Reproduction de : Thèse de doctorat : Biosciences végétales : Toulouse, INPT : 2005. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. 228 réf.

Reproduction de : Thèse de doctorat : Biotechnologies du végétal : Toulouse, INPT : 2005. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. 187 réf.

Thesis (M.S.)--University of Delaware, 2009. / Principal faculty advisor: Mark Parcells, Dept. of Animal & Food Sciences. Includes bibliographical references.

Thesis (Ph. D.)--University of Chicago, Committe on Genetics, December 2003. / Includes bibliographical references. Also available on the Internet.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2003. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 59-68).

published_or_final_version / Medical Sciences / Master / Master of Medical Sciences

No description available.

The chromosomes involved in twenty reciprocal translocations in G. hirsutum were reidentified by means of a specially designed crossing program. Each translocation line was crossed to appropriate monosomic, monotelodisomic, and/or translocation lines. The F₁ hybrids were then scored cytologically to verify the original chromosome identification. These twenty reciprocal translocations now become the cytogenetic tester set for G. hirsutum. Seed stocks for each verified translocation line will be maintained at, and distributed by, the University of Arizona. Nineteen of the twenty heterozygous translocations had a modal chiasma frequency per quadrivalent of four. Fourteen of these translocation lines formed predominantly ring multivalents at MI, and the remaining five translocations usually formed multivalents with at least one interstitial chiasma. One translocation line, which was originally produced by an interspecies cross, formed predominantly chains at MI. This increased amount of chaining in the quadrivalent is probably the result of interspecific chromosome material within the translocation reducing the chiasma frequency. The orientation of the centromeres in quadrivalents is influenced by the size of the chromosomes involved in the reciprocal translocation, and the constraints imposed by the chiasmata within the chromosome arms. Ten of the twenty reciprocal translocations studied formed predominantly alternate orientations at MI. Eight of these ten translocation lines were reciprocal translocations between two A subgenome chromosomes. This suggests that the large A subgenome chromosomes allow the quadrivalent to be more flexible, resulting in easy reorientation to the stable alternate configuration. Proximal chiasma formation influences the orientation and probable involvement of the homologous centromeres in spindle formation. Lines in which a high frequency of multivalents with interstitial chiasma were observed had a significantly lower frequency of multivalents with either one or two centromeres not involved in spindle formation of 3:1 orientations. In most of the heterozygous translocations, identification of each chromosome within the quadrivalent at MI was not possible. Estimation formulae were developed to estimate the positions of the breakpoints and the genetic lengths of each segment defined by multivalents in these translocations.

Αντικείμενο της παρούσας εργασίας είναι η ταξινόμηση των χρωμοσωμάτων, η οποία είναι βασισμένη σε εικόνα-ομαδοποίηση. Σκοπός αυτής της μεθόδου είναι η ταξινόμηση των χρωμοσωμάτων που δείχνει κάθε εικόνα. Στην πραγματικότητα δίνονται έξι (6) διαφορετικές εικόνες που κάθε μία αντιστοιχεί σε μία διαδικασία χρώσης (dye). Κάθε χρωμόσωμα παίρνει έξι τιμές (μία από κάθε εικόνα) από τις οποίες και ταυτοποιείται. Οι διαδικασίες της ταυτοποίησης είναι διαδικασίες ομαδοποίησης και ταξινόμησης. Η ομαδοποίηση γίνεται στον 6-διάστατο χώρο των χαρακτηριστικών και έπειτα γίνεται η ταξινόμηση στο επίπεδο της εικόνας. Η ταξινόμηση αυτή δημιουργεί έναν χάρτη που ονομάζεται καρυότυπος και ο οποίος αναφέρεται στην ταυτοποίηση (αναγνώριση) των χρωμοσωμάτων. Είναι δηλαδή το σύνολο των χρωμοσωμάτων του με τη συγκεκριμένη μορφολογία τους. Ως γνωστόν, ο άνθρωπος έχει 46 διαφορετικά χρωμοσώματα σε κάθε σωματικό του κύτταρο, τακτοποιημένα σε 22 ζευγάρια, τα οποία είναι μορφολογικά ίδια στα αρσενικά και στα θηλυκά άτομα και ονομάζονται αυτοσωμικά ή αυτοσωματικά. Το εικοστό τρίτο ζεύγος που απομένει καθορίζει το φύλο, δηλαδή στη γυναίκα αποτελείται από δύο όμοια χρωμοσώματα, τα XX, ενώ στον άνδρα από δύο διαφορετικά, τα ΧΥ και ονομάζονται χρωμοσώματα φύλου ή φυλετικά. Επομένως, υπάρχουν 24 κατηγορίες χρωμοσωμάτων. Πραγματοποιήθηκαν δύο εφαρμογές σε εικόνες της βάσεως δεδομένων M-FISH (Multiplex or Multicolor Fluorescence In Situ Hybridization), μέσω MATLAB. Η πρώτη εφαρμογή εκτελέστηκε με τη χρήση της Ευκλείδειας απόστασης για την εύρεση του πλησιέστερου γείτονα (nearest neighbor). Eνώ, η δεύτερη μέθοδος με χρήση του αλγόριθμου FCM (Fuzzy C-Means), ο οποίος δίνει τη δυνατότητα διαχωρισμού των n στοιχείων σε c ομάδες, όπου κάθε ομάδα έχει και ένα κέντρο V. Στην ουσία, ξεκινά από ένα τυχαίο σημείο και ύστερα από επαναλήψεις βρίσκει τα σωστά κέντρα. / The object of present work is the classification of chromosomes, which is based on picture-regrouping. Aim of this method is the classification of chromosomes that shows each picture. Actually they are given six (6) different pictures that every correspond in a process of pigmentation (dye). Each chromosome takes six values (one of each picture) from which also is identifying. The processes of identification are processes of regrouping and classification. The regrouping becomes in the 6-dimensional space of characteristics and then becomes the classification in the level of picture. This classification creates a map that is called karyotype and which is reported in the identification of chromosome, depending on it’s form and size. As we know, the person has 46 different chromosomes in each of his bodily cell, arranged in 22 pairs, which are morphological, same in arsenics and in feminine individuals and are named autosomes. The twentieth third pair that remains determines the sex, that is to say in the woman is constituted by two similar chromosomes, the XX, while in the man from the two otherwise, XY. Consequently, there are 24 types or categories of chromosomes. Were realised two applications in pictures of base of data M-FISH (Multiplex Fluorescence In Situ Hybridization), via MATLAB. The first application was executed with the use of Euclidean distance for the finding of nearest neighbour. While, the second method using FCM algorithm (Fuzzy C-Means), which gives the possibility of segregation of n of elements in c teams, where each team has also a centre V. In the substance, it begins from a accidental point and after repetitions finds the right centres.

No description available.