Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2015-12-15T14:41:52Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Carolina Schuch de Oliveira.pdf: 1837687 bytes, checksum: a763f1a2bfad3f4462423676533353ec (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-15T14:41:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Carolina Schuch de Oliveira.pdf: 1837687 bytes, checksum: a763f1a2bfad3f4462423676533353ec (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-08-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This work tested two predictions of positive correlation between birds population density and two metrics of avian malaria infection: prevalence and number of parasites lineages. Prevalence measures the proportion of infected individuals in the host population, while number of lineages measures the parasite diversity. For this, we estimated the population density of twelve Amazonian understory bird species (seven Thamnophilidae and five Furnariidae) using a spatially explicit mark-recapture model, fitted to five months of banding data in a upland forest site near Manaus (Amazonas, Brazil). This approach takes into account the individual moviments and the imperfection of sampling process, allowing us to obtain estimates of number of individuals per unit area (density) with associated uncertainties, providing a more accurate picture of a parasite-host system by reducing the sample bias. To estimate prevalence and number of lineages for each host species, we collected and analysed blood samples from host individuals with PCR assays and sequencing of the parasites’ mitochondrial DNA. These samples were taken from the same birds that appear in the mark-recapture data used for estimate species density. Our results didn’t support predictions of a positive relation between host abundance and the two metrics of infection. The absence of relation between abundance and prevalence reinforces the idea that indirect transmission by arthropod vectors prevents host rarity from limiting prevalence. On the other hand, the absence of a relation between density and number of lineages suggests that a community of mostly generalist parasites is shared by a wide group of species. / Este trabalho testou duas predições de correlação positiva entre densidade populacional de aves e duas métricas de infecção para malária aviária: prevalência e número de linhagens de parasitas. A prevalência mensura a proporção de indivíduos infectados na população de hospedeiros, enquanto o número de linhagens mensura a diversidade de parasitas. Para tal, nós estimamos a densidade populacional de doze espécies de aves de sub-bosque (sete Thamnophilidae e cinco Furnariidae) usando um modelo de marcação-recaptura espacialmente explícito, ajustado para dados de cinco meses de amostragem em uma floresta de terra firme próxima a Manaus (Amazonas, Brasil). Esta abordagem leva em consideração as movimentações dos indivíduos e a imperfeição do processo de amostragem, nos permitindo obter estimativas do número de indivíduos por unidade de área (densidade) com incertezas associadas, proporcionando uma visão mais acurada do sistema parasita-hospedeiro através da redução do viés amostral. Para estimar a prevalência e número de linhagens para cada espécie hospedeira, coletamos e analisamos amostras de sangue de indivíduos hospedeiros com ensaios de PCR (Polymerase Chain Reaction) e sequenciamento do DNA mitocondrial dos parasitas. Estas amostras são provenientes das mesmas aves capturadas para estimar a densidade de espécies. Nossos resultados não apoiaram as predições de relação positiva entre densidade do hospedeiro e as duas métricas de infecção. A ausência de relação entre abundância e prevalência reforça a ideia de que a transmissão indireta por vetores artrópodes evita que a raridade de hospedeiros e limita a prevalência. Por outro lado, a ausência de uma relação entre densidade e número de linhagens sugere que uma comunidade de parasitas em sua maioria generalistas é compartilhada com um amplo grupo de espécies.

Submitted by bruna ortiz (brunaortiz.f@gmail.com) on 2016-07-18T14:50:43Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Urania C. Ferreira.pdf: 696113 bytes, checksum: ee5dd4958bf29e5a41d8a7568cc07d33 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-21T19:29:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Urania C. Ferreira.pdf: 696113 bytes, checksum: ee5dd4958bf29e5a41d8a7568cc07d33 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-21T20:19:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Urania C. Ferreira.pdf: 696113 bytes, checksum: ee5dd4958bf29e5a41d8a7568cc07d33 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-21T20:20:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao-Urania C. Ferreira.pdf: 696113 bytes, checksum: ee5dd4958bf29e5a41d8a7568cc07d33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-06 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Description of distribution patterns of species and the mechanisms that generate them are essential to understanding the relationships between organisms and environmental gradients. Riparian zones are distinguished form non-riparian zones by topography, hydrological regimes, soil types and plant and animal communities. In central Amazônia, distinctive bird assemblages have been described in riparian an non-riparian zones. Negative effects as those produced by human disturbance interfere directly on the richness and abundance of birds in forests, mainly through changes in some components of vegetation, affecting the availability of food resources and microclimate conditions. A pattern often observed in areas with urban influence is the homogenization of communities resulting in communities of mostly generalist species after the extinction of specialist species. Thus, it is important to know if in a forest with a strong influence of urbanization, bird assemblages respond to environmental variation generated by the proximity to water courses, as observed in undisturbed forests. It is also important to know if edge effects generated by the urbanization process negatively affect the distribution of these bird communities locally. This study was conducted in an urban forest of about 600 hectares in the city of Manaus (AM) in which the campus of the Federal University of Amazonas - UFAM is found. The forest includes the university campus and is surrounded by residential neighborhoods, streets and urban areas with different uses. To characterize the avifauna of the understory in riparian and non- riparian zones we used the capture-recapture technique and mist-nets. We selected 20 sampling sites, with 10 riparian sites and 10 non- riparian sites. At each site we used a mist-net line (120m) activated for two consecutive days from 06:30h to 11:30h from July to November 2013. Birds were identified, measured, weighed and banded, except humming birds. We, captured 27 species of 12 families with a total of 118 individuals of which 9.3% were recaptures. We found a similar total abundance (T = -0.17 , df = 9 , p = 0.86 ) and species richness (T = -0.2641 , df = 9 , p = 0.79) in riparian and non-riparian sites. We also found that quantitative composition of bird assemblages was not different between riparian and non- riparian sites. However, when the effect of distance to the edge was included into the models we found a different pattern. The best model to explain the variation of biomass of birds, was the one with an interaction between the effect of the distance to the edge and the effect of environment (riparian and non-riparian) (AICweight = 0.716). Thus, according to this model there was a positive relationship between the bird biomass and the distance to the edge in riparian zones while the opposite pattern was observed in non-riparian zones. Regarding similarity between riparian and non-riparian zones, we observed a pattern of increasing similarity between pairs of riparian sites and non-riparian sites with decreasing distance to the forest edge, that is, pairs of riparian / non-riparian sites that are closer to the forest edge are more similar to each other than sites that are in the interior of the forest. We conclude that the edge effect generated by the negative influence of the urban matrix into the forest is the determining factor in increasing the similarity between riparian and non- riparian zones, thus leading to a community homogenization process. / A descrição de padrões de distribuição de espécies e os mecanismos que os geram são essenciais para entender as relações entre os organismos e os gradientes ambientais. Zonas ripárias se distinguem de zonas-não ripárias pela topografia, regimes hidrológicos, tipos de solo e comunidades de plantas e animais. Em florestas primárias na Amazônia central existem assembleias de aves diferenciadas entre as zonas riparias e não ripárias. No entanto, efeitos negativos como os produzidos por perturbações antrópicas interferem diretamente sobre a riqueza e abundância de aves em florestas, principalmente através de mudanças em alguns componentes da vegetação, afetando a disponibilidade de recursos alimentares e as condições microclimáticas. Um padrão frequentemente observado em zonas com influência urbana é a homogenização das comunidades resultando em uma comunidade composta por espécies principalmente generalistas após a extinção das espécies especialistas. Assim, é importante conhecer se em uma floresta com forte influência da urbanização as assembleias de espécies de aves respondem à variação ambiental gerada pela proximidade de igarapés como observado em florestas não-perturbadas e se o efeito de borda gerado pelo processo de urbanização afeta negativamente a distribuição dessas aves localmente. Este estudo foi realizado em uma floresta urbana de aproximadamente 600 hectares na cidade de Manaus (AM) na qual se encontra o campus da Universidade Federal do Amazonas - UFAM. A floresta que compreende o campus universitário é circundada por bairros residenciais, avenidas e áreas urbanas de diferentes usos. Para caracterizar a avifauna de sub-bosque nas zonas ripárias e não-ripárias utilizamos a técnica de captura-recaptura com o uso de redes de neblina. Selecionamos 20 sítios de amostragem, sendo 10 sítios ripários e 10 sítios não ripários. Em cada sítio utilizamos uma linha de rede (120m) ativadas durante dois dias consecutivos das 06:30h às 11:30h no período de julho a novembro de 2013. Identificamos, medimos, pesamos e anilhamos todas as aves capturadas, exceto beija-flores. No total, capturamos 27 espécies de 12 famílias com um total de 118 indivíduos dos quais 9,3% foram recapturas. A abundância foi similar nos sítios ripários e não ripários (T = -0.17, df = 9, p = 0,86) assim como riqueza também não variou entre sítios ripários e não ripários (T = -0.2641, df = 9, p = 0,79). Também verificamos que a composição quantitativa da assembleia de aves não se diferenciou nas zonas ripárias e não ripárias. Contudo, quando incluímos o efeito da distância à borda nos modelos os resultados mostrarem um padrão diferente. O melhor modelo para explicar a variação da biomassa de aves, foi aquele que considerou uma interação entre o efeito da distância à borda como o efeito do ambiente (ripário ou não ripário) (AICw = 0,716). Assim, de acordo com este modelo observamos uma relação positiva entre a biomassa de aves e a distância à borda nas áreas ripárias sendo que o padrão inverso foi observado para as áreas não riparias. Com relação a similaridade entre as áreas ripárias e não ripárias, observamos um padrão de aumento da similaridade entre pares de sítios ripários e não ripários com a diminuição da distância a borda, ou seja, aqueles pares de sítios que estão mais próximos a borda são mais similares entre si do que os sítios que estão no interior da floresta. Concluímos que o efeito de borda gerado pela influencia negativa da matriz urbana para o interior da floresta é o fator determinante no aumento da similaridade entre as zonas ripárias e não ripárias, acarretando assim ao processo de homogenização de comunidades.