Thesis (Ph. D.)--University of Oregon, 2006. / Typescript. Includes vita and abstract. "This thesis includes both previously published and co-authored materials"--P. iv. Includes bibliographical references (leaves 57-63). Also available for download via the World Wide Web; free to University of Oregon users.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 2000. / Vita. Includes bibliographical references (leaves 137-142).

A existência de polimorfismos de DNA mitocondrial analisados por um fragmento de 1413 nucleotídeos do gene COI (correspondente à 92% do gene) foi investigada em três populações de Drosophila willistoni e uma de Drosophila paulistorum. Este marcador foi utilizado para o estabelecimento de relações filogenéticas entre diferentes populações (naturais e de laboratório, bem como algumas das semi-espécies de Drosophila paulistorum). Para realizar este estudo foram feitas três coletas em três locais, de abril a setembro de 2002, nas cidades de Porto Alegre e Viamão. Surpreendentemente, com base em estudos anteriores, verificou-se uma queda expressiva na freqüência de aparecimento de D. paulistorum provavelmente como conseqüência da recente invasão das assembléias locais de drosofilídeos pela mosca africana Zaprionus indianus, que, desde 1999, tem se espalhado rapidamente pela América do Sul. A análise da diversidade nucleotídica revelou uma não estruturação das populações de D. willistoni de Porto Alegre e arredores. Este resultado vai de encontro com o que foi achado em estudos anteriores, utilizando marcadores nucleares, cromossômicos, morfométricos e comportamentais. Para explicar esta diferença, alguns testes para diferentes modelos seletivos foram realizados, e os resultados sugerem que estas seqüências estariam sofrendo seleção purificadora, evitando a diversificação destas populações neste nível Ao contrário do que se tem encontrado em outros drosofilídeos, o marcador por nós utilizado para D. willistoni e D. paulistorum, não foi sensível o suficiente para resolver a filogeografia do grupo. Apesar disto, este marcador mostrou-se útil para separar as espécies, podendo ser utilizado em estudos posteriores.

A existência de polimorfismos de DNA mitocondrial analisados por um fragmento de 1413 nucleotídeos do gene COI (correspondente à 92% do gene) foi investigada em três populações de Drosophila willistoni e uma de Drosophila paulistorum. Este marcador foi utilizado para o estabelecimento de relações filogenéticas entre diferentes populações (naturais e de laboratório, bem como algumas das semi-espécies de Drosophila paulistorum). Para realizar este estudo foram feitas três coletas em três locais, de abril a setembro de 2002, nas cidades de Porto Alegre e Viamão. Surpreendentemente, com base em estudos anteriores, verificou-se uma queda expressiva na freqüência de aparecimento de D. paulistorum provavelmente como conseqüência da recente invasão das assembléias locais de drosofilídeos pela mosca africana Zaprionus indianus, que, desde 1999, tem se espalhado rapidamente pela América do Sul. A análise da diversidade nucleotídica revelou uma não estruturação das populações de D. willistoni de Porto Alegre e arredores. Este resultado vai de encontro com o que foi achado em estudos anteriores, utilizando marcadores nucleares, cromossômicos, morfométricos e comportamentais. Para explicar esta diferença, alguns testes para diferentes modelos seletivos foram realizados, e os resultados sugerem que estas seqüências estariam sofrendo seleção purificadora, evitando a diversificação destas populações neste nível Ao contrário do que se tem encontrado em outros drosofilídeos, o marcador por nós utilizado para D. willistoni e D. paulistorum, não foi sensível o suficiente para resolver a filogeografia do grupo. Apesar disto, este marcador mostrou-se útil para separar as espécies, podendo ser utilizado em estudos posteriores.

A existência de polimorfismos de DNA mitocondrial analisados por um fragmento de 1413 nucleotídeos do gene COI (correspondente à 92% do gene) foi investigada em três populações de Drosophila willistoni e uma de Drosophila paulistorum. Este marcador foi utilizado para o estabelecimento de relações filogenéticas entre diferentes populações (naturais e de laboratório, bem como algumas das semi-espécies de Drosophila paulistorum). Para realizar este estudo foram feitas três coletas em três locais, de abril a setembro de 2002, nas cidades de Porto Alegre e Viamão. Surpreendentemente, com base em estudos anteriores, verificou-se uma queda expressiva na freqüência de aparecimento de D. paulistorum provavelmente como conseqüência da recente invasão das assembléias locais de drosofilídeos pela mosca africana Zaprionus indianus, que, desde 1999, tem se espalhado rapidamente pela América do Sul. A análise da diversidade nucleotídica revelou uma não estruturação das populações de D. willistoni de Porto Alegre e arredores. Este resultado vai de encontro com o que foi achado em estudos anteriores, utilizando marcadores nucleares, cromossômicos, morfométricos e comportamentais. Para explicar esta diferença, alguns testes para diferentes modelos seletivos foram realizados, e os resultados sugerem que estas seqüências estariam sofrendo seleção purificadora, evitando a diversificação destas populações neste nível Ao contrário do que se tem encontrado em outros drosofilídeos, o marcador por nós utilizado para D. willistoni e D. paulistorum, não foi sensível o suficiente para resolver a filogeografia do grupo. Apesar disto, este marcador mostrou-se útil para separar as espécies, podendo ser utilizado em estudos posteriores.

Mitants of Prosophila melanogaster which are paralysed by exposure to one temperature, but recover mobility at another temperature may aid in the investigation of the neural and muscular components which govern motor activity. With the help of a mechanical screening method, a recessive sex-linked temperature-sensitive paralytic mutant (parats -53°9) was discovered among the progeny of ethyl methane- sulphonate-treated males and attached-X females. Parats flies which had been raised at 22°C were paralysed within 5 seconds after transfer to 29°C, but quickly regained mobility when returned to 22°C. When left at 29°C for prolonged periods, the flies gradually regained mobility. Further studies indicated that the time required for recovery following an increase in temperature was directly related to the magnitude and rate of the temperature rise. Temperature-sensitive paralysis was seen only in adult flies. The abnormal movements which are characteristic of the behavioural mutants Hk1P, Hk2T , Sh⁵, when linked to parats in males,were quickly stopped and started by temperature shifts from 22°C to 29°C and 29°C to 22°C, respectively. The possible significance of these observations is discussed. parats/M(1)0 females exhibited temperature-sensitive paralysis. The possibility that the chromosome bearing the M(1)0 mutation might also carry a deletion or mutant allele of parats has not yet been investigated. A sex-linked dominant mutation which caused abnormal movements of the head and appendages under ether anaesthesia as well as shuddering movements in unetherised flies was also discovered. The mutation was called Shuddering (Shu – 55.1). The shuddering movements could be temporarily suppressed by feeding the flies media containing LiCl but not NaCl, NH₄Cl or KCl. The evidence presented in this and other studies suggests that the effects of parats and Shu mutations upon motor activity are mediated through their effects upon the nervous system. / Medicine, Faculty of / Medical Genetics, Department of / Graduate

A dissertation submitted to the Faculty of Science, University of the Witwatersrand, in fulfilment of the requirements for the degree of Master of Science. Johannesburg, 2015. / RBBP6 is an E3 Ubiquitin ligase protein with a U-box motif. It interacts with p53 and Rb and is linked to several cellular functions. SNAMA is the Drosophila RBBP6 homolog, but is less characterized than its vertebrate counterparts. Gene expression studies on Drosophila have a potential to advance the knowledge on molecular mechanism underlying genotoxic stress. Previous studies have shown that SNAMA plays a critical role as an apoptosis suppressor and possibly in responses to genotoxic stress. The molecular basis for this is, however, unknown. Initially, two isoforms were identified by bioinformatics and one (Snama A) experimentally as well. Here, we confirm experimentally the existence of the second isoform (Snama B). We also show that these are differentially expressed during development and when the organism undergoes genotoxic stress. Total RNA samples were used to demonstrate gene expression by using Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction. Using samples collected at different stages of development and from adult flies treated with the DNA damaging agent, irinotecan, it is shown that these isoforms are differentially expressed throughout development and upon genotoxic stress. This knowledge may help to understand the functional role SNAMA plays in normal physiology and in response to genotoxic stress. Furthermore, the results show that SNAMA is involved in a potentially beneficial intervention whereby the glycolytic pathway is bypassed by the addition of methyl pyruvate.

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