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Efficient and optimal designs for correlated observations

Chauhan, Nikhil January 2000 (has links)
No description available.
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Estimativa de parâmetros genéticos de caracteres de produção e de aparência de tubérculo de batata (Solanum tuberosum L.) / Estimates of genetic parameters for yield and tuber appearance traits of potatoes (Solanum tuberosum L.).

Ney, Vicenti Gonçalves 24 September 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_vicenti_ney.pdf: 630832 bytes, checksum: 05f28490c9c5a1e8995eeb1e15ec6f26 (MD5) Previous issue date: 2012-09-24 / Yield components and tuber appearance components constitute the two trait groups primarily considered in potato selection. Therefore, the establishment of selection criteria for these characters is essential for defining the strategies for breeding. The choice of parents and trait selection in early generations, when carefully defined and incorporated as a practice in breeding programs, increase efficiency and reduces the cost of developing new cultivars. The objectives of this research were (i) to estimate genetic variability, heritability and expected selection gain for yield components and tuber appearance in early generations, and (ii) to investigate the relationship between phenotypic traits assessed in tubers of potato families in the seedling and the first clonal generation. Twelve potato families were obtained from artificial crosses between two genotype groups: Eliza, C1730-7-94 and C1742-8-95; and Shepody, Asterix, White Lady and Caesar. Crosses were made in factorial mating design (3x4). Each family was constituted of 75 genotypes, distributed a randomly block design with three replications of 25 genotypes per plot. The 12 families were evaluated in the seedling generation, grown in greenhouse, and in the first clonal generation, grown in the field, in autumn season of 2010 and 2011, respectively. The families were evaluated for the following traits: skin roughness (ASP), eye depth (OLH), eyebrow prominence (SOB), tuber shape (FOR), uniformity of tuber shape (UFO), tuber pointing (APO), tuber curvature (CUR), tuber flatness (ACH), uniformity of tuber size (UTA), and tuber appearance (APA), components of overall tuber appearance; tuber number (NTU), total tuber mass (MAS), and average tuber mass (MAM), components of tuber yield. The analysis of variance detected no significant family X generation interaction for the following tuber trait components: OLH, SOB, UFO, CUR, ACH, APA, and TAM. The interaction was significant for FOR, APO, UTA, NTU, MAS, and MAM. Heritability estimates ranged from moderate to high in the joint analysis of the seedling generation and first clonal generation, for traits that showed no interaction between generations. The estimates were high for OLH, SOB, CUR, and ACH; moderately high for APA and UFO; and low for TAM. These results indicate the possibility of moderate to strong intensity selection at the seedling generation for these traits, except for TAM. Significant correlations between tuber general appearance traits (in both generations) were moderate for OLH x ASP, CUR x ACH e CUR x UFO; moderate to strong for ASP x APA and CUR x FOR; and strong to very strong for CUR x APO and SOB x OLH. Correlations between yield traits was strong for MAS x NTU; moderate for MAM x NTU and MAM x MAS. The correlations between the seedling generation and the first clonal generation was high for OLH, and moderate for SOB, CUR, ACH, NTU, and MAS, suggesting that selection for these traits could be made in the seedling generation. / Para programas de melhoramento genético de batata, os componentes de produção e aparência dos tubérculos constituem os dois grupos de caracteres considerados primeiramente na seleção de novos genótipos. Portanto, o estabelecimento de critérios de seleção para estes caracteres é indispensável para a definição de estratégias nos programas de melhoramento de batata. A escolha de genitores e de caracteres de seleção nas primeiras gerações, quando cuidadosamente definidos e incorporados como prática em programas de melhoramento, aumenta sua eficiência e reduz o custo de desenvolvimento de novas cultivares. Os objetivos da presente pesquisa foram (i) estimar variabilidade genética, herdabilidade e ganho de seleção esperado para componentes de produção e de aparência de tubérculos de batata, nas primeiras gerações, e (ii) verificar a relação entre caracteres fenotípicos de tubérculo avaliados em famílias de batata na geração de plântula e primeira geração clonal. Foram avaliadas 12 famílias de batata obtidas de cruzamentos artificiais entre os dois grupos de genótipos: Eliza, C1730-7-94 e C1742-8-95; e Shepody, Asterix, White Lady e Caesar. Os cruzamentos foram realizados na forma de delineamento genético fatorial (3x4). Cada família foi constituída de 75 genótipos, distribuídos em experimentos de blocos ao acaso, com três repetições de parcelas de 25 genótipos. As 12 famílias foram avaliadas na geração de plântula cultivada em casa de vegetação, e na primeira geração clonal, no campo, nos outonos de 2010 e 2011, respectivamente. As famílias foram avaliadas para os seguintes caracteres: aspereza da película (ASP), profundidade de olho (OLH), proeminência de sobrancelha (SOB), formato de tubérculo (FOR), uniformidade de formato de tubérculo (UFO), apontamento de tubérculo (APO), curvatura de tubérculo (CUR), achatamento de tubérculo (ACH), tamanho de tubérculo (TAM), uniformidade de tamanho de tubérculo (UTA) e aparência geral de tubérculo (APA), componentes de aparência geral de tubérculo; número de tubérculos (NTU), massa total de tubérculos (MAS) e massa média de tubérculos (MAM), componentes de produção. A análise da variância conjunta das gerações não detectou interação significativa família x geração para os caracteres de tubérculo: OLH, SOB, UFO, CUR, ACH, APA e TAM. A interação foi significativa para FOR, APO, UTA, NTU, MAS e MAM. As estimativas de herdabilidade variaram de moderada a alta na análise conjunta da geração de plântula e primeira geração clonal, para os caracteres que não apresentaram interação entre as gerações, com valores altos para OLH, SOB, CUR e ACH, moderadamente alto para APA e UFO, e baixo para TAM. Estes resultados indicam a possibilidade de seleção de moderada a forte intensidade na geração de plântula para esses caracteres, exceto TAM. As correlações significativas entre caracteres da aparência geral de tubérculo, em ambas as gerações, foram moderadas para OLH x ASP, CUR x ACH e CUR x UFO; moderada a forte para ASP x APA e CUR x FOR; e forte a fortíssima para CUR x APO e SOB x OLH. Correlações entre caracteres de produção, foi forte para MAS x NTU; moderada para MAM x NTU e MAM x MAS. A correlação entre a geração de plântula e a primeira geração clonal foi alta para o caráter OLH, e moderada para SOB, CUR, ACH, NTU e MAS, sugerindo que a seleção para estes caracteres poderia ser feita na geração de plântula.
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Avaliação da eficiência do teste precoce no melhoramento genético de soja / Evaluation of early generation testing effectiveness in soybean breeding

Carvalho, Agnaldo Donizete Ferreira de 10 April 2008 (has links)
O teste em gerações precoces no melhoramento genético de plantas consiste em identificar e selecionar progênies promissoras em gerações iniciais de endogamia, tais como F2 ou F3, e com isso concentrar tempo e recursos somente em populações com potencial para gerar linhas puras superiores. Considerando a ocorrência de relatos conflitantes, este trabalho teve como objetivo avaliar a eficiência do teste precoce no melhoramento genético de soja, utilizando uma população derivada de um cruzamento biparental entre as linhagens 14 e 38, contrastantes para produção de grãos, e selecionadas do cruzamento entre os genitores PI-123439 e PI-239235. Os tratamentos consistiram de uma amostra de 100 progênies de cada tipo: F2:3, F3:4 e F4:5, que foram avaliadas em experimentos em látice 10 x 10 no ano agrícola 2005/6 na área experimental do Departamento de Genética da ESALQ/USP, em Piracicaba, SP. Os experimentos foram avaliados novamente no ano agrícola 2006/7, em dois locais: Piracicaba, SP e Anhumas, SP, utilizando, para isso, os bulks oriundos dos experimentos do ano anterior, isto é, progênies F2:4, F3:5 e F4:6,. A parcela experimental foi constituída de uma linha de 2 m de comprimento, espaçada de 0,5 m, contendo 35 plantas por parcela após o desbaste. Foram avaliados os seguintes caracteres: altura das plantas no florescimento (AF), dias para florescimento (DF), altura das plantas na maturação (AM), dias para maturação (DM) e produção de grãos por parcela (PG). Devido à baixa taxa de germinação das sementes nos experimentos derivados de plantas F3 (F3:4 e F3:5) e, consequentemente à baixa precisão experimental, estes foram excluídos do estudo. Com base nos resultados dos experimentos de 2005/6 foram estimadas as variâncias genéticas e fenotípicas, os coeficientes de herdabilidades e as respostas esperadas com seleção, supondo diferentes intensidades (20%, 30%, 40% e 50%). Com base nos resultados das avaliações de 2006/7 foram obtidas as respostas observadas com seleção, que possibilitaram avaliar a eficiência do teste precoce nas diferentes intensidades de seleção. Observou-se uma boa correspondência entre as respostas preditas e observadas somente para as progênies F4:5, fato este já esperado, considerando o alto grau de heterozigose nas progênies F2:3. Os resultados gerais indicaram que a seleção em geração tão precoces como F2:4 pode ser efetuada, desde que sejam utilizadas intensidades moderados de seleção, da ordem de 40%. / Early generation testing in plant breeding consists of selecting progenies in early generations of selfing such as in F2 or F3, in order to save time and resources. The objective of this work was to assess the early generation testing effectiveness in soybean breeding programs. The base population consisted of a two way cross between inbred lines 14 and 38, derived from the cross between PI-123439 and PI-239235 parents. Entries consisted of a sample of 100 progenies of each generation: F2:3, F3:4 e F4:5, evaluated in lattice 10 x 10 designs in the 2005/6 growing season at Department of Genetics (ESALQ/USP) in Piracicaba, SP. In the 2006/7 growing season new experimental evaluations were performed, using the same experimental designs, in two locations: Piracicaba, SP, and Anhumas, SP, where the entries consisted of bulks derived from 2005/6 entries, i.e., F2:4, F3:5 and F4:6 progenies. Plots consisted of single 2-meter-long rows spaced 0.5 meter apart, with 37 plants after thinning in all experiments. The following traits were evaluated: plant height at flowering (AF), days to flowering (DF), plant height at maturity (AM), days to maturity (DM), and grain yield (PG). Due to the low germination rate and, consequently, the low experimental precision, experiments of F3 derived lines (F3:4 and F3:5) were eliminated. Estimates of genetics variances, heritabilities and expected response to selection, considering four selection intensities (20%, 30%, 40% e 50%) were obtained from 2005/6 evaluations. The observed responses to selection were obtained from the 2006/7 experiments, in order to evaluate the effectiveness of early selection. A good correspondence between estimated and observed responses to selection were observed only for experiments based on F4 derived lines, which is expected, considering the higher degree of heterozigosity of the progenies in as early generations as in F2. General results has shown that selection based in early generation as in F2 can be performed, using moderate intensities of selection, such as 40%.
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Seleção e expressão de caracteres componentes da aparência e rendimento de tubérculos na geração de plântulas de batata / Selection and expression of trait components for appearance and yield of tubers in the potato seedling generation

Cerioli, Murilo de Farias 17 May 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T13:25:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_murilo_cerioli.pdf: 248504 bytes, checksum: 5753f583efc83bb06c02cd0f2c7db965 (MD5) Previous issue date: 2013-05-17 / Improvements in methods of selection are extremely important for breeding programs because the market requires speed and efficiency in development new cultivars. In potato breeding, the elimination of genotypes with undesirable characteristics through early generation selection avoids that inferior genotypes be taken to the field. Selection for some traits in the seedling generation saves considerable resources and improves the quality of the population carried to the field. The aim of this study was to investigate in the seedling generation the influence of pot size on the expression of general appearance and yield of tubers and the selection efficiency. The study consisted of two generations of seedlings obtained from ten different crosses grown in the greenhouse in three different pot sizes during the autumn and spring. A first clonal generation was derived from autumn seedlings and planted in the field. Traits components of tuber appearance and yield were measured and trait correlations within seedling generation and between generations were determined. The results show that pot size influences trait expression and that early selection in the seedling generation is a viable option for many tuber appearance and yield component traits. Most traits are better expressed in large pots except skin roughness which showed more reticulated skin tubers in small pots. Skin roughness, tuber shape, tuber weight and number of tubers are more efficient for selection in the seedling generation. / Buscar melhorias em um programa de melhoramento é de grande importância, pois cada vez mais o mercado exige rapidez e eficiência no desenvolvimento de novas cultivares. No melhoramento de batata, a exclusão de genótipos com características indesejáveis o mais cedo possível, por meio da seleção em gerações iniciais, evita que genótipos inferiores sejam mantidos nos ensaios de campo. A seleção para alguns caracteres na geração de plântulas pode economizar recursos consideráveis e melhorar a qualidade da população que é levada a campo. O objetivo desse estudo foi verificar a influência do tamanho de recipiente na expressão de caracteres de aparência e rendimento de tubérculos na geração de plântulas, assim como a eficiência da seleção nessa geração. O estudo foi composto de duas gerações de plântulas obtidas de dez cruzamentos distintos, cultivadas em casa de vegetação no outono e na primavera, conduzidas em três tamanhos diferentes de recipiente e a primeira geração clonal derivada de uma das gerações de plântulas. Foram avaliados caracteres componentes da aparência geral e rendimento de tubérculos e suas correlações entre caracteres na geração de plântulas e entre a geração de plântulas e sua respectiva primeira geração clonal. Os resultados evidenciam que o tamanho do recipiente influencia na expressão de caracteres e que a seleção precoce na geração de plântulas é uma opção viável para muitos caracteres componentes de aparência geral e rendimento de tubérculos. A maior parte dos caracteres avaliados se expressa melhor nos recipientes de tamanho grande, exceto o caráter aspereza de película, que apresentou tubérculos com película mais reticulada no recipiente de tamanho pequeno. Aspereza de película, formato, massa e número de tubérculos são os caracteres com maior eficiência para seleção em geração de plântulas.
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Avaliação da eficiência do teste precoce no melhoramento genético de soja / Evaluation of early generation testing effectiveness in soybean breeding

Agnaldo Donizete Ferreira de Carvalho 10 April 2008 (has links)
O teste em gerações precoces no melhoramento genético de plantas consiste em identificar e selecionar progênies promissoras em gerações iniciais de endogamia, tais como F2 ou F3, e com isso concentrar tempo e recursos somente em populações com potencial para gerar linhas puras superiores. Considerando a ocorrência de relatos conflitantes, este trabalho teve como objetivo avaliar a eficiência do teste precoce no melhoramento genético de soja, utilizando uma população derivada de um cruzamento biparental entre as linhagens 14 e 38, contrastantes para produção de grãos, e selecionadas do cruzamento entre os genitores PI-123439 e PI-239235. Os tratamentos consistiram de uma amostra de 100 progênies de cada tipo: F2:3, F3:4 e F4:5, que foram avaliadas em experimentos em látice 10 x 10 no ano agrícola 2005/6 na área experimental do Departamento de Genética da ESALQ/USP, em Piracicaba, SP. Os experimentos foram avaliados novamente no ano agrícola 2006/7, em dois locais: Piracicaba, SP e Anhumas, SP, utilizando, para isso, os bulks oriundos dos experimentos do ano anterior, isto é, progênies F2:4, F3:5 e F4:6,. A parcela experimental foi constituída de uma linha de 2 m de comprimento, espaçada de 0,5 m, contendo 35 plantas por parcela após o desbaste. Foram avaliados os seguintes caracteres: altura das plantas no florescimento (AF), dias para florescimento (DF), altura das plantas na maturação (AM), dias para maturação (DM) e produção de grãos por parcela (PG). Devido à baixa taxa de germinação das sementes nos experimentos derivados de plantas F3 (F3:4 e F3:5) e, consequentemente à baixa precisão experimental, estes foram excluídos do estudo. Com base nos resultados dos experimentos de 2005/6 foram estimadas as variâncias genéticas e fenotípicas, os coeficientes de herdabilidades e as respostas esperadas com seleção, supondo diferentes intensidades (20%, 30%, 40% e 50%). Com base nos resultados das avaliações de 2006/7 foram obtidas as respostas observadas com seleção, que possibilitaram avaliar a eficiência do teste precoce nas diferentes intensidades de seleção. Observou-se uma boa correspondência entre as respostas preditas e observadas somente para as progênies F4:5, fato este já esperado, considerando o alto grau de heterozigose nas progênies F2:3. Os resultados gerais indicaram que a seleção em geração tão precoces como F2:4 pode ser efetuada, desde que sejam utilizadas intensidades moderados de seleção, da ordem de 40%. / Early generation testing in plant breeding consists of selecting progenies in early generations of selfing such as in F2 or F3, in order to save time and resources. The objective of this work was to assess the early generation testing effectiveness in soybean breeding programs. The base population consisted of a two way cross between inbred lines 14 and 38, derived from the cross between PI-123439 and PI-239235 parents. Entries consisted of a sample of 100 progenies of each generation: F2:3, F3:4 e F4:5, evaluated in lattice 10 x 10 designs in the 2005/6 growing season at Department of Genetics (ESALQ/USP) in Piracicaba, SP. In the 2006/7 growing season new experimental evaluations were performed, using the same experimental designs, in two locations: Piracicaba, SP, and Anhumas, SP, where the entries consisted of bulks derived from 2005/6 entries, i.e., F2:4, F3:5 and F4:6 progenies. Plots consisted of single 2-meter-long rows spaced 0.5 meter apart, with 37 plants after thinning in all experiments. The following traits were evaluated: plant height at flowering (AF), days to flowering (DF), plant height at maturity (AM), days to maturity (DM), and grain yield (PG). Due to the low germination rate and, consequently, the low experimental precision, experiments of F3 derived lines (F3:4 and F3:5) were eliminated. Estimates of genetics variances, heritabilities and expected response to selection, considering four selection intensities (20%, 30%, 40% e 50%) were obtained from 2005/6 evaluations. The observed responses to selection were obtained from the 2006/7 experiments, in order to evaluate the effectiveness of early selection. A good correspondence between estimated and observed responses to selection were observed only for experiments based on F4 derived lines, which is expected, considering the higher degree of heterozigosity of the progenies in as early generations as in F2. General results has shown that selection based in early generation as in F2 can be performed, using moderate intensities of selection, such as 40%.
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The Response of Tepary Bean (Phaseolus actifolius) Germplasm to Induced Mutation

Thangwana, Andries 05 1900 (has links)
MSCAGR ( Plant Production) / Department of Plant Production / See the attached abstract below
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Genética dos teores de fósforo e de zinco em sementes de feijão / Genetic of the phosphorus and zinc contents in common bean seeds

Rosa, Simone Saydelles da 24 August 2009 (has links)
The common bean (Phaseolus vulgaris L.) stands out as an important source of phosphorus and zinc in for human consumption. Therefore, the legume can be used to reduce the risk of deficiency of phosphorus and zinc and to reduce the number of cases of malnutrition. The objectives of this research were: (1) investigate the presence of maternal effect for phosphorus and zinc contents in common bean; (2) obtain estimates of heritability in early generations. The crossings were performed among cultivars Pérola x Guapo Brilhante and TPS Nobre x Guapo Brilhante. The F1, F1 reciprocal, F2, F2 reciprocal and backcross (RCP1 and RCP2) were obtained. The phosphorus and zinc contents were ascertained by nitric-perchloric digestion and determination on the UV-VIS spectrophotometer (phosphorus) and the atomic absorption spectrophotometer (zinc). The results showed presence of genetic variability for the phosphorus and zinc contents in common bean seeds. No was observed effect maternal significant for phosphorus and zinc contents in common bean seeds. For phosphorus, in the narrow sense heritability of high (65.54%) and low (21.37%) magnitude was obtained. For zinc, estimates of heritability in the narrow sense, high (77.84%) and moderate (57.46%) magnitude were obtained. Transgressive segregation was observed and an increase of 19.17% for the phosphorus content and of 37.26% for the zinc content in common beans seeds was obtained by crop breeding. The selection performed in the early generation may be effective for development of common bean germplasm with higher minerals content. / O feijão (Phaseolus vulgaris L.) destaca-se como uma importante fonte de fósforo e de zinco para a alimentação humana. Portanto, essa leguminosa pode ser utilizada para diminuir os riscos de deficiência de fósforo e de zinco e para reduzir o número de casos de má nutrição. Sendo assim, esse trabalho foi conduzido com os objetivos de: (1) investigar a presença de efeito materno para os teores de fósforo e de zinco em sementes de feijão; (2) obter estimativas de herdabilidade em gerações precoces. Os cruzamentos dirigidos foram realizados entre as cultivares Pérola x Guapo Brilhante e TPS Nobre x Guapo Brilhante e obtiveram-se as gerações F1, F1 recíproco, F2, F2 recíproco e retrocruzamentos (RCP1 e RCP2). Os teores de fósforo e de zinco foram quantificados por meio de digestão nítrica-perclórica e leitura em espectrofotômetro UV-VIS (fósforo) e em espectrofotômetro de absorção atômica (zinco). Os resultados obtidos revelaram presença de variabilidade genética para os teores de fósforo e de zinco em sementes de feijão. Esses minerais não apresentaram expressão de efeito materno significativo. Para o fósforo, herdabilidade em sentido restrito de alta (65,54%) a baixa magnitude (21,37%) foi obtida. Para o zinco, estimativas de herdabilidade, em sentido restrito, de alta (77,84%) a moderada magnitude (57,46%) foram constatadas. Segregação transgressiva foi verificada e um aumento de 19,17% para o teor de fósforo e de 37,26% foi obtido por melhoramento genético. A seleção precoce poderá ser efetiva no desenvolvimento de germoplasma de feijão com maior teor de minerais.

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