L'usage d'animaux axéniques comme modèles a augmenté exponentiellement dans les dernières années en recherche expérimentale. Afin de conserver leur statut axénique, les animaux doivent être contenus dans des isolateurs traditionnels ou des isolateurs au niveau de la cage, incluant la cage scellée à pression positive de Tecniplast : l'Isocage. Cependant, le moyen le plus efficace de confirmer leur statut axénique des animaux reste incertain, particulier pour les isolateurs au niveau de la cage, comportant un plus grand risque de contamination que l'isolateur traditionnel en raison de leur contact plus fréquent avec l'environnement extérieur. Ce projet de maîtrise a pour buts de gérer le risque de contamination associé à l'Isocage en optimisant la désinfection par immersion et en déterminant l'efficacité des mesures de précautions axéniques, puis finalement de déterminer l'efficacité des mesures de détection à démontrer la présence de contaminants en cages axéniques Les travaux d'optimisation de la désinfection par immersion a permis de déterminer la charge microbienne résiduelle retrouvée à la surface des Isocages entre deux changements de cage, d'évaluer l'efficacité sporicide de deux désinfectants, et finalement de déterminer le temps optimal de désinfection pour l'immersion des cages axéniques lors d'un changement de cage selon la concentration du désinfectant utilisé. L'efficacité de mesures de précaution axéniques a été confirmée en comparant les flores microbiennes retrouvées à la surface de cages contenues dans des locaux axéniques et non axéniques. L'efficacité des mesures de détection à démontrer la présence de contaminants en Isocage a été déterminée en développant, validant et optimisant trois différentes méthodes, puis en testant in situ leur efficacité à détecter des contaminants artificiellement introduits dans des cages axéniques. Cet ouvrage constitue un apport important au domaine puisqu'il est l'un des premiers à aborder la gestion des risques et l'efficacité des méthodes de détection lors d'utilisation de l'Isocage et du bassin d'immersion annexé à la station de biosécurité avec des animaux axéniques. / The use of axenic animals as models have increased exponentially in recent years in experimental research. In order to maintain their axenic status, animals must be contained in traditional isolators or isolators at the cage level, which includes Tecniplast's sealed positive pressure Isocage. However, the most effective way to confirm animal axenic status remains uncertain, especially for cage-level isolators, which carry a greater risk of contamination than the traditional isolator due to their most frenquent contact with outer environment. This Master's project aims were to manage the risk of contamination associated with Isocage by optimizing disinfection by immersion and determining the effectiveness of axenic precautionary measures; then finally to determine the effectiveness of the detection measures to demonstrate the presence of microbial contaminants in axenic Isocages. The optimization of disinfection by immersion made it possible to determine the residual microbial load found on the surface of Isocages between two cage changes, to evaluate the sporicidal efficiency of two disinfectants, and finally to determine the optimal disinfection time for the immersion of the axenic cages during a change of cage depending on the concentration of disinfectants used. The effectiveness of axenic precautionary measures has been confirmed by comparing the microbial flora found on the surface of cages contained in axenic and non-axenic rooms. The effectiveness of detection measures to demonstrate the presence of contaminants in Isocage has been determined by developing, validating and optimizing three different methods, then by testing in situ their effectiveness to detect contaminants artificially introduced into axenic cages. This work constitutes an important contribution to the field since it is one of the first to discuss risk management and the effectiveness of detection methods when using Isocage and the immersion basin attached to the biosecurity station with axenic animals.