Mi trabajo de investigación se centra en el estudio de problemas organizacionales en situaciones de colaboración. En particular, esta tesis se compone de tres capítulos en los que analizo problemas de incentivos en la investigación interdisciplinar y en acuerdos de colaboración entre empresas y universidades. El primero capitulo de mi tesis, "Incentives for Interdisciplinary Research", es (hasta el momento y según mi conocimiento) el primero trabajo que caracteriza formalmente la investigación interdisciplinar a través de complementariedad en la producción y desventaja innata en los costes para el desarrollo de una nueva área científica. Mi trabajo demuestra que cuando los objetivos de la investigación son suficientemente exigentes, la investigación interdiciplinar es preferible a la investigación especializada. En el segundo capítulo de la tesis, "Business-Science Research Collaboration under Moral-Hazard", analizo cómo las características de acuerdos de colaboración son el resultado de un contrato óptimo entre las partes contratantes. Además, el tipo de acuerdo puede ser un importante instrumento de incentivo cuando algún (algunos) de los recursos importantes para la colaboración no son contratables. El análisis se hace en dos dimensiones: de la estructura del gobierno del acuerdo (descentralizada o centralizada), y de los problemas de información que esa estructura enfrenta. Aunque una estructura descentralizada siempre elije proyectos que están más cercanos a los intereses de la parte gobernante, las dos estructuras podrán utilizar el proyecto como mecanismo para reducir el efecto de riesgo moral. El tercero capítulo de la tesis, "Patents and Business-Science Research Partnership" (escrito en conjunto con Walter Garcia-Fontes), presenta un estudio empírico que relaciona las características de patentes con el proceso de investigación que las precedieron. Utilizando datos de patentes europeas, los resultados de este capítulo están de acuerdo con las predicciones teóricas del capítulo anterior de esta tesis: la identidad institucional de las organizaciones que hacen la investigación se hacen visibles en las características de las patentes. / The research of my PhD dissertation focuses on the study of organizational problems, in the context of collaborative relations. In particular, the dissertation is composed by three chapters, in which I analyze incentives problems in interdisciplinary research and in collaboration agreements between firms and universities. The first chapter of the thesis, "Incentives for Interdisciplinary Research", is (up to the moment and to my knowledge), the first article that formally characterizes interdisciplinary research: through the presence of complementarities in the production and through an innate cost disadvantage, when developing a new scientific area. My work shows that when the goals for the research are sufficiently demanding, interdisciplinarity is preferred to specialization. In the second chapter of the thesis, "Business-Science Research Collaboration under Moral-Hazard", I analyze on how the characteristics of a research agreement can be the optimal outcome of a contract between the parties. Furthermore, the type of project can also be an importance incentive tool when some of the resources that are important for the success are non-verifiable and non-contractibe. The analysis is developed in two dimensions: the structure of partnership governance (decentralized and centralized), and the informational constraints that such structures may face. Even if a decentralized structure chooses a type of project that is closer to the interests of the governing party, both structures may optimally use the project as a mechanism to reduce the impact of moral-hazard. In the third chapter of the thesis, "Patents and Business-Science Research Partnership" (jointly written with Walter Garcia-Fontes), I present an empirical study that relates the characteristics of the patents with the research process that lead to the inventions. Using data from the European Inventors Survey, PatVal-EU, the results of this chapter are aligned with the theoretical predictions of the previous chapter of the thesis: the institutional identity of the research organizations are associated with different basicness levels of the patens.