Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-26T10:51:28Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thainara Calixto da Paz - 2016.pdf: 1536674 bytes, checksum: 9a527593418c3d06cd5b9029999ee4b3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-01-26T10:52:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thainara Calixto da Paz - 2016.pdf: 1536674 bytes, checksum: 9a527593418c3d06cd5b9029999ee4b3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-26T10:52:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Thainara Calixto da Paz - 2016.pdf: 1536674 bytes, checksum: 9a527593418c3d06cd5b9029999ee4b3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-12-05 / Human adenoviruses (HAdVs) may cause several clinical syndromes, and are a major cause of respiratory and acute gastroenteritis (AGE), especially among children. However, data on viral load, in more than one type clinical sample obtained from the same child, are still scarce. The aims of the present study were to evaluate the frequency of the HAdV, to determine the load viral in clinical samples, and to proceed molecular characterization of positive samples from children up to five years of age in association with symptomatology. For this, 200 children attended at Hospital Materno Infantil in Goiânia, Goiás; between March 2014 ad July 2015. One fecal and one nasopharyngeal swab sample was obtained from each child. The clinical samples (fecal and nasopharyngeal swabs) were submitted the DNA extraction by a commercial kit (Qiagen-Hilden, Alemanha), and screened by RT-qPCR (TaqMan) assay, with specific primers and probe targeting the hexon region of HAdV genome. The global frequency of HAdVs was 21% (42/200). Positivity in swabs was 9.5% (19/200), and in fecal samples 16% (32/200). Among the symptomatic children (n=129), 21% were positive in fecal samples (22/105) and 9.2% (10/108) in swab samples. Futhermore, 4.5% (9/200) were positive in both clinical samples. High viral loads were observed in both fecal and nasopharyngeal swab samples from symptomatic and asymptomatic children, and major positivity was found in symptomatic children with high load viral. High viral loads were observed in samples from symptomatic and asymptomatic children. Major positivity and load viral was found betwenn symptomatic children. HAdV types 3 of species B and 41 of HadV F species were detected. We hope that the data obtained can help in a better understanding of the pathogenesis of HAdV in children. / Os adenovírus humanos (HAdVs) são importantes agentes causadores de gastroenterite aguda e doença respiratória, principalmente entre as crianças menores de cinco anos de idade. Dados sobre a carga viral, em mais do que um tipo de amostra clínica obtida de um mesmo indivíduo durante a infecção, ainda são escassos. Os objetivos do presente estudo foram avaliar a frequência do HAdVs, determinar a carga viral em amostras clínicas, e proceder a caracterização molecular de amostras positivas de crianças até aos cinco anos de idade, em associação com a sintomatologia. Foram incluídas no estudo amostras de 200 crianças atendidas no Hospital Materno Infantil de Goiânia, Goiás; entre março de 2014 e julho de 2015. Uma amostra fecal e um swab nasofaringeano foram obtidos de cada criança. As amostras foram submetidas a extração, utilizando kit comercial (RNA mini-kit, Qiagen), e triadas por ensaio RT-qPCR (TaqMan, Life Technologies), com iniciadores e sonda específicos para a região codificadora do hexon. Foi observado índice global de positividade para HAdVs de 21% (42/200), o índice de positividade nas fezes foi 16% (32/200) e em swab foi de 9,5% (19/200). Entre as crianças sintomáticas (n=129), 21% foram positivas em amostras fecais (22/105) e 9,2% (10/108) em amostras de swabs. Ainda, 4,5% (9/200) foram positivas em ambas as amostras clínicas. Cargas virais elevadas foram observadas em amostras de crianças sintomáticas e assintomáticas, maior positividade foi encontrada em crianças sintomáticas com maiores cargas virais. Foram detectados HAdV tipos 3 da espécie B e 41 da espécie F de HadV. Esperamos que os dados obtidos possam auxiliar em um melhor entendimento da patogenia dos HAdV na população infantil.

Submitted by Marlene Santos (marlene.bc.ufg@gmail.com) on 2016-05-04T18:41:09Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Denisy Marques Mendanha de Oliveira - 2013.pdf: 1154542 bytes, checksum: e32fe195aaa52077c2e1d030caeadea3 (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-05-05T13:05:48Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Denisy Marques Mendanha de Oliveira - 2013.pdf: 1154542 bytes, checksum: e32fe195aaa52077c2e1d030caeadea3 (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-05T13:05:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Denisy Marques Mendanha de Oliveira - 2013.pdf: 1154542 bytes, checksum: e32fe195aaa52077c2e1d030caeadea3 (MD5) license_rdf: 19874 bytes, checksum: 38cb62ef53e6f513db2fb7e337df6485 (MD5) Previous issue date: 2013-04-17 / The calicivirus (CV) are important etiologic agents of acute gastroenteritis, affecting people of different ages and in various parts of the world. The present study aimed at the detection and molecular characterization of caliciviruses - norovirus (NoV) and sapovirus (SaV) - from fecal samples from children attending a daycare in Goiânia, Goiás. Were collected and analyzed 539 fecal samples 56 children from October 2009 to October 2011. The viral detection and genotyping was done by polymerase chain reaction post-transcription (RT-PCR) and by genomic sequencing using primers designed for partial regions of the viral capsid. From the 56 children participants of the study, 29 (51.8%) had at least one positive sample for CV during the study period. Positive children, 21 (37.5%) had at least one sample for NoV, 16 (28.6%) for SaV and eight (14.3%) positivity to both the virus. The CV were detected in children of both genders, and a higher positivity rate was detected among children aged 13 to 24 months, when compared to the other age groups. A significantly higher positivity for CV was observed in samples from asymptomatic children, and a defined seasonality pattern was not detected for these agents. In terms of molecular characterization for NoV the circulation of samples GII.6, GII.2, GII.1, GII.4, GI.1 and GI.7 was observed, whereas for SaV samples were detected GI.1 and GI.3. During the study period five outbreaks took place, being three of NoV, GII.6, GII.2 and GII.1, two SaV GI.1 and GI.3. Two children presented by prolonged NoV excretion, one for two months and another for 23 days. Twelve (20.4%) children had more than infection for NoV and / or SaV. This study showed circulation of CV at the daycare, a higher rate of infection in asymptomatic children, and prolonged de NoV excretion, which may have contributed to the occurrence of outbreaks and to the dissemination of these agents in such environment. / Os calicivírus (CV) são importantes agentes etiológicos da gastroenterite aguda, acometendo pessoas de diversas idades e em várias partes do mundo. O presente estudo teve como objetivo a detecção e caracterização molecular de amostras de calicivírus - norovírus (NoV) e sapovírus (SaV) - provenientes de amostras fecais de crianças frequentadoras de uma creche em Goiânia, Goiás. Foram coletadas e analisadas 539 amostras fecais de 56 crianças no período de outubro de 2009 a outubro de 2011. A detecção viral e genotipagem foi feita pela reação em cadeia pela polimerase pós-transcrição (RT-PCR) e por sequenciamento genômico, utilizando iniciadores desenhados para regiões parciais do capsídeo viral. Das 56 crianças participantes do estudo, 29 (51,8%) apresentaram pelo menos uma amostra positiva para CV durante o período do estudo. Das crianças positivas, 21 (37,5%) apresentaram pelo menos uma amostra para NoV e 16 (28,6%), para SaV, sendo que 8 (14,3%) apresentaram positividade para ambos os vírus. Os CV foram detectados em crianças de ambos os gêneros, sendo observada uma maior positividade entre as crianças com idade entre 13 a 24 meses. Foi observada ainda detecção significativamente maior nas crianças assintomáticas não tendo sido observado padrão definido de sazonalidade para esses agentes. Em termos da caracterização molecular para NoV, foi observado circulação de amostras GII.6, GII.2, GII.1, GII.4, GI.1 e GI.7 enquanto que para SaV as amostras detectadas foram GI.1 e GI.3. Durante o período do estudo foi observado a ocorrência de cinco surtos sendo três deles por NoV, amostras, GII.6, GII.2 e GII.1, e dois por SaV, GI.1 e GI.3. Duas crianças apresentaram excreção prolongada por NoV, uma por dois meses e outra por 23 dias. Doze (21,4%) crianças apresentaram mais de uma infecção por NoV e/ou SaV. Este estudo mostrou circulação de CV no ambiente de creche, maior índice de infecção em crianças assintomáticas, além de excreção prolongada de NoV, o que pode ter contribuído para a ocorrência de surtos e a disseminação destes agentes naquele ambiente.