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Avaliação de métodos de seleção tradicionais, assistida por marcadores moleculares, e por genes candidatos, com dados simulados / Evaluation of traditional selection methods, molecular markers assisted selection, and cadidates genes selection, with simulated dataCorrêa, Felipe José de Carvalho 16 March 2001 (has links)
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Previous issue date: 2001-03-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Como o objetivo do melhoramento animal é o aumento da freqüência dos alelos favoráveis relacionados com características de importância econômica, os melhores indivíduos são selecionados, de forma a transmitir esses alelos favoráveis às gerações futuras. Para este objetivo, vários métodos de seleção foram propostos e aperfeiçoados, como a seleção individual, o índice de seleção e a seleção baseada na melhor predição linear não-viesada, BLUP. Porém, nos últimos anos, avanços observados na biotecnologia têm indicado revolução nas metodologias de seleção. Isto é feito pela seleção assistida por marcadores (MAS) e seleção por genes candidatos (CGS). Apesar da seleção ser importante ferramenta, o tempo e a necessidade de animais e laboratórios que aumentam os custos, se tornam fatores limitantes, dificultando a realização de alguns trabalhos. Assim, pesquisadores utilizam técnicas de simulação, permitindo a obtenção de grande volume de dados em um curto período de tempo, sem os elevados custos de animais e de laboratórios. Este trabalho visou verificar, na condição de dez marcas moleculares polimórficas, uma característica quantitativa de herdabilidade baixa (0,10), durante 20 gerações; os desempenhos dos métodos de seleções tradicionais (individual e baseada no BLUP), dos métodos de seleções moleculares (assistida por marcadores moleculares e por genes candidatos) e da combinação dos dois (associação da seleção individual e a assistida por marcadores), na tentativa de apresentar a superioridade dos métodos de seleção moleculares. Foi simulado um genoma (GENESYS 2000) composto de 200 locos. Seis populações-base de 1000 animais cada (500 machos e 500 fêmeas) foram criadas, a partir do mesmo genoma, com alterações nos efeitos aditivos (aleatórios no intervalo de –1,258 a 1,258, fixados nos valores -2 e 2 e fixado nos valores -5 e 5) dos genes próximos aos marcadores, e da transformação dos marcadores em candidatos. Para cada população base, foi construída uma população inicial, na qual teve início o processo de avaliação genética. Os parâmetros avaliados foram: ganho fenotípico, porcentagem de homozigotos, variância genética aditiva, porcentagem de alelos desfavoráveis e favoráveis fixados e limite de seleção. Com o uso do BLUP, obtiveram -se, para os três grupos de efeitos aditivos dos genes, os maiores ganhos fenotípicos, após as 20 gerações simuladas. À medida que se fixaram os valores dos efeitos aditivos moleculares dos (seleção genes, o assistida desempenho por dos marcadores métodos e seleção de seleção por genes candidatos), melhorou, sendo superior as respostas dos métodos de seleção tradicionais até a quinta geração. Em todas as respostas analisadas, as variâncias genéticas aditivas decresceram, sendo que, a maior queda foi observada quando foram usados métodos de seleção moleculares. Os resultados das porcentagens de locos fixados com alelos desfavoráveis e favoráveis, mostraram que os métodos de seleção moleculares foram semelhantes para os grupos de efeitos aditivos dos genes e superiores aos demais métodos tanto na fixação dos locos com alelos favoráveis quanto desfavoráveis. Conclui-se que os métodos de seleção tradicionais são melhores que os de seleção moleculares, durante 20 gerações, sem genes de grande efeito aditivo. Entretanto, aumentando o efeito aditivo dos genes, os métodos de seleção moleculares são as melhores opções até cinco gerações.
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