DIAS, F. T. C. Utilização de técnicas multivariadas e moleculares na caracterização e seleção de genótiopos de feijão-caupi de porte ereto e ciclo precoce. 2009. 99 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fitotecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2009. / Submitted by Francisco Lacerda (lacerda@ufc.br) on 2014-07-03T21:31:56Z No. of bitstreams: 1 2009_dis_ftcdias.pdf: 1046800 bytes, checksum: cb4c138ce0139a21b5789191f47fa721 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2014-07-16T20:28:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_dis_ftcdias.pdf: 1046800 bytes, checksum: cb4c138ce0139a21b5789191f47fa721 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-07-16T20:28:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_dis_ftcdias.pdf: 1046800 bytes, checksum: cb4c138ce0139a21b5789191f47fa721 (MD5) Previous issue date: 2009 / Cowpea has great socioeconomic importance in relation to their high contents of protein, drought resistance and good yield. Being cultivated in tropical and subtropical regions of Africa, Brazil and Asia, cowpea is cultivated predominantly by small farmers who use few technological resources. In recent years, cowpea has drawn the attention of medium and large farmers, which require cultivars suited to mechanization, early and responsive to environmental improvements. To start a breeding program that meets the needs of these new cowpea cultivars become necessary the knowledge of the germplasm available, and the relationship between variables related to yield and techniques appropriate to the selection of cowpea. In this context, this study aimed to evaluate the genetic divergence of erect and early cowpea genotypes through phenotypic and molecular characters, besides to study the interrelations among traits related to yield and the selection index appropriate to indentify the best erect and early cowpea genotypes. For the assessment of genetic diversity by molecular markers, there were extractions of DNA from 46 genotypes from the Germplasm Bank of the Universidade Federal do Ceará and Embrapa Meio Norte and then PCR was performed with eight ISSR primers in the Laboratory of Molecular Biology of Embrapa Agroindústria Tropical. For the analysis of genetic divergence of phenotypic markers, study of canonical correlation, analysis and application to track the index of selection was carried out an experiment in randomized blocks with four replicates and 28 genotypes in Fazenda Lavoura Seca, which belongs to the Centro de Ciências Agrárias Universidade Federal do Ceará (CCA / UFC), located in Quixadá, Ceará. From the results obtained by molecular markers it was found that these were effective in identifying the polymorphism in erect and early cowpea genotypes. There is a tendency for grouping of genotypes according to the origin. Assessing the genetic divergence in phenotypic markers showed that CE-46 genotype is the most divergent among the 28 genotypes. Crossings between the groups VIII and XI and groups VII and VIII may result in favorable gene combinations and response variables initial flowering of the crop cycle and contribute to greater magnitude to the quantification of genetic divergence among the genotypes. From studies using canonical correlation and path analysis it is concluded that direct selection based on the seed number per pod and one hundred seed weight favors the increase in yield cowpea. A direct selection based on the number of pods per plant tends to decrease the cycle in cowpea, the decrease in the pod length and the increase in the seed number per pod contribute to the increase in cowpea yield. The base and multiplicative selection indices are more efficient in the erect and early cowpea genotypes selection . The CE-113 and CE-748 genotypes combine, simultaneously, several favorable morphological and agronomic characters besides the high yield. / A cultura do feijão-caupi (Vigna unguiculata L. Walp) possui grande importância socioeconômica em função dos seus teores elevados de proteína, de sua resistência a seca e boa produtividade. Sendo cultivado nas regiões tropicais e subtropicais da África, Brasil e Ásia, o feijão-caupi é cultivado, predominantemente, por pequenos agricultores os quais utilizam poucos recursos tecnológicos. Nos últimos anos, o feijão-caupi tem chamado a atenção de médios e grandes produtores, os quais necessitam de cultivares adaptadas a mecanização, precoces e responsivas as melhorias do ambiente. Para iniciar um programa de melhoramento genético que atenda as necessidades desses novos produtores de feijão-caupi tornam-se necessários o conhecimento do germoplasma disponível, assim como o das relações entre as variáveis relacionadas com a produtividade e técnicas de seleção apropriadas ao feijão-caupi. Nesse contexto, objetivou-se com esse trabalho avaliar a divergência genética por caracteres fenotípicos e moleculares, estudar as inter-relações entre caracteres relacionados com a produtividade e índices de seleção adequados a genótipos de porte ereto e ciclo precoce. Para a avaliação da divergência genética por marcadores moleculares, realizaram-se extrações de DNA de 46 genótipos provenientes do Banco de Germoplasma da Universidade Federal do Ceará e da Embrapa Meio Norte e posteriormente foram realizadas PCR com oito iniciadores ISSR no Laboratório de Biologia Molecular da Embrapa Agroindústria Tropical. Para a análise da divergência genética por marcadores fenotípicos, estudo de correlações canônicas, análise de trilha e aplicação de índices de seleção realizou-se um experimento em blocos ao acaso com quatro repetições e 28 genótipos na Fazenda Lavoura Seca, pertencente ao Centro de Ciências Agrárias da Universidade Federal do Ceará (CCA/UFC), localizada no município de Quixadá, Ceará. A partir dos resultados obtidos pelos marcadores moleculares verificou-se que estes foram eficientes na identificação do polimorfismo em genótipos de feijão-caupi de porte ereto e ciclo precoce e que há uma tendência de agrupamento desses genótipos em função da origem. Avaliando a divergência genética através de marcadores fenotípicos observou-se que o genótipo CE-46 é o mais divergente entre os 28 genótipos avaliados. Os cruzamentos entre os grupos VIII e XI e grupos VII e VIII podem resultar em combinações gênicas favoráveis e as variáveis respostas floração inicial e ciclo da cultura contribuem em maior magnitude para a quantificação da divergência genética entre os genótipos avaliados. A partir dos estudos realizados utilizando correlações canônicas e análise de trilha conclui-se que a seleção direta com base no número de sementes por vagem e peso de 100 sementes favorece o aumento em produtividade de feijão-caupi; a seleção direta com base no número de vagens por planta tende a diminuir o ciclo cultural em feijão-caupi; o decréscimo no comprimento da vagem e o aumento no número de sementes por vagem contribuem para o aumento na produtividade em feijão-caupi de porte ereto e ciclo precoce. Constatou-se que os índices base e multiplicativo são mais eficientes na seleção de genótipos de feijão-caupi precoces e de porte ereto e que os genótipos CE-113 e CE-748 reúnem, simultaneamente, vários caracteres morfológicos e agronômicos favoráveis além da produtividade elevada.

Com as constantes mudanças do sistema produtivo de bovinos de corte, e um mercado consumidor ainda mais exigente, o enfoque sobre a escolha de animais que apresentem qualidade e rendimento de carcaça é cada vez maior. Para que as reivindicações dos frigoríficos sejam atendidas, o criador necessita de ferramentas de avaliação genética que possam identificar com mais precisão os touros que serão, de fato, melhoradores para as características desejáveis. Com isso, este trabalho teve como objetivo: (i) Estimar os componentes de variância e covariância, e os parâmetros genéticos para a característica de musculosidade em animais da raça Nelore; (ii) Estimar os componentes de variância e covariância, e os parâmetros genéticos para características de desenvolvimento ponderal (peso ao nascimento, peso a desmama, ganho de peso aos 345 dias) e reprodutivo (circunferência escrotal) em animais da raça Nelore; (iii) Estimar a correlação entre as características de musculosidade, desenvolvimento ponderal e reprodutivo; (iv) Comparar as metodologias que consideram o grupo de manejo a desmama como efeito fixo e aleatório; (v) Comparar as metodologias uni, bi e multicaracterística e avaliar as vantagens em incluir nos programas de seleção, através do cálculo de resposta correlacionada, a característica de musculosidade; (vi) Estimar as DEP´s para as características de musculosidade, desenvolvimento ponderal e reprodutivo; (vii) Comparar as metodologias multicaracterística e bivariadas na avaliação genética de touros, através do cálculo de perda de eficiência de seleção. / With the constant changes in the beef cattle production system, and an even more demanding consumer market, the focus on the carcass yield and quality is increasing. For the slaughters claims to be met, the breeder needs a tool that can identify the bulls that will be, in fact, the improvers to those specific features. Therefore, this project aims to: (i) Estimate the variance and covariance components, and the genetic parameters for the muscle score trait in Nellore animals; (ii) Estimate the variance and covariance components, and the genetic parameters for the growth traits (birth weight, weaning weight, post-weaning gain) and reproductive traits (scrotal circumference) in Nellore animals; (iii) Estimate the correlation between muscle score, growth and reproductive traits; (iv) Compare methodologies that consider the weaning management group as fixed and random effects; (v) Compare uni, bi and multi-trait methodologies and evaluate the advantages to include in the animal breeding programs, by the correlated response, the muscle score trait; (vi) Estimate the EPD\'s for muscle score, growth and reproductive traits and (vii) Compare the multi-trait and bivariate methodologies in the genetic evaluation of bulls through the calculation of selection efficiency loss.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T11:31:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 168448 bytes, checksum: cac1c0a520e55d1c502dc8fdb8011b36 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T11:31:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 168448 bytes, checksum: cac1c0a520e55d1c502dc8fdb8011b36 (MD5) Previous issue date: 2003-07-10 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Utilizaram-se registros de pesos do nascimento aos 196 dias de idade de 927 cordeiros filhos de 45 reprodutores e 323 matrizes de ovinos da raça Santa Inês, controlados de 1983 a 2000, pertencentes à Empresa Estadual de Pesquisa Agropecuária da Paraíba (EMEPA-PB), com os objetivos de estimar parâmetros genéticos para os efeitos aditivos direto e materno e predizer os valores genéticos dos animais, por meio de análises bicaracterísticas e regressão aleatória, para pesos em diferentes idades. Os componentes de (co)variâncias e os parâmetros genéticos direto e materno para os pesos foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal, por intermédio de análises unicaracterísticas, para testar três modelos de análises, com o intuito de determinar o mais apropriado para descrever as características estudadas, o qual foi utilizado nas análises bicaracterísticas e de regressão aleatória. O modelo bicaracterística foi ajustado utilizando-se o aplicativo MTDFREML (BOLDMAN et al., 1995) e regressão aleatória, por meio de polinômios de Legendre quadráticos e cúbicos, do programa DXMRR (MEYER, 1998). De acordo com o teste de razão de verossimilhança, o modelo que incluiu o efeito aditivo mais o materno foi o que apresentou maior valor para o logaritmo da função de verossimilhança em todas as características estudadas, sendo, portanto, o escolhido. A não-inclusão do efeito materno no modelo de análise resultou em superestimação das herdabilidades para o efeito direto. A importância do efeito materno diminuiu ao longo da trajetória de crescimento, à medida que a idade dos cordeiros aumentava. As herdabilidades estimadas nas análises bicaracterísticas para o efeito genético direto foram superiores às obtidas pelas análises unicaracterísticas e tenderam a decrescer do nascimento aos 196 dias de idade, variando de 0,23 a 0,03. Já as estimadas por meio dos modelos de regressão aleatória aumentaram do nascimento aos 196 dias de idade (0,004 a 0,28), com tendência de serem mais baixas nas idades em que as estimativas do efeito materno foram mais altas. As herdabilidades para o efeito materno, obtidas por ambos os modelos, aumentaram do nascimento aos 56 dias e, então, decresceram com a idade, tendendo a apresentar o mesmo comportamento, porém as estimadas pelos modelos de regressão aleatória foram de menor magnitude. As correlações genéticas estimadas por ambos os modelos tenderam a ser altas e positivas. As correlações de Spearman e de Pearson entre os valores genéticos preditos pelos dois modelos foram baixas. As herdabilidades estimadas por meio das análises bicaracterísticas sugerem que este método permite obter estimativas mais acuradas, comparadas às obtidas nas análises unicaracterísticas. As estimativas de herdabilidade e correlações genéticas obtidas pelo modelo de regressão aleatória foram biologicamente mais coerentes quando comparadas àquelas obtidas pelo modelo bicaracterística. Entretanto, estudos adicionais envolvendo maior número de informações devem ser realizados, como também usando dados simulados, com o objetivo de avaliar com mais precisão os resultados obtidos por ambos os modelos. / Records of body weights from birth to 196 days of age of 927 lambs progeny of 45 sires and 323 dams of Santa Ines sheep, controlled from 1983 to 2000, extracted from a database of Agricultural Research Corporation of Paraiba, were used to estimate genetic parameters for the additive direct and maternal effects and to predict breeding values by two-trait and random regression analyses for weights in different ages. The (co)variance components and both direct and maternal genetic parameters were estimated by using restricted maximum likelihood methods, under animal model, by means of single-trait analyses, to test three analyses models, to establish the most appropriated to describe the studied traits, which was used in two-trait and random regression analyses. The two-traits model was fitting by using MTDFREML system (BOLDMAN et al., 1995) and the random regression by means of orthogonal Legendre polynomials, using DXMRR program (MEYER, 1998). According to the likelihood ratio test, the model that included additive direct effect and the maternal was the one that showed higher value for ln likelihood for all the studied trait. The not inclusion of maternal effect in analyses model overestimated the heritability for direct effect. The importance of maternal effect decreased along the growth trajectory, while the age of the lambs increased. The heritability estimates in two-trait analyses for genetic direct effect were higher than those obtained by single-trait analyses and tended to decrease from birth to 196 days of age, ranging from 0.23 to 0.03. However, these estimated by means of the random regression models increased from ixbirth to 196 days of age (0.004 to 0.28), tending to be lower at ages where the estimates of the maternal effects were higher. The heritability for the maternal effect obtained by both models, increased from birth to 56 days and, after, decreased with the age, tending to show the same behavior, however these estimated by random regression models were of smaller greatness. The genetic correlations estimated for both models tended to be high and positive. The Spearman and Pearson correlations among the breeding values obtained both by the models were low. The heritability estimated by means of the two-trait analyses suggest that technique allows to obtain more accurated estimates, compared to the obtained by single-trait analyses. The estimates of heritability and genetic correlations obtained by means of random regression model were biologically more consistent when compared those obtained by two-trait model. However, additional studies involving larger number of information should be accomplished, as well using simulated data, with purpose of evaluation with more accuracy the results obtained by both models.

MUNIZ, Lorena Mirelle Santos. Associação genética entre a mudança de peso vivo e características relacionadas à fertilidade e à habilidade materna de ovelhas Santa Inês. 2016. 96 f. Tese (Doutorado em Zootecnia)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016 / Submitted by Aline Mendes (alinemendes.ufc@gmail.com) on 2017-01-18T20:54:01Z No. of bitstreams: 1 2016_tese_lmsmuniz.pdf: 6678931 bytes, checksum: 726bdafc2862a3655fe80abfe10e37f2 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-01-19T11:55:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_tese_lmsmuniz.pdf: 6678931 bytes, checksum: 726bdafc2862a3655fe80abfe10e37f2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-19T11:55:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_tese_lmsmuniz.pdf: 6678931 bytes, checksum: 726bdafc2862a3655fe80abfe10e37f2 (MD5) Previous issue date: 2016 / As Santa Inês is the breed with the largest number of animals available in Brazil, which makes it the maternal base of the country's meat sheep industry, and in the moment that signals to need to increase the effective size of the flocks, to meet the suppressed domestic demand by meat lamb, evaluate the reproductive performance of this breed is a fundamental issue. As in meat production, much emphasis is given to growth traits over those of fertility, the aim of this study was to investigate a possible association between the change in body weight in the pre- and post-partum, and traits related to fertility and maternal ability of Santa Ines sheep. The analyzed traits were mating weight (MW), lambing weight (LW) and weight of the ewe at weaning of their lambs (WW), number of lambs born per ewe (NLB), number of lambs weaned per ewe (NLW), total weight of lambs born per ewe (LWB) and total weight of lambs weaned per ewe (LWW), weight change between mating and lambing (WC1 = (LW – MW)/(lambing date – mating date)) and weight change between lambing and weaning (WC2 = (WW – PP)/(weaning date – lambing date)) of 2,166 ewes, from 2004 to 2010. Four multivariate animal models were analyzed: 1) Limiar2 x Linear2 (NLB, NLW, WC1 and WC2), 2) Linear4 (LWB, LWW, WC1 and WC2), 3) Linear3 x Limiar2 (MW, LW, WW, NLB and NLW) and 4) Linear5 (MW, LW, WW, LWB and LWW) by Bayesian inference with THRGIBBS1F90 and GIBBS2F90 software. The heritabilities for NLB, NLW, LWB, LWW, WC1, WC2, MW, LW and WW were 0.24, 0.24, 0.15, 0.10, 0.07, 0.01, 0.40, 0.44 and 0.44, respectively. The mode estimation for genetic correlation between WC1 and WC2 was equal to 1.0. Genetic correlations of WC1 and WC2 with the traits NLB, NLW, LWB and LWW tended to be negative. We conclude that ewes which do not show major changes in their body weight, in the period close to lambing, are more efficient and should be selected to improve flock productivity. This aspect should be associated with a greater number of lambs weaned per ewe. / Por ser a raça com maior número de animais disponíveis no Brasil, o que a torna a base materna da ovinocultura de corte do país, e no momento que se sinaliza para necessidade do aumento do tamanho efetivo dos rebanhos, para atender a demanda interna reprimida por carne ovina, avaliar o desempenho reprodutivo da raça Santa Inês é um tema fundamental. Como na exploração para corte, muita ênfase é dada às características de crescimento em detrimento daquelas de fertilidade, o objetivo deste estudo foi verificar uma possível associação entre a mudança de peso vivo, nos períodos pré e pós-parto, e características relacionadas à fertilidade e habilidade materna de ovelhas da raça Santa Inês. Foram analisadas as características peso à cobrição (PC), peso ao parto (PP) e peso ao desmame das crias (PDES), número de crias nascidas por matriz (NCN), número de crias desmamadas por matriz (NCD), peso total de crias nascidas por matriz (PTCN) e peso total de crias desmamadas por matriz (PTCD), mudança de peso entre a cobrição e o parto (MUD1 = (PP – PC)/(data do parto – data da cobertura)) e mudança de peso vivo entre o parto e o desmame (MUD2 = (PDES – PP)/(data do desmame – data do parto)) de 2.166 ovelhas, no período de 2004 a 2010. Quatro modelos animal multivariados foram analisados: 1) Limiar2 x Linear2 (NCN, NCD, MUD1 e MUD2), 2) Linear4 (PTCN, PTCD, MUD1 e MUD2), 3) Linear3x Limiar2 (PC, PP, PDES, NCN e NCD) e 4) Linear5 (PC, PP, PDES, PTCN e PTCD) por meio de inferência bayesiana com os softwares THRGIBBS1F90 e GIBBS2F90. As herdabilidades para NCN, NCD, PTCN, PTCD, MUD1, MUD2, PC, PP e PDES foram 0,24; 0,24; 0,15; 0,10; 0,07; 0,01; 0,40; 0,44 e 0,44, respectivamente. A estimativa da moda para a correlação genética entre MUD1 e MUD2 foi igual a 1,0. As correlações genéticas de MUD1 e MUD2 com as características NCN, NCD, PTCN e PTCD tenderam a ser negativas. Conclui-se que ovelhas que não apresentam grandes mudanças em seu peso vivo, nos períodos próximo ao parto, são mais eficientes e devem ser selecionadas para melhoria da produtividade do rebanho. Deve-se associar a isto um maior número de cordeiros desmamados por matriz.

Com as constantes mudanças do sistema produtivo de bovinos de corte, e um mercado consumidor ainda mais exigente, o enfoque sobre a escolha de animais que apresentem qualidade e rendimento de carcaça é cada vez maior. Para que as reivindicações dos frigoríficos sejam atendidas, o criador necessita de ferramentas de avaliação genética que possam identificar com mais precisão os touros que serão, de fato, melhoradores para as características desejáveis. Com isso, este trabalho teve como objetivo: (i) Estimar os componentes de variância e covariância, e os parâmetros genéticos para a característica de musculosidade em animais da raça Nelore; (ii) Estimar os componentes de variância e covariância, e os parâmetros genéticos para características de desenvolvimento ponderal (peso ao nascimento, peso a desmama, ganho de peso aos 345 dias) e reprodutivo (circunferência escrotal) em animais da raça Nelore; (iii) Estimar a correlação entre as características de musculosidade, desenvolvimento ponderal e reprodutivo; (iv) Comparar as metodologias que consideram o grupo de manejo a desmama como efeito fixo e aleatório; (v) Comparar as metodologias uni, bi e multicaracterística e avaliar as vantagens em incluir nos programas de seleção, através do cálculo de resposta correlacionada, a característica de musculosidade; (vi) Estimar as DEP´s para as características de musculosidade, desenvolvimento ponderal e reprodutivo; (vii) Comparar as metodologias multicaracterística e bivariadas na avaliação genética de touros, através do cálculo de perda de eficiência de seleção. / With the constant changes in the beef cattle production system, and an even more demanding consumer market, the focus on the carcass yield and quality is increasing. For the slaughters claims to be met, the breeder needs a tool that can identify the bulls that will be, in fact, the improvers to those specific features. Therefore, this project aims to: (i) Estimate the variance and covariance components, and the genetic parameters for the muscle score trait in Nellore animals; (ii) Estimate the variance and covariance components, and the genetic parameters for the growth traits (birth weight, weaning weight, post-weaning gain) and reproductive traits (scrotal circumference) in Nellore animals; (iii) Estimate the correlation between muscle score, growth and reproductive traits; (iv) Compare methodologies that consider the weaning management group as fixed and random effects; (v) Compare uni, bi and multi-trait methodologies and evaluate the advantages to include in the animal breeding programs, by the correlated response, the muscle score trait; (vi) Estimate the EPD\'s for muscle score, growth and reproductive traits and (vii) Compare the multi-trait and bivariate methodologies in the genetic evaluation of bulls through the calculation of selection efficiency loss.

O presente trabalho teve como objetivo estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos das características de qualidade de carne e de características de desempenho, carcaça e composição corporal em uma linhagem macho de frangos fornecida pela Agroceres Ross Melhoramento Genético de Aves S. A. As aves faziam parte do programa denominado sib test, ou teste de irmãos, aonde são coletadas informações de carcaça dos irmãos dos indivíduos a serem selecionados na referida linhagem, estes chamados de rebanho elite. As características de desempenho analisadas foram peso à seleção (PS), peso ao abate (PA) e medidas de ultra-sonografia de músculo peitoral (US). As características de carcaça analisadas foram o peso de peito (PPEI), o peso eviscerado (PE) e o peso de pernas (PPER) e as características de composição corporal analisadas foram o peso da gordura abdominal (GOR), o peso do fígado (FIG) e o peso do coração (COR). As características de qualidade de carne analisadas foram: medida de pH inicial (pHi), medida de pH em 6 horas após o abate (pH6), medida de pH final (pHf), amplitude inicial de queda de pH (AMi), amplitude final de queda de pH (AMf), teor de luminosidade (L*), teor de vermelho (a*), teor de amarelo (b*), perdas de água por exsudação (EXSU), perdas de água por descongelamento (CONG), perdas de água por cozimento (COZ) e força de cisalhamento (FC). Os componentes de (co) variância foram estimados por verossimilhança restrita, utilizando-se o programa MTDFREML. A matriz de parentesco foi composta por 107.154 animais. Para as características pH6, pHf e L* foram estimados coeficientes de herdabilidade moderados; para as demais características estes coeficientes foram baixos. As estimativas de correlações genéticas obtidas não foram indicativas de associações importantes entre as características de qualidade de carne e as características de desempenho, carcaça e composição corporal, exceto pela seleção a favor de PS, que pode reduzir as perdas de água da carne. As estimativas de correlações genéticas encontradas entre as características de qualidade de carne puderam contribuir para o entendimento dos mecanismos relacionados à qualidade da carne na linhagem analisada, de modo que CONG, FC e L* foram características capazes de trazer respostas correlacionadas favoráveis às demais e em maior ou menor grau apresentarem capacidade de resposta à seleção, recomendando-se sua utilização como critério de seleção quando na existência de necessidade de melhoria na qualidade da carne na linhagem estudada. Contudo, esta necessidade não foi aparente, uma vez que as tendências genéticas das características de qualidade de carne, além de terem sido de pequena magnitude, foram em sua maioria favoráveis à qualidade da carne da linhagem analisada. / This research was conducted to estimate genetic and phenotypic parameters of meat quality, performance, carcass and body composition traits in a male broiler line provided by Agroceres Ross Melhoramento Genético de Aves S. A. Broilers measured belonged to a sib test program, in which data from sibs of the individuals to be selected in this line, called elite flock, are collected. Performance traits analyzed were body weight at selection (PS), body weight at slaughter (PA) and ultrasound records of pectoral muscle (US). Carcass traits analyzed were meat breast weight (PPEI), eviscerated body weight (PE) and leg weight (PPER) and the body composition traits analyzed were abdominal fat weight (GOR), liver weight (FIG) and heart weight (COR). Meat quality traits analyzed were: initial pH measure (pHi), pH measure at 6 hours after slaughter (pH6), final pH measure (pHf), initial range of pH fall (AMi), final range of pH fall (AMf), lightness (L*), redness (a*), yellowness (b*), weep losses (EXSU), drip losses (CONG), shrink losses (COZ) and shear force (FC). (Co) variance components were estimated by restricted maximum likelihood method, using the software MTDFREML. The numerator relationship matrix was composed by 107.154 individuals. For pH6, pHf and L*, moderate heritability coefficients were estimated; for the other traits these coefficients were low. Genetic correlation estimates obtained indicated a small association among meat quality traits and performance, carcass and body composition traits, except for the selection to PS, which seemed to be able to reduce water losses of meat. Genetic correlations estimates among meat quality traits could orientated the understanding of the mechanisms related to meat quality in the analyzed line; CONG, FC and L* seemed to be able to bring favorable correlationed responses, so it was recommended its use as selection criterion if existing the necessity of improving the meat quality in the analyzed line. However, this necessity was not apparent, since the genetic trends of meat quality traits were small and favorable to meat quality in the analyzed broiler line.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-07-20Bitstream added on 2014-06-13T18:29:29Z : No. of bitstreams: 1 alves_dnm_me_jabo.pdf: 283323 bytes, checksum: ee31eb0fac2fd6cd06f249038ec9709e (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Para estimar parâmetros genéticos para o número total de leitões nascidos (NLNT) e nascidos vivos (NLNV), empregaram-se modelos de repetibilidade, uni-características, bi-características, e de regressão aleatória (MRA). Os grupos de contemporâneos (GC) empregados nos três primeiros modelos foram: GC1 (granja-anoépoca) GC2 (granja-ano-mês) e GC3 (granja-ano-semana) relacionados com local e data em que ocorreu a parição. Para NLNT e NLNV, a herdabilidade (h2) estimada pelo modelo de repetibilidade foi de 0,09 ± 0,02. Nos modelos uni-características, a definição GC3 levou à estimativas mais elevadas nas ultimas parições. O modelo de repetibilidade com três classes de variâncias residuais foi o que apresentou melhor ajuste segundo o Teste da Razão de Verossimilhança (LRT) e o Critério de Informação de Akaike (AIC), para ambas as características. Dois MRA adicionais também foram ajustados para ambas as características. Para NLNT, um MRA linear e um quadrático de rank 2, ambos com três classes de variâncias residuais. Para NLNV, o primeiro foi um MRA linear, o segundo foi um MRA linear (genética) e quadrática com rank 2 (ambiente permanente). As estimativas de herdabilidade obtidas pelos MRA foram menores que as para o modelo multi-característica. As correlações genéticas obtidas pelos MRA tenderam a diminuir com o decorrer das parições, para ambas características. As correlações genéticas entre ordens de parição, de maneira geral foram altas, indicando que ao selecionar-se para primeira ganhos genéticos podem ser obtidos nas parições subseqüentes. / Repeatability, single-trait, multiple-trait (MTM) and random regression models (RRM) were used with the objective to estimate genetic parameters for the number of piglets born in total (NOBT) and the number of piglets born alive (NOBA). Three different structures of cotemporary groups were applied: CG1 (herdyear- season), CG2 (herd-year-monthly) e CG3 (herd-year-weekly). For NOBT and NOBA, the estimates of heritability by repeatability model, were 0.09 ± 0.02. The estimates of heritability by single-trait model with CG3 definition were higher in 5th and 6th parities. The repeatability model with three classes of residual variances presented best fit. Two additional RRM were adjusted for both traits. For NOBT a linear and a quadratic RRM with rank 2, and three classes of residual variances, were utilized and for NOBA a linear RRM and Linear, for genetics effects, and quadratic with rank 2, for permanent environmental. The heritability estimates by RRM model were lower than MTM. The genetic correlations estimated by RRM tended to decrease over parities, for both traits. The genetics correlations were high among the most parities, indicating that the selection in the first parity will result in genetic gains in later parities.

O presente trabalho teve como objetivo estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos das características de qualidade de carne e de características de desempenho, carcaça e composição corporal em uma linhagem macho de frangos fornecida pela Agroceres Ross Melhoramento Genético de Aves S. A. As aves faziam parte do programa denominado sib test, ou teste de irmãos, aonde são coletadas informações de carcaça dos irmãos dos indivíduos a serem selecionados na referida linhagem, estes chamados de rebanho elite. As características de desempenho analisadas foram peso à seleção (PS), peso ao abate (PA) e medidas de ultra-sonografia de músculo peitoral (US). As características de carcaça analisadas foram o peso de peito (PPEI), o peso eviscerado (PE) e o peso de pernas (PPER) e as características de composição corporal analisadas foram o peso da gordura abdominal (GOR), o peso do fígado (FIG) e o peso do coração (COR). As características de qualidade de carne analisadas foram: medida de pH inicial (pHi), medida de pH em 6 horas após o abate (pH6), medida de pH final (pHf), amplitude inicial de queda de pH (AMi), amplitude final de queda de pH (AMf), teor de luminosidade (L*), teor de vermelho (a*), teor de amarelo (b*), perdas de água por exsudação (EXSU), perdas de água por descongelamento (CONG), perdas de água por cozimento (COZ) e força de cisalhamento (FC). Os componentes de (co) variância foram estimados por verossimilhança restrita, utilizando-se o programa MTDFREML. A matriz de parentesco foi composta por 107.154 animais. Para as características pH6, pHf e L* foram estimados coeficientes de herdabilidade moderados; para as demais características estes coeficientes foram baixos. As estimativas de correlações genéticas obtidas não foram indicativas de associações importantes entre as características de qualidade de carne e as características de desempenho, carcaça e composição corporal, exceto pela seleção a favor de PS, que pode reduzir as perdas de água da carne. As estimativas de correlações genéticas encontradas entre as características de qualidade de carne puderam contribuir para o entendimento dos mecanismos relacionados à qualidade da carne na linhagem analisada, de modo que CONG, FC e L* foram características capazes de trazer respostas correlacionadas favoráveis às demais e em maior ou menor grau apresentarem capacidade de resposta à seleção, recomendando-se sua utilização como critério de seleção quando na existência de necessidade de melhoria na qualidade da carne na linhagem estudada. Contudo, esta necessidade não foi aparente, uma vez que as tendências genéticas das características de qualidade de carne, além de terem sido de pequena magnitude, foram em sua maioria favoráveis à qualidade da carne da linhagem analisada. / This research was conducted to estimate genetic and phenotypic parameters of meat quality, performance, carcass and body composition traits in a male broiler line provided by Agroceres Ross Melhoramento Genético de Aves S. A. Broilers measured belonged to a sib test program, in which data from sibs of the individuals to be selected in this line, called elite flock, are collected. Performance traits analyzed were body weight at selection (PS), body weight at slaughter (PA) and ultrasound records of pectoral muscle (US). Carcass traits analyzed were meat breast weight (PPEI), eviscerated body weight (PE) and leg weight (PPER) and the body composition traits analyzed were abdominal fat weight (GOR), liver weight (FIG) and heart weight (COR). Meat quality traits analyzed were: initial pH measure (pHi), pH measure at 6 hours after slaughter (pH6), final pH measure (pHf), initial range of pH fall (AMi), final range of pH fall (AMf), lightness (L*), redness (a*), yellowness (b*), weep losses (EXSU), drip losses (CONG), shrink losses (COZ) and shear force (FC). (Co) variance components were estimated by restricted maximum likelihood method, using the software MTDFREML. The numerator relationship matrix was composed by 107.154 individuals. For pH6, pHf and L*, moderate heritability coefficients were estimated; for the other traits these coefficients were low. Genetic correlation estimates obtained indicated a small association among meat quality traits and performance, carcass and body composition traits, except for the selection to PS, which seemed to be able to reduce water losses of meat. Genetic correlations estimates among meat quality traits could orientated the understanding of the mechanisms related to meat quality in the analyzed line; CONG, FC and L* seemed to be able to bring favorable correlationed responses, so it was recommended its use as selection criterion if existing the necessity of improving the meat quality in the analyzed line. However, this necessity was not apparent, since the genetic trends of meat quality traits were small and favorable to meat quality in the analyzed broiler line.

Os objetivos deste trabalho foram estimar as associações genéticas entre características de crescimento e produção de leite, utilizando análises bicaracterísticas, e entre características de crescimento, perímetro escrotal e idade ao primeiro parto utilizando modelos de regressão aleatória, de animais da raça Guzerá. Para as análises bicaracterísticas foram utilizadas 252.257 informações de pesos de machos e fêmeas aos 120 dias (P120), ao desmame (PD), ao ano (P365), ao sobreano (PSOBRE) aos 24 meses de idade (P24) e 6.493 lactações encerradas (P305), pertencentes a 4.723 vacas, e os modelos incluíram como os efeitos aleatórios o genético aditivo direto, de ambiente permanente materno e residual, e como efeitos fixos os grupos de contemporâneos e a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático). Para as análises com os modelos de regressão aleatória foram utilizadas 159.366 observações de pesos e 23.780 de perímetro escrotal, realizadas entre 335 e 724 dias de idade dos animais e agrupadas em classes com intervalo de 10 dias, e 63.596 observações de idade ao primeiro parto. Os efeitos aleatórios considerados foram o genético aditivo direto, de ambiente permanente e residual e como efeitos fixos os grupos de contemporâneos, a idade da vaca ao parto (efeito linear e quadrático) e a curva fixa para modelar a tendência média da população (quadrática) sobre as classes de idade. Foram testados quatro possíveis graus de polinômios de Legendre (zero, linear, quadrático e cúbico), sendo o quadrático mais adequado para descrever as variâncias das características analisadas. Para verificar a existência de diferentes padrões de crescimento e agrupar os touros com base nos seus valores genéticos para produção de carne, leite e duplo propósito, foram realizadas análises de componentes principais e de agrupamento. As herdabilidades estimadas foram 0,23; 0,14; 0,16; 0,17; 021 e 0,22 para P305, P120, PD, P365, PSOBRE e P24, respectivamente, sugerindo que para as características de pesos, as herdabilidades aumentam com o aumento da idade dos animais. Mesma tendência foi observada pelas análises de regressão aleatória, cujas herdabilidades variaram de 0,17 a 0,31. As correlações genéticas entre os pesos em diferentes idades e a produção de leite foram positivas e de magnitude moderada a baixa, variando de 0,27 a 0,38 sugerindo que a seleção para peso e P305 possa ser realizada de forma simultânea nos mesmos animais. As análises de componentes principais indicaram a mesma tendência observada pelas correlações genéticas. As análises de agrupamento mostraram que a raça Guzerá possui touros com diferentes perfis genéticos, sendo possível realizar a seleção para corte, leite ou duplo propósito. As correlações genéticas entre os pesos e perímetro escrotal foram positivas e favoráveis, variando de 0,31 a 0,47, indicando que a seleção para aumento do peso poderá resultar em animais com maior perímetro escrotal. As correlações entre peso e idade ao primeiro parto variaram de -0,56 a -0,38 e perímetro escrotal e idade ao primeiro parto variaram de -0,55 a 0,08, sugerindo que a redução da idade ao primeiro parto poderá ocorrer, a longo prazo, quando peso e perímetro escrotal forem objetivos de seleção. A eficiência relativa de seleção indicou maior resposta pela seleção indireta para idade ao primeiro parto, quando realizada a seleção para perímetro escrotal a partir dos 615 dias de idade, quando comparada com o ganho genético direto para idade ao primeiro parto. / The objectives of this study were to estimate the genetic associations between growth and milk production traits in Guzerat cattle using two-trait analysis and between growth traits, scrotal circumference and age at first calving using random regression models. For two-trait analysis, 252,257 weight records of males and females obtained at 120 days of age (W120), weaning (WW), yearling (YW), post-weaning (PWW) and 24 months of age (W24), as well as 6,493 complete lactation records (W305) of 4,723 cows, were used. The models included direct additive genetic, maternal permanent environmental and residual effects as random effects, and the contemporary groups and age of cow at calving (linear and quadratic effect) as fixed effects. For the random regression models, 159,366 observations of weight and 23,780 observations of scrotal circumference, obtained at 335 and 724 days of age of the animals and divided into classes at 10-day intervals, as well as 63,596 observations of age at first calving, were used. Random direct additive genetic, permanent environmental and residual effects and the fixed effects of contemporary group and age of cow at calving (linear and quadratic effect) were considered. A fixed curve was used to model the average trend of the population (quadratic) on the age classes. Four possible degrees of Legendre polynomials (zero, linear, quadratic and cubic) were tested and the quadratic polynomial was the most appropriate to describe the variances in the traits analyzed. Principal component and cluster analyses were performed to determine the existence of different growth patterns and to group bulls based on their breeding values for meat, milk and dual-purpose production. The estimated heritabilities were 0.23, 0.14, 0.16, 0.17, 0.21 and 0.22 for W305, W120, WW, YW, PWW and W24, respectively, suggesting that, for the growth traits, heritabilities increased with increasing age of the animals. The same trend was observed when random regression analysis was performed, with heritabilities ranging from 0.17 to 0.31. The genetic correlations between weights at different ages and milk yield were positive and of moderate to low magnitude, ranging from 0.27 to 0.38. These estimates suggest that selection for weight and W305 can be performed simultaneously in the same animals. Principal component analysis indicated the same trend as observed by the genetic correlations. Cluster analysis showed the presence of bulls with different genetic profiles in the Guzerat breed, thus permitting selection for meat, milk or dual purpose. The genetic correlations between weights and scrotal circumference were positive and favorable (0.31 to 0.47), indicating that selection for increased weight will result in animals with greater scrotal circumference. The correlations between weights and age at first calving ranged from -0.56 to -0.38 and between scrotal circumference and age at first calving from -0.55 to 0.08, suggesting that the use of weight and scrotal circumference as selection objectives will result in the long-term reduction of age at first calving. The relative efficiency of selection indicated a greater response to indirect selection for age at first calving when selecting for scrotal circumference after 615 days of age, compared to the genetic gain obtained by direct selection for age at first calving.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-16Bitstream added on 2014-06-13T19:12:58Z : No. of bitstreams: 1 leite_cds_me_jabo.pdf: 286709 bytes, checksum: 5dbd29633c088bfd8c09e91c549a77c3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A seleção baseada em características reprodutivas tem sido muito empregada em programas de melhoramento genético de suíno. Assim, objetivaram-se avaliar os efeitos ambientais e genéticos que influenciam o intervalo desmame-cio (IDC) e verificar sua influência no número de nascidos total (TL), nascidos vivos (NV) e mortos (NM) em fêmeas suínas. Para análise dos efeitos ambientais, utilizaram-se 8.104 dados da 1ª a 6ª ordem de parição, e, para as estimativas dos parâmetros genéticos, apenas as informações do 1º ao 3º IDC, o que resultou em 6.548 observações, que foram analisadas pelo método REML, utilizando-se modelos uni e multicaracterística. Para este último, considerou-se cada IDC (1º, 2º e 3º) como uma característica distinta. Avaliaram-se, também, as correlações genéticas entre o IDC, TL, NM e idade ao primeiro parto (IPP). Para os fatores ambientais, o modelo incluiu como efeitos fixos rebanho, linhagem, ano (AP) e estação (EP) de parto, e as covariáveis idade da porca ao parto (IDPP), TL e duração da lactação (DL). A DL, na forma linear, e a IDPP, na forma quadrática, influenciaram o IDC. Rebanho, AP e EP foram fontes de variação significativas, enquanto TL e linhagem não o foram. Não foi observada influência do IDC sobre TL, NV, nem sobre NM. A herdabilidade estimada para o IDC pelo modelo de repetibilidade foi baixa. As correlações genéticas entre os IDC (1º, 2º e 3º) foram de moderada a baixa magnitude, evidenciando que o modelo multicaracterística é mais indicado para as estimativas de parâmetro genético nessa população. As correlações genéticas entre IDC, TL e NM, assim como IDC e IPP foram favoráveis à seleção. / Selection for reproductive traits has been largely used in swine breeding programs. The aims of this study were to evaluate environmental and genetic effects that affect the weaning-to-estrus interval (WEI) in sows and to assess their influence on litter size (LS), number of live born (LP) and dead born piglets (DP). Data consisting of 8,104 WEI from the 1st to 6th farrowing recorded in two herds were used for environmental analysis, but for estimating the genetic parameters only data from the 1st to 3rd farrowing were used, totalling 6,548 records. Genetic analysis was performed using the REML method with single and multitrait models, where each WEI was considered as a different trait. Genetic correlations among WEI, LS, DP and age at first farrowing (AFF) were also estimated using a multitrait model. For the environmental analysis, the model included as fixed effects the herd, line, and year (YF) and season (SF) of farrowing, and as covariates the sow’s age at farrowing (SAF), LS, and lactation length (LL). The effects were linear for LL and quadratic for SAF. The herd, YF and SF were important sources of variation, whereas LS and line were not significant. There were no effects of WEI on the litter traits (LS, LP and DP). The heritability estimated for WEI was low, and genetic correlations among its different intervals were of moderate to low magnitude, evidencing that a multitrait model was more indicated for estimating the genetic parameters for this trait in this population. The genetic correlations between WEI and LS, DP and AFF would be favourable in a selection.