Market Indices are perhaps one of the most well known concepts in finance. They have also a crucial role in the professional financial field: hundreds of institutional investors, pension funds or investment banks use, follow and create market indexes. Since 1880, indexes have spread over the world developing a huge industry. The Modern Portfolio Theory (MPT), the CAPM or the efficiency analysis contributed to this expansion, and theoretical and empirical studies concluded passive investments (or indexing) were winning strategies. Indexing grew exponentially supported by lower management costs, simplification of the manager selection, superior performance in average, and the EMH and CAPM fever. In the last 20 years indexed institutional assets have grown 40% annually. Having in mind the importance of indexing, it is really shocking not to find a complete and deep analysis of market indexes. No many books or articles about index construction are available. Regarding this reality, the main objective of this thesis was to contribute with a complete theoretical and empirical analysis of market indexes. A deep literature analysis is presented and completed with an empirical study in three articles. In the first article, a revision of financial fundamental pillars is provided. This revision is absolutely essential to understand theoretical and empirical bases of indexing and hypotheses underlying index construction. The analysis let us present five market index biases (the sample, the construction, the efficiency and the active bias, and finally, tracking error). The definition of these biases is fundamental to understand how indexes can be improved. In the second article, a deep Market Index analysis is presented. After an historical revision and a discussion about functions of an index and desirable characteristics, market index's biases are provided and studied. The author pays attention to how these biases are created and how the can be mitigated. Finally, in the last article, Minimum Risk Indices are generated for the Spanish, American and Argentinean Stock Markets. Minimum Risk Indices using VaR provide market indices with less risk and with higher profitability in some cases, due to the partial elimination of some market index biases, specially, the efficiency one.KEYWORDS: Market Indices, Biases, Passive Investment, Prtfolio Management, Minimun Risk Indices. / Los índices de mercado son uno de los conceptos más conocidos en finanzas. Además, tienen un papel importantísimo en el mundo profesiona, siendo centenares e incluso miles los inversores institucionales, fondos de pensiones o de inversión que siguen este tipo de inversión. La teoría moderna de carteras, el CAPM y la creencia en la eficiencia de mercado han ayudado a desarrollar una industria, basada en los índices de mercado, de una importancia crucial. El objetivo principal de esta tesis doctoral es el de contribuir a la literatura especializada con una profunda reflexión teórica y práctica sobre la indexación. En el primer capítulo de la misma se revisan conceptos fundamentales de finanzas como son el mercado como juego de suma cero, el concepto de eficiencia, el CAPM y la inversión pasiva, poniendo especial énfasis en las hipótesis sobre las que se basan estas ideas. Las conclusiones son bastante diferentes de las tradicionales. La cartera de mercado no es una cartera totalmente eficiente ni óptima, no se sitúa sobre la frontera eficiente, y no es deseable por todos los inversiones, en contra de lo que dicen los modelos tradicionales. La indexación, como "proxy" de la cartera de mercado, se considera una estrategia sesgada. Concretamente, se presentan cinco sesgos a tener en cuenta por cualquier inversor pasivo. Finalmente, en este capítulo se presenta la Ecología como una vísión interesante y aplicable en los sistemas financieros. Una aproximación cualitativa de un sistema financiero como un sistema ecológico global, donde diferentes especies conviven y compiten por la supervivencia, es presentada al final del primer capítulo. En el capítulo dos de la tesis doctoral se analizan con detalle los fundamentos de los índices de mercado, prestando especial énfasis a los a los sesgos que les afectan, se presentan y analizan extensamente los sesgos de muestra, de construcción, de "tracking error", el sesgo de eficiencia y el sesgo activo, tratando sus orígenes, efectos y posibles técnicas para reducirlos o minimizarlos.En el tercer capítulo se presenta el marco conceptual de los índices de mínimo riesgo como estrategia para crear índices de mercado que reduzcan parte del sesgo de eficiencia. Se presenta un marco conceptual basado en la minimización del riesgo medido por el "value-at-risk" y se aplica la metodología presentada a tres mercados (español, margentino y americano). Los índices resultantes presentan menos riesgo que los existentes actualmente, y en el caso español y argentino presentan también mayor rendimiento, solucionando en parte los sesgos que sufren los índices actuales de estos mercados.