Les poux humains (Pediculus humanus) sont des ectoparasites hématophages, ayant vécu avec leur hôte pendant des milliers d’années. Durant cette thèse, nous avons d’abord élaboré une large bibliographie nous permettant de rédiger une revue, puis d’apporter des réponses à certains nombres de questions restées en suspens à travers le traitement de certaines thématiques qui nous semblaient importantes. En effet, nous avons (i) démontré que les poux de tête et les poux de corps en Afrique peuvent être infectés par B. quintana quand les patients vivent dans des conditions économiques pauvres et sont aussi exposés aux poux de corps; identifié pour la première fois le clade mitochondrial des poux de tête du Mali, Kenya, Congo et Madagascar, et confirmé celui du Sénégal, Algérie, Ethiopie, Rwanda et Burundi, (ii) démontré que les poux de tête et les poux de corps chez les SDF doublement infestés appartiennent à la même population de poux de corps, et dans les conditions d’infestation massive, les poux de corps peuvent migrer et coloniser les cheveux et vice-versa, (iii) prouvé la nécessité de réaliser des enquêtes épidémiologiques nationales sur la pédiculose dans les régions du Mali, (iv) démontré par le modèle in vitro que la doxycycline a un effet direct sur la bactérie endosymbionte du pou Candidatus Riesia pediculicola via le mycetome. Ce dernier travail nous a permis de mettre en exergue l’efficacité synergique des antibiotiques + ivermectine permettant de lutter plus efficacement l’infestation des poux et éviter l’apparition de résistance. Ce travail a fait l’objet de dépôt d’un brevet. / Human lice (Pediculus humanus) are bloodsucking ectoparasites, having lived with their host for thousands of years. During this thesis, we first developed an extensive bibliography allowing us to write a review and provide answers to certain number of questions remained pending through treating some thematic that seemed us significant. Indeed, we have (i) demonstrated that head and body lice in Africa can be infected with B. quintana when patients live in poor economic conditions and are also exposed to body lice; identified for the first time the mitochondrial clade of lice Mali, Kenya, Congo and Madagascar, and confirmed that of Senegal, Algeria, Ethiopia, Rwanda and Burundi, (ii) demonstrated that head and body lice in SDF doubly infected belong to the same population of body lice, and under conditions of massive infestation, body lice can migrate and colonize the hair and vice versa, (iii) proved the need to make national epidemiological surveys on pediculosis in areas of Mali, (iv) demonstrated by in vitro model that doxycycline has a direct effect on endosymbiont bacteria of louse Candidatus Riesia pediculicola via mycetoma. This last work allowed us to highlight the synergistic efficacy of ivermectin + antibiotics to fight more effectively the infestation of lice and avoid the appearance of resistance. This work was subject of a patent.

Les amibes appartenant au genre Acanthamoeba sont ubiquitaires et responsables de diverses infections, en particulier de kératite amibienne. Par ailleurs elles sont résistantes à de nombreux traitements de désinfection, aussi bien sous leur forme libre (trophozoite) que sous leur forme enkystée. La plupart des données d’efficacité disponibles ont évalué des biocides utilisés pour la désinfection de l’eau potable et/ou des lentilles de contact, mais peu de données sont disponibles concernant le traitement des surfaces ou des matériels médicaux. Ces amibes sont également capables de servir de réservoir à des bactéries pathogènes, notamment des nouvelles espèces de Chlamydia regroupées sous le terme « Chlamydia-like ». Il s’agit de bactéries découvertes récemment et potentiellement responsables d’infections respiratoires et d’avortements spontanés. Malgré leur importance, peu de données sont disponibles concernant la survie et la résistance aux biocides de ces bactéries. L’objectif de ce travail a été dans un premier temps d’évaluer la résistance des amibes aux traitements de désinfections, aussi bien pour les trophozoites que pour les kystes. Dans un second temps, nous avons étudié la survie et la résistance des Chlamydia-like à la désinfection, ainsi que leurs interactions avec les amibes et avec différentes lignées cellulaires ; Chlamydia trachomatis a servi de contrôle dans cette deuxième série d’expérimentations. Les méthodes de culture et d’enkystement des trophozoites ainsi que le choix des souches testées se sont avérés critiques pour l’évaluation des biocides. Certains traitements de désinfection généralement réputés efficaces contre la plupart des micro-organismes ont montré une efficacité limitée vis-à-vis des kystes amibiens ainsi que des trophozoites (glutaraldehyde). Les Chlamydia-like se sont avérées capables de survivre dans l’environnement pendant de longues périodes mais sont globalement sensibles aux désinfectants. Certaines de ces bactéries sont également capables de survivre dans les kystes d’amibes, ce qui peut leur conférer une résistance accrue vis-à-vis des biocides. / Acanthamoebae are ubiquitous amoebae responsible for several infections, mostly amoebic keratitis. They are also resistant to numerous disinfection treatments, as well under their free shape (trophozoite ) as under their encysted shape. Most of the available data of efficiency estimated biocides used for the disinfection of the drinking water and\or the contact lenses, but few data are available concerning the treatment of surfaces or medical devices. These amoebae are also capable of serving as reservoir for pathogenic bacteria, in particular for new species of Chlamydia named " Chlamydia-like ". These new bacteria recently discovered are potentially responsible for respiratory infections and miscarriages. Despite their importance, only few data are available concerning the survival and the resistance to biocides. The objective of this work was at first time to evaluate the resistance of amoebae to disinfection treatments, as well for the trophozoites as for the cysts. Secondly, we studied the survival and the resistance of Chlamydia-like to disinfection, as well as their interactions with amoebae and with various cellular lineages; Chlamydia trachomatis served as control in this second series of experiments. The methods of culture and encystement of trophozoites as well as the choice of selected strains turned out critical for the evaluation of biocides. Some treatments generally considered as effective treatments of disinfection against most of the microorganisms showed an efficiency limited towards the amoebic cysts as well as the trophozoites ( glutaraldehyde ). Chlamydia-like turned out capable of surviving in the environment during long periods but are globally sensitive to disinfectants. Some of these bacteria are also capable to surve in amoebal cysts, what can confer them a resistance increased towards biocides.

Les amibes appartenant au genre Acanthamoeba sont ubiquitaires et responsables de diverses infections, en particulier de kératite amibienne. Par ailleurs elles sont résistantes à de nombreux traitements de désinfection, aussi bien sous leur forme libre (trophozoite) que sous leur forme enkystée. La plupart des données d'efficacité disponibles ont évalué des biocides utilisés pour la désinfection de l'eau potable et/ou des lentilles de contact, mais peu de données sont disponibles concernant le traitement des surfaces ou des matériels médicaux. Ces amibes sont également capables de servir de réservoir à des bactéries pathogènes, notamment des nouvelles espèces de Chlamydia regroupées sous le terme " Chlamydia-like ". Il s'agit de bactéries découvertes récemment et potentiellement responsables d'infections respiratoires et d'avortements spontanés. Malgré leur importance, peu de données sont disponibles concernant la survie et la résistance aux biocides de ces bactéries. L'objectif de ce travail a été dans un premier temps d'évaluer la résistance des amibes aux traitements de désinfections, aussi bien pour les trophozoites que pour les kystes. Dans un second temps, nous avons étudié la survie et la résistance des Chlamydia-like à la désinfection, ainsi que leurs interactions avec les amibes et avec différentes lignées cellulaires ; Chlamydia trachomatis a servi de contrôle dans cette deuxième série d'expérimentations. Les méthodes de culture et d'enkystement des trophozoites ainsi que le choix des souches testées se sont avérés critiques pour l'évaluation des biocides. Certains traitements de désinfection généralement réputés efficaces contre la plupart des micro-organismes ont montré une efficacité limitée vis-à-vis des kystes amibiens ainsi que des trophozoites (glutaraldehyde). Les Chlamydia-like se sont avérées capables de survivre dans l'environnement pendant de longues périodes mais sont globalement sensibles aux désinfectants. Certaines de ces bactéries sont également capables de survivre dans les kystes d'amibes, ce qui peut leur conférer une résistance accrue vis-à-vis des biocides.