Un grand nombre de maladies cardiaques apparaissent à la suite de problèmes développementaux dus à des mutations dans des gènes très conservés durant l'évolution. Il est donc crucial d'identifier les acteurs intervenants dans la cardiogenèse. Durant ma thèse, j'ai étudié la différenciation cardiaque, en utilisant la Drosophile comme modèle, avec comme objectifs d'identifier des nouveaux intervenants grâce à l'acquisition de données globales par une approche génomique tissue spécifique. J'ai tout d'abord mis au point un protocole permettant d'acquérir des données génomique spécifiquement dans le tube cardiaque de la Drosophile lors de la différenciation des cardiomyocytes. Ce fut une étape primordiale pour le reste de ma thèse. Ce protocole me permet d'isoler spécifiquement les cellules du système cardiaque.A partir de là, j'ai réalisé une cinétique transcriptomique qui a permis de mettre en évidence environ 1000 gènes différenciellement exprimés au cours de la différenciation cardiaque. Ensuite, En collaboration avec Delphine Potier, une thésarde bio-informaticienne de l'équipe, des modules Cis-régulateur (CRM) pouvant conduire à l'expression dans le tube cardiaque ont été prédits, ainsi que des facteurs de transcription putatifs régulant ces CRM. Ces nouveaux acteurs du réseau de régulation génique cardiaque sont en cours de validation.Dans un second temps, je me suis intéressé à un facteur de transcription à homéoboîte clé de la cardiogenèse : Abdominal-A (AbdA). AbdA est essentiel pour la différenciation de la partie postérieure du tube cardiaque, le cœur proprement dit, et à l'acquisition de sa fonction. Cependant, ses cibles ainsi que son action tissue spécifique sont encore inconnu à ce jourAfin d'apporter un élément de réponse, j'ai analysé le transcriptome consécutif à un Gain de Fonction de AbdA spécifiquement dans le système cardiaque ce qui m'a permis de mettre en évidence plus de 1000 gènes dérégulés par AbdA lors de la différenciation cardiaque. / Cardiac diseases generally arise from developmental disorders caused by mutations in genes that are highly conserved during evolution. It is therefore of prime interest to identify actors which participate to cardiogenesis. During my thesis, I have analyzed cardiac differentiation, using Drosophila as a model. My objective was to identify news actors of the cardiac Gene Regulatory Network (GRN) using a genomic approach and starting from tissue specific whole data acquisition.First, I have set a protocol to allow tissue specific genomic data acquisition during cardiac differentiation. It was a critical step for my thesis. This protocol allowed me to isolate specifically cardiac system cells.Using this protocol, I analyzed the transcriptome dynamics and determined that 1000 genes are dynamically expressed during cardiac differentiation.Next, in collaboration with Delphine Potier, a PhD student in bio-informatic in the team, cis-regulatory modules (CRM), which can drive expression in the cardiac tube, have been predicted, and also putative transcription factors regulating these CRM. These new cardiac GRN actors are currently tested in vivo.In a second time, I have analyzed the function of Abdominal-A (AbdA) a homeobox transcription factor which plays a key role during cardiogenesis. :. AbdA is crucial for the differentiation of the posterior part of the organ, called heart My aim was to identify cardiac specific AbdA targets.

Les gènes Hox codent des facteurs de transcription à homéodomain (HD). Bien que ce dernier reconnaisse des séquences similaires in vitro, les protéines Hox achèvent des fonctions hautement spécifiques in vivo. Des séquences protéiques en dehors de l’HD influencent la spécificité d’action des protéines Hox par le recrutement de cofacteurs, dont le mieux caractérisé est Extradenticle (Exd) chez la drosophile. Des travaux récents au sein de notre équipe ont démontré la contribution fonctionnelle de trois motifs de AbdA, aussi bien dans des fonctions Exd-dépendantes qu’à des fonctions Exd-indépendantes. Mon travail de thèse a porté sur la caractérisation de la contribution des motifs protéiques de AbdA dans la sélection puis dans la régulation des gènes cibles en utilisant une approche combinée ChIPseq/RNAseq, dans un contexte Exd-indépendant. Le code ADN identifié nous a renseigné sur la présence d’inputs transcriptionnels additionnels. Ces derniers correspondant à des facteurs de transcription déjà connus, leur présence dans un complexe protéique avec AbdA a été démontrée par des analyses de spectrométrie de masse. Un second volet de mon travail de thèse a été l’identification de modifications post-traductionnelles pouvant rendre compte d’un mécanisme de régulation de l’activité des protéines Hox. Des analyses prédictives in silico, confirmées par des approches biochimiques et des analyses in vivo ont démontré la SUMOylation de AbdA. Ces résultats préliminaires posent les bases pour des travaux futures qui auront pour objectif d’identifier les résidus d’AbdA SUMOylés et d’élucider le rôle de cette modification dans la régulation de l’activité de la protéine AbdA. / Hox genes encode homeodomain-containing transcription factors (HD). Although the HD binds to similar DNA sequences in vitro, Hox proteins display a high functional specificity in vivo. Protein motifs outside of the HD influence Hox specificity through recruiting additional cofactors, with the best characterized being Extradenticle (Exd in Drosophila). Recent evidence from our group has uncovered the functional contribution of AbdA intrinsic motifs to AbdA Exd-dependent functions as well as AbdA Exd-independent functions. My PhD work has aimed to characterize the contribution of AbdA motifs to target gene selection and regulation using a combined approach of ChIPseq/RNAseq in an Exd-independent context. The DNA code identified provides us with new insights about additional transcriptional inputs from additional DNA-binding proteins lying in the vicinity of AbdA recognition sites. Mass spectrometry analysis establishes the occurrence of these additional DNA binding proteins in a multi-protein complex with AbdA. Deciphering the involvement of post-translational modifications in the regulation of Hox protein activity was another aspect of my PhD work. In silico predictive analysis, followed by biochemical approaches and in vivo assays reveal the potential for SUMOylation of AbdA as a potentially important regulatory component of AbdA activity. These preliminary results set the bases for further work aimed at identifying SUMOylated residues on AbdA and the functional relevance of such post-translational modification on AbdA activity regulation.

Admiral Thomas C. Hart And The Demise Of The Asiatic Fleet 1941 – 1942 is a chronicle of the opening days of World War II in the Pacific and the demise of the U.S. Navy’s Asiatic Fleet. Beginning with the background of Four Star Admiral Thomas Hart, this chronicle shows the history of the nearly obsolete ships that fought in the beginning of World War II. The reader will come to realize how and why this fleet ceased to exist within ninety days from the start of the war. Historical evidence will show that the damage inflicted on the Japanese was much greater than what was recorded in popular history. Hart was relieved of his command due to political considerations but not a single ship was lost while he was in command of the Asiatic Fleet. Hart fulfilled his orders to preserve the integrity and safety of the American Asiatic Fleet.