Dans le milieu clinique, Stenotrophomonas maltophilia est décrite comme bactérie pathogène opportuniste, responsable d'infections nosocomiales principalement chez des patients immunodéprimés ou présentant des pathologies sévères ou chroniques. L'impressionnant bouclier de résistance aux antibiotiques observé chez les souches cliniques rend les traitements particulièrement complexes pour les patients atteints. Les souches de S. maltophilia représentent une réelle menace pour la santé humaine. De plus, les fortes potentialités d'adaptation des S. maltophilia leur permettent une dispersion dans un éventail très large de biotopes cliniques mais aussi environnementaux. En effet, les S. maltophilia colonisent aussi abondamment les niches écologiques environnementales telles que les sols rhizosphériques. Le niveau des connaissances sur ces souches environnementales est particulièrement limité face à celui disponible du milieu médical. Les propriétés en tant que pathogène opportuniste de ces souches environnementales restent encore peu connues et controversées tant au niveau génétique que phénotypique. Afin de mieux évaluer le potentiel danger sanitaire que représentent les souches environnementales face aux souches cliniques, il a été envisagé lors de ce projet de thèse d'évaluer des caractéristiques phénotypiques d'un groupe de souches de S. maltophilia provenant de contextes différemment en contact avec l'homme et l'environnement. Des souches de S. maltophilia fortement impactées par le contact de l'homme ont été isolées de patients atteints de pathologies variables (mucoviscidose, infections nosocomiales, pathologies sévères). Ce groupe de souches considérées comme les plus à risque pour l'homme, a été comparé à un groupe de souches de S. maltophilia environnementales provenant de contextes ayant pu favoriser des acquisitions/maintiens de résistances aux molécules antimicrobiennes tels que les sols rhizosphériques, les sols pollués aux métaux lourds ou encore les sols soumis aux activités répétées de l'homme. Tout d'abord, les signatures métaboliques (croissance, dégradations de substrats) et les capacités de résistance à diverses molécules antibiotiques cliniques ont été évaluées pour la collection de souches de S. maltophilia. Dans un deuxième volet, ont été étudiées les potentialités de virulence de ces souches telles que la mobilité, les sécrétions enzymatiques, la formation de biofilm et la virulence envers des amibes. Enfin, une analyse croisée statistique a mis en lien les différentes signatures obtenues à partir des données métaboliques, de résistance aux antibiotiques et de virulence en confrontant les origines des souches et les influences qu'elles ont subies vis-à-vis de l'homme. D'après le jeu de données du projet, quatre signatures distinctes émergent entre les souches de S. maltophilia structurées par les effets dus la proximité de l'homme et à leur origine. Des souches environnementales potentiellement les plus impactées par les contacts avec l'homme possèdent des caractéristiques similaires aux souches cliniques ; elles sont donc potentiellement aussi dangereuses que les souches cliniques / In the clinical settings, Stenotrophomonas maltophilia is described as an opportunistic bacterial pathogen responsible for nosocomial infections mainly in immunocompromised patients or with severe or chronic diseases. The heavy shield of antibiotic resistances observed in clinical strains lead to particularly complex treatments for patients. S. maltophilia strains represent a real threat to human health. Moreover, the high potential for adaptation of S. maltophilia allow their dispersion in a wide range of clinical habitats but also environmental. Indeed, S. maltophilia strains also colonize widely environmental niches such as the rhizospheric soils. The knowledge about these environmental strains is particularly limited compared to the available medical data. The properties as opportunistic pathogenic of environmental strains remain poorly known and controversial. To better assess the potential health hazard of these environmental S. maltophilia compared to the clinical ones, were assessed in this Ph-D project phenotypic characteristics of a group of S. maltophilia strains from contexts differentially affected by human and environment imprints. S. maltophilia heavily impacted by human contacts have been isolated from patients with varying disease (cystic fibrosis, nosocomial infections, severe pathologies). This group of strains considered as the most at risk to humans, was compared to a group of S. maltophilia from environmental contexts that could promote acquisition/maintaining of resistances to antimicrobial molecules such as rhizospheric soils, heavy metal-contaminated soils or agricultural soils. Firstly, metabolic signatures (growth, substrate degradations) and antibiotic resistance capacities were evaluated among the collection of S. maltophilia strains. In a second part, were studied pathogenic potentialities of these strains such as mobility, enzyme secretions, biofilm formation and virulence to amoebae. Finally, a statistical analysis made connections on the different signatures obtained from the metabolic data, antibiotic resistance and virulence with the origins of the strains and human impacts. According to the datasets of the project, four distinct signatures emerged between S. maltophilia strains structured by the effects of human proximity and origin of the strains. Environmental strains potentially the most impacted by contact with humans showed similar characteristics with the clinical strains; they could potentially be as dangerous as clinical strains

Mondialement, plus de 200 millions de femmes et de filles vivent avec une mutilation génitale féminine/excision (MGF/E) (OMS, 2016). Les mouvements d’immigration impliquent la présence d'un nombre grandissant de femmes et de filles de pays où les MGF/E sont pratiqués dans des pays où le personnel médical et infirmier se doit de se questionner sur la façon d’aborder ce sujet d'une manière sensible et respectueuse ainsi que d'élaborer et de mettre en place des actions et lignes directrices pour assurer un suivi. Le but du mémoire-practicum est de circonscrire les pratiques médicales et infirmières, en contexte obstétrical d’un CHU, dans une perspective d’identification et d’assurer un suivi auprès de femmes ayant vécu une MGF/E. Les éléments clés concernant l’identification de la présence d’une MGF/E et d’assurer un suivi de qualité proposés dans le modèle d’Evans et al. (2019) ont servi d’assise pour ce mémoire-practicum. Une recension des écrits sur la scène internationale (n=30) ainsi qu'une revue de dossiers médicaux (n=46) ont fait émerger la difficulté de documenter cette pratique. Plus spécifiquement, des limites dans les dossiers médicaux étaient évidentes quant aux mentions concernant l’identification de la présence d’une MGF/E chez une femme d’une part et pour assurer un suivi adapté aux besoins, en contexte obstétrical, d’autre part. Les résultats confirment un besoin de formation spécifique aux expériences vécues par les femmes ainsi que l’élaboration de protocoles de soins pour soutenir la pratique médicale et infirmière et permettre une collaboration intersectorielle, notamment auprès d’organismes communautaires (Evans et al., 2019). / Globally, more than 200 million women and girls are living with female genital mutilation/cutting (FGM/C) (WHO, 2016). Immigration movements involve the presence of increasing numbers of women and girls from countries where FGM/C is practiced in countries where medical and nursing personnel need to reflect upon how to address this topic in a sensitive and respectful manner as well as develop and implement actions and guidelines for follow-up. The purpose of this report is to describe medical and nursing practices in the obstetrical context of a university hospital to identify and provide a follow up to women who have undergone FGM/C. The key elements of identifying the presence of FGM/C and ensuring quality follow-up proposed in the Evans et al. (2019) model inspired the work throughout in this report. An international literature review (n=30) as well as a medical record review (n=46) highlighted the difficulty of documenting this practice. More specifically, limitations in the medical records were evident with respect to the identification of the presence of FGM/C on the one hand, as well as ensuring coherent and sensitive follow-up in an obstetrical context, on the other. The results confirm a need for more training specific to women's experiences as well as the development of care protocols to support medical and nursing practice (Evans et al., 2019). The contribution of intersectoral collaboration, namely community-based organizations was highlighted.