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Collective effects in living matter : from cytokinetic rings to epithelial monolayers / Effets collectifs dans la matière vivante : des anneaux de cytokinèse aux monocouches épithéliales

Thiagarajan, Raghavan 26 September 2016 (has links)
L’émergence de comportements collectifs cellulaires n’est pas bien comprise. Nous l’abordons dans deux systèmes biologiques. A l'échelle du micromètre lors de la constriction de l’anneau cytokinétique, nous montrons que des complexes d’acto-myosine s’auto-organisent sous forme d’agrégats dans la levure à fission et dans la cellule de mammifères. Ces auto-organisations découlent de règles d'interactions communes mais pour des fonctions distinctes, le transport et la génération de stress respectivement. A l'échelle de 100 micromètres, nous observons des pulsations corrélées de cellules épithéliales. Nous montrons les rôles du frottement avec la surface, et le couplage entre l’aire cellulaire, sa hauteur et sa contractilité. Nous présentons aussi deux études, des polyamines synthétiques pour étudier la polymérisation d'actine in vivo, puis l’inversion de sens dans la migration - la ratchetaxie. Cette thèse illustre l'importance des phénomènes physiques dans la dynamique cellulaire. / The emergence of collective behavior from the interaction of individual units is not clear. In this thesis, we address this question in two different systems at different scales. At the micrometer scale during cytokinetic ring constriction, we show that acto-myosin self-organizes into rotating and static clusters in fission yeast and mammalian cells. These self-organizations arise from common interaction rules, but to serve distinct functions, transport and stress generation respectively. At 100 micrometers scale, we report correlated pulsations of cells in an epithelial monolayer. We show the key roles of substrate friction, and the tight coupling between cell area, cell height and contractility. We also present two other studies: synthetic polyamines for studying actin polymerization in vivo, and direction reversal in single cell migration during ratchetaxis. Altogether, this PhD illustrates the importance of physical phenomena in cellular dynamics.
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Active gels in vivo : patterns and dynamics in cytokinetic rings and their functions in cell division / Gels actifs in vivo : structures et dynamiques dans l'anneau de cytokinètique et leurs fonctions dans la division cellulaire

Wollrab, Viktoria 08 September 2014 (has links)
Les structures d'acto-myosine sont impliquées dans de nombreuses fonctions cellulaires. Comprendre leur organisation et leur comportement collectif est toujours difficile. Nous avons étudié l'anneau cytokinétique dans les cellules de mammifères et dans les levures de fission, en orientant les cellules dans les microcavités, ce qui permet de voir l'anneau dans un seul plan focal. Avec cette configuration, nous révélons de nouvelles structures et des dynamiques distinctes pour les deux systèmes cellulaires. Dans les cellules de mammifères, nous trouvons des motifs réguliers de la myosine et la formine. Les caractéristiques de ces motifs sont stables tout au long de sa fermeture et leur apparition coïncide avec la constriction. Nous proposons que ce phénomène est une propriété inhérente du réseau d'acto-myosine et que la formation de ces motifs entraîne une augmentation du stress. Ces hypothèses sont confirmées par notre modèle en champ moyen. Par contraste, l'anneau de levure de fission montre des inhomogénéités tournantes de l'actine, de la myosine, des protéines de la construction de la paroi (Bgs) et d'autres protéines. La dynamique des inhomogénéités de myosine est inchangée, si la croissance de la paroi est inhibée. Cependant, l'inhibition du mouvement des inhomogénéités conduit à l'arrêt de la fermeture. Nous proposons que la fermeture de l'anneau est entraînée par la rotation de l'actine et de la myosine qui tirent des protéines Bgs, lesquelles construisent ainsi le septum. Cette hypothèse est confirmée par nos calculs et par des simulations numériques. Nous suggérons que la transition entre les états de différents ordres et dynamiques pourrait être une façon de réguler in vivo les systèmes d'acto-myosine. / Actomyosin structures are involved in many cell functions. Understanding their organization and collective behavior is still challenging. We study the cytokinetic ring in mammalian cells and in fission yeasts, by orienting cells in microcavities. This allows seeing the ring in a single plane of focus. With this setup, we reveal new structures and distinct dynamics for both cellular systems. In mammalian cells we find a pattern of regular clusters of myosin and formin. The characteristics of this pattern are stable throughout closure and its formation coincides with the onset of constriction. We propose that its characteristic is an inherent property of the actomyosin network and that its formation leads to an increase in stress generation. These hypotheses are supported by our theoretical mean field model. In contrast, fission yeast rings show rotating inhomogeneities (speckles), i.e. rotations of actin, myosin, cell wall building proteins (Bgs) and other proteins. Myosin speckles dynamic is unchanged, if wall growth is inhibited. However, the inhibition of speckle motion leads to stalled closure. We propose that the ring closure is driven by the rotation of actin and myosin, which pull Bgs thereby building the septum. This model is supported by our calculations and by numerical simulations. We suggest that the transition between states of different orders and dynamics might be a way to regulate actomyosin systems in vivo.

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