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Comparision of Shell Closing between Sanguinolaria rostrata and Meretrix lusoria

Chang, Yun-chin 02 September 2004 (has links)
Sanguinolaria rostrata is a deep site-burrowing bivalve commonly found in the southwest coastal waters of Taiwan. It has a long siphon extending to the surface. It is reported that exposed S. rostrata dies in few days without silt. However trussing it up rubber bands or cut off the hinge, it can survive for over one month in the laboratory. In this study the relation of shell closing and mortality for S. rostrata were examined and compared with the hard clam Meretrix lusoria in the similar environments. The size of adductor muscle and its ratio to the shell size, the strength of shell closing and the tissue structure of adductor muscle were examined. The quantities of fructose 2,6- biphosphate, an intermediate of glycolysis, in the adductor muscle of S. rostrata were determined. The results indicated that the average strength of closing shell for S. rostrata was 36.65% and for M. lusoria was 41.19%. The trends of tropic shell closing strength and the size of adductor muscle as well as shell closing strength and the adductor muscle wet weight were the same for the two species. The ranges of strength for muscle closing among S. rostrata of different sizes were smaller than those of M. lusoria. The average ratio of the adductor muscle microfiber to muscle was 55.6¢Mfor S. rostrata and 83.2¢M for M. lusoria. Therefore, the adductor muscle of S. rostrata is looser to M. lusoria. The concentration of fructose 2,6- biphosphate fluctuated widely to the unclamped S. rostrata in the first 6 hours and the concentration reached 7.58£gmole/mg at most. The concentration did not rise between 6 and 24 hours, indicating that unclamped S. rostrata consumed energy within the first 6 hours, then showed no sign of consuming energy.
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Etude fonctionnelle du génome de Bacillus subtilis : de nouvelles régulations transcriptionnelles du métabolisme central du carbone.

Doan, Thierry 04 1900 (has links) (PDF)
Chez Bacillus subtilis, la transcription de l'opéron gapA, comprenant les gènes de la partie centrale de la glycolyse, est stimulée en présence de sources de carbone glycolytiques. Nos études in vivo et in vitro de CggR, le répresseur qui contrôle cette stimulation, ont démontré d'une part que celui-ci a la capacité de se lier à une séquence d'ADN inhabituellement longue, consistant en une répétition directe de deux motifs (CGGGACN6TGTCN4CGGGACN6TGTC) et située entre le promoteur et le codon d'initiation de l'opéron cggR-gapA, et d'autre part que son activité est inhibée par le fructose-1,6-biphosphate. Des analyses de séquence et des expériences de transcriptome ont indiqué que CggR, qui est très conservé chez les bactéries à Gram positif et qui définit une sous-famille de la famille de régulateurs transcriptionnels SorC/DeoR, est spécialisé dans le contrôle des gènes de la glycolyse. Ainsi, une collaboration a été engagée avec des structuralistes (CBS, Montpellier) pour aller plus loin dans la connaissance de ce prototype d'une famille encore peu connue de régulateurs. Deux paires de gènes paralogues ont été détectés dans le génome (ywkA et malS, ytsJ et mleA) dont les produits sont homologues à des enzymes maliques. L'analyse transcriptomique globale d'une souche sauvage cultivée en présence de glucose ou de malate comme seule source de carbone montre que l'expression d'ywkA est induite en présence de malate. En collaboration avec l'équipe de Y. Fujita, nous avons montré qu'ywkA codait bien une enzyme malique NADdépendante dont l'expression est spécifiquement induite par le malate extracellulaire et insensible à la répression catabolique. De plus, nous avons montré que le système à deux composants YufL-YufM active directement la transcription d'ywkA en présence de malate. Cependant, YwkA n'est pas requis pour la croissance en présence de malate comme seule source de carbone. La technique d'analyse du transcriptome au moyen de membranes à haute densité est maintenant acquise au laboratoire. Nous avons commencé à mettre à profit cet outil pour une étude globale de l'expression génique en fonction de différentes sources de carbone.

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