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Synthèses et applications de nouveaux ligands pyrroliques et méthodologies de synthèse de phosphines P-chirogéniques / Synthesis and applications of new ligands derived from pyrrole and methodologies for the synthesis of P-chirogenic phosphinesCopey, Laurent 27 November 2014 (has links)
Deux thématiques principales ont été étudiées au cours de cette thèse. La première partie porte sur la synthèse de complexes de manganèse dérivés de porphyrines et de salens. L'activité catalytique de ces complexes a été évaluée dans l'époxydation d'alcènes non-Fonctionnalisés. Suite à cette étude, les propriétés électroniques des ligands ont été étudiées, notamment par le biais de la complexation d'anions. Dans une deuxième étape, nous nous sommes intéressés à la synthèse de phosphines P-Chirogéniques. Afin de trouver un substitut à l'éphédrine, couramment utilisée dans ces synthèses, des dérivés du (1S,2S)-2-Aminocyclohexanol et de la D-Glucosamine ont été synthétisés. L'utilisation de groupements sulfonamides a permis l'obtention aisée d'oxazaphospholidines N-Tosylées. L'un ou l'autre diastéréoisomère de cet hétérocycle peut être obtenu en fonction du degré d'oxydation du réactif phosphoré utilisé. Avec cette stratégie, divers oxydes de phosphines ont été obtenus avec de bons rendements et de bonnes énantiosélectivités / This thesis is divided in two parts. The first part focuses on the synthesis of manganese complexes derived from porphyrins and salens. The catalytic activity of these complexes were evaluated toward the epoxidation of unfunctionalized alkenes. Next, the electronic properties of the ligands were evaluated using their anion binding properties. In a second part, we were interested in the synthesis of P-Chirogenic phosphines. In order to find a surrogate to ephedrine, that is commonly used in those syntheses, derivatives from (1S,2S)-2-Aminocyclohexanol and D-Glucosamine were synthesized. The use of sulfonamides allows the access to N-Tosylated oxazaphospholidines. Both diastereoisomers could be synthesized depending on the oxydation state of the phosphine precursor. Using this strategy, various phosphine oxides were obtained in good yields and enantioselectivities
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Production of Sialic Acid Analogs in Engineered E. coli: Characterization of Amino Sugar RecyclingVillegas-Peñaranda, Luis Roberto 06 November 2019 (has links)
This research focused on the study of the amino sugar recycling and sialic acid degradation pathway as a possible entry point for N-acyl glucosamines for the production of sialic acid analogs. Meeting this objective would allow the development of a bacterial strain capable of producing non-natural nonulosonic acids that could be used in the development of medicines, vaccines or useful compounds for the study of interactions between pathogenic organisms and their host.
The first step was to understand how N-acetyl-D-glucosamine-6-phosphate deacetylase reacts to different types of substrates in order to determine its tolerance to the size of acyl groups in acyl amino sugars. This was achieved by studying the enzymatic activity in an in vitro system. We determine that the enzyme has a preference for small and slightly bulky acyl groups. Then, an in silico docking modeling and an in vivo system experiment were carried out. These experiments allowed to confirm the previous results.
The second project was carried out due to the uncertainty of whether the kinase involved in the catabolic pathway would be able to phosphorylate the substrates. By quantifying residual ATP, the high specificity of N-acetyl-D-glucosamine kinase could be verified. This result led us to think about the design of an organic synthesis strategy that would allow the phosphorylation of glucosamine in carbon 6. A simple synthetic route was designed based on the protection of the two most reactive moieties of the amino sugars and the reactivity of the hydroxy group on carbon 6. However, we had problems with the purification step of the final product due to its high polarity.
The next stage of this investigation was to confirm the transformation of GlcNAc into ManNAc. For this, an NMR analysis was designed that would detect the presence of both sugars in the reaction system. The epimerization of ManNAc to GlcNAc was detected successfully. Notwithstanding, the reverse reaction could not be detected. Based on the results obtained in the previous stage, we realized that an error was made in the epimerization reaction since we placed the wrong kinase because we did not take into account its substrate specificity.
Finally, we tried to produce sialic acid analogs in a fermentative system using different genetic variants of Escherichia coli. Two of the expected analogs, Neu5Pr and Neu5nBu, were obtained. In addition, NagA activity towards substrates with small acyl groups was confirmed.
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Mise au point d'une nouvelle voie d'accès aux iminosucres C-glycosides à six et sept chaînons dérivés du D-glucopyranose et de la N-acétyl-D-glucosamine / Design of new synthetic route of six and seven membered iminosugar-C-glycosides derived from D-glucopyranose and N-acetyl-D-glucosamineFontelle, Nathalie 20 December 2013 (has links)
Les iminosucres, analogues de sucres dont l'oxygène intracyclique a été remplacé par un azote, constituent une classe importante de mimes de sucres. Introduire une chaîne alkyle sur le carbone pseudo-anomérique donne accès à une classe importante d'iminosucres, les iminosucres C-glycosides, qui peuvent être des inhibiteurs de glycosidases puissants et sélectifs.Le principal défi associé à la synthèse d'iminosucres C-glycosides est la mise au point de voies de synthèse efficaces et applicables à tous types de sucres permettant ainsi d'accéder à une grande diversité de synthons et d'accélérer la découverte de molécules d'intérêt biologique.Ce travail de thèse a consisté dans un premier temps à élaborer une synthèse efficace et convergente d'iminosucres C-glycosides à six et sept chaînons, à partir d'un précurseur commun, le 6-azido-6-désoxy-2,3,4-tri-O-benzyl-D-glucopyranose. Cette nouvelle méthode implique une réaction tandem Staudinger/Aza-Wittig ainsi qu'une isomérisation de cycle d'azépanes stéréocontrolée.La deuxième partie de ce manuscrit traite de l'extension de cette méthodologie à la synthèse de nouveaux D- et L-iminosucres C-glycosides à six chainons mimes de la N-acétyle-D-glucosamine.La dernière partie de ce travail a été consacrée à la synthèse d'iminosucres-aza-couronnes, qui constituent un nouveau type de récepteur moléculaire. L'étude de leur capacité à complexer des métaux a été effectuée par des techniques de RMN ou fluorimétrie et a donné des résultats prometteurs. / Iminosugars, sugar analogs in which the endocyclic oxygen has been replaced by a nitrogen, constitute a major class of sugar mimetics. Introducing an alkyl chain at the pseudoanomeric carbon position leads to another class of important iminosugars, the iminosugars C-glycosides that can be potent and selective glycosidase inhibitors. The main challenge associated with iminosugars C-glycosides synthesis is currently the design of efficient and general routes applicable to any starting sugar and enabling introduction of structural diversity from advanced synthons to accelerate the discovery of biologically relevant molecules.The first part of this work focused on the development of an efficient and convergent synthesis of six and seven membered iminosugars C-glycosides from a common 6-azido-6-deoxy-2,3,4-tri-O-benzyl-D-glucopyranose precursor. This new methodology involves a highly diastereoselective tandem ring enlargement/alkylation and a stereocontrolled ring contraction.The second part of the thesis delt with the extension of the methodology to access six-membered D- and L-iminosugars C-glycosides derived from N-acetyl-D-glucosamine.The third part of this work was devoted to the synthesis of iminosugar-aza-crowns, which constitute a new type of molecular receptors, using the synthetic route developed in the first part. The ability of these compounds to complex metals was studied either by NMR or fluorimetric techniques and showed promising results.
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D-glucosamine as "green" substrate in synthesis of ligands for asymetric catalysis / D-glucosamine comme "vert" substrat dans la synthèse de ligands pour la catalyse asymétriqueWojcik, Karolina 22 October 2012 (has links)
Plusieurs ligands dérivés de la D-glucosamine, conçus pour différentes réactions catalytiques,ont été synthétisés. Les ligands pour la catalyse homogène basés sur 1,2-glucodiamine ontété préparés, et utilisés dans des réactions d'alkylation allylique, d'hydrogénation et d'additionde Michael.La D-glucosamine a utilisee pour la preparation de catalysateur type de SPAC (SupportedAqueous Phase Catalyst). Ce catalysateur hétérogène été utilisé avec de très bons résultatsdans les réactions de couplage croisé de Suzuki Miyaura. Le catalyseur a également étérecyclé. Des essais de préparation de ligands greffés sur une matrice de silice de type SBA-15ont été réalisés ainsi que des ligands à base de poly (éthylène) glycol. / Several ligands derived from D-glucosamine, designed for different catalytic reactions havebeen synthesized. The ligands for homogeneous catalysis based on 1,2-glucodiamine wereprepared, and used in reactions of allylic alkylation, hydrogenation and Michael addition.Supported Aqueous Phase Catalyst (SAPC) system was prepared from D-glucosamine anduse with very good results in Suzuki Miyaura cross coupling reactions. Catalyst was alsorecycled. Attempt to prepare ligands grafted on SBA-silica matrix were made as well asligands containing poly(ethylene) glycol moiety.
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Labeled Mimics of N-Acetyl-D-FucosamineEvans, Michael Ryan 13 May 2008 (has links)
No description available.
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D-glucosamine as "green" substrate in synthesis of ligands for asymetric catalysisWojcik, Karolina 22 October 2012 (has links) (PDF)
Several ligands derived from D-glucosamine, designed for different catalytic reactions havebeen synthesized. The ligands for homogeneous catalysis based on 1,2-glucodiamine wereprepared, and used in reactions of allylic alkylation, hydrogenation and Michael addition.Supported Aqueous Phase Catalyst (SAPC) system was prepared from D-glucosamine anduse with very good results in Suzuki Miyaura cross coupling reactions. Catalyst was alsorecycled. Attempt to prepare ligands grafted on SBA-silica matrix were made as well asligands containing poly(ethylene) glycol moiety.
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Symbiose mycorhizienne : développement de nouvelles méthodes pour la synthèse de glycoconjugues bioactifsStevenin, Arnaud 23 September 2011 (has links) (PDF)
Les symbioses bactérie-légumineuse (nodulation) et champignon-plante (mycorhization) présentent un intérêt agrobiologique et écologique majeur ; elles permettent aux plantes de croître naturellement sur un sol aride et peu fertile. Il a été démontré très récemment que les signaux impliqués dans la mise en place de la symbiose endomycorhizienne à arbuscule (facteurs "Myc") sont très proches de ceux de la nodulation. Il s'agit de molécules appartenant à la famille des lipo-chitooligosaccharides. Afin de réaliser la synthèse de ces molécules, deux nouvelles méthodologies ont été développées. L'ouverture oxydante d'acétals de 4,6-O-benzylidène de plusieurs glycopyranosides (en série gluco, galacto et manno) par le diméthyldioxirane (DMDO) a été étudiée. Le contrôle de la régiosélectivité a été effectué grâce au groupement protecteur introduit sur la fonction alcool de la position 3. La formation directe de β-glycosides de la N-acétyl-D-glucosamine par catalyse au triflate de fer (III) a été étudiée. La réaction a été menée sous irradiation micro-ondes ou en flux continu (système minifluidique Vapourtec®). Une nouvelle stratégie pour la synthèse du facteur [Myc-IV (C16:0, S)] a ensuite été établie. Nous avons utilisé un réactif peu toxique et non odorant pour introduire le motif thio nécessaire à la formation de deux liaisons glycosidiques. Le disaccharide précurseur de l'unité réductrice a été obtenu grâce à la première méthodologie développée au cours de cette thèse.
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Ligands dérivés de saccharides et, ou supportés par un bras poly(éthylène) glycol : synthèse et applications en catalyse organométallique / Ligands derived from saccharides and, or supported on poly(ethylene) glycol arm : synthesis and applications in organometallic catalysisAdidou, Ouissam 16 October 2009 (has links)
La synthèse de deux familles de ligands a été envisagée. La première famille de ligands concerne la préparation de nouveaux ligands dérivés de la D-glucosamine ou du D-glucose qui seront engagés dans la réaction de substitution allylique de type Tsuji-Trost en phase homogène. La deuxième famillede ligands concerne la préparation de ligand supportés par un bras poly(éthylène) glycol et dérivés dela D-glucosamine ou de la di-(2-pyridyl)méthylamine. Ces ligands hydrosolubles ont été engagés dans deux réactions pallado-catalysées en phase aqueuse à savoir la substitution allylique de type Tsuji-Trost et la réaction de couplage croisé de type Suzuki-Miyaura, respectivement. / Ligands derived from saccharides and, or supported on poly(ethylene) glycol arm: synthesis and applications in organometallic catalysis. The synthesis of two types of ligands has been investigated. The first family of ligands has been the preparation of new ligands derived from D-glucosamine or D-glucose, which have been tested in the allylic substitution of Tsuji-Trost in homogeneous phase. The second one has een the preparation of ligand supported on poly(ethylene) glycol arm and derived from D-glucosamine or di-(2- pyridyl)methylamine. These last hydrosoluble ligands have been tested in two Pd-catalyzed reactions in aqueous phase: the allylic substitution of Tsuji-Trost and the cross-coupling Suzuki-Miyaura reaction, respectively.
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Symbiose mycorhizienne : développement de nouvelles méthodes pour la synthèse de glycoconjugues bioactifs / Mycorrhizal symbiosis : development of new methods for synthesis of bioactive glycoconjugatesStevenin, Arnaud 23 September 2011 (has links)
Les symbioses bactérie-légumineuse (nodulation) et champignon-plante (mycorhization) présentent un intérêt agrobiologique et écologique majeur ; elles permettent aux plantes de croître naturellement sur un sol aride et peu fertile. Il a été démontré très récemment que les signaux impliqués dans la mise en place de la symbiose endomycorhizienne à arbuscule (facteurs "Myc") sont très proches de ceux de la nodulation. Il s'agit de molécules appartenant à la famille des lipo-chitooligosaccharides. Afin de réaliser la synthèse de ces molécules, deux nouvelles méthodologies ont été développées. L'ouverture oxydante d'acétals de 4,6-O-benzylidène de plusieurs glycopyranosides (en série gluco, galacto et manno) par le diméthyldioxirane (DMDO) a été étudiée. Le contrôle de la régiosélectivité a été effectué grâce au groupement protecteur introduit sur la fonction alcool de la position 3. La formation directe de β-glycosides de la N-acétyl-D-glucosamine par catalyse au triflate de fer (III) a été étudiée. La réaction a été menée sous irradiation micro-ondes ou en flux continu (système minifluidique Vapourtec®). Une nouvelle stratégie pour la synthèse du facteur [Myc-IV (C16:0, S)] a ensuite été établie. Nous avons utilisé un réactif peu toxique et non odorant pour introduire le motif thio nécessaire à la formation de deux liaisons glycosidiques. Le disaccharide précurseur de l'unité réductrice a été obtenu grâce à la première méthodologie développée au cours de cette thèse. / Arbuscular mycorrhiza (AM) is a root endosymbiosis between plants and fungi. It has an agrobiological interest and a crucial ecological importance because it allows plants to grow on aride and infertile soil. Recently, the structure of the symbiotic signal "Myc factor" was identified as a mixture of lipochitooligosaccharides (LCOs). In order to propose a new synthesis of LCOs, we developed two green methodologies in glycochemistry. We performed the oxidative cleavage of 4,6-O-benzylidene acetals of various glycopyranosides (gluco, manno and galacto series) with dimethyldioxirane (DMDO) and its regioselective control with a suitable protecting group at position 3. We investigated the formation of β-glycoside of N-acetyl-D-glucosamine using catalytic iron (III) triflate. The reaction can be performed using microwave irradiation or, for scale-up synthesis, flow chemistry using Vapourtec® minifluidic system. We establish a new strategy for the total synthesis of the most abundant Myc factor [Myc-IV (C16:0, S)]. We used odorless and few toxic MbpSH reagent to introduce the activated thio residue involved in two glycosylation reactions. The disaccharide acceptor precursor of the reducing end was obtained after oxidative cleavage of the 4,6-O-benzylidene moiety by DMDO.
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