Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-05-08T16:37:29Z No. of bitstreams: 1 Laura Leandro da Rocha.pdf: 1419772 bytes, checksum: 81999c16deb201b3630158eccfcb1ddf (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-08T16:37:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Laura Leandro da Rocha.pdf: 1419772 bytes, checksum: 81999c16deb201b3630158eccfcb1ddf (MD5) Previous issue date: 2009-11-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of the present study was develop a panel of microsatellites for testing paternity in goats as an aid for conservation and improvement programs for local breeds. A total of 381 animals from 10 goat populations [six local Brazilian ecotypes/breeds (Azul, Canindé, Graúna, Marota, Moxotó and Repartida) and four exotic breeds currently used in Brazil (Alpine, Anglo-Nubian, Boer and Saanen) were genotyped. Nine multiplex systems were performed, totaling 27 microsatellites.Polymorphism information content (PIC), probability of exclusion (PE) of the markers and Hardy- Weinberg (HW) equilibrium were estimated for the populations and the probability of identity was determined. For the system with 27 microsatellites, the combined PE was 0.999991 and 0.999999 (PE1 and PE2) and the 21 microsatellites exhibited PIC > 0.60; four microsatellites were monomorphic in some populations. Significant deviations from HW equilibrium (P< 0.05) were found for the markers; CSSM66 was deviated from HW equilibrium in the greatest number of populations (8). Nine markers were selected to make up the panel, eight of which were common to both groups (local and exotic goats); the BM1818 marker was the most informative in the local populations and the BM6506 marker was the most informative in the exotic populations. Combined PE with the group of eight microsatellites was 0.9943 and 0.9997 (PE1 and PE2). Based on the calculation of the probabilities of exclusion within the populations, it was possible to discriminate one individual from among a million (106). The results indicate the possibility of employing few microsatellites in the investigation of paternity in goats with a satisfactory degree of reliability and minimal cost. / O presente trabalho teve como objetivo desenvolver um painel de microssatélites para teste de paternidade em caprinos como auxílio a programas de conservação e melhoramento das raças locais.Foram genotipados 381 animais de 10 populações caprinas sendo seis raças ou ecotipos locais brasileiros (Azul, Canindé, Graúna, Marota, Moxotó e Repartida) e quatro raças exóticas utilizadas atualmente no Brasil (Alpina, Anglo-Nubiana, Boer e Saanen). Realizou-se nove sistemas multiplex,totalizando 27 microssatélites. Foram estimados o PIC, as probabilidades de exclusão dos marcadores e o equilíbrio de Hardy-Weinberg nas populações e, em seguida, determinada a probabilidade de identidade. Para o sistema de 27 microssatélites a probabilidade de exclusão combinada foi de 0,999991 e 0,999999 (PE1 e PE2) e, 21 microssatélites apresentaram PIC > 0,60, onde quatro apresentaram-se monomórficos em algumas populações. Verificaram-se desvios do equilíbrio de Hardy-Weinberg significativos (P< 0,05) para os marcadores, sendo o CSSM66, o que apresentou maior número de populações (8) com desvio. Para compor o painel foram escolhidos 9 marcadores dos quais oito foram comuns aos dois grupos estudados (caprinos locais e exóticos), sendo o BM1818 mais informativo nas populações locais e, o marcador BM6506 nas populações exóticas. A probabilidade de exclusão combinada com o grupo dos oito microssatélites foi de 0,9943 e 0,9997 (PE1 e PE2). Baseado no cálculo das probabilidades de identidade dentro das populações foi possível discriminar um indivíduo entre um milhão (106). Os resultados indicaram a possibilidade de empregar poucos microssatélites na investigação de paternidade em caprinos, com grau de confiabilidade considerado bom, minimizando custos.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-26Bitstream added on 2014-06-13T20:03:31Z : No. of bitstreams: 1 cavalcanteneto_a_dr_jabo.pdf: 4939501 bytes, checksum: 3f74c1d904d705f2ad4cef0bc2ccbc70 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com os objetivos de elucidar a origem genética do suíno casco-de-burro e de contribuir para sua conservação, realizou-se uma caracterização genética em 110 animais, oriundos das regiões Nordeste (NE), Centro-Oeste (CO) e Sudeste (SE), usando-se duas classes de marcador molecular e análises citogenéticas. Foram encontrados 13 haplótipos mitocondriais entre os cascos-de-burro, sendo que apenas um foi comum às três subpopulações (NE, CO e SE). O valor médio da diversidade haplotípica e o da nucleotídica na população total foram 0,61 e 0,05 respectivamente. Por meio do DNA mitocondrial, as subpopulações de casco-de-burro apresentaram menor distância genética da população da raça portuguesa bísara. No entanto o haplótipo mais frequente nos cascos-de-burro e o único comum a todas as subpopulações pertence à raça ibérica. A variabilidade genética média obtida por meio dos 25 microssatélites na população total foi: número de alelo = 9,8; conteúdo de informação polimórfica = 0,73; heterozigose esperada = 0,69; heterozigose observada = 0,58; consaguinidade (Fis) = 0,15; e apenas seis loci apresentaram-se em equilíbrio de Hardy-Weinberg. Considerando-se a divisão da população nas três subpopulações que, por meio do DNA nuclear, estiveram mais próximas da população duroc e da bísara , os valores observados para os índices de fixação foram: 0,10 para Fis, 0,09 para Fst e 0,18 para Fit. Os cascos-de-burro possuem o número diploide 2n = 38, não sendo verificado miscigenação com o javali. Os resultados demonstram origem genética ibérica para os cascos-de-burro, com posterior introgressão alélica das raças internacionais importadas no século passado / With the purpose of elucidating the genetic origin of Brazilian Mulefoot pigs and to contribute to their conservation, 110 animals from Northeast (NE), Central- West (CW), and Southeast (SE) Brazil were characterized using two molecular marker classes and cytogenetic analysis. A total of 13 mitochondrial haplotypes was found, but only one was common to the three subpopulations (NE, CW, SE) of Brazilian Mulefoot pigs. The total population presented mean haplotype and nucleotide diversity values of 0.61 and 0.05, respectively. Mitochondrial DNA analysis showed that the Brazilian Mulefoot pig subpopulations presented the shortest genetic distance from the Portuguese Bísara breed. However, the most frequent haplotype found in the Brazilian Mulefoot population, and the only one common to all subpopulations belongs to the Ibérica breed. The mean genetic variability of the total population, obtained using 25 microsatellites, was: allele number = 9.8; polymorphic information content = 0.73; expected heterozygosity = 0.69; observed heterozygosity = 0.58; inbreeding = 0.15; and only six loci displayed Hardy-Weinberg equilibrium. Considering the three studied subpopulations which were closer to the Bísara and Duroc populations, based on nuclear DNA the values observed for the fixation indexes were: 0.09 for Fis, 0.10 for Fst, and 0.18 for Fit. Brazilian Mulefoot pigs have a diploid number of 2n = 38, which indicates that there is no interbreeding with wild boars. The results demonstrate that the genetic origin of Brazilian Mulefoot pigs is Iberian, with later allele introgression from foreign breeds imported during the 20th century