The rapid expansion of Great Cormorant populations during the second part of the 20th century has caused many conflicts, mostly with fisheries. Cormorants are often considered as important reason for depleted fish stocks, although evidences are often insufficient. This study of the Great Cormorant diet took place in the largest Lithuanian colony near Juodkrantė. Important for the impact evaluation cormorant nutrition aspects, including diet composition, its temporal variation and feeding selectivity, were determined. The reliability of pellet analysis for quantitative dietary assessments was evaluated for the first time using a stable isotope mixing model. Great Cormorant impact on spatial fish distribution was also assessed for the first time. Long-term fish community monitoring data were used for Cormorant impact assessment in the Curonian Lagoon. The results of our study are important for providing improved assessments of the long-term effects of Cormorants on fish communities in large, complex, highly productive aquatic systems. The practical significance of this study is its evaluation of competition between cormorants and commercial fishermen, which enables to substantiate the need to regulate cormorant population. Assessments of Cormorant impact on invasive Round Goby populations is also important. / XX amžiaus antroje pusėje didžiųjų kormoranų populiacijos Europoje staigus augimas sukėlė eilę konfliktų, daugiausia su žvejais ir žuvų augintojais. Kormoranai dažnai kaltinami dėl mažėjančių žuvų išteklių, tačiau moksliniais tyrimais pagrįstų įrodymų dažnai trūksta. Šiame tyrime buvo tiriama didžiųjų kormoranų mityba didžiausioje Lietuvoje Juodkrantės kolonijoje. Darbe buvo nustatyti svarbūs kormoranų poveikio vertinimui mitybos aspektai – raciono sudėtis ir jos kitimas laike, mitybos selektyvumas. Pirmą kartą buvo įvertintas atrajų analizės metodo patikimumas raciono sudėties kiekybiniam vertinimui, naudojant stabiliųjų izotopų sudėties analizės metodą. Taip pat pirmą kartą buvo vertinamas didžiųjų kormoranų poveikis žuvų populiacijoms erdvėje. Remiantis daugiamečio monitoringo duomenimis, buvo įvertintas kormoranų poveikis žuvų populiacijoms Kuršių mariose. Šio tyrimo rezultatai leidžia geriau įvertinti didžiųjų kormoranų ilgalaikį poveikį žuvų bendrijoms didelėse sudėtingose aukšto produktyvumo vandens sistemose. Praktinę vertę šiame darbe turi kormoranų ir žvejų verslininkų tiesioginės ir netiesioginės konkurencijos įvertinimas, leidžiantis pagrįsti kormoranų populiacijos reguliavimo priemonių tikslingumą. Svarbus praktiškai yra ir kormoranų poveikio invazinio juodažiočio grundalo populiacijai įvertinimas.