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Diversidade genetica, taxa de cruzamento e estrutura espacial dos genotipos fissilis Vell. (meliaceae)

Gandara, Flavio Bertin 02 January 1996 (has links)
Orientador: Paulo Y. Kageyama / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-24T17:03:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gandara_FlavioBertin_M.pdf: 1569016 bytes, checksum: c7adf80aec8739c3d070d983c87314eb (MD5) Previous issue date: 1996 / Resumo: Com a finalidade de se estimar a diversidade genética e a taxa de cruzamento em uma espécie arbórea rara, ou seja, com baixa densidade populacional, foi estudada uma população natural de Cedrela fissilis Vell. (Meliaceae). A população está situada na Fazenda Intervales pertencente à Fundação para a Conservação e Produção Florestal do Estado de São Paulo, localizada no município de Sete Barras-SP. Na área levantada, Cedrelafissilis é uma espécie rara, onde ocorrem 34 indivíduos adultos em uma área de 270 ha (densidade média de cerca de 1 indivíduo a cada 8 ha ). Para a estimativa dos parâmetros genéticos, foi utilizada a técnica de eletroforese de isoenzimas em gel horizontal de amido. Foram analisados 34 indivíduos adultos e 5 famílias de 3 O indivíduos cada, formadas a partir da coleta de sementes em 5 árvores da população. Foram utilizados 7 sistemas enzimáticos (6-PGDH, PGI, G2DH, IDH, MDH, PO), resultando em 13 locos gênicos. Para os indivíduos adultos, obteve-se os seguintes parâmetros: heterozigosidade média = 0,222, heterozigosidade para os locos polimórficos = 0,288, porcentagem de locos polimórficos = 76,9% e número médio de alelos por loco = 2,31. Para as famílias, obteve-se os seguintes parâmetros: heterozigosidade média = 0,193, heterozigosidade para os locos polimórficos = 0,228, porcentagem de locos polimórficos = 84,6% e o número médio de alelos por loco = 2,38. A população adulta está em equilíbrio de Hardy-Weinberg, porém as famílias diferiram significativamente das expectativas do equilíbrio. O valor médio da taxa de cruzamento aparente (ta) estimado a partir do coeficiente de endogamia foi de 0,85. A taxa qe cruzamento multiloco (tm) foi de 0,92, sendo que os valores da taxa de cruzamento individuais para cada árvore variaram de 0,62 a 1,08. A média das taxas de cruzamento para cada loco (t8) foi de 0,83, inferior a tm, mas sem diferir desta significativamente. As 5 árvores matrizes foram fecundadas por um conjunto de pólen homogêneo, indicando a ocorrência de cruzamentos aleatórios.Através da ocorrência de alelos exclusivos às famílias foi estimada a distância mínima de caminhamento de pólen (distância das árvores matrizes até a borda da área levantada) que atingiu o valor de 950 m. Para o estudo da estrutura genética espacial foi empregada a análise da autocorrelação espacial, utilizando-se o índice I de Moran. O pequeno número de valores significativos encontrado sugere que a distribuição espacial dos genótipos é aleatória. Os resultados mostram que a população de Cedrelafissilis estudada, apesar de ter uma baixa densidade de indivíduos adultos, apresenta altas taxa de cruzamento, amplo fluxo de pólen, cruzamentos ao acaso e distribuição espacial aleatória de genótipos. Portanto, as suposições de que espécies raras estariam sujeitas a um fluxo gênico via pólen restrito, apresentariam auto-fecundação e cruzamentos preferenciais, e teriam populações estruturadas geneticamente, não se aplica a esta população de Cedrela .fissilis. As principais conclusões deste trabalho são: 1. A diversidade genética apresentada pela população estudada de Cedrela fissilis (H=0,222) está na média das populações de espéciés arbóreas tropicais já estudadas. 2. Cedrela fissilis é uma espécie preferencialmente alógama (tm=0,92), porém pode apresentar variações da taxa de cruzamento entre árvores (tindividual entre 0,62 e 1,08). 3. O fluxo gênico via pólen em Cedrelafissilis pode ocorrer a longa distância (acima de 950 m) o que condiz com as grandes distâncias encontradas entre indivíduos. 4. A população de Cedrela fissilis não apresenta estruturação genética, o que evidencia que o fluxo gênico é suficientemente amplo para prevenir a formação de estrutura genética a partir da deriva genética e/ou da seleção local. 5. Os resultados obtidos sobre o fluxo gênico via pólen, sistema reprodutivo e distribuição espacial dos genótipos são concordantes entre si e são coerentes com a baixa densidade da população / Abstract: A natural population of Cedrela fissilis Vell. (Meliaeeae) was surveyed with the aim of estimating the genetic diversity and the outerossing rate of arare tree species, that is, a species with low populational density. The population site was at the Fazenda Intervales belonging to the "Fundação para a Conservação e Produção Florestal do Estado de São Paulo", located at Sete Barras - São Paulo State. In the study area, Cedrelafissilis is arare species, weere 34 adult trees occur in an area of 270 ha (mean density of one tree for 8 ha). To estimate the genetic parameters, the technique of isozyme eleetrophoresis in horizontal straeh gels was applied. Thirty-four adult trees and 5 families with 30 individual each, formed from seeds collected directly from 5 trees of the population were analized. Seven enzymatie systems (6-PGDH, PGI, G2DH, IDH, MDH, PO), resulting in 13 genetic loci, were utilized.For adult trees, the parameters was: mean heterozigosity = 0.222, heterozigosity for the polimorphic loci = 0.288, percentage of polimorphi lo i = 76.9% and mean number of alleles per loeus = 2.31. For families, the parameters was: mean heterozigosity = 0.193, heterozigosity for the polimorphie loei = 0.228, percentage of polimorphi loei = 84.6% and mean number of alleles per loeus = 2.38. The adult population was in Hardy-Weinberg equilibrium, but the families differed significantly from the equilibrium expectations. The mean apparent outerossing rat~ (ta) estimated from the coefficient of inbreeding was 0.85. The multiloeus outerossing rate (tm) was 0.92, but the individual outcrossing rates for each tree varied from 0.62 to 1.08. The mean single outcrossing rates (ts) was 0.83, therefor lower than tm, but did not differ significantly from it. All mother trees were fertilized by an homogeneous pollen pool, indicating random outcrossing. Utilizing alIeles exclusives to the families, the minimum distance of pollen flow (distance between the mother tree and the border of the surveyed area) was estimated and reached 950 m. To study the spatial genetic structure, spatial autocorrelation analysis through the I index of Moran was utilized. The small number of significant values showed that spatial distribution of genotypes is random. The results of this research show that the population of Cedrela fissilis, in spite of having a low density of adult trees, exhibits a high outcrossing rate, extensive polIen flow, random outcrossing and random spatial distribution of genotypes. Therefore, the presumptions that rare species exhibit limited gene flow by polen, show self-fertilization and biparental breeding, and have genetic structured populations do not apply to this population of Cedrela fissilis. The main conclusions of this study are: 1. :rhe genetic diversity showed by this population ofCedrelafissilis (H=O.222) is on the average for the populations of tropical tree species already studied. 2. Cedrelafissilis is preferably alogamous (tm=0.92), but can show variations among trees in the outcrossing rate (tindividual between 0.62 and 1.08). 3. The gene flow by pollen in Cedrelafissilis can reach a considerable distance (over 950m) agreeing with the low density of trees. 4. The population of Cedrela fissilis does not show genetic structure, suggesting that gene flow is sufficiently wide to prevent genetic structuring due to genetic drift and/or local selection. 5. The results for gene flow by pollen, breeding system and spatial distribution of genotypes agree amongst each other and are coherent with the low population density / Mestrado / Mestre em Ciências
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Melhoramento genético do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) para alto teor de proteínas / Genetic improvement of common bean (Phaseolus vulgaris L.) for high protein content

Silva, Maguida Fabiana da 18 February 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T14:25:02Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 314241 bytes, checksum: 482f255a265e7117d2b92fc2816fc6a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T14:25:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 314241 bytes, checksum: 482f255a265e7117d2b92fc2816fc6a0 (MD5) Previous issue date: 2004-02-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O feijão é um dos constituintes básicos da dieta do brasileiro, além de ser um produto agrícola de grande valor econômico-social. Neste sentido, para atender as exigências dos consumidores, os programas de melhoramento começam a voltar atenção para características de qualidade do grão. Este trabalho faz parte do programa de melhoramento de qualidade do feijoeiro desenvolvido pelo BIOAGRO/UFV em parceria com a Embrapa - Arroz e Feijão e visa o aumento do teor de proteínas nos grãos do feijoeiro por meio de retrocruzamentos assistidos por marcadores moleculares. Foram utilizadas as variedades Baliza, Laranja, Gaurama e PVA 109 como fontes doadoras de genes para alto teor de proteína e a linhagem CNFC 7827 como genitor recorrente. Para atingir este objetivo as seguintes etapas foram realizadas: (a) realização de cruzamentos entre genótipos de alto teor de proteína com uma linhagem elite; (b) análise do teor de proteína de cerca de 400 sementes segregantes (F 2 ) de cada cruzamento por método não destrutivo; (c) seleção das sementes com maior teor de proteína de cada cruzamento (intensidade de seleção de 10%); (d) realização de fingerprinting das plantas F 2 selecionadas com marcadores RAPD; (e) retrocruzamentos de todas as plantas F 2 selecionadas com o genitor recorrente; (f) confirmação do teor de proteína pelo método Kjeldahl nas sementes F 2:3 ; (g) seleção das plantas RC 1 F 1 com base nos resultados de distância genética determinada com marcadores moleculares e o teor de proteína das plantas F 2 selecionadas e confirmadas na geração F 2:3 . Todas as populações tiveram herdabilidades altas variando de 58 a 77 %, o que sugere que são adequadas para obter alta eficiência de seleção ou estudos de mapeamento para a característica teor de proteína. Os ganhos gerais variaram e - 0,95 a 4,26%, este resultado indica que a seleção em F 2 tem baixa eficiência quando utilizada isoladamente. Entretanto, a ampla variação do teor de proteína em progênies F 2:3 e as porcentagens de ganho observadas (13,66 a 25,84% considerando as cinco progênies de maiores teores) demonstram que o processo de transferência de genes para alto teor protéico por meio de retrocruzamentos é eficiente quando baseado na pré-seleção de sementes F 2 e posterior seleção das melhores famílias F 2:3 . A seleção em geração F 2 com auxílio de micro análise não destrutiva foi pouco eficiente para a população derivada do cruzamento Laranja x CNFC 7827. Fatores como o efeito de dominância e interações genótipo x ambiente diferenciadas causaram dificuldades na seleção dos genótipos superiores. Em vista deste resultado, modificações no método de seleção utilizado podem ser propostas visando aumentar sua eficiência. Os ganhos de seleção para teor de proteína com o auxílio de marcadores moleculares variaram entre 9,92 a 15,65%. As plantas F 2 das diferentes populações apresentaram distância genética em relação ao progenitor recorrente bastante variável. Foi possível obter ganhos de similaridade em relação à média de similaridade encontrada nas populações F 2 variando de 12 a 16%. Com a utilização indivíduos selecionados de alto teor de proteína mais próximos ao genitor recorrente o número de retrocruzamentos necessários para recuperar o genoma do mesmo deve ser menor. / The common bean is one of the most important component of the brazilian diet, in addition, is an agricultural product of great economic and social importance. In this sense, to attend the consumers exigencies, the breeding programs start to give attention for quality traits of the grain. This work is part of the quality bean breeding program being developed by BIOAGRO/UFV in partnership with Embrapa - Rice and Bean center and aims to increase the common bean protein content by means of backcrosses assisted by molecular markers. There were used the varieties Baliza, Laranja, Gaurama and PVA as gene donors for high protein content and the CNFC 7827 as recurrent genitor. To achieve this goal, specific steps were reached: (a) crossings high protein content genotypes with an elite cultivar (b) analysis of protein content of 400 F 2 seeds from each cross by using non-destructive method; (c) selection of seeds with high protein content from each cross (selection intensity of 10%); (d) fingerprinting the F 2 selected plants with RAPD markers; (e) backcrosses the selected F 2 plants with the recurrent genitor; (f) confirmation the protein content in the F 2:3 seeds by the Kjeldahl method; (g) selection and planting the RC1F1 based on genetic distances, obtained with molecular markers, and protein content of the F 2 plants selected and confirmed in the F2:3. All the populations had a high heritability varying from 58 to 77%, which suggested that they are adequate for selection or protein mapping loci. The general gains varied from - 0.95 to 4.26%, which indicates that the selection in F 2 has low efficiency when used isolated. However, the wide variation of protein content in F 2:3 and the gains observed (13,66 to 25,84% considering the five F 2:3 of high protein contents) demonstrate that the genes transfer process for high protein content by backcrosses is efficient when based on pre-selection of F 2 seeds and posterior selection of the best F 2:3 families . The selection gains for protein using molecular markers varied from 15.65 to 9.92%. The F 2 plants of the different populations had genetic distances regarding the recurrent genitor highly variable. It was possible to obtain similarity gains, regarding the similarity average found in the F 2 populations, varying from 12 to 16%. With the utilization of selected individuals of high protein content and genetically closer to the recurrent progenitor the number of backcrosses necessary to recover the genome of the recurrent should be smaller.

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