• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 1
  • 1
  • Tagged with
  • 2
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
1

Etude structurale du complexe CstF et de son homologue chez la levure CF IA, deux facteurs indispensables pour la maturation 3' des pré-ARN messagers / Structural studies of the homologous metazoan CstF and yeast CFIA complexes essential for 3'-processing of pre-mRNA / Estudio estructural del complejo CstF y de su homologo de levaduras CF IA, dos factores indispensables para la maduración 3’ del pre-ARN mensajero

Moreno Morcillo, Maria 18 November 2010 (has links)
Une étape clé dans la maturation des pré-ARNms est le clivage et la polyadénylation que ceux-ci subissent sur leur extrémité 3’. Chez les métazoaires, le complexe CstF (Cleavage stimulation Factor) reconnaît une région de l’ARNm riche en U et U/G et stabilise le complexe CPSF (Cleavage Polyadenylation Stimulating Factor) sur le site de polyadénylation. Nous avons déterminé la structure cristallographique du domaine N-terminal d’une des trois sous-unités de CstF, CstF-50. Ce domaine forme un homodimère compact et présente deux surfaces identiques conservées dérivées de la formation du dimère. La structure dimérique de CstF-50 est en accord avec le modèle hexamèrique du complexe. L’homologue de CstF chez la levure, CF IA (Cleavage/polyadenylation Factor IA), est impliqué dans les réactions de clivage et polyadénylation de la maturation 3’. Nous avons reconstitué le complexe entier ‘in vitro’ et résolu la structure en solution par RMN des régions minimales impliquées dans l’interaction des sous-unités Rna14p et Rna15p. Pour la formation de l’hétérodimère, la région C-terminale de Rna14p, que nous avons appelé domaine « monkeytail », s’entrelace intimement avec la région « hinge » de Rna15p. La présence de ces deux domaines chez leurs homologues de mammifères, CstF-77 et CstF-64, suggère la conservation de ce type d’organisation entre ces deux sous-unités à travers les espèces. / The removal of the 3’ region of pre-mRNA followed by polyadenylation is a key step in mRNA maturation. In metazoa, Cleavage stimulation Factor (CstF) recognizes U and G/U rich cis-acting RNA sequence elements through its 64kDa subunit and helps stabilize the Cleavage Polyadenylation Stimulating Factor (CPSF) complex at the polyadenylation site. We describe the crystal structure of the N-terminal domain of the CstF-50 subunit. Through highly conserved residues, CstF-50 forms a compact homodimer that exposes two geometrically opposite and identical conserved surfaces. Together with prior data, the structure of the CstF-50 homodimerization domain supports a hexameric model of CstF. The yeast homologue of CstF is the Cleavage/polyadenylation Factor IA (CF IA) complex and is involved in both the cleavage and polyadenylation of pre-mRNA. We have reconstituted ‘in vitro’ the overall complex and also solved the solution structure of one of the inter-subunit regions, specifically the heterodimer involving peptides from Rna14p and Rna15p. Upon binding, a short C-terminal region from Rna14p wraps intimately within the central hinge domain from Rna15p. Conservation of residues reveals that the structural tethering is preserved in the homologous mammalian proteins. / La maduración 3’ del pre-ARNm es un proceso clave de la expresión génica que incluye el corte y la poliadenilación del extremo 3’ libre del pre-ARNm. En metazoos, el complejo CstF (Cleavage stimulation Factor) reconoce una secuencia del pre-ARNm rica en U y G/U y permite la estabilización del complejo CPSF (Cleavage Polyadenylation Stimulating Factor) en el sitio de poliadenilación. Hemos descrito la estructura cristalina del dominio N-terminal de una de las tres subunidades de CstF, CstF-50. La estructura ha revelado la organización de la proteína en un dímero compacto y conservado entre las especies. Dos zonas idénticas conservadas se encuentran expuestas a ambos lados de la superficie estructural. Nuestros resultados corroboran así la hipótesis sobre el modelo hexamérico del complejo CstF. CF IA (Cleavage/ polyadenylation Factor IA), el homólogo de CstF en levaduras, interviene en las dos etapas de la maduración 3’. Las bases para la reconstitución del factor CF IA ‘in vitro’ han sido establecidas. Al mismo tiempo, hemos resuelto la estructura del subcomplejo formado por las regiones de interacción de Rna14p y de Rna15p en solución mediante RMN. En el heterodímero, las dos proteínas forman una entidad única a través de la región C-terminal de Rna14p, dominio “monkeytail”, y el dominio “hinge” de Rna15p, quedando las hélices de la dos proteínas entrelazadas. La localización de estos dominios en sus homólogos mamíferos, CstF-77 et CstF-64, sugiere que este tipo de organización está conservada entre las especies.
2

Preamplifier Design for Active Electrodes in Single-Channel EEG Applications

Marwan Abed, Thorir January 2018 (has links)
The implementation of portable electroencephalography (EEG) systems has been known to be complex. During ambulation, the integrity of recorded EEG signals is often impaired by motion artifacts and the time and effort required to set up the system is excessive. The use of single-channel EEG systems with dry, active electrodes (AEs) for signal acquisition is a topic of current interest. AEs are electrodes which have integrated bioamplifier circuitry and are known to be less susceptible to motion artifacts and environmental interference. In this report, the design of an AE preamplifier for the purpose of improving single-channel EEG recordings is presented. Initially, a thorough literature review was performed, exploring the available knowledge and state-of-the-art technology. Thereafter, the design specifications were set and the appropriate topology and circuit design techniques were selected to maximize the amplifier’s performance. Ultimately, three different preamplifier topologies were designed and their performance compared with one another as well as with established medical device standards and state-of-the-art AEs. The results of one preamplifier showed comparable performance with state-of-the-art AEs. Therefore, this topology was selected for a deep analysis and physical layout design. The layout of the selected preamplifier was designed and its parasitics extracted. The post layout performance of the design proved to be comparable to the schematic level performance, with a CMRR of 153dB, IRNV of 0.89µVRMS and an electrode offset tolerance of 450mV. The preamplifier design presented in this report has proven to be comparable with state-of-the-art AE preamplifiers and demonstrates potential for the advancement of AE performance in single-channel EEG systems. / Implementeringen av bärbara elektroencefalografisystem (EEG) har varit känd för att vara komplex. Vid rörelse påverkas ofta reliabiliteten av de inspelade EEGsignalerna av rörelseartefakter samt av att tiden och det arbete som krävs för att ställa in systemet blir överdrivet lång. Användandet av singelkanals EEG-system, med torra aktiva elektroder (AE) under inspelningen, är ett aktuellt ämne. En AE är en elektrod som har en integrerad bioförstärkarkrets och är känd för att vara både mindre mottaglig för rörelseartefakter och för störning från omgivningen. I denna rapport presenteras utformningen av en AE-förförstärkare för singelkanals EEGinspelningar. Inledningsvis utfördes en grundlig litteraturöversikt där den rådande kunskapen och toppmoderna tekniken undersöktes. Därefter bestämdes designspecifikationerna, lämpliga topologier samt kretsdesigntekniker, för att maximera förstärkarens prestanda. Slutligen konstruerades tre olika förstärkares topologier och deras prestanda jämfördes med varandra liksom med etablerade medicin tekniska standarder och toppmoderna AE. Resultaten av en förförstärkare visade sig ha jämförbar prestanda med toppmoderna AE. Därför valdes denna topologi ut för en djupanalys och för fysisk layoutkonstruktion. Layouten för den valda förförstärkaren utformades och dess parasiter extraherades. Utformningen av postlayouten visade sig vara jämförbar med prestanda på en schematisk nivå, med en CMRR på 153dB, IRNV på 0.89µVRMS och en elektrodoffsettolerans på 450mV. Förförstärkarens design som presenteras i denna rapport har visat sig vara jämförbar med toppmoderna AE-förförstärkare och visar potential till framsteg för AEprestanda i singelkanals EEG-system

Page generated in 0.023 seconds