La vaccination est souvent mal perçue par la population générale. Pour rassurer cette dernière, il serait intéressant de créer une plateforme vaccinale pouvant prédire, in vitro, les risques associés à la prise d’un vaccin. L’objectif de cette thèse est de mettre au point les prémices de cette plateforme. Le principe est simple: obtenir la signature inflammatoire d’un vaccin candidat pour évaluer son innocuité. Pour cela, cette signature sera comparée à celles obtenues par des vaccins actuellement sur le marché ou induites par des pathogènes.Durant cette thèse, nous avons sélectionné une liste de biomarqueurs pouvant être utilisés pour déterminer la signature inflammatoire d’un vaccin. Pour mettre au point cette liste, nous avons utilisé différents modèles inflammatoires (VIH et ligands TLR) et la cytométrie de masse. Par la suite, nous avons mis au point des tests in vitro pour obtenir les signatures inflammatoires induites par le Vaccinia Virus ou le Modified Vaccinia virus Ankara, tous deux utilisés pour éradiquer la variole. Nous avons identifié des signatures inflammatoires spécifiques pour chacun de ces virus, à la fois chez des individus sains et chez des patients infectés par le VIH.La poursuite de ces études, par l’obtention d’un grand nombre de signatures provenant de vaccins sur le marché ou induites par des pathogènes, pourrait permettre de finaliser la mise en place de cette plateforme. En effet, l’obtention de ces dernières permettrait d’obtenir des signatures de référence qui pourraient prédire la dangerosité d’un vaccin. / Vaccination is often not well regarded by the general population. To reassure this latest, it will be interesting to set up an in vitro platform predicting the vaccine safety. The aim of this thesis is to develop the beginnings of this platform. The principle is simple, to get inflammatory signature of a candidate vaccine to evaluate it safety. For that, this signature will be compared with those obtained by vaccine currently on the market or by pathogens.During this thesis, we selected a list of biomarkers that can be used to determinate the inflammatory signature of a vaccine. To obtain this list, we used different inflammatory models (HIV and TLR ligands) and the mass cytometry. Then, we had developed in vitro test to obtain inflammatory signatures induced by Vaccinia Virus or Modified Vaccinia virus Ankara, each used to eradicate the smallpox. We identified specific inflammatory signatures for each virus, both in healthy individuals and HIV-infected humans.The continuation of these studies, by obtaining a large number of signatures coming from vaccines on the market or induced by pathogens, could make it possible to finalize the setting up of this platform. Indeed, the obtaining of the latter would make it possible to obtain reference signatures which could predict the dangerousness of a vaccine.

Les anticorps sont des corrélats de protection pour différents vaccins qui sont sur le marché. Une meilleure connaissance des modes d’action des vaccins au cours de la primo-vaccination et des rappels sont nécessaires pour améliorer ceux déjà disponibles et ceux en cours de développement.En développant un pipeline d’analyse des données de cytométrie en masse, nous avons étudié l’hétérogénéité des cellules B de macaques et établi un atlas des cellules B dans diffèrent organes.Nous avons démontré que les cellules B du sang sont enrichies au cours du temps après la primo vaccination et/ou le rappel. Quand nous comparons la réponse humorale de 2 stratégies de vaccination, nous découvrons qu’à différence du rappel précoce (2 semaines après la primo-vaccination), le rappel classique (2 mois après la primo-vaccination) permet le développement des IgA, de la maturation d’affinité, des nAbs, d’ADCC et des cellules B spécifique du vaccin. Ces résultats montrent le rôle principal du décalage entre la primo vaccination et rappel. / The exact immunological event involved in the induction of long-term humoral memory induced by vaccines remain unknown. Antibody and B lymphocyte responses are dynamics and change progressively over time after a first antigen encounter. A second immunization perturbates this continuous evolution and modifies these cells and proteins tremendously. My goal was to characterize in depth vaccine-induced B cell response in the context of prime-boost immunizations because the optimal vaccine schedule is not precise enough and we lack a clear knowledge of the mechanisms behind this assumption. I utilize a model of non-human primates (NHP) immunized with Modified Vaccinia Ankara (MVA). I was interested in different events concerning the humoral immune response induced by MVA and used complementary tools to generate high throughput data, such as mass cytometry, and serology. It was developed tools to study macaque B cells longitudinally, including vaccine-specific B cells, using high-dimensional cytometry data (by developing a mass cytometry Ab panel and analytical tools). I mapped the phenotypic diversity of B cells across relevant tissues (blood, lymph nodes, spleen, and bone marrow), analyzed the Ab and B cell subsets dynamics over time and after one or two immunizations, and compared the Ab response after a short vs. a longer delay between prime and boost. Thus, these data point to a direct role for longer delay between prime and boost that allow better maturation of the humoral immune response, providing insights into how vaccine specific memory B cells may be enhanced to drive affinity maturation in new vaccine approaches.