Le Saguenay-Lac-St-Jean est une région isolée géographiquement située à 200 kilomètres au nord-est de la ville de Québec. La fibrose kystique, maladie héréditaire autosomale récessive, atteint une prévalence à la naissance de 1/902 naissances vivantes et un taux de porteurs de 1/15 habitants dans cette région. Les caractéristiques cliniques des 127 patients atteints de fibrose kystique semblent montrer un état général très satisfaisant ce qui pourrait être le résultat d'une la mutation ?F508 au profit de la présence d'autres mutations moins sévères. Une étude de la distribution par mois de naissance ne montre pas de distribution aberrante saisonnière ou mensuelle parmi ces patients. Par contre la distribution spatiale montre des foyers où la prévalence à la naissance est plus élevée. Alors que le coefficient moyen de consanguinité des patients atteints de fibrose kystique est marginalement plus élevé que celui des témoins appariés, le coefficient moyen de parenté est nettement plus élevé. Ces résultats combinés à des facteurs historiques, démographiques et sociaux expliquent cette prévalence à la naissance élevée pour la fibrose kystique dans cette région. De plus, elle est probablement le résultat d'un effet fondateur et d'une dérive génétique pour plusieurs mutations de fibrose kystique.

Afin d'identifier la mutation responsable de la mucolipidose de type II dans la région du Saguenay-Lac-St-Jean (Québec, Canada), un groupe de 27 porteurs obligatoires a été recruté. L'ADN de ces individus a été comparé à celui de 50 sujets provenant d'une autre population. Le gène de la N-acétylglucosamine-l-phosphotransférase (GNPTAB) a été ciblé comme candidat suite à la revue de la littérature. Ensuite, pour vérifier la provenance de la mutation et savoir si l'effet fondateur pouvait expliquer son incidence auprès de cette même population, l'étude généalogique de tous les sujets a été effectuée. Ainsi, les ascendances des individus porteurs obligatoires et d'une cohorte témoin ont été reconstituées. En conclusion, ce projet a permis d'identifier la mutation responsable de la MLII au SLSJ et les études généalogiques suggèrent que sa prévalence au SLSJ résulte d'un effet fondateur. Trois noyaux ancestraux originaires de la France sont plus susceptibles d'être à l'origine de cette mutation.

Un dépistage effectué en 1982 au Saguenay-Lac-St-Jean avait permis d'identifier près de 25 familles touchées par rhémochromatose, une maladie héréditaire autosomale récessive. Le présent mémoire analyse les données résultant de ce dépistage. L'évaluation des 53 personnes atteintes a montré que la maladie se caractérise par une atteinte précoce et sévère. Le gène de rhémochromatose est lié au complexe HLA et la distribution des différents haplotypes est semblable à celle rapportée dans la plupart des populations caucasiennes. L'analyse des généalogies a révélé une consanguinité et une parenté nettement plus élevées dans le groupe hémochromatose que dans les groupes témoins. Les lieux de naissance des homozygotes et des porteurs obligatoires sont distribués de façon non aléatoire et une étude de la fécondité n'a pas mis en évidence des différences reliées à la maladie.

Le Saguenay-Lac-St-Jean est une région isolée géographiquement située à 200 kilomètres au nord-est de la ville de Québec. La fibrose kystique, maladie héréditaire autosomale récessive, atteint une prévalence à la naissance de 1/902 naissances vivantes et un taux de porteurs de 1/15 habitants dans cette région. Les caractéristiques cliniques des 127 patients atteints de fibrose kystique semblent montrer un état général très satisfaisant ce qui pourrait être le résultat d'une la mutation ?F508 au profit de la présence d'autres mutations moins sévères. Une étude de la distribution par mois de naissance ne montre pas de distribution aberrante saisonnière ou mensuelle parmi ces patients. Par contre la distribution spatiale montre des foyers où la prévalence à la naissance est plus élevée. Alors que le coefficient moyen de consanguinité des patients atteints de fibrose kystique est marginalement plus élevé que celui des témoins appariés, le coefficient moyen de parenté est nettement plus élevé. Ces résultats combinés à des facteurs historiques, démographiques et sociaux expliquent cette prévalence à la naissance élevée pour la fibrose kystique dans cette région. De plus, elle est probablement le résultat d'un effet fondateur et d'une dérive génétique pour plusieurs mutations de fibrose kystique.

Différentes études ont mis en lumière des gènes de susceptibilité ou de protection au développement de traits complexes. Pour notre part, l'intérêt s'est concentré sur la lipase lipoprotéique (LPL), où l'impact que provoque une déficience dans ce gène a été clairement démontré sur le développement de maladies cardiovasculaires. Ce projet a pour but de faire l'étude d'association entre quatorze polymorphismes de la LPL et des facteurs de risque cardiovasculaires auprès de 252 travailleurs forestiers de la compagnie Abitibi-Consolidated de Saint-Félicien. Six des variants génotypes avaient une fréquence allélique > 2,5 % et servaient pour les régressions logistiques. Parmi les associations, S447X a été associé avec le risque de présenter de l'obésité abdominale, de l'hyperinsulinémie et de l'hyperglycémie et ce en dépit d'une diminution du risque d'hypertriglycéridémie. Ainsi, cette étude indique l'importance d'analyses supplémentaires afin de mieux comprendre l'implication de la LPL dans les mécanismes qui sous-tendent ces différents facteurs de risque.

L'analyse des données généalogiques est un outil important pour comprendre la répartition du pool génétique d'une population sur un territoire ou pour établir si un trait (maladie ou autre) comporte une composante héréditaire majeure. La mesure des liens de parenté, utilisée dans notre étude, est le coefficient moyen d'apparentement. Il existe peu d'études sur les propriétés statistiques du coefficient d'apparentement dû principalement à la dépendance inhérente et à la complexité de calcul de cette mesure ainsi qu'à l'indisponibilité de bases de données généalogiques fiables. Un test d'hypothèses faisant intervenir le coefficient moyen d'apparentement a été proposé par Hauck et Martin mais ce dernier est basé sur des résultats de normalité asymptotique et il n'est applicable que pour des tailles d'échantillons très grandes. Le premier objectif de la recherche a été d'établir les limites des résultats de normalité asymptotique dont la statistique est le coefficient moyen d'apparentement dans un contexte plus réaliste : une population et des échantillons de tailles relativement petites. Le second objectif a été de construire des algorithmes permettant de calculer un intervalle de confiance et un test d'hypothèses sur cette statistique en utilisant des techniques de simulations spécifiques. Plusieurs méthodes de construction d'intervalles et de tests ont été comparées afin de dégager le meilleur estimateur par intervalle et le meilleur test. Les meilleures méthodes de construction d'intervalles et de tests ont été obtenues à partir des techniques de rééchantillonnage. Elles ont permis d'obtenir d'excellents tests de comparaison. Cependant, les résultats concernant la détermination d'un intervalle de confiance sont mitigés. Il serait intéressant, lors de recherches ultérieures, de se pencher davantage sur ces techniques afin d'optimiser l'estimateur par intervalle. Il n'existait pas de résultats de simulation portant sur les intervalles de confiance et les tests d'hypothèses faisant intervenir le coefficient moyen d'apparentement. Ces résultats sont un premier pas vers une meilleure compréhension des propriétés statistiques du coefficient moyen d'apparentement.

Le gène de 1'apolipoprotéine E qui est polymorphique, est directement impliqué dans la régulation du métabolisme des lipides. La fréquence de ses trois allèles a été mesurée dans plusieurs populations et différentes études ont montré que le polymorphisme de l'apo E exerçait une influence sur les concentrations de lipides, de lipoprotéines et d'apolipoprotéines dans les populations, l'allèle £2 ayant pour effet d'abaisser les niveaux de cholestérol total (Chol) et de cholestérol associé aux lipoprotéines de faible densité (LDLC), tandis que l'allèle £4 exerce un effet contraire. Vu l'importance de cet effet sur les niveaux lipidiques, l'hypothèse a été émise que la variation génétique au sein des apolipoprotéines pouvait être un déterminant majeur du risque de MCV. Dans le but de déterminer les effets du polymorphisme de l'apolipoprotéine E (apo E) sur le profil lipidique de la population du Lac St-Jean-Chibougamau, les phénotypes de l'apo E ainsi que les concentrations plasmatiques de cholestérol total (Chol), de cholestérol associé aux lipoprotéines de faible densité (LDL-C) et de haute densité (HDL-C) et de triglycérides (TG) ont été déterminés chez 435 personnes âgées de 18 à 74 ans. Les fréquences des allèles £2, £3 et £4 dans cette population, ont été estimées à 0.137, 0.749 et 0.1-14, respectivement. Pour les fins de l'analyse, l'échantillon a été subdivisé en trois sous-groupes: les hommes, les femmes pré-ménopausées et les femmes ménopausées. Après ajustement des données pour les effets de l'âge, du poids, de la taille, du ratio taille/hanche (WHR) et de l'indice de masse corporelle (BMI) dans chacun des sous-groupes, l'ANOVA a permis de mettre en évidence des différences significatives entre les groupes phénotypiques Apo E2 (E2/E2 et E3/E2), Apo E3 (E3/E3) et Apo E4 (E4/E3 et E4/E4) pour toutes les variables lipidiques chez les hommes et pour le CHOL et le LDL-C chez les femmes. À la fréquence plus élevée de l'allèle £2 était également associée des concentrations plus élevées de TG chez les hommes et les femmes ménopausées. La subdivision de l'échantillon en 4 districts (Alma, Dolbeau, Roberval et Chibougamau) a révélé des différences dans les fréquences de l'apo E entre les districts, particulièrement au niveau de la fréquence de l'allèle £2. Dans le district de Chibougamau, celle-ci était significativement plus élevée que celle des trois autres districts réunis (Aima, Dolbeau, Roberval). Malgré des différences importantes dans les fréquences des allèles de l'apo E entre les districts, l'analyse de la variance à deux facteurs (Apo E et districts) n'a pas permis de révéler de différence significative dans les concentrations des variables lipidiques entre les districts concernés. A l'exception d'une fréquence plus élevée de l'allèle £2 associée à une augmentation des niveaux de triglycérides, ces résultats sont similaires à ceux observés dans d'autres populations caucasiennes

Cette étude porte sur 177 individus décédés ayant un diagnostic confirmé de dystrophie myotonique (DM). Ces derniers -Lac-Saint-Jean (SLSJ) et/ou de la clinique des maladies neuromusculaires de cette région. L'âge moyen au décès est de 51,3 ans sans différence significative entre les hommes et les femmes. Une progression du nombre de décès en fonction de l'atteinte musculaire est démontrée dans cette étude. L'âge moyen d'apparition des symptômes de la DM a été estimé à 29,8 ans pour 30 individus et la durée moyenne de leur maladie a été de 13,7 ans. Quarante-quatre causes différentes de décès ont été compilées dans cette étude. Regroupées en 9 catégories de mortalité, elles portent principalement sur les causes inconnues de décès (60 cas), les causes pulmonaires (60 cas) et les causes cardiaques (26 cas). Trois municipalités du SLSJ enregistrent une surmortalité des personnes atteintes par rapport à leur population globale; il s'agit entre autres de Chicoutimi et de Jonquière.

Ce mémoire étudie les aspects cliniques, épidémiologiques et génétiques des enfants atteints de la mucolipidose de type II (ML-II) au Saguenay-Lac-Saint-Jean (SLSJ). Le phénotype caractéristique consiste en la présence d'une hypertrophie des gencives, un faciès grossier et/ou vieillot, une altération osseuse et un retard staturo-pondéral. Le décès survient la plupart du temps avant l'âge de 5 ans. Ces signes cliniques ont été retrouvés chez la majorité des enfants du SLSJ. L'incidence estimée de la ML-II au SLSJ s'élève à 1/2.613 naissances et le taux de porteurs à 1/51. La distribution spatiale des malades et des porteurs dans le nord-est du Québec montre une accumulation de cas au SLSJ; la majorité des cas étant nés à Chicoutimi. L'exogamie et l'endogamie ne présentent pas de différence significative entre le groupe malade et les groupes témoins. Le coefficient moyen de consanguinité pour les enfants atteints et dont les parents sont mariés au SLSJ est 2 fois plus élevé que la moyenne des groupes témoins. Il n'a pas de différence entre le coefficient moyen de parenté du groupe cible et la moyenne des coefficients moyens des groupes témoins. La recherche d'un effet fondateur de la ML-II dans le nord-est du Québec a permis d'identifier 34 ancêtres communs dont 33 originaires d'Europe au 17ème siècle, ce qui laisse supposer que le gène de la ML-II a été amené par immigration.

Le syndrome de Zellweger (syndrome cérébro-hépato-rénal) est une maladie autosomale récessive rare. Dans la région du Saguenay-Lac-St-Jean cette maladie a une incidence particulièrement élevée; en effet depuis 1971 huit cas furent répertoriés, ce qui est de quatre à cinq fois supérieur à l'incidence mondiale. Le phénotype rencontré dans cette région est très semblable à celui décrit dans la littérature. La distribution spatiale des lieux d'origine des parents et des enfants a montré qu'ils étaient presque tous originaires de la région. On a calculé le coefficient moyen de consanguinité qui s'est avéré nul pour les patients et les témoins. Le coefficient de parenté par contre est plus élevé pour les cas que pour les témoins ce qui suggère que le gène est fréquent dans cette population. La cystinose est une autre maladie autosomale récessive rare qui a au Saguenay-Lac-St-Jean une incidence dix fois supérieure à l'incidence mondiale. Les signes cliniques associés à la cystinose au Saguenay-Lac-St-Jean sont semblables à ceux décrits dans d'autres populations, à l'exception éventuellement d'une atteinte ophtalmique moins sévère. L'étude de la consanguinité et de la parenté a permis de montrer que le gène est fréquent dans cette population. L'étude de la parenté ainsi que les recherches généalogiques effectuées suggèrent que la présence de cette maladie au Saguenay-Lac-St-Jean est due à un effet fondateur.