The thesis summarizes the current knowledge about the class Branchiobdellae including their anatomy, ecology and geographic distribution with respect to the presence of introduced species in Europe. Using samples of Branchiobdellidan obtained from two introduced species of crayfish caught in a pond near Čáslavice u Moravských Budějovic (signal crayfish, Pacifastacus leniusculus) and in Černíský stream (eastern crayfish, Orconectes limosus), two out of seven European species of Branchiobdellidan were identified, namely B. parasita with 100% presence in the eastern crayfish and 58.7% presence in the signal crayfish, and B. pentodonta with 41.3% presence. Based on data collected from the caught crayfish and samples of Branchiobdellidan, the individual weight of eastern crayfish was proved to influence the quantity and biomass of Branchiobdellidan on the body of crayfish (p<0.001), i.e. increased quantity and biomass of Branchiobdellidan was found on more robust specimens of crayfish, however the effect of gender was not statistically significant. With respect to the signal crayfish, a significant difference was observed in the quantity and biomass of Branchiobdellidan depending on the weight of the crayfish (p<0.001), and the influence of the gender of the crayfish was detected (p<0.001), i.e. the quantity and biomass of Branchiobdellidan was higher on the surface of male specimens of crayfish. The presence of eggs in some female signal crayfish had no significant effect on the quantity and biomass of Branchiobdellidan (p=0.052), however in combination with the weight, the influence of the presence or absence of eggs was proved (p=0.011), more robust females showed increased quantity and biomass of Branchiobdellidan.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T20:53:41Z No. of bitstreams: 1 200794.pdf: 49807309 bytes, checksum: 79f95dcfe52a1c426c83faaabbde276b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-18T20:53:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 200794.pdf: 49807309 bytes, checksum: 79f95dcfe52a1c426c83faaabbde276b (MD5) Previous issue date: 1986-09-15 / Evidencia as características hidrobiológicas do litoral de Ipanema, estudamos diversos parâmetros climatológicos, hidrológicos e biológicos e suas variações espaciais, nas duas estações, próximas à desembocadura do “Emissário Submarino de Esgotos de Ipanema”, e temporais no período de 1979 a 1983. Discutimos cada fator estudado e os correlacionamos matematicamente, visando a compreender a estrutura hidrobiológica desta área particular. Apresentamos algumas conclusões em relação às massas de águas predominantes, a situação quanto ao impacto desequilibrador do ecossistema, estado geral da população fitoplanctônica e o standing-stock da região. Dentre os zooplanctontes coletados em três estações desta área dirigimos o estudo qualitativo para os Annelida Polychaeta. Achamos seis espécies distribuídas em três famílias: Iospilidade (3), Typhloscolecidae (2) e Tomopteridae (1). As espécies encontradas são descritas e ilustradas. São estudadas biogeograficamente e plotadas quanto a sua distribuição mundial. São levantadas as presenças nas massas de água mais características desta região litorânea. São estudadas algumas larvas planctônicas das seguintes famílias bentônicas: Polynoidae, Spionidae e Poecilochaetidae, além dos estágios estoloníferos da família Syllidae (estágio Polybostrichus e Chaetosyllis). / Several climatological, hidrological and biological parameters, as well as their spatial and temporal variations are studied to put in evidence the hidrobiological characteristics of the Ipanema littoral. The study was carried out in two stations close to the outlet of the Submarine Sewage Discharger of Ipanema, throughout the period 1979/ 1983. Every factor was discussed and a mathematical correlation was established to make a full understanding of the hydrobiological structure of that particular area. Some conclusions are presented: the predominant water mass, the situations as to the environment disturbance, the general state of the phytoplanktonic population and the standing stock of the region. The qualitative study was directed to the Annelida Polychaeta out of the zooplankton collected in that area. Six species, distributed into three families, Iospilidae (3), Typhloscolecidae (2) and Tomopteridae (1); are studied with descriptions and illustrations of those species, which are biogeographically studied and ploted as to their worldwide distribution. A survey is made of their presence in the most characteristic water mass of the littoral region of Ipanema. Some planktonic larvae, belonging to the benthonic families Polynoidae, Spionidae and Poecilochaetidae are studied, as well as the stoloniferous stages of the Syllidae family (stages Polybostrichus and Chaetosyllis).

Die Polychaetenfamilie Syllidae ist mit über 600 Arten das größte Taxon innerhalb der Phyllodocida. Die Syllidae werden traditionell in vier Unterfamilien eingeteilt: Autolytinae, Exogoninae, Eusyllinae und Syllinae. Obwohl diese Einteilung umstritten ist, hat sie bis heute ihre Gültigkeit. Als die zum Grundmuster der Syllidae gehörigen Segmentalorgane werden Metanephridien angesehen. Neuere Untersuchungen konnten jedoch auch stark reduzierte Metanephridien und Protonephridien als Segmentalorgane in diesem Polychaetentaxon nachweisen. Im Rahmen der vorliegenden Dissertation wurden die Segmentalorgane der Syllidae ultrastrukturell untersucht, um Hinweise auf die Verwandtschaftsverhältnisse der vier Unterfamilien zu erhalten, und um eine sekundäre Entstehung von Protonephridien aus Metanephriden innerhalb der Syllidae nachzuweisen. Für weitere Rückschlüsse auf die Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Syllidae wurden neben den Segmentalorganen auch Spermien und Brutpflegestrukturen ultrastrukturell bearbeitet. Die Untersuchungen wurden weiterhin für eine Bewertung der systematischen Stellung innerhalb der Phyllodocida genutzt. Insgesamt wurden 21 Segmentalorgane von 18 Taxa der Syllidae und einer Sphaerodoriden-Art untersucht. Spermien und Spermiogenesestadien von fünf Sylliden und die Eianheftungsstrukturen von 11 Syllidentaxa wurden bearbeitet. Mit den in dieser Arbeit präsentierten Daten konnte die sekundäre Entstehung von Protonephridien nachgewiesen werden. Weiterhin wurden wichtige Hinweise für die Verwandtschaftverhältnisse der vier Subtaxa innerhalb der Syllidae geliefert und erstmalig die dorsalen Anheftungsstrukturen brutpflegender Exogoninae detailliert untersucht.

Historical. General descriptions of intertidal zonation have been published by many workers for almost all littoral areas, both marine and lacustrine (Doty, 1957; Glynn, 1965; Hedgpeth, 1957; Lewis, 1964; Pennak, 1951). The fact that animal species of the sandy shore are few in number eliminates many complex interspecific reactions, while great numbers of individuals make population studies feasible. In addition to certain general works (Dahl, 1952; Pirrie et al., 1932; Yonge, 1950) a number of papers have discussed causative factors or mechanisms for animal zonation.

TITLE: Leeches (Hirudinea) and Their Usage in Teaching AUTHOR: Bc. Anna Koldová DEPARTMENT: Biology and Environmental Studies, Faculty od Education Charles University SUPERVISOR: Mgr. Dagmar Říhová, Ph.D. ANNOTATION This diploma thesis is focused on leeches (Annelida: Hirudinea) in the Czech Republic. It provides a description of all species occurring in the Czech Republic, as well as the key to their classification into families. A detailed guideline about the organization of field trip and implementation of extracurricular teaching is part of this thesis. The field trip is focused on sampling, observation and determination of leeches in an excursion to a site with a traditional occurrence of the European medical leech Hirudo medicinalis - national nature reservation Hrabanovská černava. In addition, the work defines the advantages, disadvantages and other possibilities of application of the proposed program, and the inclusion of extracurricular education. KEYWORDS the European medicinal leech, Annelida, field trip, extracurricular lessons, Hrabanovská černava

In the present study, information concerning morphology, ecology, fertilization and larval development of three sympatric species of Eusonus is presented. Morphological similarities are reviewed in part I. These similarities correspond with significant lack of variation found in larval development (part IV). Despite these similarities, as well as the ability to cross fertilize their species, the ecological and reproductive isolating mechanisms presented in part II and II provide a positive indication of the existence of three biologically distinct species. A comparative discussion reviews the efficacy of morphological criteria in differentiating the three closely related Euzonus species.

Call number: LD2668 .T4 1985 S245 / Master of Science

The ability to accurately identify species is fundamental to ecological research and environmental monitoring. Current taxonomic identifications often rely on differentiation of morphologically ambiguous characters, and a process of categorization which is tedious and often leads to misidentifications. This is compounded by the presence of cryptic taxa, which may be prevalent among Polychaete worms (Polychaeta: Annelida). With increased access to genetic techniques, Cytochrome c oxidase subunit I has been suggested as a possible aid to assist in the discrimination of species resources. In this study, I tested the hypothesis that the mtDNA COI gene locus is effective in discriminating morphologically recognised species of Polychaete worms. A 543 base-pair fragment of the COI locus was successfully extracted for 111 individuals from 16 out of 20 morphologically recognised species. Average intraspecific divergences were 0.8 %, ranging from 0 % to 5 %. Average interspecific variation was 26.4 %, ranging from 13.8 % to 36.8 %. The lowest divergences were found between two Nereid species (13.8 %), and two Glycera americana species (17.2 %). Relatively high maximum divergences of over 30 % suggest that some species may have reached a divergence saturation level, which may partially explain why familial groupings in constructed trees were not monophyletic. Divergences within the different Nereid species - a group previously known to have morphologically cryptic species - did not reveal the presence of any cryptic taxa. Pairwise comparisons showed a clear divide between percentages of intra- and interspecific divergences, and the suggested threshold of 11 % is effective for the taxa investigated here. On the basis of these results, I conclude that sequence variation in the mtDNA COI gene locus is effective in discriminating morphologically recognised species of Polychaete worms, but may not be appropriate for deeper (e.g. generic or familial) phylogenetic relationships among taxa.

In dieser Arbeit wurde die progenetische Evolution der Dinophilidae innerhalb der Eunicida („Polychaeta“, Annelida) sowie der Ursprung weiterer vermutlich progenetischer Arten des Euniciden-Taxons „Dorvilleidae“ (Parapodrilus psammophilus und Microdorvillea sp. n.) mit Hilfe molekularer Daten untersucht. Ein etwa 1800 bp langer Abschnitt der 18S-rDNA wurde erfolgreich von den in Tabelle 1 aufgeführten Arten (s. S. 5-7), mit Ausnahme von Ophryotrocha puerilis und Pusillotrocha akessoni, sequenziert. Von der 28S-rDNA wurde ein etwa 2250 bp langer Abschnitt von Trilobodrilus heideri, Protodorvillea kefersteinii, Eunice sp. und Hyalinoecia tubicola sequenziert. Von den folgenden Arten wurden 488 bzw. 482 bp der CO I bestimmt: Rheomorpha neiswestonovae, Trilobodrilus axi, Trilobodrilus heideri, Ophryotrocha gracilis, Ophryotrocha puerilis, Protodorvillea kefersteinii, Schistomeringos rudolphi, Eunice sp., Marphysa sanguinea, Lumbrineris funchalensis, Hyalinoecia tubicola, Potamodrilus fluviatilis und Sabella crassicornis. Zusätzliche Sequenzen der 18S-rDNA, der 28S-rDNA und der CO I wurden der Datenbank GenBank entnommen. Weitere Sequenzen der 28S-rDNA und der CO I wurden freundlicherweise von Frau Jördens zur Verfügung gestellt. Vor den phylogenetischen Analysen wurden Bereiche unterschiedlicher Variabilität definiert. Unterschiede zwischen den Substitutions-, Transitions-, Transversions- und allgemeinen Mutationsraten sowohl untereinander als auch zwischen den Variabilitätsbereichen sowie Sättigungen wurden ermittelt. Das phylogenetische Signal wurde mittels Likelihood Mapping verdeutlicht. Phylogenetische Analysen der einzelnen Gene sowie in Kombination der beiden nukleären ribosomalen Gene und aller drei Gene wurden durchgeführt. Dabei wurden die Parsimonie-, die ML- und die Bayes´sche Analyse parallel angewendet. Soweit möglich wurden Signifikanztests durchgeführt. Die zum einen die beiden Hypothesen der Monophylie der Eunicida mit und ohne Dinophilidae gegeneinander und zum anderen die beste Lösung gegen diese beiden Hypothesen und die Hypothese einer Monophylie der Taxa der ehemaligen „Archiannelida“ verglichen. Die Voruntersuchungen an den Datensätzen der einzelnen Gene zeigen bei den drei Genen deutliche Unterschiede der Substitutionsraten sowohl zwischen den einzelnen Variabilitätsbereichen als auch untereinander. Die Muster in den beiden Genen der 28S‑rDNA und der 18S-rDNA sind sich relativ ähnlich, allerdings ist die 28S‑rDNA variabler. Die CO I unterscheidet sich deutlich von den beiden anderen Genen in ihrem Muster und in ihrer Variabilität. Es wurde in allen drei Analysen Substitutionsmodelle gewählt die diese Unterschiede adäquat berücksichtigten. In der ML- und der Bayes´schen Analyse wurden die Modelle mittels dem Programm Modeltest bzw. MrModeltest bestimmt. In den Analysen der einzelnen Gene zeichnet sich die 18S-rDNA für diese Fragestellungen durch die beste Auflösung aus. Dieses ist auf die niedrige Variabilität sowie die große Anzahl an OTUs zurückzuführen. Die 28S-rDNA ist in der Auflösung wesentlich besser als die CO I und etwa so gut wie die 18S-rDNA. Die CO I alleine ist für Fragestellungen, die die Phylogenie der höheren taxonomischen Einheiten der Polychaeten betreffen, nicht geeignet. Die Kombination meherer Gene führte ebenfalls zu einer Verbesserung der Auflösung. Dabei wird die Auflösung mit steigender Zahl der Gene besser. Auch in diesen Analysen unterstützen die „posterior probabilities“ mehr Gruppen mit signifikanten Werten und sind immer höher als die BS-Werte. Es konnte gezeigt werden, dass die Verwendung der besten Phylogenie der ML-Analyse als Startbaum in der Bayes´schen Analyse schneller und sicherer ins stabile optimale Gleichgewicht führt. Es wird daher empfohlen, diese Option wenigstens als Test für die Etablierung des stabilen optimalen Gleichgewichtes in zukünftigen Analysen zu verwenden. Die molekularen Daten lehnen eine nähere Verwandtschaft der Dinophilidae zu den Eunicida sowie zu den Taxa der ehemaligen „Archiannelida“ mit hoher Wahrscheinlichkeit, allerdings nicht signifikant, ab. Eine mögliche Verwandtschaft zu einem in die Analysen nicht eingegangenem Taxon der Eunicida kann nicht ausgeschlossen werden, da die Monophylie der Eunicida nur in den Analysen aller drei Gene bestätigt wird. Ebenfalls kann eine nähere Verwandtschaft der Dinophilidae zu einem anderen Taxon der „Polychaeta“ nicht mit signifikanter Unterstützung nachgewiesen werden. Da weder die molekularen noch die morphologischen Daten zurzeit eine eindeutige systematische Einordnung der Dinophilidae innerhalb der „Polychaeta“ erlauben, sollten die Dinophilidae wieder als eigenständiges Taxon innerhalb der „Polychaeta“ geführt und keinem anderen Taxon zugeordnet werden. Der progenetische Urspung der Dinophilidae ist aufgrund morphologischer Untersuchungen gut belegt. Die enge Verwandtschaft sowohl von Parapodrilus psammophilus als auch Microdorvillea sp. n. zu großen kiefertragenden Dorvilleiden mit polytrochen Larven wird mit signifikanten Werten in allen Analysen unterstützt. Die molekularen Daten unterstützen somit die vermutete progenetische Evolution von wenigstens Parapodrilus psammophilus. Dadurch dass die Dinophilidae mit hoher Wahrscheinlichkeit nicht in die „Dorvilleidae“ oder Eunicida eingeordnet werden können, ist auch die systematische Einordnung der Gattungen ohne muskulöses Pharynx-Organ (Apodotrocha und Apharyngtus) in die „Dorvilleidae“ nicht mehr mit eindeutiger Sicherheit gegeben. Sie wurden aufgrund der gleichen morphologischen Merkmale wie die Dinophilidae den „Dorvilleidae“ zu geordnet. Die molekular-phylogenetischen Analysen unterstützen nur in den kombinierten Analysen aller drei Gene die Monophylie der Eunicida. Dieser ist wahrscheinlich auf die „explosive Radiation“ dieses Taxons sowie der Taxa der Polychaeten im Allgemeinen zurückzuführen. Die nahe Verwandtschaft von Eunicidae und Onuphidae wird in allen Analysen, außer in denen mit der CO I, signifikant unterstützt. Die molekularen Daten unterstützen eine Monophylie der „Dorvilleidae“ nicht. Da der ctenognathe Kieferapparat der „Dorvilleidae“ sehr wahrscheinlich ein plesiomorphes Merkmal innerhalb der Eunicida ist, wird das Taxon auch morphologisch durch kein autapomorphes Merkmal charakterisiert. Die „Dorvilleidae“ sollten deshalb als parapyhletisch innerhalb der Eunicida betrachtet werden und mit Anführungsstrichen geführt werden. Die systematische Position der Histriobdellidae innerhalb der Eunicida kann basierend auf den Analysen der 18S-rDNA nicht eindeutig geklärt werden. Allerdings legt die Analyse, die eine Monophylie der Eunicida ohne Dinophilidae erzwingt, eine Verwandtschaft mit Ophryotrocha gracilis nahe. Zukünftige molekular-phylogenetische Analysen sowohl die Phylogenie der Annelida und im Besonderen der Eunicida als auch die systematische Einordnung der Dinophilidae betreffend sollten vor allem bei den Genen der 28S-rDNA und CO I noch mehr Taxa und Arten umfassen, um der geringen Auflösung der basalen Verzweigungen in allen Analysen und Problemen wie der „long branch attraction“ in zwei der Analysen mit der 28S-rDNA besser zu begegnen. Ferner sollte der Datensatz noch um andere Gene, wie zum Beispiel dem Elongationsfaktor 1a oder den Histonen, mit einer möglichst großen Zahl an Taxa erweitert werden.

Radim Žídek "Wnt/β-catenin signalling in the development of the marine annelid Platynereis dumerilii" (dissertation) Abstract: Wnt/β-catenin signalling is absolutely crucial for the early embryonic development of metazoan animals from the establishment of body axes, through the specification of germ layers and tissues to the development of organ systems. I used pharmacological manipulations of the Wnt/β-catenin pathway activity in the planktonic larvae of the marine polychaete annelid Platynereis dumerilii, the representative of the clade Spiralia, to investigate the role of Wnt/β- catenin signalling in the development and evolution of three hallmarks of Bilateria: the central nervous system, the body segmentation and the digestive tube. Wnt proteins are produced in all three aforementioned systems in Platynereis where they trigger the Wnt/β-catenin pathway in neighbouring cells. I describe here, for the first time in Platynereis, a homologue of the endpoint transcription factor of the entire pathway, Pdu-Tcf, which is subjected to an alternative splicing and along with a Wnt target gene Pdu-Axin is expressed in tissues with the active Wnt signalling - in the brain ganglia, in the neuroectoderm along the ventral midline, in segments, in the posterior growth zone and in the gut. Pharmacological manipulations...