Les PME françaises ont des difficultés à innover malgré les nombreux efforts des pouvoirs publics. Face à ce constat, les dispositifs d'aide aux PME ont cherché à se renouveler. Cette évolution se traduit par l'avènement d'une logique territoriale : il s'agit de faciliter l'innovation des PME à travers leur participation à des projets d'innovation localisés (PIL), logique développée par la politique des pôles de compétitivité. Des travaux ont analysé les faiblesses intrinsèques aux PME face à l'innovation, dans cette perspective les PME, de manière plus accentuée que les autres types d'organisations, sont incitées à collaborer pour innover afin de compenser leurs faiblesses en termes de ressources. Or, elles rencontrent de nombreuses difficultés dans ce processus. Cette recherche diffère de ces travaux en prenant pour point d'entrée de la réflexion non plus la PME en tant que telle, mais les dynamiques territoriales d'innovation (DTI). En effet, certaines dynamiques paraissent plus propices que d'autres à l'insertion des PME dans les PIL. Dans un premier temps nous cherchons à identifier les mécanismes qui sous-tendent les DTI, et dans un second temps nous étudions dans quelle mesure ces mécanismes facilitent ou freinent l'intégration des PME dans les PIL. Nous menons une étude de cas de type " grounded theory " (Glaser, 2004) sur deux clusters rassemblés au sein du pôle de compétitivité SCS " solutions communicantes sécurisées " : Marseille-Rousset-Gémenos, et Nice-Sophia Antipolis. Les résultats nous ont permis d'élaborer un " modèle théorique enraciné " explicatif de l'intégration des PME dans les dynamiques territoriales d'innovation. Ce modèle met en évidence un élément clé de l'intégration des PME dans les PIL : la présence de connaissances architecturales au niveau du cluster dans leurs trois dimensions relationnelle, technique et de marché.