Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-07-25T14:39:33Z No. of bitstreams: 1 Pedro Paulo Feitosa de Albuquerque.pdf: 705656 bytes, checksum: 3b387f372f7375364f614a52bba0c4df (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-25T14:39:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pedro Paulo Feitosa de Albuquerque.pdf: 705656 bytes, checksum: 3b387f372f7375364f614a52bba0c4df (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of the present study was to detect the IS900 region of MAP in bovine milk samples using the Real Time Polymerase Chain Reaction (qPCR) and conventional PCR, as well as to study the agreement between the tests used. In total, 121 bovine milk samples were collected from properties considered as a focus of MAP in the micro-region of Garanhuns, Pernambuco, Brazil. Of the 121 milk samples analyzed, it was possible to detect the DNA of MAP in 20 samples (16.52%) using conventional PCR and in 34 samples (28.09%) using qPCR. The DNA of the agent was detected on all of the six properties studied, ranging from 10.00% to 23.81% in the conventional PCR and from 10.00% to 36.84% in the qPCR. The agreement between qPCR and conventional PCR was moderate (Kappa =0.53; χ2 = 38.08; p<0.000). The sensitivity and specificity of conventional PCR in relation to qPCR was 50% and 96.6%, respectively. Based on these results, it was possible to conclude that the IS900 region of MAP is present in bovine milk in the micro-region of Garanhuns, Pernambuco. It was also possible to conclude that the qPCR technique used in the present study was more sensitive than conventional PCR in terms of detecting these bacteria in milk samples. / Objetivou-se com este estudo detectar a região IS900 do MAP em amostras de leite bovino utilizando-se as técnicas de Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real (qPCR) e a PCR convencional, e realizar um estudo de concordância entre os testes utilizados. Foram coletadas 121 amostras de leite bovino de propriedades consideradas foco para o MAP pertencentes à microrregião de Garanhuns, Pernambuco, Brasil. Das 121 amostras de leite analisadas foi possível detectar o DNA do MAP em 20 (16,52%) amostras na PCR convencional e em 34 (28,09%) na qPCR. O DNA do agente foi detectado em todas as seis propriedades estudadas, variando de 10,00% a 23,81% na PCR convencional e de 10,00% a 36,84% na qPCR. A concordância entre a qPCR e PCR foi moderada (Kappa =0,53; χ2 = 38,08; p<0,000) e a sensibilidade e especificidade da PCR convencional com relação a qPCR foi de 50% e 96,6%, respectivamente. Conclui-se que o DNA da região IS900 do MAP está presente no leite bovino na região estudada e que a qPCR é uma técnica sensível e rápida para detecção desse agente em amostras de leite.

Orientador: Guilherme de Paula Nogueira / Coorientadora:Elisa Helena Giglio Ponsano / Banca: Carlos Antonio de Miranda Bomfim / Banca:Maria Carolina Villani Miguel / Resumo: No Brasil, a produção de leite tem importância social, bem como econômica, pois está presente em número significativo de propriedades com mão-de-obra familiar. Entretanto, baixas produtividade e qualidade ainda são características do leite brasileiro. O objetivo do trabalho foi identificar fatores que influenciam a produtividade, a contagem bacteriana total (CBT), a contagem de células somáticas (CCS) do leite e verificar se o produto está adequado às normas da legislação brasileira. A pesquisa se baseou em entrevista estruturada e coleta de leite das propriedades participantes (n=45), pertencentes à microrregião de Birigui-SP, para análise. Foram realizadas regressão multivariada, análise de variância multivariada, com pós-teste de Tukey, e determinou-se coeficiente de correlação entre variáveis. A produtividade média observada foi de 6.274,9±4.981,4 L/ha/ano. Observou-se que a produtividade foi influenciada positivamente pela base da alimentação volumosa e produção de leite por dia de intervalo entre partos. Não houve diferença significativa entre a produtividade das propriedades que utilizavam pastejo rotativo e fornecimento de volumoso no cocho, mas estas foram superiores àquelas que utilizavam pastejo contínuo ou pastejo alternado. O fato de se possuir tanque refrigerador individual favoreceu a menor CBT. Observou- se mais alta CCS no leite de produtores que realizavam o "California Mastitis Test" (CMT) com maior frequência. O leite de apenas quatro produtores (8,9%) apr... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In Brazil, dairy production has social, as well as economic, importance, because it is present in significant number of farms with family labor. However, low productivity and low quality still are features of the Brazilian product. The aim of this study was to evaluate the influence of factors on milk productivity, total bacterial count (TBC) and somatic cell count (SCC) and verify if the product is suited to the requirements of Brazilian law. The research was based on data from structured interview and analyses of milk samples collected from each farm (n=45), which belongs to Birigui-SP microregion. Multivariate regression and multivariate analysis of variance, with Tukey's post-test, was performed and correlation coefficient was determined. The observed average productivity was 6,274.9±4,981.4 L/ha/year. Roughage feeding base and milk production per day of calving interval influenced positively the productivity. There was no difference in productivity between farms that used short-duration grazing system and roughage feeding in the trough, both had higher productivity than farms that used continuous grazing system and alternated grazing system. Milk of producers that had individual cooler tank had a lower TBC. It was observed that milk of producers that performed California Mastitis Test (CMT) frequently had a higher SCC. Milk from four farms (8.9%) was suitable for all analyzed parameters. / Mestre

Submitted by João Lucas Cânovas Delfino null (jlcdelfino@gmail.com) on 2016-08-01T19:51:03Z No. of bitstreams: 1 Delfino, João Lucas Cânovas - Dissertação.pdf: 1039434 bytes, checksum: 341be358ddbbff25bf44e43f0a660f28 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-08-03T14:46:19Z (GMT) No. of bitstreams: 1 delfino_jlc_me_araca.pdf: 1039434 bytes, checksum: 341be358ddbbff25bf44e43f0a660f28 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-03T14:46:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 delfino_jlc_me_araca.pdf: 1039434 bytes, checksum: 341be358ddbbff25bf44e43f0a660f28 (MD5) Previous issue date: 2016-07-14 / No Brasil, a produção de leite tem importância social, bem como econômica, pois está presente em número significativo de propriedades com mão-de-obra familiar. Entretanto, baixas produtividade e qualidade ainda são características do leite brasileiro. O objetivo do trabalho foi identificar fatores que influenciam a produtividade, a contagem bacteriana total (CBT), a contagem de células somáticas (CCS) do leite e verificar se o produto está adequado às normas da legislação brasileira. A pesquisa se baseou em entrevista estruturada e coleta de leite das propriedades participantes (n=45), pertencentes à microrregião de Birigui-SP, para análise. Foram realizadas regressão multivariada, análise de variância multivariada, com pós-teste de Tukey, e determinou-se coeficiente de correlação entre variáveis. A produtividade média observada foi de 6.274,9±4.981,4 L/ha/ano. Observou-se que a produtividade foi influenciada positivamente pela base da alimentação volumosa e produção de leite por dia de intervalo entre partos. Não houve diferença significativa entre a produtividade das propriedades que utilizavam pastejo rotativo e fornecimento de volumoso no cocho, mas estas foram superiores àquelas que utilizavam pastejo contínuo ou pastejo alternado. O fato de se possuir tanque refrigerador individual favoreceu a menor CBT. Observou- se mais alta CCS no leite de produtores que realizavam o “California Mastitis Test” (CMT) com maior frequência. O leite de apenas quatro produtores (8,9%) apresentou-se adequado para todos os parâmetros analisados. / In Brazil, dairy production has social, as well as economic, importance, because it is present in significant number of farms with family labor. However, low productivity and low quality still are features of the Brazilian product. The aim of this study was to evaluate the influence of factors on milk productivity, total bacterial count (TBC) and somatic cell count (SCC) and verify if the product is suited to the requirements of Brazilian law. The research was based on data from structured interview and analyses of milk samples collected from each farm (n=45), which belongs to Birigui-SP microregion. Multivariate regression and multivariate analysis of variance, with Tukey’s post-test, was performed and correlation coefficient was determined. The observed average productivity was 6,274.9±4,981.4 L/ha/year. Roughage feeding base and milk production per day of calving interval influenced positively the productivity. There was no difference in productivity between farms that used short-duration grazing system and roughage feeding in the trough, both had higher productivity than farms that used continuous grazing system and alternated grazing system. Milk of producers that had individual cooler tank had a lower TBC. It was observed that milk of producers that performed California Mastitis Test (CMT) frequently had a higher SCC. Milk from four farms (8.9%) was suitable for all analyzed parameters.