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Reações de calixarenos com biomoléculas

Lazzarotto, Márcio January 1997 (has links)
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas. / Made available in DSpace on 2012-10-17T00:12:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2016-01-08T21:29:14Z : No. of bitstreams: 1 172561.pdf: 8515203 bytes, checksum: 4df94a6fb3cc5f463b73a5e080dd28f6 (MD5) / Calixarenos são uma classe de moléculas que apresentam uma cavidade hidrofóbica e podem reconhecer e transportar moléculas neutras e metais. Derivados de calixarenos com biomoléculas foram sintetizados e suas conformações determinadas. As biomoléculas foram ligadas formando éteres, ésteres e amidas de biomoléculas, agregando em alguns casos quiralidade à estrutura do calixareno. Na reação do para-terc-butilcalix[4]areno com o O-tosil-S-(+)-lactato de etila, em K2CO3/acetona, obteve-se apenas o produto bis-substituído na conformação cone com inversão do centro assimétrico. Tentativas posteriores para reagir o produto da reação anterior com BrCH2CO2Me falharam. Os espectros de RMN de 1H e 13C mostram que o centro assimétrico desdobra os sinais dos hidrogênios metilênicos e aromáticos e os carbonos aromáticos. A determinação estrutural através de difratometria de raio-X em monocristais do calix-lactato mostrou a existência de duas moléculas por cela de acordo com a conformação cone presumida por RMN; onde uma etila de uma molécula encontra-se imersa na cavidade da outra. O éster foi hidrolisado, obtendo o derivado lático sem racemização, observando variação no sinal de a. Sintetizaram-se derivados de para-terc-butilcalix[4] areno com N-Ftaloil-aminoácidos (GLI, ALA, b-ALA, PHE, LEU e N-Ft-ORN) a partir dos cloretos em Et3N/CH2Cl2, obtendo em todos os casos os produtos de bis-substituição com conformação alternado 1,3. No caso da glicina, testou-se AlCl3 como catalisador da reação, obtendo o mesmo resultado. Com a variação dos substituintes ocorrem pequenas variações na estrutura, detectadas através de IV e RMN. Nos derivados com carbonos assimétricos, os hidrogênios aromáticos e metilênicos ligados são diastereotópicos. O produto com N-Ft-ala racemiza completamente, gerando dois diastereoisômeros em igual proporção e os produtos com outros aminoácidos quirais sofreram racemização parcial. Amidas de calixarenos com ésteres metílicos de aminoácidos (gli, L-ala, L-asp-Me) foram sintetizadas a partir de cloro-carboxi-metano-para-terc-butilcalix[4]arenos em conformação cone. Determinaram-se as porcentagens e as constantes de extração de metais alcalinos, alcalino-terrosos e amônio pelo produto com glicinato de metila e aspartato de metila via espectrofotometria de ultravioleta, e os valores encontrados foram baixos, com valores entre 2 a 3 % de extração , com exceção do sódio com o tetrakis-L-aspartato de metila-para-terc-butilcalix[4]areno, com 12,7 % de extração. A inserção do metal foi qualitativamente avaliada através do deslocamento da banda do picrato.
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Estudo da interação de pequenas moléculas sintéticas com biomacromoléculas

Oliveira, Mauricio César Bof de January 2002 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e matemáticas. Programa de Pós-graduação em Química / Made available in DSpace on 2012-10-20T02:53:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0Bitstream added on 2013-07-16T19:02:43Z : No. of bitstreams: 1 213165.pdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Foi analisada a interação de diferentes compostos de coordenação com moléculas de DNA e proteínas. O complexo CuMFF mostrou-se efetivo na clivagem de proteínas, com dependência de temperatura, pH, concentração e tempo de incubação. A adição de captadores de radicais livres não alterou a ação deste complexo. A clivagem gerou fragmentos de tamanhos específicos, indicando especificidade na quebra das ligações peptídicas, sendo estas possivelmente dirigidas a regiões da proteína mais expostas ao solvente. O complexo RuCP apresentou atividade sobre a degradação de proteínas, embora não tenha apresentado nenhuma atividade sobre moléculas de DNA. Este complexo parece não ser tão ativo na degradação de proteínas quanto o complexo CuMFF, por outro lado, parece ser mais específico na clivagem. O complexo MACu2 não mostrou nenhuma influência sobre a atividade da enzima Taq DNA Polimerase. A série M2BMXD mostrou ser dependente do centro metálico em relação à interação com moléculas de DNA. Uma vez que o complexo Ni2BMXD foi inerte, o Zn2BMXD apresentou uma pequena interação e o Cu2BMXD foi extremamente ativo na degradação de moléculas de DNA.
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Espalhamento de elétrons por moléculas de relevância biológica

Freitas, Thiago Correa de 13 December 2012 (has links)
Resumo: Estudos recentes revelaram que a interação de elétrons de baixa energia com o DNA pode levar a processos dissociativos, como a dissociação pelo elétron aprisionado (DEA). No DNA, o DEA está associado a diversos efeitos genotóxicos, como a quebra de simples fita e dupla fita. A captura de um elétron e a formação de uma ressonância disparam o mecanismo de dissociação. Nesta tese foram calculadas seções de choque para o espalhamento elástico de elétrons pelos seguintes sistemas: complexo formaldeído-água, complexo ácido fórmico-água, dímero de ácido fórmico, dímero de formamida e complexo ácido fórmicoformamida. Moléculas como ácido fórmico (HCOOH), formaldeído (CH2O) e formamida (HCONH2) são sistemas de relevância biológica, pois apresentam certas semelhanças com as bases da cadeia de DNA. Por exemplo, possuem ressonâncias, ligações simples, duplas e formam ligações de hidrogênio com outras moléculas. Já a água constitui mais da metade do corpo humano. A descrição da estrutura eletrônica dos sistemas estudados foi feita através do método de Hartree-Fock. Para os cálculos de espalhamento foi utilizado o método Schwinger Multicanal com pseudopotenciais nas aproximações estático-troca e estático-troca mais polarização. O interesse geral está em como as ressonâncias são afetadas pela microssolvatação e pelos efeitos de fase condensada. Para estudar a influência da microssolvatação nos processos de espalhamento foram realizados cálculos para os sistemas CH2O · · · H2O e HCOOH · · · (H2O)n com n=1, 2. A presença de moléculas de água afeta significativamente a posição em energia das ressonâncias destes sistemas em relação a fase gasosa. Já os dímeros HCOOH · · · HCOOH, HCONH2 · · · HCONH2 e o complexo HCOOH · · · HCONH2 são protótipos de sistemas mais próximos de uma fase condensada, os quais estão ligados por duas ligações de hidrogênio. Foram observadas mudanças consideráveis nas posições em energia das ressonâncias quando feita a comparação com os monômeros que os formam. Estas mudanças podem afetar os processos de DEA.

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