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BancoWeb: base de imagens mamográficas para auxílio em avaliações de esquemas CAD / Mammographic image database for CAD schemes evaluation

Matheus, Bruno Roberto Nepomuceno 22 April 2010 (has links)
Este trabalho teve como objetivo desenvolver uma base de imagens mamográficas online com acesso público para desenvolvimento, testes e avaliação comparativa de esquemas computadorizados de auxilio ao diagnóstico (CADs). A base contem imagens de vários hospitais, com grande variedade de laudos, também disponíveis na base assim como informações sobre dados clínicos (não confidenciais) dos pacientes. Uma interface detalhada foi criada para permitir o fácil acesso público, permitindo o uso de ferramentas de busca, recorte, analise estatística e inserção remota de imagens, entre outras. Testes comparativos com bases já existentes e amplamente usadas mostraram que a base desenvolvida tem quantidade e qualidade de imagens comparável ou superior as outras, além de oferecer uma quantidade de ferramentas muito maior. / This work has the objective of developing an online mamographic image database with public access for development, test and evaluation of computer-aided diagnosis (CAD). The database contains images from several hospitals, with great variety of medical reports, also available on the database together with other clinical information (not classified) from the patient. A detailed interface was developed to allow easy public access, allowing the use of tools for search, clipping, statistical analyses, remote insertion and others. Comparative test with other already existing databases shown that the presented database has quantity and quality comparable or superior to the others and offers a greater set of tools for the user.
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Ambiente para avaliação de algoritmos de processamento de imagens médicas. / Environment for medical image processing algorithms assessment.

Santos, Marcelo dos 20 December 2006 (has links)
Constantemente, uma variedade de novos métodos de processamento de imagens é apresentada à comunidade. Porém poucos têm provado sua utilidade na rotina clínica. A análise e comparação de diferentes abordagens por meio de uma mesma metodologia são essenciais para a qualificação do projeto de um algoritmo. Porém, é difícil comparar o desempenho e adequabilidade de diferentes algoritmos de uma mesma maneira. A principal razão deve-se à dificuldade para avaliar exaustivamente um software, ou pelo menos, testá-lo num conjunto abrangente e diversificado de casos clínicos. Muitas áreas - como o desenvolvimento de software e treinamentos em Medicina - necessitam de um conjunto diverso e abrangente de dados sobre imagens e informações associadas. Tais conjuntos podem ser utilizados para desenvolver, testar e avaliar novos softwares clínicos, utilizando dados públicos. Este trabalho propõe o desenvolvimento de um ambiente de base de imagens médicas de diferentes modalidades para uso livre em diferentes propósitos. Este ambiente - implementado como uma arquitetura de base distribuída de imagens - armazena imagens médicas com informações de aquisição, laudos, algoritmos de processamento de imagens, gold standards e imagens pós-processadas. O ambiente também possui um modelo de revisão de documentos que garante a qualidade dos conjuntos de dados. Como exemplo da facilidade e praticidade de uso, são apresentadas as avaliações de duas categorias de métodos de processamento de imagens médicas: segmentação e compressão. Em adição, a utilização do ambiente em outras atividades, como no projeto do arquivo didático digital do HC-FMUSP, demonstra a robustez da arquitetura proposta e sua aplicação em diferentes propósitos. / Constantly, a variety of new image processing methods are presented to the community. However, few of them have proved to be useful when used in clinical routine. The task of analyzing and comparing different algorithms, methods and applications through a sound testing is an essential qualification of algorithm design. However, it is usually very difficult to compare the performance and adequacy of different algorithms in the same way. The main reason is due to the difficulty to assess exhaustively the software, or at least using a comprehensive and diverse number of clinical cases for comparison. Several areas such as software development, image processing and medical training need a diverse and comprehensive dataset of images and related information. Such datasets could be used to develop, test and evaluate new medical software, using public data. This work presents the development of a free, online, multipurpose and multimodality medical image database environment. The environment, implemented such as a distributed medical image database, stores medical images, reports, image processing softwares, gold standards and post-processed images. Also, this environment implements a peer review model which assures the quality of all datasets. As an example of feasibility and easyness of use, it is shown the evaluation in two categories of medical image processing methods: segmentation and compression. In addition, the use of the set of applications proposed in this work in other activities, such as the HC-FMUSP digital teaching file, shows the robustness of the proposed architecture and its applicability on different purposes.
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Ferramentas de interação e gerenciamento do BancoWeb: uma base de imagens para auxílio a pesquisas na área de mamografia digital / Interaction and management tools of BancoWeb: a database of images to aid research in the area of digital mammography

Pâmela Serra Rodrigues 23 November 2018 (has links)
O BancoWeb é uma base de imagens para auxilio a pesquisa na área de mamografia digital. Oferece o gerenciamento da base de dados com um conjunto amplo de imagens mamográficas de qualidade apropriada ao processamento digital e, principalmente, comparação entre diferentes esquemas. O sistema de busca da base de dados/imagens mamográficas está disponível desde 2010, sendo on-line e gratuito. Com os avanços em pesquisas durante todos estes anos, a necessidade e demanda de melhorias, mudanças e incrementos no sistema de gerenciamento e buscas foram surgindo. Por isso, os objetivos deste trabalho estão em desenvolver e aperfeiçoar recursos na busca de imagens, tipos de achado, permitir a classificação pelo sistema CAD, além de implementar um novo sistema de gerenciamento e armazenamento de imagens de um novo phantom, desenvolvido como resultado de pesquisa ainda mais recente no grupo. Testes comparativos com outras bases análogas que disponibilizam imagens mamográficas para download faz do BancoWeb uma ferramenta única e poderosa para o pesquisador e interessado da área, oferecendo mais opções que as demais bases disponíveis atualmente. / BancoWeb is a database of images to aid research in the field of digital mammography. It offers the management of the database with a wide set of mammographic images of appropriate quality to the digital processing and, mainly, comparison between different schemes. The database search system/mammographic images are available since 2010, being online and free. With advances in research over the years, the need for and demand for improvements, changes, and increases in the management and search system have been emerging. Therefore, the objectives of this work are in development and improvement of resources in the search of images, types of find, allow the selection of CAD, in addition to implementing a new system of management and storage of images of a new phantom, developed as a result of even more recent research in the group. Comparative tests with other analogous databases that provide mammographic images for download makes BancoWeb a unique and powerful tool for the researcher and the interested party, offering more options than the other databases currently available.
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Ferramentas de interação e gerenciamento do BancoWeb: uma base de imagens para auxílio a pesquisas na área de mamografia digital / Interaction and management tools of BancoWeb: a database of images to aid research in the area of digital mammography

Rodrigues, Pâmela Serra 23 November 2018 (has links)
O BancoWeb é uma base de imagens para auxilio a pesquisa na área de mamografia digital. Oferece o gerenciamento da base de dados com um conjunto amplo de imagens mamográficas de qualidade apropriada ao processamento digital e, principalmente, comparação entre diferentes esquemas. O sistema de busca da base de dados/imagens mamográficas está disponível desde 2010, sendo on-line e gratuito. Com os avanços em pesquisas durante todos estes anos, a necessidade e demanda de melhorias, mudanças e incrementos no sistema de gerenciamento e buscas foram surgindo. Por isso, os objetivos deste trabalho estão em desenvolver e aperfeiçoar recursos na busca de imagens, tipos de achado, permitir a classificação pelo sistema CAD, além de implementar um novo sistema de gerenciamento e armazenamento de imagens de um novo phantom, desenvolvido como resultado de pesquisa ainda mais recente no grupo. Testes comparativos com outras bases análogas que disponibilizam imagens mamográficas para download faz do BancoWeb uma ferramenta única e poderosa para o pesquisador e interessado da área, oferecendo mais opções que as demais bases disponíveis atualmente. / BancoWeb is a database of images to aid research in the field of digital mammography. It offers the management of the database with a wide set of mammographic images of appropriate quality to the digital processing and, mainly, comparison between different schemes. The database search system/mammographic images are available since 2010, being online and free. With advances in research over the years, the need for and demand for improvements, changes, and increases in the management and search system have been emerging. Therefore, the objectives of this work are in development and improvement of resources in the search of images, types of find, allow the selection of CAD, in addition to implementing a new system of management and storage of images of a new phantom, developed as a result of even more recent research in the group. Comparative tests with other analogous databases that provide mammographic images for download makes BancoWeb a unique and powerful tool for the researcher and the interested party, offering more options than the other databases currently available.
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Ambiente para avaliação de algoritmos de processamento de imagens médicas. / Environment for medical image processing algorithms assessment.

Marcelo dos Santos 20 December 2006 (has links)
Constantemente, uma variedade de novos métodos de processamento de imagens é apresentada à comunidade. Porém poucos têm provado sua utilidade na rotina clínica. A análise e comparação de diferentes abordagens por meio de uma mesma metodologia são essenciais para a qualificação do projeto de um algoritmo. Porém, é difícil comparar o desempenho e adequabilidade de diferentes algoritmos de uma mesma maneira. A principal razão deve-se à dificuldade para avaliar exaustivamente um software, ou pelo menos, testá-lo num conjunto abrangente e diversificado de casos clínicos. Muitas áreas - como o desenvolvimento de software e treinamentos em Medicina - necessitam de um conjunto diverso e abrangente de dados sobre imagens e informações associadas. Tais conjuntos podem ser utilizados para desenvolver, testar e avaliar novos softwares clínicos, utilizando dados públicos. Este trabalho propõe o desenvolvimento de um ambiente de base de imagens médicas de diferentes modalidades para uso livre em diferentes propósitos. Este ambiente - implementado como uma arquitetura de base distribuída de imagens - armazena imagens médicas com informações de aquisição, laudos, algoritmos de processamento de imagens, gold standards e imagens pós-processadas. O ambiente também possui um modelo de revisão de documentos que garante a qualidade dos conjuntos de dados. Como exemplo da facilidade e praticidade de uso, são apresentadas as avaliações de duas categorias de métodos de processamento de imagens médicas: segmentação e compressão. Em adição, a utilização do ambiente em outras atividades, como no projeto do arquivo didático digital do HC-FMUSP, demonstra a robustez da arquitetura proposta e sua aplicação em diferentes propósitos. / Constantly, a variety of new image processing methods are presented to the community. However, few of them have proved to be useful when used in clinical routine. The task of analyzing and comparing different algorithms, methods and applications through a sound testing is an essential qualification of algorithm design. However, it is usually very difficult to compare the performance and adequacy of different algorithms in the same way. The main reason is due to the difficulty to assess exhaustively the software, or at least using a comprehensive and diverse number of clinical cases for comparison. Several areas such as software development, image processing and medical training need a diverse and comprehensive dataset of images and related information. Such datasets could be used to develop, test and evaluate new medical software, using public data. This work presents the development of a free, online, multipurpose and multimodality medical image database environment. The environment, implemented such as a distributed medical image database, stores medical images, reports, image processing softwares, gold standards and post-processed images. Also, this environment implements a peer review model which assures the quality of all datasets. As an example of feasibility and easyness of use, it is shown the evaluation in two categories of medical image processing methods: segmentation and compression. In addition, the use of the set of applications proposed in this work in other activities, such as the HC-FMUSP digital teaching file, shows the robustness of the proposed architecture and its applicability on different purposes.
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BancoWeb: base de imagens mamográficas para auxílio em avaliações de esquemas CAD / Mammographic image database for CAD schemes evaluation

Bruno Roberto Nepomuceno Matheus 22 April 2010 (has links)
Este trabalho teve como objetivo desenvolver uma base de imagens mamográficas online com acesso público para desenvolvimento, testes e avaliação comparativa de esquemas computadorizados de auxilio ao diagnóstico (CADs). A base contem imagens de vários hospitais, com grande variedade de laudos, também disponíveis na base assim como informações sobre dados clínicos (não confidenciais) dos pacientes. Uma interface detalhada foi criada para permitir o fácil acesso público, permitindo o uso de ferramentas de busca, recorte, analise estatística e inserção remota de imagens, entre outras. Testes comparativos com bases já existentes e amplamente usadas mostraram que a base desenvolvida tem quantidade e qualidade de imagens comparável ou superior as outras, além de oferecer uma quantidade de ferramentas muito maior. / This work has the objective of developing an online mamographic image database with public access for development, test and evaluation of computer-aided diagnosis (CAD). The database contains images from several hospitals, with great variety of medical reports, also available on the database together with other clinical information (not classified) from the patient. A detailed interface was developed to allow easy public access, allowing the use of tools for search, clipping, statistical analyses, remote insertion and others. Comparative test with other already existing databases shown that the presented database has quantity and quality comparable or superior to the others and offers a greater set of tools for the user.

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