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Estudo da diversidade genética do HIV-1 em indivíduos soropositivos do Rio de Janeiro com diferentes perfis de progressão para a Aids

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Previous issue date: 2015-05-21 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A infecção pelo HIV-1 écaracterizada por um período assintomático extremamente variável entre os indivíduos, o que permitiu a descrição de diferentes perfis de progressão para aids, os quais tem sido associados a características específicas do hospedeiro e/ou do vírus, tal como o subtipo viral. Diante do exposto, como o Rio de Janeiro apresenta uma cocirculação dos subtipos B, F1, recombinantes BF1, além da variante B\201Ddo subtipo B, e háum suporte do governo quanto a realização dos exames de rotina, o que permite o monitoramento dos pacientes HIV-1 positivos, foi possível a caracterização desses quanto ao perfil de progressão para aids. Sendo assim, o presente estudo teve como objetivo avaliar a associação dos subtipos de HIV-1 circulantes no Rio de Janeiro com os distintos perfis de progressão e analisar em um subconjunto de pacientes a mudança do uso do correceptor de entrada utilizado pelo vírus em dois momentos distintos da infecção, antes e após a progressão. A casuística deste estudo foi composta por pacientes HIV-1 positivos que de acordo com seu acompanhamento clínico foram classificados nos distintos perfis de progressão para aids: Progressores Rápidos (PR \2013 progressão em até3 anos), Progressores Intermediários (PI - progridem a partir de 4 anos de infecção) e Não progressores de longo termo (LTNP - mais de 10 anos de infecção sem progressão). A subtipagem das amostras foi realizada a partir da região C2-V3 da gp120 do envelope viral através da análise filogenética pelo método Neighbor-Joining com modelo de substituição de Tamura-Nei, utilizando-se o programa Mega e análise de recombinação pelo método de boostcan do programa Simplot
Das 486 amostras classificadas quanto ao seu perfil de progressão, 285 eram PI, 179 PR e 22 LTNP. Destas, 238 foram caracterizadas quanto ao subtipo, sendo 84,5% pertencentes ao subtipo B (destes 28,9% B\201D); 9,2% F1; 3,4% C; 1,3% D; 1,3% BF1 e 0,4% CRF01_AE, esta distribuição concorda com a descrita em estudos prévios com indivíduos do Rio de Janeiro. Dos 92 PR, 54,3% foram caracterizados como B, 22,8% B\201D, 12% F1, 4,3% C, 3,3%D, 1,1% AE e 2,2% BF1. Dos 131 PI, 64,1% pertenciam ao subtipo B, 24,4% B\201D, 7,6% F1, 3,1% C e 0,8% BF1. Dos 15 LTNP, 60% foram B, 33,3% B\201De 6,7% F1. Nossos achados apontam para uma maior porcentagem do subtipo F1 em PR, porém sem significância estatística. Contrapondo-se a outros estudos prévios, não foi verificada associação entre progressão mais lenta e a variante B\201D. As análises de predição do uso do correceptor foram realizadas para 29 indivíduos. A maior parte dos indivíduos caracterizados como subtipos B, B\201De F1 apresentou a form a viral R5 em ambos momentos estudados, no entanto uma alta proporção de vírus X4 (42,9%) foi detectada em indivíduos classificados como B\201D, fato que corrobora a ausência de associação da variante B\201Dcom a progressão mais lenta. No seu conjunto, os resultados deste trabalho reforçam a necessidade de melhor se compreender características virais que possam apontar marcadores de prognóstico para a aids / The HIV
-
1 infection is characterized by an asymptomatic period highly variable among the
in
dividuos leading to a description of different profiles to aids progression
, which have been
associated with specific characteristics of the host and/or virus, such as viral subtype. Given the
above, as Rio de Janeiro city has a a co
-
circulation of subtype
s B, F1, BF1 recombinants in addition
to B

variant of subtype B, and there is a government support for routine exames allowing a good
clinical follow up of the HIV
-
1 infected patients, it was possible to characterize them in the distinct
aids progression
profiles. Therefore
,
this study aimed to evaluate the association between HIV
-
1
subtypes circulating in Rio de Janeiro with distinct
progression
profiles
and analyse the shift of the
use of the correceptor used by virus in a subset of patients at two diff
erents periods of infection,
before and after progression.
The subjects of this study consisted of HIV
-
1 seropositives which were
classified according to their profile progression: rapid progressors (RP

less than to 3 years to aids
progression), intermed
iate progressors (IP

progression after 4 years of infection), and long
-
term
non
-
progressors (LTNP
-
more than 10 years of infection without progression). The samples
subtyping was performed based on the C2
-
V3 region of gp120 of the envelope viral by usi
ng
Neighbor
-
Joining
phylogenetic inferences with
Tamura
-
Nei substituition model,
in Mega program
and recombination
analysis
b
y bootscan
method i
n Simplot.
From 486 classified samples, 285 were
as IP, 179 as RP and 22 as LTNP. From those, 238 were subtype c
haracterized
,
being 84.5% B
(28.9% B"); 9.2% F1, 3.4 % C, 1.3% A, 1.3% and 0.4% CRF01_AE BF1, this distribution goes in
agreement with those reported in previous studies with individuals from Rio de Janeiro. From those
92
characterized as
RP, 54.3% were cl
assified as B, 22.8% B ", 12% F1, 4.3% C 3.3% D 1.1% and
2.2% AE BF1. From those 131 IP, 64.1% classified as B, 24.4% B

, 7.6% F1, 3.1% C and 0.8%
BF1. From those 15 LTNP, 60% were B, 33.3% B

and 6.7% F1. Our findings depicted a higher
percentage of sub
-
s
ubtype F1 in RP, even thought no statistical significance was observed.
Distinct
to the previous studies, no association between slower progression and variant B" was verified
.
The
coreceptor predition analisys were performed for 29 patients
.
Most individu
als characterized as
subtypes B, B

and F1 presented R5 viral form in both periods, however, a high proportion (42,9%)
of X4 virus was detected in individuals classified as B

, fact consistent with no association among
var
iant B

and slower progression.
Ta
ken together, our results shows the necessity of better
understanding the viral characteristics that may reinforce prognostic markers for aids.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/12018
Date January 2012
CreatorsLeite, Thaysse Cristina Neiva Ferreira
ContributorsVicente, Ana Carolina Paulo, Casseb, Jorge Simão do Rosário, Soares, Esmeralda Augusta Jardim Machado, Villar, Lívia Melo, Santos, Flávia Barreto dos, Guimarães, Monick Lindenmeyer
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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