Orientador: Marcelo Vasconcelos Meireles / Banca: Katia Denise Saraiva Bresciani / Banca: Raphael Lucio Andreatti Filho / Resumo: Devido à escassez de informações referentes à ocorrência de Cryptosporidium em aves selvagens no Brasil, este projeto foi realizado visando à detecção de Cryptosporidium em amostras de fezes de várias espécies de aves selvagens da fauna brasileira, por meio da reação em cadeia de polimerase - "nested" (n-PCR). Um total de 488 amostras de 146 espécies de aves selvagens foi coletado em zoológicos, criatórios, Hospitais Veterinários e residências, para extração do DNA genômico de oocistos e realização de n-PCR, visando à amplificação de fragmentos dos genes da subunidade 18S do RNA ribossômico e da actina. Foi observada amplificação para Cryptosporidium em 20 (4,7%) das amostras examinadas. Por meio de sequenciamento dos fragmentos de DNA amplificados foram identificadas duas espécies de Cryptosporidium: C. galli em curiós (Oryzoborus angolensis) e C. baileyi em urubu-de-cabeça-preta (Coragyps atratus). / Abstract: Due to the paucity of data related to the occurrence of Cryptosporidium in wild birds from Brazilian fauna, this research was accomplished in order to screen fecal samples from various species of wild birds in Brazil for the presence of Cryptosporidium by the use of nested polymerase chain reaction (n-PCR). A total of 488 fecal samples from 146 species of wild birds were collected in Zoos, Veterinary Hospitals, breeder's facilities and residences. After extraction of genomic DNA from oocysts n-PCR was accomplished for amplification of fragments from 18S subunit of the ribosomal RNA gene and from actin gene. Positive amplification for Cryptosporidium was obtained in 20 (4.09%) samples. Sequencing of amplified fragments allowed the identification of C. galli in lesser-seed finches (Oryzoborus angolensis) and C. baileyi in black vulture (Coragyps atratus). / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-06-04Bitstream added on 2014-06-13T18:07:10Z : No. of bitstreams: 1 simoes_dc_me_araca.pdf: 146638 bytes, checksum: 82ece9f69d229b01f099fe04675f2505 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Devido à escassez de informações referentes à ocorrência de Cryptosporidium em aves selvagens no Brasil, este projeto foi realizado visando à detecção de Cryptosporidium em amostras de fezes de várias espécies de aves selvagens da fauna brasileira, por meio da reação em cadeia de polimerase – “nested” (n-PCR). Um total de 488 amostras de 146 espécies de aves selvagens foi coletado em zoológicos, criatórios, Hospitais Veterinários e residências, para extração do DNA genômico de oocistos e realização de n-PCR, visando à amplificação de fragmentos dos genes da subunidade 18S do RNA ribossômico e da actina. Foi observada amplificação para Cryptosporidium em 20 (4,7%) das amostras examinadas. Por meio de sequenciamento dos fragmentos de DNA amplificados foram identificadas duas espécies de Cryptosporidium: C. galli em curiós (Oryzoborus angolensis) e C. baileyi em urubu-de-cabeça-preta (Coragyps atratus). / Due to the paucity of data related to the occurrence of Cryptosporidium in wild birds from Brazilian fauna, this research was accomplished in order to screen fecal samples from various species of wild birds in Brazil for the presence of Cryptosporidium by the use of nested polymerase chain reaction (n-PCR). A total of 488 fecal samples from 146 species of wild birds were collected in Zoos, Veterinary Hospitals, breeder’s facilities and residences. After extraction of genomic DNA from oocysts n-PCR was accomplished for amplification of fragments from 18S subunit of the ribosomal RNA gene and from actin gene. Positive amplification for Cryptosporidium was obtained in 20 (4.09%) samples. Sequencing of amplified fragments allowed the identification of C. galli in lesser-seed finches (Oryzoborus angolensis) and C. baileyi in black vulture (Coragyps atratus).

Made available in DSpace on 2015-09-25T12:18:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tiago Augusto Lima Cardoso.pdf: 985032 bytes, checksum: f09cf89072d07aab7edcf296e7fc6a84 (MD5) Previous issue date: 2011-10-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Several studies report the use of estuarine environments by migrant shorebirds in South America. However, distribution patterns of these species among estuarine habitats have been little studied. Our study aimed to investigate the distribution of migratory shorebirds (Charadriidae and Scolopacidae) and the composition and structure of assemblages of several habitats in the estuaries of rivers Mamanguape, Paraíba do Norte and Goiana in the coast of Paraíba, Brazil. Nine sites were selected for counting birds, four in open beach habitats (in ocean front) and five in inner estuarine habitats (tidal flats, a fluvial island and artificial ponds in a shrimp farm). Visual surveys were carried out at each site with the aid of binoculars and a spotting scope. Statistical analyses were applied to answer the following questions: (i) did occur differences in species densities among habitats? (ii) which factor had greatest influence on variations in densities? (iii) how counting sites can be grouped based on structure and species composition of their assemblages of birds? 72 counts were carried out from September 2010 through April 2011, during which 13 species of migratory shorebirds were recorded: Pluvialis squatarola, Charadrius semipalmatus, Limnodromus griseus, Numenius phaeopus, Actitis macularius, Tringa melanoleuca, Tringa semipalmata, Tringa flavipes, Arenaria interpres, Calidris alba, Calidris pusilla, Calidris minutilla and Calidris fuscicollis. Density of species varied significantly among estuaries and categories of habitats, but not among months. The category of habitat was the factor that had greatest influence upon variations of densities. The assemblages of birds in open beaches were clearly different from the assemblages of inner habitats, with regard to their species composition and dominance pattern. The species with greatest importance on differentiation between assemblages of beaches and inner habitats were C. alba, N. phaeopus, C. pusilla and C. semipalmatus. Although we suppose that some factors not measured in this study may have exerted influence upon pattern observed, our results suggest that preferences between open beaches and inner habitats may be influencing distribution of species in estuarine landscape. / Vários estudos relatam o uso de ambientes estuarinos por aves limícolas migrantes na América do Sul. No entanto, os padrões de distribuição destas espécies entre os hábitats estuarinos têm sido pouco estudados. O presente estudo teve como objetivo investigar a distribuição de aves limícolas migratórias (Charadriidae e Scolopacidae) e as diferenças na composição e estrutura das assembléias de diversos hábitats nos estuários dos rios Mamanguape, Paraíba do Norte e Goiana, no litoral do estado da Paraíba, Brasil. Para tanto, foram selecionados nove locais para contagem das aves, sendo quatro em hábitats de praia aberta (de frente para o oceano) e cinco em hábitats interiores aos estuários (lamaçais intertidais, uma ilha fluvial e lagoas artificiais de carcinocultura). Em cada local foram realizados censos visuais com o auxílio de um binóculo e uma luneta. Análises estatísticas foram aplicadas para responder as seguintes questões: (i) ocorrem diferenças nas densidades das espécies entre os hábitats? (ii) qual fator exerce maior influência sobre as variações nas densidades? (iii) de que forma os locais de contagem podem ser agrupados com base na estrutura e composição de espécies de suas assembléias de aves? Ao todo, foram realizadas 72 contagens entre os meses de setembro de 2010 e abril de 2011, durante as quais foram registradas 13 espécies de aves limícolas migratórias: Pluvialis squatarola, Charadrius semipalmatus, Limnodromus griseus, Numenius phaeopus, Actitis macularius, Tringa melanoleuca, Tringa semipalmata, Tringa flavipes, Arenaria interpres, Calidris alba, Calidris pusilla, Calidris minutilla e Calidris fuscicollis. A densidade das espécies variou significativamente entre os estuários e as categorias de hábitats, mas não entre os meses de contagem. O fator que exerceu maior influência sobre as variações na densidade foi a categoria de hábitat. As assembléias de aves que frequentaram as praias abertas foram nitidamente diferentes das assembléias dos hábitats interiores, no que diz respeito à sua composição de espécies e o padrão de dominância. As espécies com maior importância na diferenciação entre as assembléias de praia e interior foram C. alba, N. phaeopus, C. pusilla e C. semipalmatus. Apesar de reconhecermos que fatores não mensurados neste estudo podem ter exercido influência sobre o padrão observado, nossos resultados sugerem que a preferência entre hábitats de praia aberta e hábitats interiores aos estuários pode estar influenciando a distribuição das espécies na paisagem.