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The ontogenetic ecology and conservation of exploited tropical seahorses

Morgan, Siân Kristina January 2008 (has links)
This research investigated the life history and demographics of exploited, tropical seahorses. My thesis was designed to use the unusual morphology of seahorses (Hippocampus comes and H. spinosissimus in the central Philippines), to test the life history structure and strategies of tropical reef fishes. I then made direct use of ecological findings in order to evaluate risk associated with the capture of tropical seahorses for active and growing international markets. Hippocampus comes has a broadly bipartite life history comprising three biologically distinct phases; planktonic newborns, settled juveniles and adults. Most vital rates that govern the population turnover of H. comes confer low susceptibility to risk. Simultaneously, aspects of abundance (range and distribution), developed parental care, behaviour and susceptibility to fishing, increase the species' inherent vulnerability. Stage-structured matrix models examined the outcomes of temporal closures and size-based harvesting for managing artisanal seahorse fisheries. Simulations showed that when fishing occurred throughout the year at relevant intensities, slot sizes provided better protection for populations than minimum size limits, as well as greater cumulative catches over 10 year time horizons. The ontogenetic ecology of tropical seahorses is comparable to most warm-water reef fishes, sharing: 1) a broadly bipartite life history, 2) dispersal likely to confer demographic connectivity at the scale of 10s-100s of km, 3) young that advect passively early in the pelagic phase, and 4) ontogenetic habitat associations that segregate benthic individuals into multiple ecologically distinct stages. Unusually, seahorses have: 1) a pelagic phase inferred to last between 5- / Cette recherche a examiné le cycle biologique et l'ontogénie des hippocampes tropicaux exploités. Ma thèse visa à utiliser la morphologie particulière des hippocampes (Hippocampus comes et H. spinosissimus de la région centre des Philippines) afin d'évaluer la structure et les stratégies particulières du cycle biologique de poissons tropicaux. J'ai par la suite employé les résultats avec pertinence écologique, afin d'évaluer le risque associé avec l'exploitation des espèces d'hippocampes tropicales, destiné à subvenir à une demande internationale de plus en plus importante. Hippocampus comes est caractérisé par un cycle biologique généralement bi-phasique, composé de trois phases distinctes: des nouveaux-nés planctoniques, des juvéniles ainsi qu'adultes benthiques. En raison des caractéristiques démographiques contrôlant les populations de H. comes, celles-ci ne sont probablement pas très susceptibles aux effets de l'exploitation. Par contre, certains aspects touchant à leur abondance (distribution et gamme), la présence de soins parentaux, leur comportement et susceptibilité à la pêche, augmentent la vulnérabilité inhérente de cette espèce. Afin d'explorer diverses options de gestion pour la pêcherie artisanale ciblant l'hippocampe, nous avons développé des modèles matriciels incluant des scénarios de fermetures temporelles et de stratégie d'exploitation basée sur la taille. En supposant des pêcheries actives toute l'année, les simulations suggèrent que l'utilisation d'une fourchette de taille, plutôt qu'une taille minimale légale, assure une meilleure protection des populations et garantit le meilleur rendement cumulatif sur une période de 10 ans. L'ontogénie écologique de
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Aquatic and terrestrial foraging by a subarctic herbivore: the beaver

Milligan, Heather January 2009 (has links)
Freshwater and terrestrial ecosystems are tightly linked by food web interactions. Naturally occurring carbon and nitrogen stable isotopes provide a tool to quantify nutrient flows across ecological boundaries, however their application to freshwater-terrestrial systems has been limited. This thesis evaluated whether stable isotope analysis can be effective in differentiating freshwater and terrestrial vascular plants at the base of subarctic food webs and found freshwater plants to be consistently enriched in their isotopic signatures relative to terrestrial plants. Stable isotope approaches were then used to investigate spatial and temporal variability in the diet of a population of subarctic beavers (Castor canadensis). Freshwater macrophytes contributed more to the diets of beavers than previously reported. During the winter, beavers from pond habitats consumed more aquatic vegetation than beavers from stream habitats which relied more heavily on food hoards of terrestrial vegetation. Aquatic foraging may enable beavers to persist at the northern periphery of their range by reducing foraging pressure on the subarctic terrestrial ecosystem where their preferred tree species are scarce. / Les écosystèmes d'eau douce et terrestres sont liés par les interactions trophiques. Les isotopes stables naturels de carbone et d'azote offrent une méthode pour quantifier les transferts de nutriments entre les frontières écologiques, mais leurs applications aux systèmes d'eau douce-terrestres sont encore limitées. Cette thèse évalue l'efficacité des isotopes stables pour distinguer les plantes vasculaires d'eau douces et terrestres qui forment la base des chaînes alimentaires subarctiques. Nous avons trouvé qu'en général les plantes aquatiques avaient des signatures isotopiques enrichies par rapport aux plantes terrestres. Nous avons ensuite employé les techniques d'isotopes stables pour évaluer la variabilité spatiale et temporale dans le régime alimentaire d'une population de castors (Castor canadensis) subarctiques. Les macrophytes aquatiques semblent avoir une place plus importante dans le régime alimentaire des castors en comparaison avec la littérature disponible. Durant l'hiver, les castors qui habitaient les lacs ont consommé plus de végétation aquatique par rapport aux castors qui habitaient dans les rivières, ceux-ci comptant plutôt sur les provisions de végétation terrestre. L'accumulation de provisions constituées de plantes aquatiques peut permettre aux castors de persister à la limite de leurs aires de distribution où les arbres préférés des castors sont rares. Ainsi, ce phénomène pourrait réduire la pression des herbivores sur ces écosystèmes terrestres à faible productivité.
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Effects of simulated climate change on post-disturbance «Populus tremuloides - Picea mariana» ecosystems in northwestern Quebec

Dabros, Anna January 2009 (has links)
In the mixedwood-boreal transitional forest of northwestern Quebec, the establishment of trembling aspen (Populus tremuloides Michx.) has been observed at the extremes of their regional distribution, in areas previously dominated by black spruce (Picea mariana (Miller) BSP). Our main objective was to explore how climate change could affect the growth and performance of aspen and black spruce. Climate change simulation was provided by the installation of twenty open-top chambers (OTCs) and twenty control plots in the summer of 2005 at three disturbed sites (post-fire, logging road and logging). Each plot enclosed a pair of aspen and spruce seedlings. In comparison to control plots, the conditions in the OTCs were marked by higher air temperatures (2-3°C), drier soil (up to 10% volumetric moisture content) and cooler soil (up to 2.6°C), lower supply rates of Ca and Mg, and slower decomposition of aspen litter. Warm weather and high rainfall were likely responsible for increased height growth and advanced spring bud burst of aspen growing in the OTCs during the 2006 growing season, but not during the cooler and drier season of 2007. Leaf calcium concentration was higher, and beetle leaf herbivory was lower for OTC aspen in comparison to control plot aspen. Spruce was not affected by OTC treatment in terms of height growth, but its final dry biomass was higher, and spring bud burst was advanced by 2-3 days in the OTCs compared to control plots. Both species showed trends of higher root tip number and lower % ectomycorrhizae (ECM) colonization in the OTCs, and vice versa in the control plots. Aspen appeared to be more dependent on ECM colonization; therefore, potential ef / L'établissement de peupliers faux-trembles (Populus tremuloides Michx.) fut observé au nord de sa distribution, dans la forêt boréale mixte, en des endroits auparavant dominés par l'épinette noire (Picea mariana (Miller) BSP). Nous avons réalisé une simulation de réchauffement climatique, dans le but d'explorer comment les changements climatiques pourraient influencer la croissance du peuplier faux-tremble et de l'épinette noire. Le traitement de réchauffement fut fourni par l'installation, à l'été 2005, de vingt chambres sans toit (CST) et de vingt parcelles témoins et ce, sur trois sites distincts (post-incendie, route forestière et site de coupe). Chaque parcelle comprenait un jeune peuplier faux-tremble et une jeune épinette noire. Comparativement aux parcelles témoins, les conditions dans les CST furent marquées par des températures supérieures (2-3°C), un sol plus sec (jusqu'à 10% du contenu volumétrique) et plus frais (jusqu'à 2,6°C), une disponibilité plus faible du Ca et du Mg, ainsi que par une décomposition plus lente de la litière de peuplier faux-tremble. Les conditions plus chaudes et les précipitations plus intenses de la saison 2006 furent probablement responsables pour la croissance supérieure et l'éclosion plus hâtive des bourgeons, mais pas durant la saison fraîche et pluvieuse de 2007. Les dommages dus aux coléoptères furent moins importants dans les CST, ce qui peut être explicable par la concentration foliaire de calcium supérieure qu'on y observa. La croissance de l'épinette noire ne fut pas affectée en terme de hauteur par les CST, mais sa biomasse finale y était supérieure et l'éclosion des bourgeons s
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Effects of dispersal and local dynamics on spider diversity (Araneae) in an old field system

Frost, Carol January 2009 (has links)
Processes at multiple spatial scales can interact to structure community diversity. I looked at the effects of both dispersal and local dynamics on spider diversity in young buckthorn trees in an old field system in southwestern Québec, Canada. I investigated the rate, mechanism, and timescale of spider re-colonization of emptied trees and found that the rate fluctuated, peaking in mid-June and early August. Preventing cursorial immigration only significantly reduced immigrant abundance of the jumping spider guild (Salticidae), but it reduced species richness and changed taxonomic composition of immigrants. At peak immigration times, four days was enough time for emptied trees to be fully re-colonized such that spider abundance, species richness, and composition matched that in undisturbed trees, suggesting an important role for dispersal in structuring spider diversity in this system. I used a diversity addition experiment to test whether spider diversity is limited only by dispersal and found that local dynamics also limit spider diversity. This work contributes to understanding the forces structuring arboreal spider assemblages. / Certains processus à des échelles spatiales diverses intéragissent avec la structure des communautés. Je me suis intéressée à la fois aux effets de colonisation et de dynamiques locales sur la diversité des araignées dans un champ à l'abandon peuplé d'arbustes situé au sud-ouest du Québec, au Canada. J'ai étudié les mécanismes, variations temporelles et taux de recolonisation d'arbustes préalablement vidés de leurs araignées et j'ai observé que le taux de recolonisation connaissait un pic d'activité entre la mi-Juin et le début Août. Seule l'abondance de la guilde des araignées sauteuses (Salticidae) a été réduite en empêchant la recolonisation terrestre. Cette manipulation a cependant diminué la diversité des espèces collectées et a modifié la composition taxonomique des colonisateurs. Lors des pics de recolonisation, quatres jours ont suffisaient pour permettre la recolonisation totale des arbres vides, de sorte que l'abondance, la richesse et la composition taxonomique correspondent avec celles des arbres témoins. Ceci suggère que la colonisation joue un rôle important dans structuration de la diversité de ce système. Des expériences d'ajout d'espèces ont permis de vérifier si la diversité des araignées est limitée seulement par la colonisation, et ont mis en évidence que des dynamiques locales intervenaient également. Ce travail contribue à une meilleure connaissance des processus structurant les assemblages d'araignées dans les systèmes arbustifs.
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Monitoring and managing the spread of marine introduced species: development of approaches and application to the European green crab («Carcinus maenas») and the Asian shore crab («Hemigrapsus sanguineus»)

Delaney, David January 2009 (has links)
Managing introduced species, a current environmental problem, is hindered by real-world limitations of personnel, data, and funding. Monitoring is an important precursor to effective management because detecting an introduced species when its population is localized and at low density (i.e., early detection) maximizes the probability of successful eradication. Often introduced species are only detected years after the initial introduction, when eradication is no longer a viable option. Therefore, in this thesis we developed and analyzed techniques to better monitor and model the spread of the European green crab (Carcinus maenas) and the Asian shore crab (Hemigrapsus sanguineus). To overcome issues of insufficient amounts of data and personnel, we recruited nearly a thousand volunteers and validated their ability to identify introduced and native species of crabs with high levels of accuracy (Chapter 1). To increase the probability of early detection, we need to not only increase sampling intensity, but also to identify more effective and efficient sampling techniques. Therefore, we developed a quantitative, standardized experimental field approach for comparing the sensitivity of different sampling techniques for detecting organisms at low densities (Chapter 2). Even with an efficient sampling technique and increased resources of a validated volunteer monitoring network, we are still not adequately equipped for early detection monitoring on the large-scale. Since it is infeasible to monitor everywhere a species could be introduced, we should monitor where they are more likely to arrive and manage them where their impact will be greatest. To address this problem we modified an oceanographic model, incorporated biological behaviors, used extensive field data to parameterize and validate the model's ability to forecast areas that are most likely to be colonized, so we can optimally allocate our limited res / La gestion des espèces introduites est un problème environnemental pressant qui est souvent entravé par des limites de personnel, de données et de financement. La surveillance est un prérequis important afin de gérer les espèces introduites de façon efficace puisque la détection hâtive de ces espèces, lorsqu'elles sont peu dispersées et à faible densité, maximise la probabilité de les éradiquer. Il arrive souvent que les espèces introduites soient détectées plusieurs années après leur établissement, lorsqu'il n'est plus possible de les éradiquer. L'un des objectifs de cette thèse est donc de développer et d'évaluer des méthodes servant à détecter et à modéliser la propagation de deux espèces invasives: le crabe vert européen (Carcinus maenas) et le crabe asiatique (Hemigrapsus sanguineus). Pour surmonter des difficultés courantes liées à un manque de données et de personnel, nous avons recruté mille volontaires et nous avons validé leur aptitude à identifier de façon précise des espèces de crabes natives et introduites (Chapitre 1). Afin d'augmenter la probabilité de détection hâtive, il n'est pas seulement nécessaire d'augmenter la fréquence d'échantillonnage, mais aussi de déterminer quelles sont les techniques d'échantillonnage les plus efficaces. Par conséquent, nous avons développé une méthode expérimentale quantitative et standardisée servant à comparer la sensibilité de différentes techniques d'échantillonnage pour détecter des organismes présents en faible densité sur le terrain (Chapitre 2). Même avec des techniques d'échantillonnage efficaces et un système de surveillance reposant sur des volontaires formés à l'avance, il est très difficile de surveiller des aires à très grande échelle et de permettre la détection hâtive. Étant donné ces difficultés, il est nécessaire de surveiller les endroits les plus susceptibles
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Social aspects of reproductive behaviour in the black duck (Anas rubrines) in eastern Nova Scotia

Seymour, Norman R. January 1976 (has links)
No description available.
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Using case-based reasoning to learn about ecological engineering

Lanphere, Tania Ruth January 2010 (has links)
Ecological engineering, the practice of designing, creating or manipulating, and monitoring ecosystems, is applied for a variety of purposes benefiting both human society and the natural environment, often integratively. While there are basic principles that help practitioners in the development and implementation process, at this time there is no comprehensive theory that guides the design of ecosystems. In order for such theory to be developed, extensive knowledge about the interactions between ecosystem constitution and comportment, and ways to analyze and integrate this knowledge, are needed. Consequently, the ability to qualitatively and quantitatively evaluate large datasets in a multivariate fashion is required. Thus, the objective of this project was to investigate the use of case-based reasoning as a method of gathering and analyzing large sets of ecological data not only for prediction but for engineering purposes, a previously untested application. / To maximize the number of cases to be analyzed without limiting the inputs to only known systems described in the literature, a virtual ecosystem and simulation platform was created. Simulation outputs and values for applied measures were compiled into a case base for use with a case-based reasoner to attempt to predict the results of several additional randomly created virtual ecosystems. Actual results were compared to the predicted results. The accuracy of the predictions made by the case-based reasoner varied, but they were more than 75% accurate 83.3% of the time. An initial attempt was made to apply this approach to "engineering" ecosystems for specified performance levels within the virtual ecosystem framework. While the targeted values of persistence were not obtained, the "engineered" virtual ecosystems were more persistent overall than the randomly created systems, with an average ratio of 0.40527 surviving species to initial species versus an average persistence of 0.20750 for the random systems. This is indicative of the potential of this novel approach for data analysis in ecological engineering. / Le génie des écosystèmes, soit la pratique de concevoir, créer ou manipuler, et faire la suivi des écosystèmes, s'applique, souvent de manière intégrée, au bénéfice de la société humaine et de l'environnement naturel. Quoiqu'il y ait des principes de base pouvant servir à de tels ingénieurs dans le développement et mise en oeuvre de tels écosystèmes, présentement il n'existe aucune théorie compréhensive pouvant guider la conception d'écosystèmes artificiels. Afin qu'une telle théorie soit énoncée, il nous faut acquérir des connaissances approfondies quant aux interactions existant entre les constituants et le comportement de l'écosystème, et quant à comment procéder dans l'analyse et l'intégration de ces connaissances. Il devient donc nécessaire de pouvoir faire l'évaluation qualitative et quantitative de grands ensembles de données par des méthodes d'analyse multivariable. L'objectif de ce projet fut donc d'étudier l'utilisation d'une méthodologie de raisonnement par cas pour recueillir et faire l'analyse de grands ensembles de données écologiques, autant pour servir à des prédictions qu'à des fins d'ingénierie, une application préalablement inévalué. / Afin de maximiser le nombre de cas pouvant être analysés sans limiter les données d'entrée à celles décrites dans les ouvrages scientifiques, un écosystème virtuel et une plateforme de simulation furent conçus. Les données de sortie des simulations et les valeurs pour les mesures mises en oeuvre furent compilés dans une base de cas conçue pour servir d'intrant à un raisonneur par cas qui servirait à prédire les résultats de plusieurs écosystèmes virtuels supplémentaires, chacun créé de façon aléatoire. Ces résultats furent comparés aux valeurs prédites. L'exactitude des prédictions du raisonneur par cas varia, mais, 83.3% du temps, dépassa 75%. Un essai préliminaire fut entrepris pour mettre en oeuvre cette démarche d'ingénierie d'écosystème pour des niveaux de performance précis dans le cadre d'un écosystème virtuel. Quoique les niveaux de persistance visés ne furent pas atteints, les écosystèmes virtuels "façonnés" furent, dans l'ensemble, plus persistants que ceux bâtis de façon aléatoire, avec un rapport moyen des espèces ayant survécu aux espèces initiales de 0.40527, comparé à 0.20750 pour les écosystèmes aléatoires. Cela met en évidence le potentiel de cette nouvelle démarche pour l'analyse de données en génie des écosystèmes.
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Habitat use by breeding and molting red-breasted mergansers in the Gulf of St. Lawrence

Craik, Shawn Robert January 2010 (has links)
The choice of habitat plays an important role on the population dynamics of ducks (Anatinae). However, little is known of the patterns of habitat use by nearctic Red-breasted Mergansers (Mergus serrator). From 2002 to 2006, I studied habitat use and selection by breeding and molting Red-breasted Mergansers in the Gulf of St. Lawrence, Canada, by measuring macro- and microhabitat and obtaining radio telemetry, time-activity, and stomach content information. My objectives were to examine 1) nest-site selection, 2) brood habitat selection, and 3) habitat use by flightless male mergansers. / Concealment was the most important feature for nest placement by Red-breasted Mergansers on Tern Islands at Kouchibouguac National Park, New Brunswick. Over 95% of nests were in dense stands of marram grass (Ammophila breviligulata), and overhead concealment, vegetation density, and vegetation height at nests were greater than that at random sites. Microhabitat at successful nests was similar to that at unsuccessful nests. Radio-marked broods originating from Tern Islands moved large distances (>3 km) to rearing habitat and remained highly mobile throughout the rearing period (mean = 1.0 km/day). Broods selected shallow waters (<75 cm) over continental estuarine intertidal flats and in tidal streams, and avoided tidal rivers and marine habitats. Age class I broods (≤10 days post-nest exodus) selected continental estuarine intertidal, tidal stream, and saltmarsh habitats, whereas older broods often used estuarine subtidal wetlands. / By the early brood-rearing period, most male Red-breasted Mergansers had migrated from Kouchibouguac National Park to molting sites. At Anticosti Island, Québec, I estimated that males were flightless for 30-33 days between late July and early September. Flightless males used clear, shallow waters (≤12 m) near shore (<850 m) in coastal bays with a sand-rock substrate and stands of submergent algae. Foraging flocks were generally restricted to intertidal and shallow subtidal areas (<4 m), whereas nonforaging flocks often used deeper subtidal sites. These observations were consistent with analyses of stomach contents, which indicated that males fed on small, inshore fish, particularly grubby (Myoxocephalus aenaeus) and sandlance (Ammodytes spp.). / My thesis identifies factors influencing the distribution of breeding and molting Red-breasted Mergansers in the Gulf of St. Lawrence, and prioritizes future research that will provide additional insight into habitat selection and its implication on survival of this species. / La sélection des habitats joue un rôle important dans la dynamique des populations de canards (Anatinae), mais reste méconnue chez le Harle huppé (Mergus serrator). De 2002 à 2006, j'ai étudié l'utilisation et la sélection des habitats par le Harle huppé pendant les périodes de reproduction et de mue dans le Golfe du St-Laurent au Canada. Pour ce faire, j'ai recueilli de l'information sur les paramètres d'habitats, les déplacements des couvées, la fréquence des comportements, ainsi que le contenu des estomacs. Les objectifs de mon étude étaient d'examiner 1) la sélection des sites de nidification, 2) la sélection des habitats par les couvées, et 3) l'utilisation des habitats par les mâles pendant la période de mue des ailes. / Le camouflage des nids était le facteur le plus important pour le choix de l'emplacement des nids par les Harles huppés sur les Îles aux Sternes au Nouveau-Brunswick (Parc national du Canada Kouchibouguac). Plus de 95% des nids étaitent aménagés dans de denses parcelles d'ammophile à ligule (Ammophila breviligulata). Le couvert végétal au dessus du nid, la densité, ainsi que la hauteur de la végétation, étaient plus grands aux sites de nidification comparativement aux sites aléatoires. Le microhabitat caractérisant les nids qui ont eu du succès était similaire à celui des nids où l'éclosion des oeufs a échoué. Les couvées, qui ont étées suivies à l'aide d'émetteurs radio-télémetriques, ont parcouru de grandes distances (>3 km) à partir des Îles aux Sternes et ont continué de se déplacer pendant la période de d'élevage (moyenne = 1.0 km/jour). Les couvées ont préféré les eaux peu profondes (<75 cm) dans les zones intertidales continentales de l'estuaire et les ruisseaux; elles ont évité les habitats riverains et marins. Les couvées de la classe d'âge I (≤10 jours après avoir quitté le nid) ont sélectionné les zones intertidales continentales de l'estuaire, les ruisseaux, et les marais salés. Les couvées plus agées utilisaient d'avantage les habitats subtidaux de l'estuaire. / Au début de la période d'élevage des couvées, la plupart des mâles Harles huppés avaient quitté Kouchibouguac pour se rendre aux sites de mue. Sur l'Île d'Anticosti, Québec, j'ai estimé que les mâles en mues étaient incapables de voler pour une période de 30-33 jours entre la fin de juillet et le début de septembre. Les mâles incapables de voler fréquentaient les baies côtières ayant un substrat sablonneux à rocheux ainsi que les parcelles d'algues submergées. Ils utilisaient des eaux claires et peu profondes (≤12 m), et restaient près de la rive (<850 m). Les groupes d'harles qui se nourissaient étaient généralement confinés dans les zones de marées intertidales et subtidales peu profondes (<4 m). Les groupes d'harles qui ne se nourrissaient pas, quant à eux, utilisaient le plus souvent les zones subtidales plus profondes. Ces observations ont été appuyées par les analyses des contenus d'estomacs, qui ont indiquées que les mâles se nourrissaient de petits poissons de rivage, comme le chaboisseau bronzé (Myoxocephalus aenaeus) et le lançon (Ammodytes spp.). / Ma recherche contribue à la compréhension des facteurs influenceant la distribution des Harles huppés pendant les périodes de reproduction et de mue dans le Golfe du St-Laurent, et identifie les priorités de recherche pour mieux comprendre la sélection des habitats et la survie de l'espèce.
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Experimental evolution of «Chlamydomonas reinhardtii » under salt stress

Moser, Chase January 2010 (has links)
Abstract The environment is now changing much faster than in recent geological time, causing increasing population extinctions. Experiments have shown that extinction can be avoided by adaptation through natural selection leading to evolutionary rescue. I first determined the response of Chlamydomonas to stressful environments by growing populations over a range of salinity. The population growth is halved at 5 g/L salt (NaCl), and 8 g/L is lethal. In this experiment, the genetic correlation between environments increases with environmental similarity. I then manipulated the genotypic diversity in experimental populations and cultured them by serial transfer at 5 g/L salt. The outcome of adaptation is not influenced by initial genetic variation. Instead, populations adapted mainly through the spread of new beneficial mutations. These results suggest that populations have a greater chance of adapting when new environments are similar to current conditions and that adaptation is sometimes dominated by the spread of new mutations, even in the presence of a substantial amount of standing genetic variation. / Résumé Notre environnement change maintenant beaucoup plus rapidement que dans le passé géologique récent, précipitant l'extinction de plus en plus d'espèces. Des chercheurs ont démontré que, grâce à l'adaptation par la sélection naturelle, des espèces peuvent éviter l'extinction, un processus nommé sauvetage évolutif. J'ai d'abord étudié la capacité de Chlamydomonas à croitre dans des environnements dont la salinité augmente. J'ai trouvé que 5 g/L de sel diminue la croissance de moitié tandis que 8 g/L est suffisant pour empêcher toute croissance. Ici, la corrélation génétique entre environnement augmente avec la similarité des environnements comparés. J'ai ensuite soumis des populations contenant différentes quantités de diversité génétique initiale à une salinité de 5 g/L. La diversité génétique initiale ne semble pas influencer la capacité d'adaptation. Cependant, les populations semblent plutôt s'adapter en utilisant de nouvelles mutations dont l'effet est bénéfique. Ces résultats suggèrent que les populations s'adapteront plus facilement à des environnements similaires aux conditions présentes. De plus, ce processus sera dominé par la fixation de nouvelles mutations, même dans des populations contenant de la diversité génétique.
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Philopatry and the spatial structuring of kin in the Red-breasted Merganser (Mergus serrator)

Fishman, David January 2011 (has links)
The detection of genetic-spatial structures has been facilitated by the advancement and increased accessibilities of molecular technologies. Using an empirical genetics approach, we explore aspects of the ecology of red-breasted mergansers (Mergus serrator) nesting on barrier islands off the coast of New Brunswick, Canada. Objectives were three-fold: first, to compare two sources of genetic material, i.e. blood and contour feathers, on the basis of quantity and quality of the nuclear DNA yielded; second, to screen several heterologous microsatellite primers in the M. serrator genome in order to find polymorphic loci which could subsequently be implicated in ecological analyses; third, to characterize spatial patterns of relatedness across this colony. DNA was successfully obtained from both blood and feather samples; that originating from blood was obtained at a much higher yield (µg) while the feather-derived DNA was more pure. Altogether 12 microsatellite primers successfully amplified products from the M. serrator genome. Of these, four were genotyped across 46 genetic samples and moderate levels of allelic variability were observed. Significant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium were apparent at two loci. Finally, genetic-spatial structuring was observed within the colony over both broad and fine-scales. / La détection des structures génétiques spatiales a été facilitée par l'avancement et accessibilités accrue des technologies moléculaires. En utilisant une approche empirique génétique, nous explorons les aspects de l'écologie de harles huppés (Mergus serrator) nichant sur les îles de la barrière au large des côtes du Nouveau-Brunswick, Canada. Les objectifs étaient de trois ordres: d'abord, de comparer les deux sources de matériel génétique, le sang et les plumes de contour, sur la base de la quantité et la qualité de l'ADN nucléaire, en deuxième lieu, à l'écran plusieurs amorces hétérologues microsatellites dans le génome M. serrator loci polymorphes qui pourrait ensuite être impliqués dans les analyses écologiques, en troisième lieu, pour caractériser les patrons spatiaux de parenté dans cette colonie. L'ADN a été obtenu avec succès des deux échantillons de sang et de plumes; celle qui provient du sang a été obtenu avec un rendement beaucoup plus élevé (µg) tandis que l'ADN provenant de plumes était plus pur. Au total, 12 marqueurs microsatellites amplifiés avec succès des produits à partir du génome M. serrator. Parmi eux, quatre ont été génotypés dans 46 échantillons génétiques et des niveaux modérés de la variabilité allélique ont été observés. Des écarts significatifs de l'équilibre de Hardy-Weinberg sont apparents sur deux loci. Enfin, la structuration spatiale génétique a été observée dans la colonie plus large et fine-échelles.

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