Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-07T12:52:48Z No. of bitstreams: 1 Ana Patricia Souza de Lima.pdf: 977295 bytes, checksum: 33939fc8bb3c79d0da66b07e710666b5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T12:52:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Patricia Souza de Lima.pdf: 977295 bytes, checksum: 33939fc8bb3c79d0da66b07e710666b5 (MD5) Previous issue date: 2007-02-07 / Although Brazil has an an important position in the world shrimp farming industry scenario, information on the genetic basis of the most important species, the exotic Litopenaeus vannamei, still scarce. The Brazilian shrimp industry has been facing difficulties, such as US antidumping action against shrimp products, unfavorable currency exchange rate impacts and viruses outbreaks. Shrimp resistant to viral diseases, as well as with better growth rates are wanted in breeding programs for this species in Brazil. A Federal Normative Instruction, instituted in 1997, prohibited shrimp importation into Brazil as a sanitary precaution to prevent the spread of shrimp diseases, and since then, all shrimp broodstock rely on the domesticated stocks. This fact raises questions about the success of a breeding program on this species, because one can not know if the genetic variability is enough to guarantee selection response. The objective of this study was to genetically characterize the broodstock of two shrimp hatcheries and to monitor the genetic variability of one of them after three consecutive broodstock replacements in the state of Pernambuco, Northeast Brazil. Genetic characterization of the two hatcheries was carried out using 5 microsatellite loci and pleopods tissue samples taken from 100 shrimp (50 of each broodstock). For the monitoring 3 microsatellite loci were used in 150 shrimp samples (50 of each broodstock replacement). Our results showed that there is sufficient genetic variability in both hatcheries based on the alleles frequency, inbreeding coefficient, FIS (Larv. A = 0,380 e Larv. B = 0,250), and observed and expected heterozygosities ranging from Ho= 0,190 to 0,810 and He= 0,460 to 0,870,respectively. The monitoring results showed that in closed systems, broodstock replacement does not interfer in the genetic variability, based on the alleles frequency, observed and expected heterozygosities (Ho= 0,460 and He= 0,660 in first sample collection, Ho= 0,420 and He= 0,620 in the second sample collection and Ho= 0,600 and He= 0,660 in the third sample collection), inbreeding coefficient, FIS (0,37 for the 1st, 0,39 for the 2nd and 0,13 for the 3rd sample collection). Our results suggested that genetic variability is high, thus reflecting the history of the shrimp activity in Brazil, where broodstock from different origins were introduced in the country up to 1997. / Desde 1997 a introdução de novos reprodutores de Litopenaeus vannamei está proibida pelo o Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis (IBAMA), Portaria de nº. 119, o que levanta questões sobre a viabilidade de programas de melhoramento no Brasil, uma vez que não há mais renovação dos plantéis. O objetivo do presente trabalho foi caracterizar geneticamente duas larviculturas de Litopenaues vannamei e monitorar a variabilidade genética de uma das larviculturas, com reposição de matrizes, em três períodos sucessivos, ambas, localizadas no estado de Pernambuco, Nordeste do Brasil. A caracterização genética foi feita usando 5 loci de microssatélites e um total de 100 amostras teciduais de reprodutores, para o monitoramento foram utilizados 3 loci de microssatélites e um total de 150 amostras teciduais de reprodutores. Foi evidenciado que há variabilidade genética suficiente nas duas larviculturas, para subsidiar programas de melhoramento genético, baseado na freqüência dos alelos, nos coeficientes de endogamia FIS (Larv. A = 0,380 e Larv. B = 0,250) e heterozigosidades que variaram de Ho= 0,190 a 0,810 e He= 0,460 a 0,870, respectivamente. Os resultados do monitoramento mostraram que a reposição de matrizes no sistema de ciclo fechado não interferiu na variabilidade genética desta larvicultura, o que pode ser evidenciado através da freqüência dos alelos, nas heterozigosidades obtidas que foram de Ho= 0,460 e He= 0,660 na primeira coleta, de Ho= 0,420 e He= 0,620 na segunda coleta e de Ho= 0,600 e He= 0,660 na terceira coleta, e nos valores do coeficiente de endogamia FIS (0,37 para a primeira coleta, 0,39 para a segunda coleta e 0,13 para a terceira coleta) encontrados. Os resultados aqui relatados podem ser considerados bons, refletindo a história da atividade no Brasil que se destacou pela introdução de reprodutores de diversas origens.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:54:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 225296 bytes, checksum: d002b20836b6d51ee31c358241176510 (MD5) Previous issue date: 2009-02-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A total of 17,985 animals, within 8,746 quails from UFV1 strain and 9,239 from UFV2 strain, belonging to the Poultry Breeding Program of UFV were used to evaluate the effect of inbreeding on body weight characteristics at 28 and 42 days of age and egg production. The MTDFNRM (Multiple Trait Derivative Free Numerator Relationship Matrix) software, a system component of MTDFREML (Boldman et al., 1995), was used to process the records of the quails in numerical codes, so the identification number of the quail was always greater than the identification number of their parents, and to obtain the coefficient of inbreeding of it quail. The complete pedigree file was used to analyze the genetic structure of the population by mean of ENDOG v. 4.5 software (Gutiérrez and GOYACHE, 2008). The UFV1 strain showed an average F of 0.54%, anaverage relationship coefficient of 1.27% and 0.25% of increment or new inbreeding. The percentage of inbred this strain was 30.85% with an average F of 1.73%, ranging from 0.1% to 26.6%. The effective population size was 200.38 quails. The UFV2 strain showed an average F of 0.76%, an average relationship coefficient of 1.83% and 0.30% of increment or new inbreeding. The percentage of inbred quails for this strain was 45.54%, with an average F of 1.67%, ranging from 0.1% to 25.8%. The effective population size was 164.42. Inbreeding did not affect body weight at 28 and 42 days and egg production. The UFV genetic group 2 showed a lower effective population size, larger increment or new inbreeding, smaller effective population size than UFV1, requiring more accurate control in mating of the selected quails. / Foram utilizados dois grupos genéticos de codornas da subespécie Coturnix coturnix coturnix, totalizando 17985 aves, sendo 8746 da linhagem UFV1 e 9239 da linhagem UFV2, pertencentes ao Programa de Melhoramento de Codornas da Universidade Federal de Viçosa, com o objetivo de avaliar o efeito da endogamia nas características peso corporal das aves aos 28 e 42 dias de idade e produção de ovos. Utilizou-se o programa computacional MTDFNRM ("Multiple Trait Derivative Free Numerator Relationship Matrix"), componente do sistema MTDFREML (Boldman ET AL., 1995) para transformação dos registros dos animais em códigos numéricos, de modo que o número do animal sempre fosse maior que o número dos pais, e obter o coeficiente de endogamia das aves. O arquivo de pedigree completo foi utilizado para análise da estrutura genética da população, executada pelo programa ENDOG v. 4.5 (Gutiérrez E Goyache, 2008). O Grupo Genético UFV 1 apresentou um F médio de 0,54%, coeficiente de relação médio de 1,27% e 0,25% de incremento de endogamia. Do total de animais, 30,85% são endogâmicos, com um F médio de 1,73%, variando de 0,1% a 26,6 %. O tamanho efetivo encontrado foi de 200,38. O Grupo Genético UFV 2 apresentou um F médio de 0,76%, coeficiente de relação médio de 1,83% e 0,30% de incremento de endogamia. Do total de animais, 45,54% são endogâmicos, com um F médio de 1,67%, variando de 0,1% e 25,8 %. O tamanho efetivo encontradofoi de 164,42. A endogamia não influenciou nenhuma das características estudadas (peso corporal aos 28 e 42 dias e produção de ovos). O Grupo Genético UFV 2 apresentou menor tamanho efetivo, maior incremento de endogamia , menor número efetivo de fundadores e de ancestrais do que o UFV 1, requerendo maior controle nos acasalamentos das codornas selecionadas para reprodução.