Šio darbo tikslas buvo ištirti atsitiktinai padaugintos polimorfinės DNR (APPD) metodu skirtingas Europinio bebro (Castor fiber) subpopuliacijas Lietuvoje.
Buvo ištirtos Europinio bebro 4 subpopuliacijose: Mituvos, Vilkaraisčio, Giedraičių ir Rusnės salos. DNR atsitiktinai padaugintų fragmentų polimorfizmas buvo tirtas naudojant 10 pradmenų.
Pagal Nei apskaičuotą genetinę distanciją tarp populiacijų, labiausiai genetiškai panašios buvo Giedraičių ir Vilkraisčio subpopuliacijos (0,936), didžiausia genetinė distancija nustatyta tarp Rusnės salos ir Vilkaraisčio subpopuliacijų (0,288). Ištirtos subpopuliacijos grupuojasi į du klasterius: vieną klasterį sudaro Rusnės salos ir Mituvos subpopuliacijos, kitą – Vilkaraisčio ir Giedraičių subpopuliacijos.
Europinio bebro subpopuliacijų genetinei įvairovei nustatyti, Popgene programa buvo apskaičiuoti 4 parametrai. Shannon informacinis indeksas svyravo nuo 0,2527 (Rusnės sala) iki 0,3895 (Giedraičiai). Nei genetinė įvairovė svyravo nuo 0,1677 (Rusnės sala) iki 0,2589 (Mituva). Didžiausias nustatytas alelių skaičius buvo Mituvoje (1,8911), mažiausias Rusnės saloje (1,5050). Efektyvus alelių skaičius svyravo nuo 1,2864 (Rusnės sala) iki 1,444 (Giedraičiai). Didžiausia genetinė įvairovė buvo aptikta Mituvos subpopuliacijoje, o mažiausia genetine įvairove pasižymi Rusnės salos subpopuliacija.
Daugiausia polimorfinių lokusų buvo aptikta Mituvos subpopuliacijoje (89,11%), o mažiausiai Rusnės salos subpopuliacijoje (50,5%).
Nustatėmė, kad... [toliau žr. visą tekstą] / The aim of this study is to evaluate genetic structure of European beavers (Castor fiber) subpopulations from Lithuania using RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) method. We investigated genetic variability of 4 subpopulations from Rusne, Mituva, Giedraiciai and Vilkaraistis. 10 primers were used in this analysis.
Acording to Nei‘s genetic identity, the most similar were subpopulations from Giedraiciai and Vilkaraistis (0,936), the highest genetic distance was observed between subpopulations from Rusnes island and Vilkaraistis (0,288). These subpopulations form two clusters: Mituva and Rusnes island forms one cluster and Vilkaraistis and Giedraiciai – another.
To evaluate the genetic variation in subpopulations we analysed four parameters. Shannon’s informations index was from 0,2527 in Rusnes island to 0,3895 in Giedraiciai.The highest Nei‘s genetic variaty was observed in subpopulation from Mituva and the smallest in Rusnes island (0,1677).The highest number of alleles was detected in Mituva (1,8911) and the smalest in Rusnes island (1,5050). The efective number of alleles was from 1,2864 in Rusnes island to 1,444 in Giedraiciai. From these parametres we can see that the most genetic diversity is observed in subpopulation from Mituva and the smallest in subpopulation from Rusnes island.
We detected that the in Rusnes island 50,5 % of loci were polimorphic, and in subpopulation from Mituva even 89,11% of loci were polimorphic.
We found out that molecular diversity is... [to full text]
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LABT_ETD/oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080627_120504-71916 |
| Date | 27 June 2008 |
| Creators | Rimkevičienė, Deimantė |
| Contributors | Paulauskas, Algimantas, Ambrasienė, Daiva, Vytautas Magnus University |
| Publisher | Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), Vytautas Magnus University |
| Source Sets | Lithuanian ETD submission system |
| Language | Lithuanian |
| Detected Language | Unknown |
| Type | Master thesis |
| Format | application/pdf |
| Source | http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20080627_120504-71916 |
| Rights | Unrestricted |
Page generated in 0.0027 seconds