Os centros de manutenção de aeronaves da América Latina possuem portfólios de serviços limitados e esse é um fator que restringe o crescimento do transporte aéreo na região. Faz-se necessário, portanto, o desenvolvimento de novos serviços de reparo de aeronaves e seus componentes nesses centros. Apesar de o Desenvolvimento de Produtos ter recebido uma atenção substancial na ultima década, há pouca literatura sobre o Desenvolvimento de Serviços e trabalhos que tratam de gestão de portfólio de serviços são ainda mais escassos. A pouca literatura existente não é suficientemente abrangente para tratar da gestão de portfólio de serviços de manutenção complexa. O objetivo deste trabalho é, portanto, desenvolver um processo de gestão de portfólio de serviços para empresas de manutenção aeronáutica, chamado de modelo específico. O desenvolvimento do modelo será feito utilizando a pesquisa-ação, abordagem que objetiva tanto a tomada de ação quanto a criação de conhecimento com ciclos contínuos. Durante a criação do modelo específico foram usados como base de conhecimento modelos de referência de PDP e PDS, posteriormente adaptados para a realidade de serviços, para a região e tipologia da indústria. A pesquisa ação se iniciou numa pré-fase de contextualização, seguida por quatro ciclos, sendo que em cada ciclo uma etapa do modelo foi desenvolvida e avaliada, resultando em um modelo especifico de gestão de portfólio para indústria de MRO aeronáutico brasileiro. Ao final dos ciclos foi feita uma avaliação do processo criada por meio de um questionário. Os participantes da pesquisa avaliaram o método de desenvolvimento do modelo como adequado e avaliaram também o próprio modelo como adequado. / The aircraft maintenance centers in Latin America have limited portfolios of services; this is a factor that restricts the growth of air transport in the region. Therefore is necessary to develop new maintenance, repair and overhaul (MRO) services for aircraft and their components in those centers. New Product Development (NPD) process theory has received substantial attention in the last decade but there is little literature on the New Services Development (NSD), and papers dealing directly with services portfolio management are even scarcer. The existing literature is not holistic enough to deal with maintenance services portfolio management. Therefore this paper aims to develop a services portfolio management (SPM) for aircraft components maintenance. The SPM model development will be done using the action research approach trough the creation of knowledge in continuous PDCA cycles. During the creation of the specific model, were used as knowledge base reference models of PDP and PDS, later adapted to the reality of services to the region and type of industry. The action research began in pre contextualization phase, followed by four cycles, and each cycle a stage of the model was developed and evaluated, resulting in a specific model of portfolio management for MRO Brazilian aeronautics industry. At the end of cycles an evaluation process created by means of a questionnaire. Survey participants rated the method as proper development of the model, the model itself also rated as adequate.

Os centros de manutenção de aeronaves da América Latina possuem portfólios de serviços limitados e esse é um fator que restringe o crescimento do transporte aéreo na região. Faz-se necessário, portanto, o desenvolvimento de novos serviços de reparo de aeronaves e seus componentes nesses centros. Apesar de o Desenvolvimento de Produtos ter recebido uma atenção substancial na ultima década, há pouca literatura sobre o Desenvolvimento de Serviços e trabalhos que tratam de gestão de portfólio de serviços são ainda mais escassos. A pouca literatura existente não é suficientemente abrangente para tratar da gestão de portfólio de serviços de manutenção complexa. O objetivo deste trabalho é, portanto, desenvolver um processo de gestão de portfólio de serviços para empresas de manutenção aeronáutica, chamado de modelo específico. O desenvolvimento do modelo será feito utilizando a pesquisa-ação, abordagem que objetiva tanto a tomada de ação quanto a criação de conhecimento com ciclos contínuos. Durante a criação do modelo específico foram usados como base de conhecimento modelos de referência de PDP e PDS, posteriormente adaptados para a realidade de serviços, para a região e tipologia da indústria. A pesquisa ação se iniciou numa pré-fase de contextualização, seguida por quatro ciclos, sendo que em cada ciclo uma etapa do modelo foi desenvolvida e avaliada, resultando em um modelo especifico de gestão de portfólio para indústria de MRO aeronáutico brasileiro. Ao final dos ciclos foi feita uma avaliação do processo criada por meio de um questionário. Os participantes da pesquisa avaliaram o método de desenvolvimento do modelo como adequado e avaliaram também o próprio modelo como adequado. / The aircraft maintenance centers in Latin America have limited portfolios of services; this is a factor that restricts the growth of air transport in the region. Therefore is necessary to develop new maintenance, repair and overhaul (MRO) services for aircraft and their components in those centers. New Product Development (NPD) process theory has received substantial attention in the last decade but there is little literature on the New Services Development (NSD), and papers dealing directly with services portfolio management are even scarcer. The existing literature is not holistic enough to deal with maintenance services portfolio management. Therefore this paper aims to develop a services portfolio management (SPM) for aircraft components maintenance. The SPM model development will be done using the action research approach trough the creation of knowledge in continuous PDCA cycles. During the creation of the specific model, were used as knowledge base reference models of PDP and PDS, later adapted to the reality of services to the region and type of industry. The action research began in pre contextualization phase, followed by four cycles, and each cycle a stage of the model was developed and evaluated, resulting in a specific model of portfolio management for MRO Brazilian aeronautics industry. At the end of cycles an evaluation process created by means of a questionnaire. Survey participants rated the method as proper development of the model, the model itself also rated as adequate.

Estudos de expressão gênica geralmente envolvem a realização de processos de análise integrados para a obtenção de respostas biológicas de interesse. A realização destes processos frequentemente requer o uso combinado de uma série de ferramentas de software. No entanto, o processo de integração manual de ferramentas pode ser demorado e propenso a erros devido ao crescente número de ferramentas e formatos de dados disponíveis no domínio. De modo a automatizar o processo de integração, algumas abordagens têm sido propostas tanto para a adaptação das ferramentas de análise existentes como serviços web semânticos, quanto para o desenvolvimento de ambientes de suporte à integração (composição) de serviços web semânticos. Embora estas abordagens representem avanços, nenhuma solução adequada para o desenvolvimento e composição de serviços foi especificamente definida para o domínio de genômica funcional. Neste contexto, o principal objetivo deste projeto foi investigar uma solução completa para o desenvolvimento e composição de serviços web semânticos para a análise de expressão gênica. Como parte da solução proposta, definimos uma metodologia integrada para a implementação de serviços web semânticos criados a partir de ferramentas de software existentes e para a anotação semântica destes serviços. Nossa metodologia fornece diretrizes concretas para o desenvolvimento sistemático de serviços, considerando também os principais aspectos técnicos associados ao processo de desenvolvimento. Esta metodologia foi aplicada a um conjunto representativo de serviços que fornecem suporte às principais atividades de análise realizadas em diferentes tipos de dados de expressão gênica. De forma complementar, definimos uma solução completa para a composição semântica de serviços no domínio de análise de expressão gênica. A solução proposta foi implementada em uma plataforma de suporte semi-automático à composição de serviços web semânticos, chamada SemanticSCo. Esta plataforma fornece suporte flexível a todas as atividades envolvidas no processo de composição de serviços, incluindo a criação, publicação, requisição, descoberta, seleção, composição e execução de serviços. Além disto, a plataforma SemanticSCo foi projetada para prover suporte adequado a diferentes tipos de usuários, incluindo biologistas e bioinformatas. Neste sentido, a plataforma fornece aos usuários um alto nível de abstração para a definição de seus processos de análise, permitindo que os mesmos se concentrem mais nas questões de pesquisa biológicas do que nos aspectos subjacentes do processo de composição. Adicionalmente, a plataforma SemanticSCo suporta a definição e incorporação não apenas de serviços simples, definidos em termos de uma única operação, mas também de serviços complexos, definidos em termos de um conjunto de condições que restringem a ordem de invocação de suas operações. Finalmente, de modo a avaliar a plataforma de suporte desenvolvida, definimos diferentes cenários de composição para a análise (integrada) de dados de expressão gênica. O uso da plataforma SemanticSCo facilitou a definição destes cenários, permitindo assim a reprodução dos resultados obtidos a partir de diferentes estudos de expressão gênica previamente documentados na literatura / Gene expression studies usually involve the creation of integrated analysis processes for obtaining responses for a biological question. The creation of such processes often require the combined use of a number of software tools. However, the manual integration of tools can be cumbersome and error prone due to the increasing number of tools and data formats available in the domain. In order to automate the integration process, some approaches have been proposed for the adaptation of existing analysis tools as semantic web services as well as for the development of software environments to support the integration (composition) of semantic web services. Although these approaches present advances, to the best of our knowledge, no suitable solution has been proposed for the development and composition of web services in the functional genomics domain. In this context, this project aimed at investigating a complete solution for the development and composition of semantic web services to support gene expression analysis. As part of the proposed solution, we have defined an integrated methodology for the implementation of semantic web services created from existing software tools and the semantic annotation of such services. Our methodology provides concrete guidelines for the systematic development of services, also taking into account the main technical aspects associated with the development process. This methodology has been applied in the development of a representative set of services that support the main analysis activities performed on different types of gene expression data. Complementary to our methodology, we have defined a complete solution for the semantic composition of web services in the gene expression analysis domain. The proposed solution has been implemented in a software platform to support the semi-automatic composition of semantic web services, named SemanticSCo. This platform provides flexible support to all activities involved in the service composition process including service creation, publication, request, discovery, selection, composition and execution. Additionally, the SemanticSCo platform has been designed to support different types of users, including biologists and bioinformaticians. In this sense, the platform provides users with a high level of abstraction in the definition of their analysis processes, thus allowing them to focus more on biological research issues rather than on underlying details of the composition process. In addition, the SemanticSCo platform supports not only the definition and incorporation of (simple) services defined in terms of a single operation, but also (complex) services defined in terms of a set of conditions that constrain the order in which service operations should be invoked. Finally, in order to evaluate the developed support platform, we have defined a number of composition scenarios for the (integrated) analysis of gene expression data. The use of the SemanticSCo platform has facilitated the definition of these scenarios, thus allowing the reproduction of the results obtained from different gene expression studies previously documented in the literature.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2018-05-04T11:52:00Z No. of bitstreams: 1 leonardodeaguiarpereira.pdf: 2326653 bytes, checksum: 8c6f963d57bb5da46d8fcfcac54d29b8 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2018-09-03T16:02:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 leonardodeaguiarpereira.pdf: 2326653 bytes, checksum: 8c6f963d57bb5da46d8fcfcac54d29b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-03T16:02:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 leonardodeaguiarpereira.pdf: 2326653 bytes, checksum: 8c6f963d57bb5da46d8fcfcac54d29b8 (MD5) Previous issue date: 2018-03-22 / Plataformas de apoio à experimentação científica apoiam cientistas e permitem que eles possam desfrutar de recursos para prosseguir com suas pesquisas. Dentre esses recursos estão os serviços científicos, usados para processar dados em determinadas tarefas de um processo de experimentação científica. Desenvolvedores especializados criam e mantêm esses serviços científicos. O sucesso de uma experimentação científica depende da correta execução de seu processo. Como os serviços científicos são utilizados em tarefas dos processos, suas falhas comprometem toda a experimentação. Por isso, é importante que os serviços estejam funcionando corretamente. Neste contexto, é necessário apoiar o desenvolvedor de serviços científicos para que ele possa desenvolver serviços com o máximo de eficiência possível. Diante disso, o objetivo deste trabalho é apresentar recursos que buscam apoiar o desenvolvimento de serviços científicos em uma plataforma de ecossistema de software científico. Esses recursos são associados a um processo de desenvolvimento de serviços que mapeia as atividades dos desenvolvedores e cientistas durante o desenvolvimento de serviços. Apresenta uma interface para análise contextual dos serviços, oferecendo elementos de visualização associados a informações contextuais. Além disso, utiliza a análise de redes sociais científicas para auxiliar na seleção de cientistas mais adequados à avaliação dos serviços. Visando avaliar estes recursos, foram realizados estudos de caso envolvendo o desenvolvimento de serviços científicos. Os resultados sugerem que os recursos empregados podem apoiar o desenvolvimento de serviços científicos em uma plataforma de ecossistema de software científico. / Platforms supporting scientific experimentation support scientists and allow them the use of resources to pursue their research. Among these resources are the scientific services, used to process data in certain tasks of a process of scientific experimentation. Specialized developers create and maintain these scientific services. The success of a scientific experiment depends on the correct execution of its process. As scientific services are used in process tasks, their failures undermine all experimentation. Therefore, it is important that the services are working properly. In this context, it is necessary to support the scientific services developer so that he can develop services as efficiently as possible. Therefore, the objective of this work is to present resources that seek to support the development of scientific services in a scientific software ecosystem platform. These resources are associated with a service development process that maps the activities of developers and scientists during service development. It presents an interface for contextual analysis of the services, offering elements of visualization associated with contextual information. In addition, it uses the analysis of scientific social networks to assist in the selection of better suited scientists to the evaluation of services. In order to evaluate these resources, case studies involving the development of scientific services were carried out. The results suggest that the resources employed can support the development of scientific services in a scientific software ecosystem platform.

Estudos de expressão gênica geralmente envolvem a realização de processos de análise integrados para a obtenção de respostas biológicas de interesse. A realização destes processos frequentemente requer o uso combinado de uma série de ferramentas de software. No entanto, o processo de integração manual de ferramentas pode ser demorado e propenso a erros devido ao crescente número de ferramentas e formatos de dados disponíveis no domínio. De modo a automatizar o processo de integração, algumas abordagens têm sido propostas tanto para a adaptação das ferramentas de análise existentes como serviços web semânticos, quanto para o desenvolvimento de ambientes de suporte à integração (composição) de serviços web semânticos. Embora estas abordagens representem avanços, nenhuma solução adequada para o desenvolvimento e composição de serviços foi especificamente definida para o domínio de genômica funcional. Neste contexto, o principal objetivo deste projeto foi investigar uma solução completa para o desenvolvimento e composição de serviços web semânticos para a análise de expressão gênica. Como parte da solução proposta, definimos uma metodologia integrada para a implementação de serviços web semânticos criados a partir de ferramentas de software existentes e para a anotação semântica destes serviços. Nossa metodologia fornece diretrizes concretas para o desenvolvimento sistemático de serviços, considerando também os principais aspectos técnicos associados ao processo de desenvolvimento. Esta metodologia foi aplicada a um conjunto representativo de serviços que fornecem suporte às principais atividades de análise realizadas em diferentes tipos de dados de expressão gênica. De forma complementar, definimos uma solução completa para a composição semântica de serviços no domínio de análise de expressão gênica. A solução proposta foi implementada em uma plataforma de suporte semi-automático à composição de serviços web semânticos, chamada SemanticSCo. Esta plataforma fornece suporte flexível a todas as atividades envolvidas no processo de composição de serviços, incluindo a criação, publicação, requisição, descoberta, seleção, composição e execução de serviços. Além disto, a plataforma SemanticSCo foi projetada para prover suporte adequado a diferentes tipos de usuários, incluindo biologistas e bioinformatas. Neste sentido, a plataforma fornece aos usuários um alto nível de abstração para a definição de seus processos de análise, permitindo que os mesmos se concentrem mais nas questões de pesquisa biológicas do que nos aspectos subjacentes do processo de composição. Adicionalmente, a plataforma SemanticSCo suporta a definição e incorporação não apenas de serviços simples, definidos em termos de uma única operação, mas também de serviços complexos, definidos em termos de um conjunto de condições que restringem a ordem de invocação de suas operações. Finalmente, de modo a avaliar a plataforma de suporte desenvolvida, definimos diferentes cenários de composição para a análise (integrada) de dados de expressão gênica. O uso da plataforma SemanticSCo facilitou a definição destes cenários, permitindo assim a reprodução dos resultados obtidos a partir de diferentes estudos de expressão gênica previamente documentados na literatura / Gene expression studies usually involve the creation of integrated analysis processes for obtaining responses for a biological question. The creation of such processes often require the combined use of a number of software tools. However, the manual integration of tools can be cumbersome and error prone due to the increasing number of tools and data formats available in the domain. In order to automate the integration process, some approaches have been proposed for the adaptation of existing analysis tools as semantic web services as well as for the development of software environments to support the integration (composition) of semantic web services. Although these approaches present advances, to the best of our knowledge, no suitable solution has been proposed for the development and composition of web services in the functional genomics domain. In this context, this project aimed at investigating a complete solution for the development and composition of semantic web services to support gene expression analysis. As part of the proposed solution, we have defined an integrated methodology for the implementation of semantic web services created from existing software tools and the semantic annotation of such services. Our methodology provides concrete guidelines for the systematic development of services, also taking into account the main technical aspects associated with the development process. This methodology has been applied in the development of a representative set of services that support the main analysis activities performed on different types of gene expression data. Complementary to our methodology, we have defined a complete solution for the semantic composition of web services in the gene expression analysis domain. The proposed solution has been implemented in a software platform to support the semi-automatic composition of semantic web services, named SemanticSCo. This platform provides flexible support to all activities involved in the service composition process including service creation, publication, request, discovery, selection, composition and execution. Additionally, the SemanticSCo platform has been designed to support different types of users, including biologists and bioinformaticians. In this sense, the platform provides users with a high level of abstraction in the definition of their analysis processes, thus allowing them to focus more on biological research issues rather than on underlying details of the composition process. In addition, the SemanticSCo platform supports not only the definition and incorporation of (simple) services defined in terms of a single operation, but also (complex) services defined in terms of a set of conditions that constrain the order in which service operations should be invoked. Finally, in order to evaluate the developed support platform, we have defined a number of composition scenarios for the (integrated) analysis of gene expression data. The use of the SemanticSCo platform has facilitated the definition of these scenarios, thus allowing the reproduction of the results obtained from different gene expression studies previously documented in the literature.