近年來由於全球化、自由化及科技化時代的來臨，企業面對此嚴峻的挑戰，已逐漸瞭解僅僅將企業內部的作業流程最佳化，已經無法滿足企業快速回應市場的迫切需求，企業必需提升到與不同交易夥伴間在資訊以及作業流程上的整合。 然而在此整合的過程中，企業之所以得以和交易夥伴達到流程及資訊的成功整合，憑藉的就是「協同運作(Collaboration)」的機制。 在運用協同作業之下，企業得以對交易之上下游合作廠商在流程與資訊上整合，並根據企業資源的現況(包含內部資源與外部資源)作最佳化安排，並與上下游合作廠商、客戶的價值鏈相連，構成一個產業的價值鏈（value chain）。 證券市場整體的交易流程，或是整個證券市場的活動，其實就是一個產業的價值鏈的關係，從下單開始到完成後續的款券交割，需上、下游相關機構充分合作方能如期且精確的完成，任何一個環節發生問題或作業不順暢，均將影響整體市場的運作效率及成本效益。 在本研究所探討的國內投資法人交易對帳流程，可以發現當一個產業的作業流程充滿過多的人工作業、資料傳輸、資料格式轉換、甚至於需要多次的確認對帳的作業，整個產業的效率自然無法提升。然而若僅以個別資訊化之角度探討證券市場交易對帳流程之改善，其效益頂多只是將企業本身之人工作業方式改以利用電腦處理方案解決，整體交易對帳流程能夠減少之作業有限。產業真正需要的是建構協同運作機制，充分整合資訊，改變流程，才能提升產業的整體競爭力。 而證券市場價值鏈的組成份子眾多，建構協同運作時，如何形成共同願景、如何改善流程、如何消弭對虛擬組織的疑慮等等，實為證券市場協同運作的最大挑戰，也是本文探討的目的。