Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-09-25T21:19:46Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Raíssa Guerra Sales.pdf: 3719949 bytes, checksum: 35cc33d9d2858f9173b404a9cafae4c0 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-28T18:25:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Raíssa Guerra Sales.pdf: 3719949 bytes, checksum: 35cc33d9d2858f9173b404a9cafae4c0 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-28T18:25:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Raíssa Guerra Sales.pdf: 3719949 bytes, checksum: 35cc33d9d2858f9173b404a9cafae4c0 (MD5) Previous issue date: 2016-11-16 / CAPES / Populações de aves podem se diferenciar morfológica e/ou geneticamente quando isoladas por uma barreira física. No entanto, ainda é incerto como a variação vocal em aves acompanha mudanças genotípicas e fenotípicas. Na região amazônica do Escudo das Guianas tem sido descrita uma importante zona de sutura, onde numerosos pares de espécies e diferentes subespécies se substituem geograficamente em margens opostas dos rios Branco e Negro. Cerca de um terço das espécies de aves típicas das florestas de terra firme (totalizando aproximadamente 80 taxa) possuem uma subespécie diferente ou uma alo-espécie do outro lado dessas barreiras. Das quase 80 espécies de aves com estrutura genética ou morfológica na região, pelo menos 15 pertencem à família Thamnophilidae. Este grupo é ideal para entender a relação entre as barreiras físicas e a variação vocal, pois acredita-se que estas aves herdam o canto geneticamente. Além do mais, por terem cantos relativamente simples e estereotipados, são relativamente fáceis de serem analizados. Desta forma, estudando a variação vocal de populações isoladas por uma barreira física, é possível avaliar se estas se encontram em processo de diferenciação. Historicamente, o principal gargalo na realização de estudos bioacústicos era a obtenção de amostras do canto das aves para posterior análise em softwares específicos. Na última década, o número de amostras disponíveis em bancos de dados online tem aumentado dramaticamente. Infelizmente, o principal arquivo acústico digital do mundo (Xeno-canto) disponibiliza os arquivos de forma comprimida (mp3), o que tem levantado críticas sobre seu uso em pesquisas bioacústicas. Portanto, para poder aproveitar o enorme acervo disponível de gravações digitais disponíveis neste tipo de arquivos acústicos, é necessário avaliar a utilidade desse material em formato mp3. O capítulo 1 teve como objetivo testar se o formato comprimido de áudio distorce significativamente as gravações ornitológicas, avaliando se todas as variáveis medidas são afetadas da mesma forma ou se alguns parâmetros podem ser utilizados apesar do formato de qualidade reduzida, levando em consideração as propriedades acústicas da Família Thamnophilidae. Para esse teste foram utilizadas 27 gravações referentes a 3 espécies dessa família (Herpsilochmus dorsimaculatus, Thamnophilus murinus e Thamnophilus amazonicus), e testadas 27 variáveis acústicas. As variáveis vocais mais utilizadas em pesquisas ornitológicas (frequência, tempo, nº de notas e ritmo) não sofreram distorções significativas após compressão. No Capítulo 2, avaliei o grau de variação vocal em 19 linhagens de aves dessa família no Escudo das Guianas, onde várias espécies possuem diferentes graus de variação genética e fenotípica. Utilizando apenas as variáveis não afetadas pelo formato do áudio, avaliei se o grau de variação vocal está associado com o grau de variação genética entre os 19 pares de taxa separados pelas barreiras ribeirinhas. Os resultados sugerem que a variação genética não é um bom preditor da variação vocal; algumas espécies com pouca variação genética apresentaram uma grande variação vocal e pares de taxa muito diferenciados geneticamente tiveram cantos pouco diferenciados. / Bird populations can differentiate morphologically and/or genetically when isolated on opposite sides of a geographic barrier. However, remains uncertain how vocal variation follows these genotypic and phenotypic changes. In the Amazon region the Guiana Shield has been described as an important suture zone, where several pairs of different species and subspecies geographically replace on opposite banks of the Branco and Negro rivers. About a third of the bird species typical of upland forests (totaling approximately 80 taxa) have a different subspecies or alo-specie across these barriers. Of the nearly 80 species of birds with genetic or morphological structure in the region, at least 15 belong to Thamnophilidae family. This group is perfect to understand the relationship between physical barriers and vocal variation, since it’s believed that these birds inherit genetically song. Moreover, by having relatively simple and stereotyped songs are relatively easy to be analyzed. Thus, studying the vocal range of isolated populations by a physical barrier, it is possible to avaliate whether these are in the process of differentiation. Historically, the main bottleneck in the realization of bioacoustics studies was to obtain samples of birdsong for later analysis of specific software. In the last decade, the number of samples available in online databases has increased dramatically. Unfortunately, the main digital sound file of the world (Xeno-canto) provides the compressed form of files (mp3), which is not suitable for bioacoustical research. Thus, there’s a need to assess the usefulness of the material, taking into account the available audio format. Chapter 1 aimed to test whether the compressed audio format significantly distorts ornithological recordings assessing whether all the measured variables are affected in the same way or if some parameters can be used despite the reduced quality format, taking into account the acoustic properties of the Thamnophilidae Family. For this test were used 27 recordings relating to 3 species of this family (Herpsilochmus dorsimaculatus, Thamnophilus murinus and Thamnophilus amazonicus) and tested 27 acoustic variables. The vocal variables most used in ornithological research (frequency, time, number of notes and pace) showed no significant distortions after compression. In Chapter 2, I evaluated the degree of vocal range in 19 strains of birds of this family in the Guiana Shield, where several species have different degrees of genetic and phenotypic variation. Using only the variables unaffected by the audio format, evaluated if the degree of vocal variation is associated with the degree of genetic variation among the 19 pairs of taxa divided by river barriers. The results suggest that genetic variability is not a good predictor of the vocal range; some species with little genetic variation showed a great vocal variation and differentiated pairs of taxa had little genetically different songs.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-09-12T18:26:08Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2823105 bytes, checksum: f4b98ff5357d9a46fe9ff06f2b559283 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-12T18:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2823105 bytes, checksum: f4b98ff5357d9a46fe9ff06f2b559283 (MD5) Previous issue date: 2016-03-22 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Melanopareia torquata, encontrada no leste do Paraguai e em todos os estados brasileiros por onde o Cerrado se estende, apresenta duas subespécies, M. t. torquata e M. t. rufescens. Esta espécie, juntamente com M. bitorquata, a única outra espécie do gênero encontrada no Brasil e que foi recentemente elevada ao status de espécie independente, constituem um modelo de interesse ao estudo e compreensão dos padrões de diversificação das savanas Neotropicais. Embora M. bitorquata tenha morfologia e limites de distribuição bem definidos, as subespécies de M. torquata apresentam grande variação morfológica, comprometendo a delimitação clara de sua distribuição e a sua diagnose. Este estudo pretende, a partir de caracteres morfológicos, vocais e moleculares, reavaliar o status taxonômico e limites intra e interespecíficos dessas espécies, além de investigar os padrões geográficos e temporais de diversificação do grupo, avaliando os possíveis processos climáticos, geológicos e biogeográficos associados à sua diversificação. As análises morfológicas não foram eficientes para a delimitação de grupos intraespecíficos em M. torquata, devido à já relatada variação clinal e individual das variáveis avaliadas. De forma semelhante, os caracteres bioacústicos são bastante similares entre todos os grupos, não tendo sido eficazes na delimitação dos taxa estudados. A abordagem molecular, por outro lado, apresentou agrupamentos muito divergentes e com grande diversidade genética e estruturação geográfica para todos os clados avaliados e para grupos internos em cada clado. As datações indicaram que o complexo M. torquata se originou no início do Plioceno, quando houve a divergência de M. t. rufescens e outro clado contendo M. t. torquata como irmã de M. bitorquata. Embora os dados disponíveis e os métodos utilizados não permitiram chegar a uma delimitação segura da distribuição geográfica de M. t. torquata e de M. t. rufescens, nem indicar caracteres que possam ser utilizados na diagnose entre elas, as análises moleculares indicaram a existência de três clados igualmente divergentes, com evidência de especiação sem diferenciação morfológica e vocal claras. Esse estudo mostra as complexidades e dificuldades inerentes à tentativa de delimitar grupos taxonômicos, especialmente na América do Sul, que apresenta cenários biogeográfico e evolutivo sabidamente complexos. / Melanopareia torquata occurs in eastern Paraguay and in all Brazilian states where the Cerrado extends, harboring two subspecies, M. t. torquata and M. t. rufescens. This species, together with M. bitorquata, the only other species in the genus found in Brazil and that has recently been elevated to species status, is a model of interest to the study and understanding of the diversification of Neotropical savannas. Although M. bitorquata shows well established morphological characters and range limits, the subspecies of M. torquata exhibit large morphological variation, hampering a clear delimitation of their range and diagnosis. This study aims to reevaluate, using morphological, vocal and molecular tools, the taxonomic status and intra- and interspecific limits of these species, and also to investigate the spatial and temporal patterns of diversification of the group, evaluating the possible climate, geological and biogeographical processes associated with its diversification. Morphological analyses were not useful for the delimitation of intraspecific groups within M. torquata due to the already reported clinal variation and large individual variation in the species. Similarly, bioacoustic parameters measured are quite similar between groups, being of little usage to the understanding of distribution and taxonomic limits of the species. The molecular approach, on the other hand, revealed very distinct clusters and great genetic diversity and geographic structure for all three clades evaluated, and also for internal groups in each clade. The complex M. torquata originated in early Pliocene, with a divergence between M. t. rufescens and the clade containing M. t. torquata as sister to M. bitorquata. We conclude that, although it was not possible to clearly delimit the geographical distribution of the subspecies of M. torquata, or point which characters are useful to diagnose them, the molecular analyses indicated the existence of three equally divergent clades with evidence of speciation without a clear morphological and vocal differentiation. This study shows the complexities and difficulties inherent to every attempt to delimit taxonomic groups, especially in South America, which is well known for their complex biogeographic and evolutionary scenarios.