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Sintese de carboidratos nitrogenados componentes de antibioticos

Baptistella, Lucia Helena Brito, 1955- 14 July 2018 (has links)
Orientador : Anita Jocelyne Marsaioli / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-14T03:36:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Baptistella_LuciaHelenaBrito_D.pdf: 19795784 bytes, checksum: 54aa81c70d982e272dcc67c9acc09059 (MD5) Previous issue date: 1987 / Doutorado
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Efeitos bioquímicos da suplementaçao de carboidratos em uma competiçao simulada de short duathlon terrestre

Mamus, Renata Teixeira January 2004 (has links)
Orientadora : Maria Gisele dos Santos / Dissertaçao (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciencias Biológicas, Programa de Pós-Graduaçao em Educaçao Física. Defesa: Curitiba, 2004 / Inclui bibliografia e anexos / Área de concentraçao: Exercício e esporte
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Descrição conformacional de carboidratos e glicoproteínas : validação de protocolo baseado em dinâmica molecular e implicações funcionais

Fachin, Laércio Pol January 2009 (has links)
O desenvolvimento de técnicas complementares a métodos experimentais clássicos, tais como a cristalografia de raios-X e a ressonância magnética nuclear (RMN), capazes de descrever e prever a diversidade estrutural e conformacional de carboidratos e glicoconjugados, consiste em um potencial impacto no entendimento dos processos biológicos em que estas moléculas estão envolvidas. Neste sentido, o presente trabalho tem por objetivo: 1) a validação de um conjunto de parâmetros, desenvolvidos no nosso grupo de pesquisas, na reprodução de dados de RMN descrevendo a conformação de uma série de glicoproteínas em solução aquosa, e 2) a avaliação do emprego de geometrias de dissacarídeos em solução como modelo para a construção de glicanas complexas, na ausência de dados experimentais. Através do emprego de técnicas de modelagem molecular como cálculos ab initio, construção de mapas de contorno para dissacarídeos e simulações de dinâmica molecular (DM) em escalas de tempo de até 0.1 ms, os resultados obtidos confirmam a adequação dos parâmetros gerados na descrição da conformação de carboidratos e glicoproteínas. Adicionalmente, sugerem que o emprego de populações de confôrmeros de dissacarídos em solução, obtidos através de simulações de DM, constitui-se em uma estratégia promissora na obtenção de modelos de glicanas condizentes com condições biológicas. Esperamos, a partir destas observações, que os resultados obtidos na presente dissertação possam contribuir no crescimento do número de trabalhos de DM abordando carboidratos e glicoproteínas biológicas e, assim, no crescimento do entendimento de processos biológicos nos quais estas biomoléculas estejam envolvidas. / The development of novel techniques, capable of describing and predicting the structural and conformational diversity of carbohydrates and glycoconjugates, in complement to experimental methods as X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance (NMR), might bring a potential impact in the comprehension of the biological processes in which such molecules are involved. In this context, this work aims to: 1) validate a set of parameters, developed by our research group, to reproduce NMR data describing the conformation of a series of glycoproteins in aqueous solutions; and 2) evaluate the use of solution geometries of disaccharides to assemble complex glycans, in the absence of experimental data. Employing molecular modelling techniques as ab initio calculations, construction of energy contour plots for disaccharides and molecular dynamics (MD) simulations with time scales up to 0.1 ms, the obtained results confirm the adequacy of the studied parameters to describe the conformation of carbohydrates and glycoproteins. Additionaly, such data suggest that the use of solution conformations of disaccharides, as obtained through MD simulations, consists in a promissing strategy to obtain glycans representation in accordance to biological conditions. We expect, with such observations, that the obtained results contribute to increase the number of works employing MD simulations of biological carbohydrates and glycoproteins and, thus, to raise the comprehension of the biological processes in which such molecules are involved.
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Descrição conformacional de carboidratos e glicoproteínas : validação de protocolo baseado em dinâmica molecular e implicações funcionais

Fachin, Laércio Pol January 2009 (has links)
O desenvolvimento de técnicas complementares a métodos experimentais clássicos, tais como a cristalografia de raios-X e a ressonância magnética nuclear (RMN), capazes de descrever e prever a diversidade estrutural e conformacional de carboidratos e glicoconjugados, consiste em um potencial impacto no entendimento dos processos biológicos em que estas moléculas estão envolvidas. Neste sentido, o presente trabalho tem por objetivo: 1) a validação de um conjunto de parâmetros, desenvolvidos no nosso grupo de pesquisas, na reprodução de dados de RMN descrevendo a conformação de uma série de glicoproteínas em solução aquosa, e 2) a avaliação do emprego de geometrias de dissacarídeos em solução como modelo para a construção de glicanas complexas, na ausência de dados experimentais. Através do emprego de técnicas de modelagem molecular como cálculos ab initio, construção de mapas de contorno para dissacarídeos e simulações de dinâmica molecular (DM) em escalas de tempo de até 0.1 ms, os resultados obtidos confirmam a adequação dos parâmetros gerados na descrição da conformação de carboidratos e glicoproteínas. Adicionalmente, sugerem que o emprego de populações de confôrmeros de dissacarídos em solução, obtidos através de simulações de DM, constitui-se em uma estratégia promissora na obtenção de modelos de glicanas condizentes com condições biológicas. Esperamos, a partir destas observações, que os resultados obtidos na presente dissertação possam contribuir no crescimento do número de trabalhos de DM abordando carboidratos e glicoproteínas biológicas e, assim, no crescimento do entendimento de processos biológicos nos quais estas biomoléculas estejam envolvidas. / The development of novel techniques, capable of describing and predicting the structural and conformational diversity of carbohydrates and glycoconjugates, in complement to experimental methods as X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance (NMR), might bring a potential impact in the comprehension of the biological processes in which such molecules are involved. In this context, this work aims to: 1) validate a set of parameters, developed by our research group, to reproduce NMR data describing the conformation of a series of glycoproteins in aqueous solutions; and 2) evaluate the use of solution geometries of disaccharides to assemble complex glycans, in the absence of experimental data. Employing molecular modelling techniques as ab initio calculations, construction of energy contour plots for disaccharides and molecular dynamics (MD) simulations with time scales up to 0.1 ms, the obtained results confirm the adequacy of the studied parameters to describe the conformation of carbohydrates and glycoproteins. Additionaly, such data suggest that the use of solution conformations of disaccharides, as obtained through MD simulations, consists in a promissing strategy to obtain glycans representation in accordance to biological conditions. We expect, with such observations, that the obtained results contribute to increase the number of works employing MD simulations of biological carbohydrates and glycoproteins and, thus, to raise the comprehension of the biological processes in which such molecules are involved.
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Obtenção de um anel azepinico a partir do D-glucitol

Valle, Marcelo Siqueira 27 July 2018 (has links)
Orientador: Raquel Marques Braga / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-27T02:23:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valle_MarceloSiqueira_M.pdf: 5329915 bytes, checksum: b712d6e2e3e5c9801739baed9efb69d6 (MD5) Previous issue date: 2000 / Mestrado
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Produção de fruto-oligossacarídeose aspectos da biosseparação das frações leves de levana hidrolisada

Gisele de Oliveira Coimbra, Cynthia January 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:52:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4530_1.pdf: 1054201 bytes, checksum: c7f147e6b1005ac6280b50c21e15fdd8 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Este trabalho foi realizado com o objetivo de comparar e estudar a produção fermentativa e a enzimática de fruto-oligossacarídeos, bem como estudar formas de biosseparação das frações leves de levana. No estudo da produção de FOS por fermentação, foram testadas temperaturas de 30, 35 e 40ºC, parâmetro de forte influência no tamanho das cadeias formadas. Para a produção enzimática, a levanassacarase foi submetida a diferentes condições de temperatura, de pH e de concentração de sacarose. A purificação das frações leves de levana, tanto pelo método clássico de adição de um não-solvente quanto por partição em três fases, foi estudada. Os resultados obtidos mostraram que a melhor temperatura para a produção de FOS por via fermentativa e mais favorável à atividade de transfrutosilação da levanassacarase é de 40ºC, dentre as testadas. Nos processos fermentativos, a temperaturas que favorecem a produção de oligossacarídeos são contrárias às que favorecem a produção de levana. A construção de diagramas ternários para os sistemas água / fração de levana / etanol mostrou que as curvas de solubilidade das referidas frações neste sistema apresentaram-se diferentes do esperado. No entanto, evidenciou-se a eficiência do método, uma vez que pode ser aplicado em soluções bastante diluídas de frações leves de levana. Nos sistemas de partição em três fases testados para a recuperação da levana total e das frações leves da levana hidrolisada, os rendimentos foram muito baixos. O melhor rendimento obtido foi para a fração 90, da qual se recuperou uma porção de 27% do total do carboidrato. É possível que este rendimento possa ser elevado após um estudo de otimização do método
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Utilização do yacon (Smallanthus sonchifolia) para estudo de seus açucares e como fonte de invertase : purificação e caracterização de invertase extraida do yacon

Passos, Luciana Maria Liboni 09 June 2002 (has links)
Orientador: Yong Kun Park / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-02T01:58:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Passos_LucianaMariaLiboni_D.pdf: 22421623 bytes, checksum: e98e183502d09b07df170798fe1542d8 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: o yacon é uma raiz andina, rica em frutooligossacarídeos, e de fácil cultivo. Além da presença de grande quantidade de açúcares, há evidências da presença de enzimas do tipo beta-frutofuranosidases, como invertases, em seu metabolismo. Raízes de yacon (Smallanthus sonchifolia) foram colhidas e armazenadas em diferentes condições. Foram acompanhados o conteúdo de carboidratos e a atividade enzimática de invertases destas raízes. Em termos de carboidratos as maiores mudanças observadas, nas raízes de yacon, foram no conteúdo de frutose e 1-kestose. A atividade enzimática variou bastante durante os diferentes armazenamentos, sendo a atividade máxima de invertase obtida após 15 dias de armazenamento a 4°C. As concentrações dos açúcares variaram bastante, sendo que os açúcares que se encontraram em maiores concentrações foram frutose e 1-kestose. As concentrações dos açúcares como um todo aumentaram durante os diferentes armazenamentos. Enzimas do tipo beta-frutofuranosidase foram extraídas de yacon. A otimização da extração foi realizada utilizando diferentes tampões, com diferentes valores de pH, e com diferentes tipos de fracionamento de proteínas. O extrato enzimático de yacon apresentou invertase com pH ótimo igual a 5,5 e temperatura ótima igual a 40° C, e valores Km e Vmáx, para substrato sacarose, iguais a 0,0258M e O,1265 umol/mL/mim, respectivamente. O extrato apresentou atividade de invertase detectada por açúcares redutores resultantes da reação enzimática. As enzimas apresentaram estabilidade a valores de pH entre 5,0 e 5,5, e estabilidade à temperatura entre 25° C e 40° C. As invertases de yacon extraídas foram semipurificadas e caracterizadas. O perfil cromatográfico e SDS-PAGE indicaram a presença de isoformas na fração final da purificação enzimática, bem como o seu comportamento com relação a temperatura e pH. O pH ótimo de atuação da invertase semipurificada foi de 5,5, e a temperatura ótima de atuação foi a 60° C. O peso molecular da invertase foi estimado em 68 KDa por eletroforese SDS-PAGE e filtração em gel Sephacril S200. A enzima apresentou baixa estabilidade ao pH, e estabilidade a temperatura somente entre 35° C e 40° C. / Abstract: Yacon is an Andean root, rich in fructooligosaccharides, and easy to grow. It contains great amount of sugars, and evidence of the presence of enzymes of the beta-fructofuranosidase type, such as invertases, in its metabolism. Yacon (Smallanthus sonchifolia) roots were harvested and stored under different conditions. The sugar contents and invertase activity of these roots were followed. The greatest changes in the sugar contents occurred with fructose and 1-kestose. The enzymatic activity varied with the different storage conditions, and the maximum activity was after 15 days storage at 4°C. The sugar concentrations varied a lot, and the highest sugar concentrations were found for fructose and 1-kestose. All the sugar concentrations increased during the different storage conditions and times. Enzymes of the type p-fructofuranosidase were extracted from yacon. The extraction optimization was accomplished using different buffers, different pH values and different types of protein precipitation. The enzymatic extract was biochemically characterized, showing an optimum pH of 5.5, optimum temperature of 40° C and the following kinetic parameters: Km= 0.0258 and Vmax = 0.1265. The extract presented invertase activity, detected by the production of reducing sugars from the enzyme reaction. The enzymes showed pH stability between 5,0 and 5,5, and temperature stability between 25° C and 40° C. The yacon invertases were semipurified and characterized. The chromatographic profile and SDS-PAGE indicated the presence of isoforms in the final fraction of the purification, as well as its behavior with respect to temperature and pH. The optimum pH of the semipurified invertase was 5.5 and the optimum temperature was 60° C. The molecular weight of the invertase was 68 Kda, determined by eletroforese SDS/PAGE and gel filtration in Sephacril S-200. The enzyme presented low stability to pH, and temperature stability only between 30° C and 40° C. / Doutorado / Doutor em Ciência de Alimentos
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Descrição conformacional de carboidratos e glicoproteínas : validação de protocolo baseado em dinâmica molecular e implicações funcionais

Fachin, Laércio Pol January 2009 (has links)
O desenvolvimento de técnicas complementares a métodos experimentais clássicos, tais como a cristalografia de raios-X e a ressonância magnética nuclear (RMN), capazes de descrever e prever a diversidade estrutural e conformacional de carboidratos e glicoconjugados, consiste em um potencial impacto no entendimento dos processos biológicos em que estas moléculas estão envolvidas. Neste sentido, o presente trabalho tem por objetivo: 1) a validação de um conjunto de parâmetros, desenvolvidos no nosso grupo de pesquisas, na reprodução de dados de RMN descrevendo a conformação de uma série de glicoproteínas em solução aquosa, e 2) a avaliação do emprego de geometrias de dissacarídeos em solução como modelo para a construção de glicanas complexas, na ausência de dados experimentais. Através do emprego de técnicas de modelagem molecular como cálculos ab initio, construção de mapas de contorno para dissacarídeos e simulações de dinâmica molecular (DM) em escalas de tempo de até 0.1 ms, os resultados obtidos confirmam a adequação dos parâmetros gerados na descrição da conformação de carboidratos e glicoproteínas. Adicionalmente, sugerem que o emprego de populações de confôrmeros de dissacarídos em solução, obtidos através de simulações de DM, constitui-se em uma estratégia promissora na obtenção de modelos de glicanas condizentes com condições biológicas. Esperamos, a partir destas observações, que os resultados obtidos na presente dissertação possam contribuir no crescimento do número de trabalhos de DM abordando carboidratos e glicoproteínas biológicas e, assim, no crescimento do entendimento de processos biológicos nos quais estas biomoléculas estejam envolvidas. / The development of novel techniques, capable of describing and predicting the structural and conformational diversity of carbohydrates and glycoconjugates, in complement to experimental methods as X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance (NMR), might bring a potential impact in the comprehension of the biological processes in which such molecules are involved. In this context, this work aims to: 1) validate a set of parameters, developed by our research group, to reproduce NMR data describing the conformation of a series of glycoproteins in aqueous solutions; and 2) evaluate the use of solution geometries of disaccharides to assemble complex glycans, in the absence of experimental data. Employing molecular modelling techniques as ab initio calculations, construction of energy contour plots for disaccharides and molecular dynamics (MD) simulations with time scales up to 0.1 ms, the obtained results confirm the adequacy of the studied parameters to describe the conformation of carbohydrates and glycoproteins. Additionaly, such data suggest that the use of solution conformations of disaccharides, as obtained through MD simulations, consists in a promissing strategy to obtain glycans representation in accordance to biological conditions. We expect, with such observations, that the obtained results contribute to increase the number of works employing MD simulations of biological carbohydrates and glycoproteins and, thus, to raise the comprehension of the biological processes in which such molecules are involved.
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Influência da fonte e do dreno de fotoassimilados no metabolismo glicídico de plantas de milho

Matter, Uilson Fernando [UNESP] 22 February 2002 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002-02-22Bitstream added on 2014-06-13T18:34:45Z : No. of bitstreams: 1 matter_uf_me_jabo.pdf: 745361 bytes, checksum: 93aa125f7dc4d4b2f32ce23443fc2730 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Avaliou-se os efeitos de diferentes proporções de folhas e grãos sobre o metabolismo glicídico de milho. As principais características produtivas, o acúmulo de matéria seca, os teores de açúcares redutores, sacarose e amido nas folhas, colmos e endospermas bem como as atividades de: invertase nas folhas e colmos; invertase e sacarose sintetase nos endospermas, foram determinados. O experimento foi conduzido na FCAV/Unesp-Jaboticabal, em delineamento de blocos casualizados com quatro repetições, com o híbrido Agromen 3050. Os tratamentos foram: 1) testemunha (100 % de folhas e grãos); 2) retirada de 100% das folhas, mantendo-se 100% de grãos; 3) retirada de 33% das folhas, mantendo-se 100% de grãos; 4) retirada de 66% das folhas, mantendo-se 100% de grãos; 5) sem polinização da espiga mantendo-se as folhas; 6) polinização de 25% da espiga mantendo-se as folhas; 7) polinização de 50% da espiga mantendo-se as folhas. O menor número de estigmas polinizados resultou em maior acúmulo de matéria seca no caule e folhas, acúmulo de sacarose nos colmos, acúmulo de açúcares redutores, sacarose e amido nas folhas. O desfolhamento e a polinização parciais não afetaram a concentração de açúcares redutores e sacarose nos endospermas, e açúcares redutores nos colmos. A desfolha parcial acarretou menor matéria seca na espiga, principalmente pelo menor número de grãos; menor concentração de amido nos endospermas, colmos e folhas; menor concentração de sacarose nos colmos. Plantas sem grãos tiveram acúmulo de amido nos colmos. A atividade enzimática no endosperma e nas folhas não foi afetada pelos tratamentos. / The development and dry matter accumulation in stem, leaves and ear, the concentrations of reducing sugars, sucrose and starch in leaves, stems and endosperms besides the activities of: invertase in leaves and stems; invertase and sucrose synthase in endosperms of corn plants submitted to defoliation and partial pollination were evaluated. A completely randomized block design with four replications was used. The treatments were constituted by the control (100% of leaves and grains), three variations of the source size (0%, 33% and 66% of leaves) with 100% of grains, and three variations in the sink size (0%, 25% and 50% of grains) keeping 100% of leaves. Leaf number reduction resulted in smaller ear dry matter, due to smaller grain number, but the 100 kernels weight was not altered. Grain number reduction increased stem and leaf dry matter, but increase in the remaining weight was not significant. There was no ear and grain development when plants were completely defoliated. Defoliation and partial pollination did not affect the concentration of reducing sugars and sucrose in the endosperms, and reducing sugars in the stems. Partial defoliation did not result in smaller starch concentration in the endosperm and stalks; but induced lower sucrose levels. The reduction of grain number caused sucrose accumulation in the stems. Plants without grains had starch accumulation in leaves. Leaf soluble invertase activity was much higher than that from the particulate form. Leaf and endosperm enzyme activities were not altered by treatments.
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Influência da fonte e do dreno de fotoassimilados no metabolismo glicídico de plantas de milho /

Matter, Uilson Fernando. January 2002 (has links)
Orientador: Jairo Oswaldo Cazetta / Banca: Antônio Álvaro Corsetti Purcino / Banca: Marcelo Murad Magalhães / Resumo: Avaliou-se os efeitos de diferentes proporções de folhas e grãos sobre o metabolismo glicídico de milho. As principais características produtivas, o acúmulo de matéria seca, os teores de açúcares redutores, sacarose e amido nas folhas, colmos e endospermas bem como as atividades de: invertase nas folhas e colmos; invertase e sacarose sintetase nos endospermas, foram determinados. O experimento foi conduzido na FCAV/Unesp-Jaboticabal, em delineamento de blocos casualizados com quatro repetições, com o híbrido Agromen 3050. Os tratamentos foram: 1) testemunha (100 % de folhas e grãos); 2) retirada de 100% das folhas, mantendo-se 100% de grãos; 3) retirada de 33% das folhas, mantendo-se 100% de grãos; 4) retirada de 66% das folhas, mantendo-se 100% de grãos; 5) sem polinização da espiga mantendo-se as folhas; 6) polinização de 25% da espiga mantendo-se as folhas; 7) polinização de 50% da espiga mantendo-se as folhas. O menor número de estigmas polinizados resultou em maior acúmulo de matéria seca no caule e folhas, acúmulo de sacarose nos colmos, acúmulo de açúcares redutores, sacarose e amido nas folhas. O desfolhamento e a polinização parciais não afetaram a concentração de açúcares redutores e sacarose nos endospermas, e açúcares redutores nos colmos. A desfolha parcial acarretou menor matéria seca na espiga, principalmente pelo menor número de grãos; menor concentração de amido nos endospermas, colmos e folhas; menor concentração de sacarose nos colmos. Plantas sem grãos tiveram acúmulo de amido nos colmos. A atividade enzimática no endosperma e nas folhas não foi afetada pelos tratamentos. / Abstract: The development and dry matter accumulation in stem, leaves and ear, the concentrations of reducing sugars, sucrose and starch in leaves, stems and endosperms besides the activities of: invertase in leaves and stems; invertase and sucrose synthase in endosperms of corn plants submitted to defoliation and partial pollination were evaluated. A completely randomized block design with four replications was used. The treatments were constituted by the control (100% of leaves and grains), three variations of the source size (0%, 33% and 66% of leaves) with 100% of grains, and three variations in the sink size (0%, 25% and 50% of grains) keeping 100% of leaves. Leaf number reduction resulted in smaller ear dry matter, due to smaller grain number, but the 100 kernels weight was not altered. Grain number reduction increased stem and leaf dry matter, but increase in the remaining weight was not significant. There was no ear and grain development when plants were completely defoliated. Defoliation and partial pollination did not affect the concentration of reducing sugars and sucrose in the endosperms, and reducing sugars in the stems. Partial defoliation did not result in smaller starch concentration in the endosperm and stalks; but induced lower sucrose levels. The reduction of grain number caused sucrose accumulation in the stems. Plants without grains had starch accumulation in leaves. Leaf soluble invertase activity was much higher than that from the particulate form. Leaf and endosperm enzyme activities were not altered by treatments. / Mestre

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