2000年，民主進步黨籍的陳水扁以39.3％得票率當選中華民國第十任總統，完成中華民國歷史上第一次政黨輪替。陳水扁就任後，台海兩岸的政治關係雖然沒有顯著的進展，但是兩岸在經貿方面卻是屢創紀錄，兩岸貿易金額超越台灣－美國、台灣－日本之間的雙邊貿易額，中國成為台灣最大且最重要貿易夥伴。 任何國家的經濟政策，皆必須因不同時空背景、內外環境及政策目標而適時修訂與調整。特別是在2000~2004年，兩岸先後加入世界貿易組織，彼此的經貿關係從此進入國際經貿框架中。本文希望探討台灣政府如何因應加入世貿組織後的新局面，構思並提出適宜的兩岸貿易與投資政策，並嘗試分析直接通航對台灣的利弊與衝擊。因此，本文選定「小三通」政策、「8吋晶圓廠赴大陸投資」政策以及「春節包機」政策進行個案分析，探究這些政策的成效與影響。 研究結果發現，陳水扁在首次執政期間，對於兩岸經貿的往來相當重視，也提出不少試辦性或開放部分管制措施；然而，這些動作卻是在外在壓力環境下不得不為的動作，缺乏主動性與積極性。此外，扁政府主導的大陸經貿政策受限於多方角力的制約，導致政策開放幅度與內容不盡理想，不能滿足企業的佈局和民眾之需求。本文建議，台灣政府應以積極、開放且主動的策略與中國大陸就經濟層面的議題進行合作與協商，未來亦可朝向「兩岸自由貿易區」的層次邁進，方能有效維持台灣整體競爭力與國家最高利益。