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L’anémie de Fanconi (FA) est une maladie rare et les patients présentent des malformations congénitales, des problèmes hématologiques et une prédisposition à certains cancers. Jusqu’à maintenant, 13 protéines FA ont été identifiées, dont 8 (FANC- A, B, C, E, F, G, L, M) s’associent pour former un complexe qui permet l’ubiquitination de FANCD2 et FANCI. Les autres protéines FA sont impliquées au niveau de la réparation de l’ADN ce qui ne permet pas d’expliquer en totalité le phénotype des patients. Récemment, HES1, effecteur de la voie de Notch, a été identifié comme un partenaire essentiel à la formation du complexe FA. HES1 est connue pour être impliquée dans le développement et l’hématopoïèse. L’interaction d’HES1 avec le complexe FA altérée pourrait expliquer en partie le phénotype des patients. L’objectif principal est de créer un peptide inhibiteur visant à altérer la liaison d’HES1 avec le complexe FA, sans toutefois modifier les autres fonctions d’HES1 dans la cellule. Un deuxième objectif est d’identifier de nouveaux partenaires au complexe FA afin de mieux comprendre le lien génotype-phénotype. L’identification d’un peptide inhibiteur a été réalisée premièrement par la sélection de quatre régions d’HES1 (les acides aminés 90-123, 86-121, 76-111 et 152-190) et deuxièmement par le criblage d’une banque de peptides aléatoires avec FANCG1-112+390-622. Le système double hybride en levure a été utilisé pour vérifier les interactions directes entre les peptides et les membres du complexe FA et ces interactions ont été testées dans un modèle cellulaire par la technique de co-immunoprécipitation. L’identification de nouveau partenaire au complexe FA a été réalisée par le criblage d’une banque d’ADNc de moelle osseuse avec FANCE. Le criblage avec FANCG1-112+390-622 a permis d’identifier deux peptides, mais leur activité inhibitrice n’a pas été évaluée. Les quatre régions d’HES1 semblent n’avoir aucun effet sur la liaison entre HES1 et le complexe FA. Le criblage de la banque d’ADNc n’a pas permis d’identifier de nouveaux partenaires à FANCE. Des études approfondies sont nécessaires pour confirmer les effets des peptides sur la liaison entre HES1 et le complexe FA.

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Les analogues nucléosidiques sont des antimétabolites utilisés depuis longtemps dans le traitement de plusieurs cancers. Due aux similarités de leurs structures chimiques à celles des nucléosides, ils sont assimilés, métabolisés et incorporés à l’ADN comme les nucléosides. Pourtant, quelques remplacements d’atomes dans leurs structures provoquent l’arrêt de la synthèse de l’ADN. Parmi les analogues nucléosidiques les plus utilisés dans la clinique, on retrouve la cytarabine et la gemcitabine, le premier étant important dans les traitements des cancers hématopoïétiques, tandis que le dernier est plus utilisé dans le traitement des tumeurs solides. La cytarabine a été utilisée dans le traitement de la leucémie myéloïde chronique (LMC) en combinaison avec l’interféron jusqu’en 2001, lorsqu’on a approuvé l’inhibiteur de kinase imatinib comme première ligne de traitement pour cette maladie. L’imatinib se lie au site ATP de la protéine BCR-ABL, qui provient d’une translocation entre deux gènes, et leur présence dans les cellules leucémiques caractérise la Leucémie myéloïde chronique. Environ 80% des patients répondent très bien au traitement avec l’imatinib, mais 20% développent de la résistance ou de l’intolérance après quelques années de traitement. Pour ces patients, quelques thérapies alternatives sont à l’étude, comme par exemple, l’utilisation de la cytarabine en combinaison avec l’imatinib. On a travaillé sur l’hypothèse que les inhibiteurs de kinase interfèrent dans le transport des analogues nucléosidiques. Les objectifs de cette étude était de 1) mesurer l’assimilation des analogues nucléosidiques en présence des inhibiteurs de kinases, 2) vérifier si ces derniers ont un rôle dans le transport et la cytotoxicité des analogues nucléosidiques et 3) démontrer qu’une thérapie utilisant ces deux médicaments de façon successive peut être plus efficace qu’un traitement qui les utilise simultanément. Pour ce faire, on a mesuré l’assimilation des nucléosides et des analogues nucléosidiques en utilisant la [3H] thymidine et la [3H] gemcitabine et on a utilisé la méthode d’effet de proximité pour vérifier l’effet de l’inhibiteur de kinase nilotinib sur la cytotoxicité des cellules. Nos résultats ont montré que les inhibiteurs de kinases bloquent l’assimilation des nucléosides et analogues nucléosidiques. Les inhibiteurs de kinases utilisés dans le traitement de la LCM, l’imatinib et surtout le nilotinib, protègent les cellules de la cytotoxicité de l’analogue nucléosidique gemcitabine lorsqu’on les utilise simultanément, mais ils peuvent aussi augmenter la cytotoxicité de la gemcitabine après un traitement successif de l’analogue nucléosidique suivi de l’inhibiteur de kinase nilotinib

Les microARN (miARN) sont des acides ribonucléiques (ARN) endogènes, d’environ 19 à 24 nucléotides (nt), produits lors du clivage d’une structure d’ARN en forme de tige-boucle par la ribonucléase III (ARNase III) Dicer. Il a été rapporté que le virus de l’immunodéficience humaine de type 1 (VIH-1), en période de latence dans les lymphocytes T CD4+, produit un court transcrit d’ARN appelé « Trans-Activation Response element » (TAR) et que celui-ci est sujet au clivage par Dicer, ce qui génère deux miARN fonctionnels, soit miR-TAR-5p et miR-TAR-3p. Il a donc été suggéré que les miARN dérivés de TAR pourraient jouer un rôle dans la latence du VIH-1. L’objectif, au cours de ma maîtrise, était de déterminer le rôle potentiel de ces miARN dans la régulation de l’expression des gènes de l’hôte en utilisant les cellules en culture J-lat et Jurkat exprimant miR-TAR-5p et miR-TAR-3p de manière stable. Suite à cela, une analyse protéomique grande échelle iTRAQ a été effectuée pour tenter de faire la lumière sur le rôle potentiel des miARN dérivés de l’ARN TAR du VIH-1. En conclusion, il a été montré que la majorité des protéines d’intérêts sont réfractaires à une régulation génique par les miARN. Par contre, ceci ne supporte pas l’idée que ces miARN ne possèdent aucun rôle, d’où l’importance des résultats protéomiques qui ont montré que plusieurs protéines sont potentiellement régulées par les miARN viraux.

Les alcanols aliphatiques sont des substances ubiquitaires utilisées dans une multitude d’applications domestiques et industrielles. Bien que les effets de l’éthanol sur différentes composantes du système immunitaire soient bien connus, il n’existait presqu’aucune donnée concernant les autres alcanols avant le présent travail. Le premier objectif du projet a été d’étudier les impacts immunologiques d’une exposition aigue aux deux autres alcanols les plus utilisés : l’isopropanol et le méthanol. Nous avons trouvé que l’isopropanol compromet les fonctions effectrices des lymphocytes T, des cellules NK, des monocytes et des macrophages. Par contre, le méthanol agit en synergie avec les stimuli activateurs des lymphocytes T et accroît leur production de cytokines pro-inflammatoires. Les effets biologiques sur ces cellules n’impliquent pas les événements de signalisation précoce en aval des récepteurs activateurs, ils résultent d’une dérégulation sélective de l’activation de facteurs de transcription NFAT avec ou sans la participation d’AP-1. Dans les monocytes activés au LPS, l’isopropanol ne modifie pas les sentiers de signalisation de NF-κB et des MAPK p38 et JNK, mais compromet l’activation de ERK2. Il en résulte une activation défective des sous-unités d’AP-1 c-Fos et JunB. La deuxième partie du projet a été de vérifier si les n-alcanols (de C1 à C12) avaient des effets immunologiques qui suivent la règle de Meyer-Overton. Cette règle établie une corrélation entre le potentiel anesthésique d’une molécule et son hydrophobicité. Nous avons trouvé que les n-alcanols de C2 à C10 inhibent la sécrétion d’IFN-γ par les lymphocytes T activés d’une manière reliée à leur degré d’hydrophobicité, mais cette corrélation s’interrompt à C11. Les n-alcanols exercent leur effet en aval de la membrane plasmique en altérant progressivement et en fonction de leur taille l’activation du facteur de transcription NFAT; cette tendance s’interrompt aussi à C11. L’activation de la voie NF-κB est altérée par les n-alcanols, mais leur effet s’arrête avant, aux environs de C8. Ces derniers résultats suggèrent l’existence de pochettes d’intéraction de dimensions définies sur des cibles protéiques qui compromettent l’activation de NFAT et NF-κB et altèrent la fonction effectrice des lymphocytes T. L’ensemble de ces travaux contribue à une meilleure compréhension de l’activité biologique des alcanols. / Aliphatic alkanols are ubiquitous substances used in a variety of household and industrial applications. Although the effects of ethanol on the immune system have been extensively studied, far fewer data is available for the other alkanols. The first objective of the project was to study the immunological impact of acute exposure to the two other most frequently used alkanols, namely isopropanol and methanol. We found that isopropanol is detrimental to the effector functions of T lymphocytes, NK cells, monocytes, and macrophages; they produce less pro-inflammatory cytokines in presence of this alcohol and, in the case of macrophages, phagocytosis is also reduced. Methanol synergizes with activating stimuli to increase their cytokine production. These changes do not involve early signaling events downstream of the cell membrane; they result from the selective dysregulation of the activation of discrete members of the NFAT family of transcription factors with or without the involvement of AP-1. In LPS-activated monocytes, isopropanol does not alter NF-κB and p38/JNK MAPK signaling cascades, but impairs ERK2 activation. The result is a deficient activation of AP-1 subunits c-Fos and JunB. Aliphatic n-alkanols also display anesthetic properties in accordance to their degree of hydrophobicity, following the Meyer-Overton rule. The second part of the project was to determine whether these structurally similar molecules (from C1 to C12) had immunological effects following the same rule. We found that n-alkanols from C2 to C10 inhibit IFN-γ release by activated T lymphocytes in correlation with their hydrophobicity but a cutoff effect was evident at C11. n-Alkanols act downstream of the cell membrane by progressively down-regulating the activation of NFAT in accordance to the size of their aliphatic chain with a clear downward trend that is interrupted at C11. NF-κB signaling is also compromised but the cutoff appears earlier, in the vicinity of C8. Our results suggest the existence of interaction pockets of defined dimensions within intracellular targets that compromise the activation of the NFAT and NF-κB transcription factors and ultimately modulate the effector function of T lymphocytes. Altogether, this work contributes to a better understanding of the biological activity of alkanols.