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Avaliação da microbiota endofítica de citros com potencial antagônico no controle biológico de Guignardia citricarpa / Utilization of endophytic microbiot of citrus as tool for antagonistic to biologic control of Guignardia citricarpa

Correa, Alex da Silva January 2008 (has links)
Diversas espécies de fungos e de bactérias constituem a microbiota endofítica nas plantas cítricas. Interações simbióticas, sinérgicas ou antagônicas, fazem parte do cotidiano das relações entre esses microorganismos endofíticos e seus hospedeiros. Nos últimos anos, os microorganismos endofíticos vêm despertando grande interesse devido ao seu potencial de utilização como fármacos e principalmente no controle biológico. Este trabalho teve por objetivo a identificação de microorganismos endofíticos com potencial antagônico a Guignardia citricarpa na cultura do citros, em pomares orgânicos. Inicialmente foram feitos isolamentos através da assepsia de ramos, folhas e frutos de diferentes variedades de citros em manejo orgânico através do plaqueamento de segmentos dos tecidos em meio de cultura BDA. Diversos microorganismos endofíticos foram obtidos. O pareamento em placas de Petry dos diferentes microorganismos possibilitou a identificação de bactérias com potencial antagônico a G. citricarpa. isolados de Trichoderma ssp. também estavam presentes na comunidade endofítica, Trichoderma ssp. é utilizado no controle biológico por parasitar diferentes fitopatógenos. Inoculações dos endófitos foram feitas em casa de vegetação e em campo, possibilitando a seleção de microorganismos promissores para a utilização em grande escala no controle de G. citricarpa. A compreensão dos mecanismos biológicos e moleculares dessas diferentes interações nos possibilitará um melhor e mais adequado manejo desses diferentes microorganismos em sistemas de cultivo mais sustentáveis. / Several species of fungi and bacteria are endophytic microorganism in citrus plants. symbiotic, synergistic or antagonistic Interactions, are part of the daily lives of relations among these endophytic microorganisms and their hosts. In the last years, the endophytic microorganisms have been arousing great interest because of their potential use as drugs, and mainly on biological control. The aim of this study was the identify endophytic microorganisms with antagonistic potential to Guignardia citricarpa on citrus cultures in organic orchards. Initially isolates were made through aseptic of branches, leaves and fruits of different varieties of citrus through the plating of segments tissue in PDA (Potato Dextrose Agar). Several endophytic microorganisms were obtained. The pairied cultivation, in Petry dishes, of different microorganisms, allowed the identification of bacteria with potential antagonism to G. citricarpa. Trichoderma sp. isolates also were present in the endophytic community. Trichoderma sp. is widely used in biological control as a parasite on different phytopathogens. Endophytic inoculations were made in a greenhouse and in the field. These inoculations allowed the selection of promising microorganisms for the use in large scale for control of G. Citricarpa. The understanding of biological and molecular mechanisms of these different interactions will enable a better and more appropriate management of these microorganisms in different and more sustainable cropping systems.
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Avaliação da microbiota endofítica de citros com potencial antagônico no controle biológico de Guignardia citricarpa / Utilization of endophytic microbiot of citrus as tool for antagonistic to biologic control of Guignardia citricarpa

Correa, Alex da Silva January 2008 (has links)
Diversas espécies de fungos e de bactérias constituem a microbiota endofítica nas plantas cítricas. Interações simbióticas, sinérgicas ou antagônicas, fazem parte do cotidiano das relações entre esses microorganismos endofíticos e seus hospedeiros. Nos últimos anos, os microorganismos endofíticos vêm despertando grande interesse devido ao seu potencial de utilização como fármacos e principalmente no controle biológico. Este trabalho teve por objetivo a identificação de microorganismos endofíticos com potencial antagônico a Guignardia citricarpa na cultura do citros, em pomares orgânicos. Inicialmente foram feitos isolamentos através da assepsia de ramos, folhas e frutos de diferentes variedades de citros em manejo orgânico através do plaqueamento de segmentos dos tecidos em meio de cultura BDA. Diversos microorganismos endofíticos foram obtidos. O pareamento em placas de Petry dos diferentes microorganismos possibilitou a identificação de bactérias com potencial antagônico a G. citricarpa. isolados de Trichoderma ssp. também estavam presentes na comunidade endofítica, Trichoderma ssp. é utilizado no controle biológico por parasitar diferentes fitopatógenos. Inoculações dos endófitos foram feitas em casa de vegetação e em campo, possibilitando a seleção de microorganismos promissores para a utilização em grande escala no controle de G. citricarpa. A compreensão dos mecanismos biológicos e moleculares dessas diferentes interações nos possibilitará um melhor e mais adequado manejo desses diferentes microorganismos em sistemas de cultivo mais sustentáveis. / Several species of fungi and bacteria are endophytic microorganism in citrus plants. symbiotic, synergistic or antagonistic Interactions, are part of the daily lives of relations among these endophytic microorganisms and their hosts. In the last years, the endophytic microorganisms have been arousing great interest because of their potential use as drugs, and mainly on biological control. The aim of this study was the identify endophytic microorganisms with antagonistic potential to Guignardia citricarpa on citrus cultures in organic orchards. Initially isolates were made through aseptic of branches, leaves and fruits of different varieties of citrus through the plating of segments tissue in PDA (Potato Dextrose Agar). Several endophytic microorganisms were obtained. The pairied cultivation, in Petry dishes, of different microorganisms, allowed the identification of bacteria with potential antagonism to G. citricarpa. Trichoderma sp. isolates also were present in the endophytic community. Trichoderma sp. is widely used in biological control as a parasite on different phytopathogens. Endophytic inoculations were made in a greenhouse and in the field. These inoculations allowed the selection of promising microorganisms for the use in large scale for control of G. Citricarpa. The understanding of biological and molecular mechanisms of these different interactions will enable a better and more appropriate management of these microorganisms in different and more sustainable cropping systems.
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Avaliação da microbiota endofítica de citros com potencial antagônico no controle biológico de Guignardia citricarpa / Utilization of endophytic microbiot of citrus as tool for antagonistic to biologic control of Guignardia citricarpa

Correa, Alex da Silva January 2008 (has links)
Diversas espécies de fungos e de bactérias constituem a microbiota endofítica nas plantas cítricas. Interações simbióticas, sinérgicas ou antagônicas, fazem parte do cotidiano das relações entre esses microorganismos endofíticos e seus hospedeiros. Nos últimos anos, os microorganismos endofíticos vêm despertando grande interesse devido ao seu potencial de utilização como fármacos e principalmente no controle biológico. Este trabalho teve por objetivo a identificação de microorganismos endofíticos com potencial antagônico a Guignardia citricarpa na cultura do citros, em pomares orgânicos. Inicialmente foram feitos isolamentos através da assepsia de ramos, folhas e frutos de diferentes variedades de citros em manejo orgânico através do plaqueamento de segmentos dos tecidos em meio de cultura BDA. Diversos microorganismos endofíticos foram obtidos. O pareamento em placas de Petry dos diferentes microorganismos possibilitou a identificação de bactérias com potencial antagônico a G. citricarpa. isolados de Trichoderma ssp. também estavam presentes na comunidade endofítica, Trichoderma ssp. é utilizado no controle biológico por parasitar diferentes fitopatógenos. Inoculações dos endófitos foram feitas em casa de vegetação e em campo, possibilitando a seleção de microorganismos promissores para a utilização em grande escala no controle de G. citricarpa. A compreensão dos mecanismos biológicos e moleculares dessas diferentes interações nos possibilitará um melhor e mais adequado manejo desses diferentes microorganismos em sistemas de cultivo mais sustentáveis. / Several species of fungi and bacteria are endophytic microorganism in citrus plants. symbiotic, synergistic or antagonistic Interactions, are part of the daily lives of relations among these endophytic microorganisms and their hosts. In the last years, the endophytic microorganisms have been arousing great interest because of their potential use as drugs, and mainly on biological control. The aim of this study was the identify endophytic microorganisms with antagonistic potential to Guignardia citricarpa on citrus cultures in organic orchards. Initially isolates were made through aseptic of branches, leaves and fruits of different varieties of citrus through the plating of segments tissue in PDA (Potato Dextrose Agar). Several endophytic microorganisms were obtained. The pairied cultivation, in Petry dishes, of different microorganisms, allowed the identification of bacteria with potential antagonism to G. citricarpa. Trichoderma sp. isolates also were present in the endophytic community. Trichoderma sp. is widely used in biological control as a parasite on different phytopathogens. Endophytic inoculations were made in a greenhouse and in the field. These inoculations allowed the selection of promising microorganisms for the use in large scale for control of G. Citricarpa. The understanding of biological and molecular mechanisms of these different interactions will enable a better and more appropriate management of these microorganisms in different and more sustainable cropping systems.
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Reprodução, patogenicidade e potencial toxigênico de Fusarium graminearum, F. meridionale e F. cortaderiae / Reproduction, pathogenicity and toxigenicity of Fusarium graminearum, F. meridionale and F. cortaderiae

Nicolli, Camila Primieri January 2015 (has links)
A giberela do trigo na região sul do Brasil é causada por várias espécies do complexo de espécies Fusarium graminearum (FGSC, F. graminearum species complex). Dentre essas, destacam-se em prevalência, nessa ordem, Fusarium graminearum sensu stricto (Fgra), F. meridionale (Fmer) e F. cortaderiae (Fcor). Baseado na hipótese de que Fgra apresenta vantagens adaptativas em relação às demais, objetivou-se comparar essas espécies quanto a fecundidade (reprodução assexuada), fertilidade (reprodução sexuada, patogenicidade e produção de tricotecenos). Para isso, foi selecionado um total de 33 isolados de três espécies, sendo 12 F. graminearum, 11 F. meridionale e 10 F. cortaderiae, identificados em estudos anteriores. Experimentos foram conduzidos para avaliar: crescimento micelial em duas temperaturas; esporulação e germinação de macroconídios; formação e produção de peritécios em grãos de arroz, trigo e milho; a agressividade na cultivar BRS Guamirim e produção dos tricotecenos deoxinivalenol (DON), nivalenol (NIV) e duas formas acetiladas de DON (3-ADON e 15-ADON). Quanto ao crescimento micelial, houve interação significativa entre espécie e temperatura. Isolados Fgra mostraram maior resposta no crescimento ao incremento da temperatura, assim como Fmer em relação à Fcor Na formação e produção de peritécios nos grãos, um índice de fertilidade relativa (IFR), calculado com base na frequência de formação de peritécios em diferentes níveis de colonização dos grãos, foi maior para todos os isolados quando inoculados em grãos de arroz e milho, comparado com trigo. Independente do substrato, Fgra foi a espécie com o maior IFR seguido de Fmer e Fcor. Fgra apresentou maior percentual de germinação e um maior número de esporos viáveis em relação à média de Fmer + Fcor. No ensaio de patogenicidade, a severidade média da doença foi de 36% e não foi observada diferença estatística entre as espécies. Na análise de micotoxinas produzidas in vitro, foram detectadas apenas as duas formas acetiladas de deoxinivalenol e nivalenol, sendo a produção total maior em substrato de arroz. De forma coerente Fgra produziu mais 15-ADON que Fmer e Fcor, da mesma forma que Fmer e Fcor produziram mais nivalenol. Assim, Fgra apresentou evidências de maior vantagem adaptiva em relação às demais espécies. / Fusarium head blight (FHB) of wheat in southern Brazil is caused by several species of the Fusarium graminearum species complex (FGSC, F. graminearum species complex). The most prevalent species include Fusarium graminearum sensu stricto (Fgra), F. meridionale (Fmer) and F. cortaderiae (Fcor), in this order. Based on the hypothesis that Fgra is more fit than the others, this study aimed to compare these species with regards to fecundity (asexual reproduction), fertility (sexual reproduction), pathogenicity and in vitro production of trichothecene mycotoxins. For this purpose, 33 isolates of these species were selected, being 12 of F. graminearum, 11 of F. meridionale and 10 of F. cortaderiae, identified in previous studies. Experiments were conducted to assess: mycelial growth rate at two temperatures; sporulation and germination of macroconidia; perithecia formation and trichothecene production in rice, wheat and maize grain susbstrate; and aggressiveness towards a moderately resistant cultivar (BRS Guamirim) and production of deoxynivalenol (DON), nivalenol (NIV) and two DON acetylates (3-ADON and 15-ADON). Fgra isolates were more responsive in mycelial growth to the increase of temperature, as was Fmer related to Fcor Higher relative fertility index (RFI), estimated based on the frequency of different levels of perithecia covering grains, was found for all isolates inoculated on corn and rice grains, rather than wheat grains. Regardless of the substrate, Fgra was the species with the highest IFR followed by Fmer and Fcor. Fgra showed higher percent of macroconidia germination and a greater number of viable spores than the average of Fmer + Fcor. In the pathogenicity test, the average severity of the disease was 36% and there was no significant effect of species. As to mycotoxin analysis, only the two acetylated forms of DON and nivalenol, were detected, with higher total production in the rice substrate. Fgra consistently produced more 15-ADON than Fmer and Fcor, which produced more nivalenol. Therefore, there is evidence that Fgra possess adaptive advantages over the other species.
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Distribuição de mating-type em Fusarium decemcellulare Brick agente causal de superbrotamento em guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis H.B.K.)

Siqueira, Vanessa Kellen de Souza 19 February 2016 (has links)
Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-02-13T19:00:50Z No. of bitstreams: 2 Dissertação- Vanessa Siqueira ATU 2016.pdf: 1258786 bytes, checksum: 8866db4ee63bb58e42bb5ce9a292645a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T19:00:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação- Vanessa Siqueira ATU 2016.pdf: 1258786 bytes, checksum: 8866db4ee63bb58e42bb5ce9a292645a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-02-19 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Fusarium decemcellulare is the main causal agent supersprouting in guarana, currently one of the major fungal diseases of culture in the State of Amazonas. Although considered free zone the disease years ago, in 2013 the disease was first detected in the State of Bahia, the main producer of guarana in Brazil. Depending the attacks area, supersprouting features three different symptoms: galls on stems, multiplication of vegetative buds or floral hypertrophy in inflorescences. Considered by many years a disease secondary and unimportant for the guarana crop, few studies have been conducted on this pathosystem the past 30 years. The analysis of distribution in MAT-1 and MAT-2 idiomorphs population is critical for the inference of the dynamics and potential of genetic variation of a pathogen and the degree of risk to the host. This work aimed to analyze the distribution of mating-type in F. decemcellulare and to estimate the effective number of the pathogen population in the main producing areas of guarana in the state of Amazonas. Of the different symptoms of supersprouting, 285 isolates were obtained and characterized. Of these, 165 presented the idiomorph MAT-1 and 120 MAT-2. Unlike other host species of F. decemcellulare, in guarana there was no occurrence of homothallic isolates and most producing cities of guarana analyzed had an effective population number over than 80%, showing a balance in the frequency of the idiomorphs MAT-1 and MAT- 2, suggesting the possibility of sexual reproduction in the field. / Fusarium decemcellulare é o agente causal de superbrotamento em guaranazeiro, atualmente uma das principais doenças fúngicas da cultura no Estado do Amazonas. Embora considerada zona sem ocorrência da doença por anos, em 2013 foi detectada pela primeira vez no Estado da Bahia, principal produtor de guaraná no Brasil. Dependendo do tecido atacado, o superbrotamento apresenta três diferentes sintomas: galhas no caule, multiplicação das gemas vegetativas e hipertrofia floral. Considerada por muitos anos uma doença secundária e sem importância para a cultura do guaranazeiro, poucos estudos foram realizados sobre este patossistema nos últimos 30 anos. A análise da distribuição na população dos idiomorfos MAT-1 e MAT-2 é fundamental para a inferência da dinâmica e do potencial de variação genética de um patógeno e o grau de risco para o hospedeiro. Este trabalho teve como objetivo analisar a distribuição de mating-type em F. decemcellulare e estimar o número efetivo da população do patógeno nas principais áreas produtoras de guaraná no estado do Amazonas. Dos diferentes sintomas de superbrotamento em guaranazeiro, foram obtidos e caracterizados 285 isolados. Destes 165 apresentaram o idiomorfo MAT-1 e 120 MAT-2. Diferente de outras espécies hospedeiras de F. decemcellulare, em guaranazeiro não houve ocorrência de isolados homotálicos e a maioria dos municípios produtores de guaraná analisados apresentaram número efetivo de população superior a 80%, mostrando um equilíbrio na frequência dos idiomorfos MAT-1 e MAT-2, sugerindo a possibilidade de reprodução sexuada no campo.
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Detecção de Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis em plantas de batata através de PCR com oligonucleotídeos iniciadores a partir das seqüências dos genes pnl e rdg / Detection of Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis in potato plants through pcr with primers based on pnl and rdg gene sequences

Ribas, Aícha Daniela Ribas e January 2007 (has links)
A canela-preta, causada por Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis (Pcbr), está entre as principais doenças bacterianas da batata. Estudos epidemiológicos desta doença dependem de métodos eficientes de detecção. Como a principal característica das pectobactérias é a produção de enzimas pectolíticas em grande quantidade, os genes pnl e rdg, relacionados à pectina liase foram selecionados para a projeção de oligonucleotídeos iniciadores (primers) específicos para Pcbr. Os alinhamentos das seqüências de nucleotídeos dos genes pnl e rdg mostraram a existência de seqüências conservadas entre as estirpes de Pcbr, a partir das quais foram projetados os primers PcbrPnlF/ PcbrPnlR e PcbrRdgF/PcbrRdgR, que geraram produtos de 130 e 180 pb, respectivamente. Para a avaliação dos primers e métodos de extração de DNA Total, 10 hastes de plantas de batata com sintomas de canela-preta, foram coletadas de cada uma de quatro lavouras (Ágata: 3, Asterix: 1) no município de São Francisco de Paula, RS. Pcbr foi detectada através de PCR com PcbrRdgF/PcbrRdgR e DNA extraído por fervura e FTACard em 25 e 55% das amostras, e com PcbrPnlF/ PcbrPnlR em 12 e 45%, respectivamente. Estes resultados indicaram que os primers PcbrRdgF/PcbrRdgR foram mais eficientes, tanto na extração com FTACard (22%) quanto por fervura (108%). A detecção por PCR com ambos pares de primers foi maior quando o DNA foi extraído pelo método FTACard. / Blackleg, caused by Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis (Pcbr), is among the major bacterial diseases of potato. Epidemiological studies of this disease depend on efficient methods of detection. As the main trait of pectobacteria is the production of large amounts of pectolytic enzymes, genes pnl and rdg, related to pectin liase, were chosen to project primers specific to Pcbr. The nucleotide sequence alignments of the genes pnl and rdg showed the existence of conserved sequences among Pcbr strains. Primers PcbrPnlF/PcbrPnlR (130 bp product) and PcbrRdgF/PcbrRdgR (180 bp product) were designed based on them. To evaluate them and the total DNA extraction methods, 10 stems of potato plants, with blackleg, were harvested from each of four fields (Ágata: 3; Asterix: 1) in the São Francisco de Paula county, RS. Pcbr was detected through PCR with PcbrPnlF/ PcbrPnlR and PcbrRdgF/PcbrRdgR primers and DNA extracted by boiling and FTACard in 25 and 55%, and in 12 and 45% of stems, respectively. These results indicated the PcbrRdgF/PcbrRdgR primers were more efficient with DNA extracted by both boiling (108%) and FTACard (22%). Pcbr detection using both primer sets was higher with DNA extracted by FTACard method.
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Avaliação do impacto da variabilidade/mudanças climáticas sobre Euschistus heros, Telenomus podisi e ferrugem asiática na soja, no Região Sul do Brasil / Risk assessment of variability/climate change on the Euschistus heros, Telenomus podisi and asian soybean rust of soybean, in the southern region of Brazil

Chevarria, Vanessa Vitoria January 2011 (has links)
O Brasil é o segundo maior produtor mundial de soja, entretanto, fatores bióticos e abióticos representam ameaças à cultura causando sérios danos, com significativo impacto econômico. Dentre os problemas fitossanitários destacam-se o percevejo-marrom Euschistus heros e a ferrugem asiática. Para o controle biológico do percevejo, o parasitóide Telenomus podisi tem sido referido como um dos agentes potenciais em programas de MIP. A temperatura média diária e a precipitação são fatores abióticos que afetam tanto à cultura da soja, quanto aos organismos a ela associados. Assim, o trabalho teve como objetivos: 1) determinar faixas de favorabilidade para o desenvolvimento de E. heros e T. podisi; 2) simular o número de gerações dos insetos e a severidade da ferrugem asiática em soja, em municípios do Rio Grande do Sul, em cenários históricos de clima, considerando o ciclo da cultivar, a data da semeadura e o momento de detecção da praga e da doença e 3) avaliar os impactos potenciais das mudanças climáticas sobre estes organismos por meio do mapeamento de risco em cenários de clima futuros projetados pelos modelos globais do IPCC (média de 15 modelos). O trabalho considerou duas abordagens de simulação do efeito do clima sobre o desenvolvimento destes organismos. Na primeira, simulou-se os efeitos da variabilidade climática anual com dados de séries históricas de clima sobre o desenvolvimento dos organismos, por meio da integração de modelos bioclimáticos e, de simulação da cultura, considerando-se a época de semeadura, o momento de detecção e o ciclo da cultivar. Na segunda abordagem os modelos bioclimáticos foram integrados a sistemas de informações geográficas com dados de clima futuro, gerando mapas de favorabilidade para ocorrência dos insetos e da severidade da doença. E. heros apresentou melhor desenvolvimento na temperatura de 26º a 28ºC; maior número de gerações na data de semeadura mais precoce, na cultivar de ciclo médio e no momento de detecção em R1, variando de duas a três gerações. A temperatura muito favorável ao desenvolvimento de T. podisi foi de 20º a 28ºC; o número de gerações variou de três a seis, sendo mais encontrado no plantio mais precoce. Para a ferrugem asiática, não houve tendência de variação significativa dos níveis de severidade em função dos parâmetros avaliados. Os cenários de clima projetados para o futuro indicam um aumento na área favorável ao estabelecimento de E. heros e T. podisi e na severidade da ferrugem asiática em relação ao clima atual, diretamente relacionados às potenciais mudanças nas condições médias de temperatura e precipitação conforme apontadas pelos cenários do IPCC. / Brazil is the second largest soybean producer, however, biotic and abiotic factors affect the crop, causing serious damage, with significant economic impact. Among these problems, Euschistus heros and asian soybean rust. For biological control of the insects, the parasitoid Telenomus podisi has been described as one of the potential agents in MIP programs. The daily average temperature and precipitation are both environmental factors that affect the soybean crop, and its associated organisms. Thus, the study aimed to: 1) determine ranges of favorability for the development of E. heros and T. podisi; 2) simulate the number of generations of insects and severity of asian soybean rust on soybeans in municipalities of Rio Grande do Sul, historical weather scenarios, given the cycle of the cultivar, sowing date and time of pest and disease detection and 3) assess the potential impacts of climate change on these organisms by mapping risk in future climate scenarios projected by the IPCC global models (average of 15 models). The study considered two approaches for simulating the effect of climate on the development of these organisms. It was simulated the variability of climate effects with data from annual time series of climate on the development of organisms through the integration of bioclimatic models and simulation of culture, considering the time of sowing, time of detection and the cultivation cycle. In the second approach bioclimatic models were integrated into geographic information systems with future climate data, generating maps of favorability for the occurrence of insects and disease severity. E. heros showed better development at 26º to 28ºC, high number of generations in the early sowing date, at medium maturity cultivar and time of detection in R1, ranging from two to three generations. The temperature most favorable to the development of T. podisi was 20º to 28º C, the number of generations ranged from three to six, the most found in the earlier planting. For asian soybean rust, no significant trend of variation in levels of severity depending on the parameters. The climate scenarios projected for the future indicate an increase in the area favored the establishment of E. heros and T. podisi and severity of asian soybean rust in relation to the current climate, directly related to potential changes in average conditions of temperature and precipitation as noted by the IPCC scenarios.
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Prevalência, perfil toxigênico e agressividade de espécies de Fusarium associadas aos grãos de milho do Estado do Rio Grande do Sul / Prevalence, toxigenic profile and aggressiveness of fusarium species associated with corn kernels from Rio Grande Do Sul state

Stumpf, Raquel January 2011 (has links)
A maior preocupação com micotoxinas em grãos de milho tem ganhado importância devido às podridões da espiga causadas por Fusarium spp. Este estudo teve como objetivos: 1) levantar a incidência de Fusarium spp. e determinar níveis de fumonisinas em grãos de milho (safras 2009 e 2010) em municípios do estado do Rio Grande do Sul; 2) identificar as espécies de Fusarium associadas com os grãos; 3) determinar o potencial toxigênico dos isolados por método moleculare e 4) avaliar características fisiológias e patogênicas em uma seleção de 12 isolados. Vinte e nove amostras de grãos foram avaliadas quanto à incidência de espécies dos complexos Gibberella fujikuroi e G. zeae, além de fumonisina (FB1 e FB2), por HPLC. Foi observada uma dominância de espécies do complexo G. fujikuroi (96%), em comparação à G. zeae (18%). Análises químicas mostraram a presença de FB1 em 27/29 amostras (média = 1,38 μg.g-1) e FB2 em 13/29 amostras, (média de 0,42 μg.g- 1). Foram obtidos 304 isolados monospóricos em quatro populações (regional 2009; regional 2010; Cruz Alta e Veranópolis), os quais foram identificados com base na morfologia e PCR usando primers específicos para G. fujikuroi (F. verticillioides, F. subglutinans e F. proliferatum) e G. zeae (F. graminearum = Fg). PCR foi usada para detectar o gene FUM+, preditivo da síntese de fumonisina e os genes Tri3 e Tri12, preditivos dos genótipos tricotecenos: 3-ADON, 15-ADON e NIV. F. verticillioides foi encontrada em maior prevalência (86,8%), seguido de F. graminearum (6,9%), F. subglutinans (1,3%) e F. proliferatum (0,7%). Em 30/264 isolados de F. verticillioides o gene FUM+ não foi detectado. Em 12 isolados de F. graminearum houve dominância do genótipo NIV (8/12), seguido de 15-ADON (3/12) e 3-ADON (1/12). Todos os isolados selecionados para avaliação das características fisiológicas e patogênicas mostraram diferenças na taxa de crescimento micelial (TCM) e sensibilidade ao tebuconazole. Os isolados de F. verticillioides apresentaram os menores valores de TCM e mais alta sensibilidade ao fungicida, seguido dos isolados Fg NIV e Fg 15-ADON. Todos foram eficientes na infecção das sementes com efeitos negativos na germinação e emergência de plântulas. Ambas as espécies colonizaram o colmo de plantas de 20 dias, com destaque para um isolado Fg NIV. A análise multivariada permitiu identificar três grupos distintos de isolados. / The increasing concern to mycotoxins in maize kernels is related to a frequent occurrence of epidemics of ear rot of corn caused by Fusarium spp in Brazil. This study aimed to: 1) assess the incidence of Fusarium spp. and determine fumonisin levels in maize samples (harvest seasons 2009 and 2010) from several municipalities of the Rio Grande do Sul state, Brazil; 2) identify Fusarium species associated with the maize kernels; 3) determine the toxigenic potential of isolates using molecular markers; and 4) evaluate the physiological and pathogenic characteristics in a group 12 selected isolates. Twenty-nine commercial grain samples were evaluated for the incidence of Gibberella fujikuroi and G. zeae species complex, and fumonisin (FB1 and FB2) levels by using HPLC. We observed a dominance of G. fujikuroi (96%) over G. zeae (18%) species. Chemical analysis showed the presence of FB1 in 27/29 samples (mean = 1,38 μg.g-1) and FB2 in 13/29 samples (mean 0,42 μg.g-1). A sample of 304 single-spore isolates was obtained and separated into four populations (regional 2009, regional 2010, Cruz Alta and Veranópolis), which were identified based on morphology and PCR using specific primers for three species of the G. fujikuroi complex (F. verticillioides, F. subglutinans and F. proliferatum) and G. zeae (F. graminearum sensu lato). PCR was also used to detect FUM+ gene, predictive of fumonisina synthesis and Tri3 and Tri12 genes, predictive of three trichothecene genotypes: 3-ADON, 15-ADON and NIV. F. verticillioides was found in higher prevalence (86,8%), followed by F. graminearum (6.9%), F. subglutinans (1.3%) and F. proliferatum (0,7%). FUM+ gene was not detected in 30/264 F. verticillioides isolates. For the 12 F. graminearum isolates, NIV was the dominant genotype (8/12), followed by 15-ADON (3/12) and 3-ADON (1/12). All isolates selected for assessment of physiological and pathogenic characteristics showed differences in mycelial growth rate (MGR) and sensitivity to tebuconazole. All F. verticillioides isolates had the lowest MGR and a much higher sensitivity to the fungicide, followed by 15-ADON and NIV isolates. All isolates successfully infected and colonized the seeds, with negative effects on seed viability and seedling emergence. Both species colonized the stems of 20-days old plants using a toothpick inoculation method, and one F. graminearum NIV strain was the most aggressive. Multivariate analysis identified three distinct groups of isolates.
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Resposta de Gryon gallardoi (Brèthes) (Hymenoptera: Scelionidae) à qualidade dos ovos de Spartocera dentiventris (Berg) (Hemiptera: Coreidae) e evidências dos mecanismos de seleção envolvidos

Rocha, Luciane da January 2005 (has links)
Foi investigada, em condições de laboratório, a resposta de Gryon gallardoi a grupos de ovos de Spartocera dentiventris de diferentes idades (2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 e 12 dias), registrando-se o efeito destas nos processos de seleção do parasitóide e na prole produzida. Os estímulos envolvidos em tais processos e a descrição morfológica das sensilas antenais também foram estudados. O aumento da idade do hospedeiro modificou o comportamento de oviposição, acarretando em um maior tempo de tamborilamento e de inserção do ovipositor, não influenciando o percentual de parasitismo, auto-parasitismo e a proporção de machos, porém acarretou em um maior tempo de desenvolvimento, redução no percentual de emergência, diminuição na aceitação das fêmeas e redução do tamanho corporal da prole do parasitóide. Testes em olfatômetro demonstraram que folhas de fumo provocaram uma maior resposta nas fêmeas recém-emergidas do parasitóide do que nas experientes. (Continua Através do contato, as fêmeas não diferenciaram extratos de ovos jovens e velhos, quando aplicados em ovos lavados com solvente. Ovos não parasitados, impregnados com extrato de parasitados, foram evitados. Cilindros de acrílico de maior tamanho, usados como hospedeiro artificial, resultou em um maior tempo de tamborilamento em relação aos menores. A análise cromatográfica detectou três substâncias diferentes em extrato de ovos de um dia de idade em relação a extrato de ovos de 5 e 12 dias. Nas antenas das fêmeas do parasitóide encontrou-se diferentes tipos de sensilas porosas e aporosas. Os resultados deste trabalho sugerem que a condição do hospedeiro acarreta em modificações no comportamento bem como no sucesso da prole, sendo a aceitação e a discriminação dos mesmos possivelmente influenciada por uma complexa mistura de estímulos.
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Reprodução, patogenicidade e potencial toxigênico de Fusarium graminearum, F. meridionale e F. cortaderiae / Reproduction, pathogenicity and toxigenicity of Fusarium graminearum, F. meridionale and F. cortaderiae

Nicolli, Camila Primieri January 2015 (has links)
A giberela do trigo na região sul do Brasil é causada por várias espécies do complexo de espécies Fusarium graminearum (FGSC, F. graminearum species complex). Dentre essas, destacam-se em prevalência, nessa ordem, Fusarium graminearum sensu stricto (Fgra), F. meridionale (Fmer) e F. cortaderiae (Fcor). Baseado na hipótese de que Fgra apresenta vantagens adaptativas em relação às demais, objetivou-se comparar essas espécies quanto a fecundidade (reprodução assexuada), fertilidade (reprodução sexuada, patogenicidade e produção de tricotecenos). Para isso, foi selecionado um total de 33 isolados de três espécies, sendo 12 F. graminearum, 11 F. meridionale e 10 F. cortaderiae, identificados em estudos anteriores. Experimentos foram conduzidos para avaliar: crescimento micelial em duas temperaturas; esporulação e germinação de macroconídios; formação e produção de peritécios em grãos de arroz, trigo e milho; a agressividade na cultivar BRS Guamirim e produção dos tricotecenos deoxinivalenol (DON), nivalenol (NIV) e duas formas acetiladas de DON (3-ADON e 15-ADON). Quanto ao crescimento micelial, houve interação significativa entre espécie e temperatura. Isolados Fgra mostraram maior resposta no crescimento ao incremento da temperatura, assim como Fmer em relação à Fcor Na formação e produção de peritécios nos grãos, um índice de fertilidade relativa (IFR), calculado com base na frequência de formação de peritécios em diferentes níveis de colonização dos grãos, foi maior para todos os isolados quando inoculados em grãos de arroz e milho, comparado com trigo. Independente do substrato, Fgra foi a espécie com o maior IFR seguido de Fmer e Fcor. Fgra apresentou maior percentual de germinação e um maior número de esporos viáveis em relação à média de Fmer + Fcor. No ensaio de patogenicidade, a severidade média da doença foi de 36% e não foi observada diferença estatística entre as espécies. Na análise de micotoxinas produzidas in vitro, foram detectadas apenas as duas formas acetiladas de deoxinivalenol e nivalenol, sendo a produção total maior em substrato de arroz. De forma coerente Fgra produziu mais 15-ADON que Fmer e Fcor, da mesma forma que Fmer e Fcor produziram mais nivalenol. Assim, Fgra apresentou evidências de maior vantagem adaptiva em relação às demais espécies. / Fusarium head blight (FHB) of wheat in southern Brazil is caused by several species of the Fusarium graminearum species complex (FGSC, F. graminearum species complex). The most prevalent species include Fusarium graminearum sensu stricto (Fgra), F. meridionale (Fmer) and F. cortaderiae (Fcor), in this order. Based on the hypothesis that Fgra is more fit than the others, this study aimed to compare these species with regards to fecundity (asexual reproduction), fertility (sexual reproduction), pathogenicity and in vitro production of trichothecene mycotoxins. For this purpose, 33 isolates of these species were selected, being 12 of F. graminearum, 11 of F. meridionale and 10 of F. cortaderiae, identified in previous studies. Experiments were conducted to assess: mycelial growth rate at two temperatures; sporulation and germination of macroconidia; perithecia formation and trichothecene production in rice, wheat and maize grain susbstrate; and aggressiveness towards a moderately resistant cultivar (BRS Guamirim) and production of deoxynivalenol (DON), nivalenol (NIV) and two DON acetylates (3-ADON and 15-ADON). Fgra isolates were more responsive in mycelial growth to the increase of temperature, as was Fmer related to Fcor Higher relative fertility index (RFI), estimated based on the frequency of different levels of perithecia covering grains, was found for all isolates inoculated on corn and rice grains, rather than wheat grains. Regardless of the substrate, Fgra was the species with the highest IFR followed by Fmer and Fcor. Fgra showed higher percent of macroconidia germination and a greater number of viable spores than the average of Fmer + Fcor. In the pathogenicity test, the average severity of the disease was 36% and there was no significant effect of species. As to mycotoxin analysis, only the two acetylated forms of DON and nivalenol, were detected, with higher total production in the rice substrate. Fgra consistently produced more 15-ADON than Fmer and Fcor, which produced more nivalenol. Therefore, there is evidence that Fgra possess adaptive advantages over the other species.

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