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Remote sensing representation learning for a species distribution modeling case study

Elkafrawy, Sara 08 1900 (has links)
Les changements climatiques et les phénomènes météorologiques extrêmes sont devenus des moteurs importants de changements de la biodiversité, posant une menace pour la perte d’habitat et l’extinction d’espèces. Comprendre l’état actuel de la biodiversité et identifier les zones hautement adaptées (still strugling with this expression, high suitability for who or what?) sont essentiels afin de lutter contre la perte de biodiversité et guider les processus décisionnels en lien avec les études scientifiques (added scientifiques, as in scientific surveys), les mesures de protection et les efforts de restauration. Les modèles de distribution des espèces (MDE ou SDM en anglais) sont des outils statistiques permettant de prédire la distribution géographique potentielle d’une espèce en fonction de variables environnementales et des données recueillies à cet endroit. Cependant, les MDE conventionnels sont souvent confrontés à des limitations dues à la résolution spatiale et à la couverture restreinte des variables environnementales, lesquelles sont obtenues suite à des mesures au sol ou à l’aide de stations météorologiques. Pour mieux comprendre la distribution des espèces à des fins de conservation, le défi GeoLifeCLEF 2022 a été organisé. Cette compétiion comprend un vaste ensemble de données composé de 1,6 million géo-observations liées à la présence de 17 000 espèces végétales et animales. L’objectif principal de ce défi est d’explorer le potentiel des données de télédétection afin de prédire la présence d’espèces à des géolocalisations spécifiques. Dans ce mémoire, nous étudions diverses techniques d’apprentissage automatique et leur performance en lien avec le défi GeoLifeCLEF 2022. Nous explorons l’efficacité d’algorithmes bien connus en apprentissage par transfert, établissons un cadre d’apprentissage non supervisé et étudions les approches d’apprentissage auto-supervisé lors de la phase d’entraînement. Nos résultats démontrent qu’un ajustement fin des encodeurs pré-entraînés sur différents domaines présente les résultats les plus prometteurs lors de la phase de test. / Climate change and extreme weather events have emerged as significant drivers of biodiversity changes, posing a threat of habitat loss and species extinction. Understanding the current state of biodiversity and identifying areas with high suitability for different species are vital in combating biodiversity loss and guiding decision-making processes for protective measures and restoration efforts. Species distribution models (SDMs) are statistical tools for predicting a species' potential geographic distribution based on environmental variables and occurrence data. However, conventional SDMs often face limitations due to the restricted spatial resolution and coverage of environmental variables derived from ground-based measurements or weather station data. To better understand species distribution for conservation purposes, the GeoLifeCLEF 2022 challenge was introduced. This competition encompasses a large dataset of 1.6 million geo-observations linked to the presence of 17,000 plant and animal species. The primary objective of this challenge is to explore the potential of remote sensing data in forecasting species' presence at specific geolocations. In this thesis, we investigate various machine learning techniques and their performance on the GeoLifeCLEF 2022 challenge. We explore the effectiveness of standard transfer learning algorithms, establish an unsupervised learning framework, and investigate self-supervised learning approaches for training. Our findings demonstrate that fine-tuning pre-trained encoders on different domains yields the most promising test set performance results.
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A personality aware recommendation system

Elourajini, Fahed 08 1900 (has links)
Les systèmes de recommandation conversationnels (CRSs) sont des systèmes qui fournissent des recommandations personnalisées par le biais d’une session de dialogue en langage naturel avec les utilisateurs. Contrairement aux systèmes de recommandation traditionnels qui ne prennent comme vérité de base que les préférences anciennes des utilisateurs, les CRS impliquent aussi les préférences actuelles des utilisateurs durant la conversation. Des recherches récentes montrent que la compréhension de la signification contextuelle des préférences des utilisateurs et des dialogues peut améliorer de manière significative les performances du système de recommandation. Des chercheurs ont également montré un lien fort entre les traits de personnalité des utilisateurs et les systèmes de recommandation. La personnalité et les préférences sont des variables essentielles en sciences sociales. Elles décrivent les différences entre les personnes, que ce soit au niveau individuel ou collectif. Les approches récentes de recommandation basées sur la personnalité sont des systèmes non conversationnels. Par conséquent, il est extrêmement important de détecter et d’utiliser les traits de personnalité des individus dans les systèmes conversationnels afin d’assurer une performance de recommandation et de dialogue plus personnalisée. Pour ce faire, ce travail propose un système de recommandation conversationnel sensible à la personnalité qui est basé sur des modules qui assurent une session de dialogue et recommandation personnalisée en utilisant les traits de personnalité des utilisateurs. Nous proposons également une nouvelle approche de détection de la personnalité, qui est un modèle de langage spécifique au contexte pour détecter les traits des individus en utilisant leurs données publiées sur les réseaux sociaux. Les résultats montrent que notre système proposé a surpassé les approches existantes dans différentes mesures. / A Conversational Recommendation System (CRS) is a system that provides personalized recommendations through a session of natural language dialogue turns with users. Unlike traditional one-shot recommendation systems, which only assume the user’s previous preferences as the ground truth, CRS uses both previous and current user preferences. Recent research shows that understanding the contextual meaning of user preferences and dialogue turns can significantly improve recommendation performance. It also shows a strong link between users’ personality traits and recommendation systems. Personality and preferences are essential variables in computational sociology and social science. They describe the differences between people, both at the individual and collective level. Recent personality-based recommendation approaches are traditional one-shot systems, or “non conversational systems”. Therefore, there is a significant need to detect and employ individuals’ personality traits within the CRS paradigm to ensure a better and more personalized dialogue recommendation performance. Driven by the aforementioned facts, this study proposes a modularized, personality- aware CRS that ensures a personalized dialogue recommendation session using the users’ personality traits. We also propose a novel personality detection approach, which is a context-specific language model for detecting individuals’ personality traits using their social media data. The goal is to create a personality-aware and topic-guided CRS model that performs better than the standard CRS models. Experimental results show that our personality-aware conversation recommendation system has outperformed state-of-the-art approaches in different considered metrics on the topic-guided conversation recommendation dataset.
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Etude et prédiction d'attention visuelle avec les outils d'apprentissage profond en vue d'évaluation des patients atteints des maladies neuro-dégénératives / Study and prediction of visual attention with deep learning net- works in view of assessment of patients with neurodegenerative diseases

Chaabouni, Souad 08 December 2017 (has links)
Cette thèse est motivée par le diagnostic et l’évaluation des maladies neuro-dégénératives et dans le but de diagnostique sur la base de l’attention visuelle.Néanmoins, le dépistage à grande échelle de la population n’est possible que si des modèles de prédiction automatique suffisamment robustes peuvent être construits. Dans ce contexte nous nous intéressons `a la conception et le développement des modèles de prédiction automatique pour un contenu visuel spécifique à utiliser dans l’expérience psycho-visuelle impliquant des patients atteints des maladies neuro-dégénératives. La difficulté d’une telle prédiction réside dans une très faible quantité de données d’entraînement. Les modèles de saillance visuelle ne peuvent pas être fondés sur les caractérisitiques “bottom-up” uniquement, comme le suggère la théorie de l’intégration des caractéristiques. La composante “top-down” de l’attention visuelle humaine devient prépondérante au fur et à mesure d’observation de la scène visuelle. L’attention visuelle peut-être prédite en se basant sur les scènes déjà observées. Les réseaux de convolution profonds (CNN) se sont révèlés être un outil puissant pour prédire les zones saillantes dans les images statiques.Dans le but de construire un modèle de prédiction automatique pour les zones saillantes dans les vidéos naturels et intentionnellement dégradées, nous avons conçu une architecture spécifique de CNN profond. Pour surmonter le manque de données d’apprentissage,nous avons conçu un système d’apprentissage par transfert dérivé de la méthode de Bengio.Nous mesurons ses performances lors de la prédiction de régions saillantes. Les r´esultatsobtenus sont int´eressants concernant la r´eaction des sujets t´emoins normaux contre leszones d´egrad´ees dans les vid´eos. La comparaison de la carte de saillance pr´edite des vid´eosintentionnellement d´egrad´ees avec des cartes de densit´e de fixation du regard et d’autresmod`eles de r´ef´erence montre l’int´erˆet du mod`ele d´evelopp´e. / This thesis is motivated by the diagnosis and the evaluation of the dementia diseasesand with the aim of predicting if a new recorded gaze presents a complaint of thesediseases. Nevertheless, large-scale population screening is only possible if robust predictionmodels can be constructed. In this context, we are interested in the design and thedevelopment of automatic prediction models for specific visual content to be used in thepsycho-visual experience involving patients with dementia (PwD). The difficulty of sucha prediction lies in a very small amount of training data.Visual saliency models cannot be founded only on bottom-up features, as suggested byfeature integration theory. The top-down component of human visual attention becomesprevalent as human observers explore the visual scene. Visual saliency can be predictedon the basis of seen data. Deep Convolutional Neural Networks (CNN) have proven tobe a powerful tool for prediction of salient areas in static images. In order to constructan automatic prediction model for the salient areas in natural and intentionally degradedvideos, we have designed a specific CNN architecture. To overcome the lack of learningdata we designed a transfer learning scheme derived from bengio’s method. We measureits performances when predicting salient regions. The obtained results are interestingregarding the reaction of normal control subjects against degraded areas in videos. Thepredicted saliency map of intentionally degraded videos gives an interesting results comparedto gaze fixation density maps and other reference models.

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