臺灣水資源多年來供不應求的問題，由於供給面管理已面臨瓶頸，不得不尋求以強調經濟誘因，效率使用為理念的需求面管理。水權交易制度是需求面管理政策中最符合價格機能運作的制度，本文由臺灣的水資源財產權演進的歷史，以及理論模型的推導，加上既有文獻的探討，和國外施行的經驗，認為此制度確實可行。它的優點是讓用水者面對真實的機會成本，可以增加用水效率，除此之外，還可分散缺水風險，使分配更具彈性，反應留川使用效益的公共價值，並且可以顧及公平性和增進整體社會福利。雖然此制度有其缺陷，但是藉制度的設計，政府適當的管制，應可克服這些問題。 　　國內現行的水利法不允許水權自由交易，其中充滿政府管制色彩。在制定之初幾乎不顧及經濟法則，但是隨著由供需主導的經濟力量，例如嘉南平原水權之爭，已迫使水利法的修正，允許需由政府核准的附帶補償的移轉，這新增條文的精神已離自由交易不遠。不過由各種跡象顯示，政府對水資源的管理態度將更強調對水資源調配的主控權，但是此主控權的行使，四十年以來一直拋不開各種包袱，在未來也很難相信主管機關能做到社會最適的調配。 　　本文所提出的理論模型，是為了做政策上的選擇。參考Baumol and Oates(1988)，徐世勳（民國80年），蕭代基（民國81年）等的模型架構，將留川及離川使用交互影響的關係，以及污染排放因素模型化。並討論在確定及不確定下的政策選擇，比較Pareto最適條件及市場均衡條件，在水量方面，主要是是探討水權費及水權交易制度，在水質方面，比較污染排放稅和可轉讓污染染排放許可證。論文結果發現，在確定情況下，上述政策無差異。在供給函數不確定下，應採水權交易制度和污染排放稅。本文最後提出政策建議，以集水區地方自治組織，來輔助市場交易，以及外部效果內部化工作。本文目的除了在財產權歷史和理論上做進一步探討，也希望提供臺灣成立水權交易制度政策上的參考。