen?rio constante foi semelhante ao obtido com o migrate-n. Por fim, o skyline plot obtido com o migrate-n sugere um aumento do tamanho efetivo de mais de uma ordem de magnitude se estendendo por centenas de milhares de gera??o, o que sugere que esta estimativa pode na verdade refletir o tamanho populacional de uma da metapopula??o abrangendo todo o hemisf?rio sul ou mesmo toda a esp?cie, hip?tese que precisa ser testada com a adi??o de outras popula??es e cen?rios demogr?ficos apropriados.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:tede2.pucrs.br:tede/7268 |
| Date | 29 September 2016 |
| Creators | Emerim, J?lia Dworakowski |
| Contributors | Bonatto, Sandro Luis |
| Publisher | Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul, Programa de P?s-Gradua??o em Zoologia, PUCRS, Brasil, Faculdade de Bioci?ncias |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da PUC_RS, instname:Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, instacron:PUC_RS |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 2008925231902741151, 600, 600, 600, 600, 36528317262667714, -6482652380601267558, 2075167498588264571 |
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