Afin de mieux appréhender l’expérience doctorale, le présent travail s’intéresse tout particulièrement à trois dimensions : le stress, la santé physique et la relation d’encadrement. Du point de vue théorique, il s’appuie d’une part sur le modèle intégratif et multifactorial de Bruchon-Schweitzer (2002), de l’autre sur le concept d’ « alliance de travail » (Schlosser et Gelso, 2001).La première partie de cette thèse propose un état des lieux des études sur les doctorants. La deuxième partie est constituée de deux études sur le stress et la santé des doctorants. Une première enquête en ligne montre que l’année d’inscription en thèse, la filière disciplinaire et le degré de satisfaction par rapport à l’encadrement sont des prédicteurs significatifs du stress perçu et, dans une certaine mesure, des symptômes somatiques. Par ailleurs le stress perçu joue un rôle médiateur entre l’activité physique et les symptômes somatiques. Une étude qualitative exploratoire sur les facteurs de stress vient compléter la première enquête et montre que la précarité et l’incertitude par rapport à l’avenir professionnel constituent les principales causes de stress qui affectent les doctorants.La troisième partie porte sur la relation d’encadrement et sur son évaluation. Elle comprend également deux études : la première analyse les différentes échelles de mesure de la relation d’encadrement disponibles en anglais, tandis que la deuxième a pour objectif de valider la traduction française de l’Advisory working alliance inventory (Schlosser et Gelso, 2001) et de proposer un modèle prédicitif de la satisfaction par rapport aux études doctorales. / In order to gain a better understanding of the doctoral experience, the current work focuses on three dimensions: stress, physical health and mentoring. From a theoretical point of view, it is based on the integrative and multifactorial model of Bruchon-Schweitzer (2002) and on the concept of “working alliance” (Schlosser and Gelso, 2001). The first part of this thesis presents the current state of the art of doctoral studies. The second part consists of two studies on doctoral students’ stress and health. A first online survey conducted among a large sample of participants led to a better understanding of the relationships between socio-demographic factors and health behaviours on the one hand and stress and physical health on the other hand. The results show that thesis year, discipline and satisfaction with supervision are significant predictors of perceived stress and, to some extent, somatic symptoms. In addition, they show that perceived stress plays a mediating role between physical activity and somatic symptoms and that a sustained practice of physical activity helps reduce the harmful effects of stress on physical health. The second study is an exploratory qualitative research on stressors. It completes the first survey and shows that precariousness and uncertainty about their professional future are the main causes of stress affecting doctoral students. The last part deals with the advisory relationship and its evaluation. It also consists in two studies: the first one analyses the different measures of the advisory relationship available in English, while the second study validated the French translation of the Advisory working alliance inventory (Schlosser et Gelso, 2001), and proposed a predictive model of satisfaction with respect to doctoral studies.