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O impacto das migrações na constituição genética de populações latino-americanasGodinho, Neide Maria de Oliveira January 2008 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2008. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-09-18T13:47:25Z
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Previous issue date: 2008 / A América Latina tem sido palco de grandes transformações populacionais, sendo hoje
caracterizada por ter uma constituição multiétnica, porém com maior influência de três
populações parentais - européia, africana e ameríndia. Apesar das similaridades, cada
país latino-americano apresentou uma história de povoamento singular, já que
ocorreram variações na distribuição das populações parentais e na quantidade de fluxo
gênico entre elas. Esse trabalho teve por objetivo avaliar a constituição genética de
populações miscigenadas da América Latina e Caribe e a estruturação genética entre
elas. Para tanto, foram considerados quatro conjuntos populacionais e dois conjuntos de
marcadores. Primeiro, foram analisados treze países da América Latina e Caribe
(Argentina, Bahamas, Brasil, Chile, Colômbia, Costa Rica, El Salvador, Equador,
Jamaica, México, Peru, Porto Rico e Venezuela), utilizando marcadores do tipo STRs
(CSF1PO, D3S1358, D5S818, D7S820, D8S1179, D13S317, D16S539, D18S51,
D21S11, FGA, TH01, TPOX e vWA). Em um segundo momento, foram avaliadas as
diferenças entre as regiões geográficas de três países da América do Sul (Argentina,
Brasil e Colômbia) utilizando os mesmos marcadores. Para uma análise mais regional,
populações urbanas da região centro-oeste brasileira foram analisadas utilizando os
mesmo marcadores anteriores adicionados do Penta E. O povoamento da região centrooeste
foi também avaliado pela comparação de duas populações da região – Goiás e
Distrito Federal – utilizando marcadores AIMs autossômicos - APO, AT3, D1, DRD2-
A, ECA, FXIIIB, FyNull, GC, LPL, OCA2, PV92, Rb2300, Sb19.3 e TPA25. As
análises de distância genética entre as populações latino-americanas e entre as regiões
dos três países mostraram um quadro bastante heterogêneo quanto à distribuição das
freqüências alélicas dos marcadores utilizados. A análise de mistura corroborou os
dados de distância, sendo que a contribuição parental ameríndia variou de 5% a 73%, a
africana de 4% a 90% e a européia de 4% a 66%. Com relação à análise das populações
da região centro-oeste do Brasil, não foi observado diferenciação entre a distribuição
gênica e genotípica, provavelmente devido ao intenso fluxo gênico entre elas. A mistura
gênica estimada, considerando os marcadores microssatélites, foi de 11% para a
parental ameríndia, 21% para a parental africana e de 68% para a parental européia. Os
resultados obtidos com os marcadores AIMs foi de 15%, 21% e 63%, respectivamente.
A maioria das populações analisadas apresentou modelo tri-híbrido de mistura. Esses
resultados são concordantes com dados históricos e demográficos das populações
latino-americanas. ____________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Latin American population has been under great transformations and today
it can be characterized as having a multiethnic constitution, however with three main
parental populations influence - European, African and Amerindian. Despite their
similarities, each country has a unique history of settlement, since there have been
variations in the distribution of the parental populations and in the amount of gene flow
between them. This study aimed to evaluate the genetic constitution in Latin American
and Caribbean populations and the genetic structure between them. For that matter, four
groups of populations and two sets of markers were employed. First, thirteen countries
of Latin America and Caribbean (Argentina, Bahamas, Brazil, Chile, Colombia, Costa
Rica, El Salvador, Ecuador, Jamaica, Mexico, Peru, Puerto Rico and Venezuela), were
analyzed with STR markers (CSF1PO, D3S1358, D5S818, D7S820, D8S1179,
D13S317, D16S539, D18S51, D21S11, FGA, TH01, TPOX and vWA). In a second
moment, the differences between the geographic regions of three South-American
countries were evaluated (Argentina, Brazil and Colombia) using the same markers.
Next, for a more regional analysis, urban populations from Brazilian Middle-Western
region were studied using the same markers listed above and Penta E. The settlement of
the Brazilian Middle-Western region was also evaluated regarding the comparison of
two populations of this region - Goiás and Federal District - using autosomic AIMs -
APO, AT3, D1, DRD2-A, ECA, FXIIIB, FyNull, GC, LPL, OCA2, PV92, Rb2300,
SB19.3 and TPA25. The analyses of the genetic distance between the Latin American
populations and between the regions of the three countries had shown a heterogeneous
picture of the distribution of the allelic frequencies. The admixture analysis
corroborated the genetic distance data, with the Amerindian parental contribution
presenting variations ranging from 5 to 73%, the African from 4 to 90% and the
European from 4 to 66%. Regarding the analysis of the populations of the Brazilian
Middle-Western region, differentiation between the genetic and genotypic distribution
was not observed, probably due the intense gene flow between them. The genetic
admixture estimate, considering the STRs markers, was 11% for the Amerindian
parental, 21% for the African parental and 68% for the European parental. The results
generated with the AIMs were 15%, 21% and 63%, respectively. The majority of the
analyzed populations are tri-hybrid, having been formed by three parental groups. These
results agree with historical and demographic data of the Latin American populations.
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Contribuição genética de duas populações urbanas da região Centro-oeste brasileira estimada por marcadores uniparentaisBarcelos, Rejane da Silva Sena January 2006 (has links)
Tese (doutorado)-Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 2006. / Submitted by Mariana Fonseca Xavier Nunes (nanarteira@hotmail.com) on 2010-09-25T18:16:49Z
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2006_Rejane da Silva Sena Barcelos.pdf: 1116902 bytes, checksum: e5d460c540afd6b0f7ba420948133f97 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-10-06T23:28:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1
2006_Rejane da Silva Sena Barcelos.pdf: 1116902 bytes, checksum: e5d460c540afd6b0f7ba420948133f97 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-10-06T23:28:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1
2006_Rejane da Silva Sena Barcelos.pdf: 1116902 bytes, checksum: e5d460c540afd6b0f7ba420948133f97 (MD5) / O objetivo desse trabalho foi analisar e comparar a constituição genética masculina e feminina da região Centro-Oeste brasileira utilizando 11 UEPs, um elemento AluYAP e 4 STRs localizados na região não-recombinante do cromossomo Y, além de 13 SNPs situados na região codificante do DNA mitocondrial (DNAmt) e uma deleção de 9 pb localizados no DNAmt. Estes marcadores foram analisados em 200 homens não aparentados do Estado de Goiás e Distrito Federal. As análises dos marcadores situados no cromossomo Y e no DNA mitocondrial demonstraram uma ampla diversidade genética entre as populações. A análise estatística dos dados foi realizada pelos programas ARLEQUIN 2000, PopGENE e pelo teste Z. Os marcadores binários do cromossomo Y e do DNA mitocondrial não indicaram diferenças estatisticamente significativas entre as populações. Entretanto, na análise dos STRs Y específicos foram observadas diferenças genéticas (p<0.05). Os resultados para contribuição paterna indicaram uma maior contribuição de homens europeus que africanos e ameríndios. Já o DNA mitocondrial mostrou uma predominância de linhagem materna ameríndia/asiática em ambas populações, seguida pela africana e uma pequena contribuição européia. Sendo assim, os resultados da contribuição paterna e materna são claramente divergentes. Esses resultados corroboram dados históricos que indicam: o cruzamento direcional entre homens europeus e mulheres dos três grupos étnicos principais que colonizaram o Brasil; e um pequeno número de homens descendentes de ameríndios na população brasileira atual, o qual é conseqüência da colonização européia. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This research aimed to analyze and compare the male and female genetic constitution of Middle-West Brazilian region by the investigation of 11 UEPs, an AluYAP element and 4 STRs located in the nonrecombinant region of the Y-chromosome, and, also, 13 SNPs placed in coded regions of mitochondrial DNA (mtDNA) and a 9 bp deletion of mtDNA. These markers were analyzed in 200 unrelated men from Goiás state and Federal District. The analysis of the Y-chromosome and mtDNA markers demonstrated a great genetic diversity between populations. The statistical analysis of the data obtained was done using the ARLEQUIN 2000 software, PopGENE and Z test. The binary markers of Y-chromosome and mtDNA did not indicate statistic supported differences between the populations. However, genetic differences were observed in Y-chromosome STRs analysis (p<0.05). The paternal contribution results indicated a greater European men contribution than African or Amerindian ones. Besides, mtDNA showed a predominance of Amerindian/Asiatic maternal lineage in both populations constitution, followed by African and then a small European contribution. Therefore, the results showed a clear divergence from paternal to maternal lineages. These results corroborated historical data that points to: directional mating between European males and females from any of the main three ethnic groups that colonized Brazil; and to a small number of Amerindians males descendants in nowadays Brazilian populations, which is a consequence of the European colonization.
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O acaso e a decisão : modelos matematicos para dispersão populacionalDíaz Rodrigues, Luiz Alberto 15 July 1998 (has links)
Orientador: Wilson Castro Ferreira Jr / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-23T23:15:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1998 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed / Doutorado / Doutor em Matemática Aplicada
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Estrutura e dinâmica das comunidades de crustáceos decápodos no litoral norte do Estado de São Paulo /Hiroki, Kátia Aparecida Nunes. January 2012 (has links)
Orientador: Adilson Fransozo / Banca: Rogério C. da Costa / Banca: Roberto Munehisa Shimizu / Banca: Valter José Cobo / Banca: Gustavo Monteiro Teixeira / Resumo: Não disponível / Abstract: Not available / Doutor
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Distribuição espacial e biologia populacional de leptuca leptodactyla (rathbun, 1898) (decapoda: ocypodidae: gelasiminae) em um manguezal do Nordeste Semiárido brasileiroNogueira, Ravena Sthefany Alves January 2017 (has links)
OGUEIRA, R. S. A. Distribuição espacial e biologia populacional de leptuca leptodactyla (rathbun, 1898) (decapoda: ocypodidae: gelasiminae) em um manguezal do Nordeste Semiárido brasileiro. 2017. 96 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Marinhas Tropicais) - Instituto de Ciências do Mar, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Geovane Uchoa (geovane@ufc.br) on 2017-11-08T13:07:49Z
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Previous issue date: 2017 / The environmental factors that regulates the spatial distribution of Leptuca leptodactyla at Baixa Grande mangrove in Areia Branca, RN (4º55’90”S, 37º04”51”W) were studied in the period of November 2015 until October 2016. The specie’s populational biology was analyzed in terms of age structure, reproductive biology, density and sexual ratio. Three transects have been established in a mangrove area next to the river mouth, which were visited monthly. In each transect, 10 squares of 50 × 50 (0.25 cm²) were demarcated, where
all specimens of L. leptodactyla were collected, which, in laboratory, were determined the genders, measured the sizes and quantified. Sedimentological analysis (granulometry, organic matter content and humidity) were made in three squares of each transect, comprising the mangroves border, the intermediate region and the riverside, in which interstitial temperature and salinity were also measured. The results showed that L. leptodactyla occurred in every sampled area, however, showed higher affinity for fine sediments. The specie presented a negative correlation for all measured abiotic parameters, except for humidity. However, a
strong and significant relationship was only observed for salinity. In terms of populational biology, a density of 36.46 ind./m² was found and sexual ratio corresponded to the expected of 1: 1. The population presented a unimodal frequency distribution, suggesting a continuous reproduction. Meanwhile, the occurrence of ovigerous females and juvenile individuals showed a strong relation with rainfall, thus indicating that the reproductive period occurs in synchrony with the rainy period of the region. / Os fatores ambientais que regulam a distribuição espacial de Leptuca leptodactyla no manguezal de Baixa Grande, Areia Branca, RN (4º55’90”S, 37º04”51”W), foram estudados no período de novembro de 2015 a outubro de 2016. A biologia populacional da espécie foi analisada quanto a sua estrutura etária, biologia reprodutiva, densidade e razão sexual. Três transectos foram estabelecidos em uma área do manguezal próximo a foz do rio, os quais foram visitados mensalmente. Em cada transecto, 10 quadrados de 50 × 50 (0,25 cm²) foram demarcados, onde foram coletados todos os indivíduos de L. leptodactyla encontrados, os
quais, em laboratório, foram sexados, medidos e quantificados. Análises sedimentológicas (granulometria, teor de matéria orgânica e umidade) foram feitas em três quadrados de cada transecto, compreendendo a borda do manguezal, a região intermediária e a margem do rio, nos quais também foram aferidos temperatura e salinidade intersticial. Os resultados revelaram que L. leptodactyla ocorreu em toda área amostrada, porém mostrou maior afinidade por sedimentos finos. A espécie apresentou uma correlação negativa para todos os
parâmetros abióticos aferidos, com exceção da umidade. Entretanto, uma relação forte e significativa só foi observada para a salinidade. Quanto a biologia populacional, foi encontrada uma densidade de 36,46 ind./m² e razão sexual correspondeu a razão esperada de 1:1. A população apresentou uma distribuição de frequências do tipo unimodal, sugerindo uma reprodução contínua. Entretanto, a ocorrência de fêmeas ovígeras e de indivíduos juvenis, mostraram uma forte relação com a pluviosidade, indicando assim que o período
reprodutivo ocorre em sincronia com o período chuvoso da região.
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Distribuição espaço-temporal e dinâmica populacional do Siri Callinectes Danae Smith, 1869 (Decapoda: Portunidae) na região adjacente à Baía de Babitonga, Santa CatarinaSabino, Filipe Nathan Assunção [UNESP] 30 July 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-12-10T14:22:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2014-07-30. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:28:59Z : No. of bitstreams: 1
000853924.pdf: 1191289 bytes, checksum: bb966623b2af53c2c3bec2c2bf547724 (MD5) / Estudos sobre a distribuição de organismos marinhos são essenciais para obtenção de informações sobre regiões afetadas por atividades antrópicas e para o entendimento da dinâmica populacional das espécies. Assim, o presente estudo visou investigar a abundância, a distribuição espaço-temporal e a biologia populacional do siri Callinectes danae na região adjacente à baía da Babitonga. O material biológico e abiótico foram obtidos mensalmente na região, no período de julho/2010 a junho/2011. As coletas foram efetuadas nas profundidades 5, 8, 11, 14 e 17m, com um barco de pesca com redes tipo double-rig. Em cada profundidade foram verificados o número de indivíduos e os parâmetros de salinidade e temperatura de fundo, matéria orgânica e textura do sedimento. Um total de 3.999 indivíduos foi coletado, com diferença entre o número de machos (229) e fêmeas (3770). Os indivíduos foram mensurados na largura de carapaça (LC), bem como classificados quanto ao estágio de desenvolvimento. O valor estimado onde 50% dos indivíduos estão aptos à reprodução foi de 75,2 mm (LC) para os machos e 62,9 mm (LC) para as fêmeas. Para a análise do crescimento foi fixado o valor de L∞ com base nos valores da literatura, sendo que os machos e fêmeas apresentaram respectivamente a largura assintótica de 102,01 e 84,41, as contantes de crescimento de 0,007 e 0,006/dia, bem como a longevidade de 633 e 702 dias. A predominância de fêmeas nas maiores classes de tamanho pode estar associada a características da espécie, cujos indivíduos migram para diferentes regiões conforme o estágio de vida. Fêmeas reprodutivas buscam áreas com maior salinidade enquanto juvenis e machos preferencialmente vivem em áreas estuarinas, corroborando ao encontrado na bibliografia. A reprodução foi contínua, portanto a área de coleta demonstra ser de suma importância para a perpetuação... / Studies on the distribution of marine organisms are essential for obtaining information on regions affected by human activities and for the understanding of the population dynamics of species. Thus, the present study aimed to investigate the abundance, spatial-temporal distribution and population dynamics of the crab Callinectes danae in adjacent region of the Babitonga Bay. Biological and abiotic samples were obtained monthly in the region from July/2010 until June/2011. Samples were collected at 5, 8, 11, 14 and 17m deep, using a fishing boat equipped with doble -rig nets. The number of individuals and the following abiotic factors were recorded at each depth: salinity and bottom temperature, organic matter and sediment texture. A total of 3,999 individuals were collected, with difference between the numbers of males (229) and females (3770). The individuals were measured concerning the carapace width (CW) and classified according to the development stage. The estimated value where 50 % of individuals were able to reproduce was 75.2 mm (CW) for males and 62.9 mm (CW) for females. The value of L ∞ for the growth analysis was fixed based on literature values, where males and females showed the asymptotic width of 102.01 and 84.41 respectively, the growth constants of 0.007 and 0.006/day, as well as the longevity of 633 and 702 days. Prevalence of female in larger size classes may be associated with characteristics of this species, which individuals migrate to different regions depending on the life stage. Reproductive females search for areas with higher salinity, while juvenile and males preferably live in estuarine areas, corroborating with is found in the current literature. Reproduction was continuous showing that the sampled area has a primordial importance for the perpetuation of this species, since it shelters a very high percentage of reproductive females. The information from this study...
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Estrutura e dinâmica das comunidades de crustáceos decápodos no litoral norte do Estado de São PauloHiroki, Kátia Aparecida Nunes [UNESP] 24 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2012-02-24Bitstream added on 2014-06-13T19:05:53Z : No. of bitstreams: 1
hiroki_kan_dr_botib.pdf: 1803699 bytes, checksum: c9227f44b393e6f5d7010795ec8897f7 (MD5) / Not available
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Nonlinear dynamics of within-host parasite competitionRethinavel, Natarajan [UNESP] 29 May 2013 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2013-05-29Bitstream added on 2014-08-27T15:57:07Z : No. of bitstreams: 1
000778127.pdf: 1378513 bytes, checksum: d1d6783639c75c24813a467c1ea25eae (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Nesta tese estudamos a biologia de populações de sistemas hospedeiro-parasita, com especial atenção para os efeitos produzidos por múltiplas infecções de diferentes parasitas numa dada população de hospedeiros. Tal situação se assemelha a múlpiplas espécies competindo por um mesmo recurso. Com os parasitas competindo por hospedeiros, diversos resultados no nível populacional podem ocorrer. Se ambos parasitas não puderem infectar um hospedeiro conjuntamente, então o parasita mais apto elimina o menos apto. Quando co-infecções são possíveis, o padrão muda e a coexistência pode ser estabelecida. Finalmente, se um parasita pode deslocar o outro, o assim chamado efeito intraguilda, o resultado dependerá fortemente da taxa de geração de novos hospedeiros, a qual é determinada por fatores ambientais. Nós estudamos este sistema por meio de um modelo matemático su?cientemente abrangente para dar conta destas situações. Procedemos passo-a-passo: começamos com um modelo matemático simples para o caso de um parasita e um hospedeiro. Ao progredirmos para outros casos nosso modelo matemático passa a incluir novos termos até chegarmos num modelo completo. Há dois métodos de análise envolvidos. Estudamos analiticamente a estabilidade do estado livre de infecções, o que nos permite dar condições sobre a capacidade dos parasitas de invadir uma população não infectada/parasitada. Por outro lado, usamos métodos numéricos para estudar o comportamento para grandes tempos, que em todos os casos tende a um ponto ?xo. O foco é saber qual parasita prevelacerá ou se haverá coexistência, além de determinar as condições que regulam o resultado da interação. Através de diagramas de bifurcação analisamos a importância da riqueza de recursos do ambiente, relacionada à taxa de produção de novos hospedeiros. Encontramos que os estados assimptóticos dependem fortemente... / In this thesis we study the population biology of host-parasite systems, with a systematic view of the e?ects produced by multiple infections of di?erent parasites on a same host population. This situation is akin to multiple species competing for a shared resource. As parasites compete for a host, several outcomes at the population level can appear. If both parasites cannot jointly infect the same host, then the ?ttest parasite eliminates the other. When confection is possible, the pattern changes, and coexistence of both parasites becomes possible. Finally, if a parasite can displace the other within the host, the so-called intraguild e?ect, the outcome will strongly be dependent on the income rate of new hosts, which is determined by environmental factors. We studied this system through a mathematical model which is broad enough to encompass these situations. We proceed by steps: ?rst we framed a simple mathematical model for a single parasite/host case and as we progress to other cases, our mathematical model includes new terms and ?nally it is shaped into a complete model. Our methods are twofold. We study analytically the stability of the disease-free state, which allows us to give conditions for the ability of the parasites to invade a disease-free/non-infected population. On the other hand, we resort to numerical methods to study the long-term behavior of the system, which in all cases tends to a ?xed point. The main focus is to know which parasite prevails or if they are able to coexist, and determine the conditions that regulate this outcome . Through bifurcation diagrams we analyzed the importance of the richness of the environment, de?ned by the rate of production of new hosts. We found that the long-term states depend crucially on this rate. Our main original contribution is related to the study of the intraguild e?ect. Depending of the host income rate we can have four di?erent states, which are a disease...
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Distribuição espaço-temporal e dinâmica populacional do Siri Callinectes Danae Smith, 1869 (Decapoda: Portunidae) na região adjacente à Baía de Babitonga, Santa Catarina /Sabino, Filipe Nathan Assunção. January 2014 (has links)
Orientador: Antônio Leão Castilho / Banca: Sabrina Morilhas Simões / Banca: Pitágoras da Conceição Bispo / Resumo: Estudos sobre a distribuição de organismos marinhos são essenciais para obtenção de informações sobre regiões afetadas por atividades antrópicas e para o entendimento da dinâmica populacional das espécies. Assim, o presente estudo visou investigar a abundância, a distribuição espaço-temporal e a biologia populacional do siri Callinectes danae na região adjacente à baía da Babitonga. O material biológico e abiótico foram obtidos mensalmente na região, no período de julho/2010 a junho/2011. As coletas foram efetuadas nas profundidades 5, 8, 11, 14 e 17m, com um barco de pesca com redes tipo "double-rig". Em cada profundidade foram verificados o número de indivíduos e os parâmetros de salinidade e temperatura de fundo, matéria orgânica e textura do sedimento. Um total de 3.999 indivíduos foi coletado, com diferença entre o número de machos (229) e fêmeas (3770). Os indivíduos foram mensurados na largura de carapaça (LC), bem como classificados quanto ao estágio de desenvolvimento. O valor estimado onde 50% dos indivíduos estão aptos à reprodução foi de 75,2 mm (LC) para os machos e 62,9 mm (LC) para as fêmeas. Para a análise do crescimento foi fixado o valor de L∞ com base nos valores da literatura, sendo que os machos e fêmeas apresentaram respectivamente a largura assintótica de 102,01 e 84,41, as contantes de crescimento de 0,007 e 0,006/dia, bem como a longevidade de 633 e 702 dias. A predominância de fêmeas nas maiores classes de tamanho pode estar associada a características da espécie, cujos indivíduos migram para diferentes regiões conforme o estágio de vida. Fêmeas reprodutivas buscam áreas com maior salinidade enquanto juvenis e machos preferencialmente vivem em áreas estuarinas, corroborando ao encontrado na bibliografia. A reprodução foi contínua, portanto a área de coleta demonstra ser de suma importância para a perpetuação... / Abstract: Studies on the distribution of marine organisms are essential for obtaining information on regions affected by human activities and for the understanding of the population dynamics of species. Thus, the present study aimed to investigate the abundance, spatial-temporal distribution and population dynamics of the crab Callinectes danae in adjacent region of the Babitonga Bay. Biological and abiotic samples were obtained monthly in the region from July/2010 until June/2011. Samples were collected at 5, 8, 11, 14 and 17m deep, using a fishing boat equipped with doble -rig nets. The number of individuals and the following abiotic factors were recorded at each depth: salinity and bottom temperature, organic matter and sediment texture. A total of 3,999 individuals were collected, with difference between the numbers of males (229) and females (3770). The individuals were measured concerning the carapace width (CW) and classified according to the development stage. The estimated value where 50 % of individuals were able to reproduce was 75.2 mm (CW) for males and 62.9 mm (CW) for females. The value of L ∞ for the growth analysis was fixed based on literature values, where males and females showed the asymptotic width of 102.01 and 84.41 respectively, the growth constants of 0.007 and 0.006/day, as well as the longevity of 633 and 702 days. Prevalence of female in larger size classes may be associated with characteristics of this species, which individuals migrate to different regions depending on the life stage. Reproductive females search for areas with higher salinity, while juvenile and males preferably live in estuarine areas, corroborating with is found in the current literature. Reproduction was continuous showing that the sampled area has a primordial importance for the perpetuation of this species, since it shelters a very high percentage of reproductive females. The information from this study... / Mestre
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Nonlinear dynamics of within-host parasite competition /Rethinavel, Natarajan. January 2013 (has links)
Orientador: Roberto André Kraenkel / Banca: Hilda Cerdeira / Banca: Fernando Fagundes Ferreira / Banca: Mario José de Oliveira / Banca: Stefanella Boatto / Resumo: Nesta tese estudamos a biologia de populações de sistemas hospedeiro-parasita, com especial atenção para os efeitos produzidos por múltiplas infecções de diferentes parasitas numa dada população de hospedeiros. Tal situação se assemelha a múlpiplas espécies competindo por um mesmo recurso. Com os parasitas competindo por hospedeiros, diversos resultados no nível populacional podem ocorrer. Se ambos parasitas não puderem infectar um hospedeiro conjuntamente, então o parasita mais apto elimina o menos apto. Quando co-infecções são possíveis, o padrão muda e a coexistência pode ser estabelecida. Finalmente, se um parasita pode deslocar o outro, o assim chamado efeito intraguilda, o resultado dependerá fortemente da taxa de geração de novos hospedeiros, a qual é determinada por fatores ambientais. Nós estudamos este sistema por meio de um modelo matemático suficientemente abrangente para dar conta destas situações. Procedemos passo-a-passo: começamos com um modelo matemático simples para o caso de um parasita e um hospedeiro. Ao progredirmos para outros casos nosso modelo matemático passa a incluir novos termos até chegarmos num modelo completo. Há dois métodos de análise envolvidos. Estudamos analiticamente a estabilidade do estado livre de infecções, o que nos permite dar condições sobre a capacidade dos parasitas de invadir uma população não infectada/parasitada. Por outro lado, usamos métodos numéricos para estudar o comportamento para grandes tempos, que em todos os casos tende a um ponto fixo. O foco é saber qual parasita prevelacerá ou se haverá coexistência, além de determinar as condições que regulam o resultado da interação. Através de diagramas de bifurcação analisamos a importância da riqueza de recursos do ambiente, relacionada à taxa de produção de novos hospedeiros. Encontramos que os estados assimptóticos dependem fortemente... / Abstract: In this thesis we study the population biology of host-parasite systems, with a systematic view of the effects produced by multiple infections of different parasites on a same host population. This situation is akin to multiple species competing for a shared resource. As parasites compete for a host, several outcomes at the population level can appear. If both parasites cannot jointly infect the same host, then the fittest parasite eliminates the other. When confection is possible, the pattern changes, and coexistence of both parasites becomes possible. Finally, if a parasite can displace the other within the host, the so-called intraguild effect, the outcome will strongly be dependent on the income rate of new hosts, which is determined by environmental factors. We studied this system through a mathematical model which is broad enough to encompass these situations. We proceed by steps: first we framed a simple mathematical model for a single parasite/host case and as we progress to other cases, our mathematical model includes new terms and finally it is shaped into a complete model. Our methods are twofold. We study analytically the stability of the disease-free state, which allows us to give conditions for the ability of the parasites to invade a disease-free/non-infected population. On the other hand, we resort to numerical methods to study the long-term behavior of the system, which in all cases tends to a fixed point. The main focus is to know which parasite prevails or if they are able to coexist, and determine the conditions that regulate this outcome . Through bifurcation diagrams we analyzed the importance of the richness of the environment, defined by the rate of production of new hosts. We found that the long-term states depend crucially on this rate. Our main original contribution is related to the study of the intraguild effect. Depending of the host income rate we can have four different states, which are a disease... / Doutor
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