Mycobacterium tuberculosis genotipavimo ir su atsparumu vaistams susijusių mutacijų tyrimai Rūta Kudarauskaitė Santrauka Lietuvoje sergamumo tuberkulioze epidemiologiniai rodikliai yra vieni iš blogiausių Europos Sąjungoje. Šio darbo tikslas buvo atlikti Mycobacterium tuberculosis genotipavimo ir mutacijų, nulemiančių M. tuberculosis atsparumą ofloksacinui, streptomicinui, kanamicinui, amikacinui ir para-amino salicilo rūgščiai tyrimus, įgalinančius geriau suprasti vaistams atsparios tuberkuliozės atsiradimo ir plitimo mechanizmus. Atlikus 852 M. tuberculosis padermių genotipavimo spoligotipavimo metodu tyrimus buvo apibrėžta Lietuvoje cirkuliuojančių tuberkuliozės sukėlėjų filogenetinė struktūra: identifikuotos padermių genetinės linijos ir sublinijos. Labiausiai yra paplitusios Beijing (24,4%), Haarlem 4 (21,3 %), T1 (21,1%), LAM 9 (8,8%) ir Haarlem 1 (4,2%) sublinijoms priklausančios M. tuberculosis padermės. Nustatyta, kad 64,6% M. tuberculosis padermių, priklausančių 123 skirtingiems spoligotipų profiliams, turėjo tiktai septynis spoligotipus: ST1, ST35, ST42, ST 47, ST53, ST262 ir ST766. Šiuo nepriklausomu genetinės analizės metodu patvirtintas keturių giminingų M. tuberculosis padermių grupių egzistavimas. Ištyrus 41 atsparią ofloksacinui ir 72 atsparias kanamicinui M. tuberculosis padermes ir rezultatus apjungus su ankstesnių tyrimų rezultatais, nustatyta, kad 82,4% iš 108 ofloksacinui atsparių padermių turėjo gyrA arba gyrB geno mutacijas; 14,9% iš 141 kanamicinui... [toliau žr. visą tekstą] / Genotyping of Mycobacterium tuberculosis and research on mutations conferring resistance to drugs Rūta Kudarauskaitė SUMMARY Tuberculosis situation in Lithuania is one of the worst in European Society. The aim of this work was to carry out genotyping of M. tuberculosis strains and to search for mutations conferring resistance to ofloxacin, streptomycin, kanamycin, amikacin and para-aminosalicylic acid that would lead to better understanding mechanisms of origin and spread of drug-resistant tuberculosis. In total, collection of 852 M. tuberculosis strains was investigated by using internationally standardized genotyping procedure of spoligotyping. The specific spoligotype signatures, genetic sublineages and their lineages were identified. The most prevalent were strains that belonged to sublineages Beijing (24.4%), Haarlem 4 (21.3%), T1 (21.1%), LAM 9 (8.8%) and Haarlem 1 (4.2%). Analysis revealed that 64.6% of M. tuberculosis strains belonged just to seven of 123 identified spoligotypes: ST1, ST35, ST42, ST47, ST53, ST262 ir ST766. As the result of spoligotyping the presence of large groups of highly virulent and genetically related strains have been confirmed by another independent method of genotyping. Forty-one ofloxacin-resistant and 72 kanamycin-resistant isolates were searched for resistance conferring mutations and results of the tests were incorporated into continuing studies on prevalence of these mutations. In total, 82.4% of 108 ofloxacin-resistant M. tuberculosis... [to full text]