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Previous issue date: 2013 / Cepas de Plasmodiumresistentes a diferentes drogas têm sido descritasao redor do
mundo. Embora os mecanismos de desenvolvimento de resistência não sejam bem
conhecidos, sabe-se que defeitos nos sistemas de reparo do DNA podem estar
envolvidos. Esses defeitos estão relacionados principalmente a mutações nas
enzimas do sistema de reparo de mal pareamento do DNA ou mismatch repair
(MMR) e já foram descritos em populações naturais de diversos organismos. Devido
ao conhecimento limitado sobre o sistema MMR de Plasmodium, faz-se necessário
um amplo estudo sobre os genes que codificam as proteínas envolvidas nesse sistema. Neste trabalho, foi realizado um estudo sobre as enzimas envolvidas no sistema de reparo do mal pareamento do DNA em Plasmodium: variabilidade intra e interespecífica em Plasmodium, principalmente nos domínios funcionais, e comparação entre níveis de expressão entre cepas/isolados de P. falciparum.Os parasitos foram também avaliados quanto ao número de cópias e expressão dos genes gch-1emdr1. Foram identificadas proteínas pertencentes às classes MSH2, MSH6, MLH1 e PMS1. As sequências de proteínas mostraram-se muito
conservadas, tanto entre o gênero Plasmodium, quanto em relação a outros
organismos distantes evolutivamente. Foi encontradaum proteína homóloga a MutS
que possui os domínios I e V, mas ainda não identificada quanto à sua classificação.
O gene codificador desta proteína teve sua expressão confirmada neste e em outros
trabalhos. Alguns SNPs foram encontrados em cepas/isolados depositados no PlasmoDB, no entanto, o sequenciamento da região que compreende os principais domínios funcionais apontou apenas 1 SNP na proteína PMS1. Os genes estudados, em sua maioria, apresentaram-se mais expressos entre 10 e 30 horas após a sincronização. W2 e 3D7 apresentam 2 cópias do genes gch-1e mdr1. BHZ apresentou apenas 1 cópia do mdr1. Os resultados da análise de expressão desses
genes ligados à resistência concordam com os resultados encontrados para o número de cópias gênicas. Este estudo fornece uma análise ampla das principais enzimas do MMR e será importante para estudos futuros do papel funcional destas enzimas e seu envolvimento no desenvolvimento de resistência às drogas. / Drug-resistant Plasmodiumstrains have been reported world wide. The mechanisms
underlying resistance development are not well understood, but failure in DNA repair
could be involved in this process. This failure is mainly related to mutations in the enzymes of the DNA mismatch repair (MMR). Because of the limited knowledge
about the PlasmodiumMMR system, it is necessary a comprehensive study about
the genes encoding proteins involved in this system. In this work, we studied the
enzymes involved in the PlasmodiumMMR, considering the intraspecific and
interspecific variability in Plasmodium, especially within the functional domains and
comparing the expression levels between strains/isolates of P. falciparum.Parasites
were also assessed for copy number and expression of the genes pfgch-1and
pfmdr1. We identified proteins related to MSH2, MSH6, MLH1 and PMS1. The protein sequences were very conserved among the genus Plasmodium, as well in relation to other evolutionarily unrelated organisms. We found a putative protein homologous to MutS showing the domains I and V, butnot classified yet. The gene encoding this protein has its expression confirmed here and in other previous studies. SNPs were found in some strains/isolates deposited in PlasmoDB, however,
the sequencing of the region comprising the main functional domains showed only one SNP in PMS1. The genes studied, mostly, were more expressed between 10 and 30 hours after synchronization. W2 and 3D7 showed 2 copies of the gene gch-1 and mdr1. In BHZ, only one copy of the mdr1 were founded. The results of expression of these genes related to the resistanceagree with the findings for the gene copy number. This study provides a comprehensive analysis of the major enzymes of the MMR and will be important to further functional studies of this enzymes and their role in drug resistance development.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/6764 |
| Date | January 2013 |
| Creators | Resende, Sarah Stela |
| Contributors | Brito, Cristiana Ferreira Alves de, Zalis, Mariano Gustavo, Soares, Rodrigo Pedro Pinto, Murta, Silvane Maria Fonseca, Brito, Cristiana Ferreira Alves de |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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