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Diversidade genética, conectividade populacional e a conservação do Mero (Epinephelus itajara; Percifomes Epinephelidae) na costa atlântica da América do Sul

BENEVIDES, Emilly Anny 31 January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:07:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6527_1.pdf: 2175542 bytes, checksum: a264d5b0969311161a1b2144b7246125 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Petróleo Brasileiro S/A / O Mero, Epinephelus itajara, é umas das espécies de peixes marinhos mais ameaçadas no Brasil e em todo planeta e o seu status de conservação é de "Criticamente em Perigo de Extinção" pela União Internacional para a Conservação da Natureza (IUCN). Neste estudo, objetivou-se avaliar a diversidade genética da espécie, assim como as relações entre as populações do mero de diversas localidades ao longo da sua distribuição. Para tal, foi acessada, por meio de marcadores moleculares nucleares de DNA do tipo ISSRs e de seqüências do genoma mitocondrial (citocromo b), a variação genética da espécies ao longo de 12 localidades do oceano Atlântico (Belize, Estados Unidos, Guiana Francesa, Pará, Piauí, Ceará, Rio Grande do Norte, Pernambuco, Bahia, São Paulo, Paraná e Santa Catarina) Nas análises de ISSR, foram analisados 95 exemplares de 10 localidades (Guina Francesa, Pará, Piauí, Ceará, Rio Grande do Norte, Pernambuco, Bahia, São Paulo, Santa Catarina e Paraná). Oito primers ISSR foram selecionados e amplificaram 94 loci (variando de 250 a 1700bp) sendo 97% polimórficos. A análise de variância molecular (AMOVA) mostrou que 57% da variância total dos dados se encontra dentro das populações e 43% entre as populações. Os indivíduos de Santa Catarina são mais distantes geneticamente das demais localidades. A maior distância genética encontrada foi entre SC e Paraná (0,37) e a menor entre Pará e Guiana Francesa (0,10). A análise de agrupamento Bayesiano revelou um K=2 linhagens genético-evolutivas e as análises de agrupamento por Neighbor-Joinning (NJ) e Máxima Parcimônia (MP) foram similares entre si, confirmando a presença destas duas linhagens de mero ao longo da costa Atlântica da América do Sul. Uma destas linhagens compreende a maior parte da amostragem de SC. A outra é composta pelos exemplares oriundos de todas as outras localidades, incluindo alguns poucos indivíduos de SC. Os resultados obtidos para ISSRs mostram pouca estruturação genético-geográfica para a maioria das localidades amostradas, à exceção do clado monofilético observados com aqueles exemplares de SC. Tal evidência é concordante com os agrupamentos (NJ, MP e agrupamento Bayesiano) e com os valores de distância genética e FST. A alta estruturação genético-evolutiva dos Meros de Santa Catarina (Baía da Babitonga, São Francisco do Sul) pode ser explicada pelo isolamento desta população, possivelmente pela retenção das larvas e/ou fixação reprodutiva de adultos na mesma região, já que parece não existir nenhuma barreira física que pudesse isolá-las geograficamente das outras regiões. Já os dados do genoma mitocondrial, revelam uma forte estruturação genético-evolutiva da população do estuário do rio Potengi (Natal, RN), igualmente sem aparente isolamento geográfico. A união dos dados oriundos das regiões nucleares com aqueles mitocondriais sugere que Epinephelus itajara apresenta um provável comportamento filopátrico em termos reprodutivos nos estuários da baía da Babitonga (SC) e do rio Potengi (RN), dada a estruturação genético-evolutiva observada. Além disso, é possível ainda hipotetizar que na baía da Babitonga (SC) machos e fêmeas são filopátricos, mas que no rio Potengi apenas as fêmeas parecem apresentar tal comportamento demográfico-reprodutivo. Tais hipóteses são sustentadas pelas características dos genomas acessados: ISSRs nucleares de origem biparental e genoma mitocondrial de origem uniparental
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Combining species distribution modelling and environmental perceptions to support sustainable strategies for Amazon-nut (Bertholletia excelsa Bonpl.) planting and conservation / Combinando a modelagem de distribuição de espécies e percepções ambientais para fundamentar estratégias sustentáveis de plantio e conservação da Castanha-da-Amazônia (Bertholletia excelsa Bonpl.)

Daiana Carolina Monteiro Tourne 30 November 2018 (has links)
The amazon ecosystems have been compromised by historical forms of occupation and land-use causing habitat loss and forest fragmentation. These anthropogenic disturbances associated to climate changes have direct consequences on the distribution of species and their in situ persistence. Currently, 76 of 14.003 plants taxonomically identified in the Amazon have been listed by the Brasilian Ministry of the Environment as threatened species, though we believe this number to be much bigger in the reality. Among them, Amazon-nut (Bertholletia excelsa), a native tree species, national and internationally known for its cultural, social-economic and nutritional value has been classified as vulnerable. For developping of public policy turned to its management and conservation is fundamental to know the percentage of habitat available, as well as the nature and scale of threats to this environments. Species distribution modelling is an increasingly important tool for predicting habitat suitability and for understanding species environmental tolerances, but has been rarely used in Brazil, especially for Amazonian species. This study aimed to model the potential distribution of B. excelsa in the Amazon biome and to know the factors that control its distribution. To enhance our analysis, case studies were carried out with stakeholders aiming to know their perceptions about the main threats to the species and potential solutions.This research project was based on two hypotheses: (i) There is a suitable habitat to Amazon-nut which require different objectives for conservation and planting; (ii) If the local people are aware of the species vulnerability, they are able to point out the factors that cause this condition. In the chapter 1, habitat was investigated using MAXENT algoritm. We collected 3,325 Amazon-nut records and organized one hundred-and-two environmental variables into climatic, edaphic and geophysical categories at a spatial resolution of 30 arcs-second (~1km). Multi-colinearity between variables was dealt with multivariate statistics associated to expert\'s knowledge, and presence data biased with the spatial filtering. The best model was selected adopting quantitative metrics and visual examination. The most importante biophysic variables we identified were: altitude (m), coarse soil fragments (<2mm) and clay (%). Finaly, the best model indicated 2.3 million km2 i.e., 32% of the Amazon basin has potential for B. excelsa to grow. In the chapter 2, the factors that affect Amazon-nut conservation and planting were discussed with local communities, public managers and researchers, totalyzing 203 participants. Focus groups, individual interviews and questionaire techniques were used to gather information. Data were categorized and the perceptions among stakeholders compared using quali-quantitative analyses. We found that there are currently 36 problems responsible for the species vulnerability and 72% of them belong to environmental and political contexts. Deforestation was the main problem mentioned, followed by fruit depreciation, control failures and lack of organization in the communities. For three groups of stakeholders, the main solutions were related to political context. The results obtained in this study contribute to increase ecological knowledge on the species, to demonstrate the complexity of sustainable use in the Amazon and to guide decisions makers in the selection of priority areas for conservation and potential planting. / Os ecossistemas amazônicos vêm sendo impactados ao longo dos anos por diversos processos de uso e ocupação do território, os quais têm resultado em perdas de habitats e na fragmentação da paisagem nativa. Essas perturbações antrópicas, associadas às mudanças climáticas, têm consequências diretas sobre a distribuição e persistência das espécies in situ. Das 14.003 plantas da Amazônia reconhecidas taxonomicamente, somente 76 estão atualmente listadas pelo Ministério do Meio Ambiente brasileiro como espécies ameaçadas, embora acredita-se que esse número seja muito maior. Entre elas, a Castanha-da-Amazônia (Bertholletia excelsa), uma espécie de árvore nativa, reconhecida nacional e internacionalmente pela sua importância cultural, socioeconômica e nutricional, encontra-se classificada como vulnerável. Para nortear políticas públicas na conservação e no plantio dessa espécie, um profundo entendimento sobre o habitat disponível para ela, bem como a origem e escala das ameaças à esse ambiente, é necessário. A modelagem de distribuição de espécies é uma ferramenta que oferece predições espaciais robustas sobre a adequabilidade de habitat e tolerância das espécies, mas tem sido pouco utilizada no Brasil, sobretudo para espécies Amazônicas. Nesse contexto, esse estudo objetivou modelar a distribuição potencial da B. excelsa no bioma Amazônia, bem como conhecer os fatores que controlam sua distribuição. Para aprofundar essas análises, estudos de caso foram realizados com o objetivo de conhecer a percepção de atores sociais envolvidos com a espécie sobre as principais ameaças e potenciais soluções. Essa tese baseou-se em duas hipóteses: (i) existem áreas com maior adequabilidade para a ocorrência da Castanha-da-Amazônia que demandam diferentes objetivos, para conservação e para o plantio; (ii) se a população local é conciente da vulnerabilidade da espécie, ela pode indicar os fatores que geram essa condição. No capítulo 1, o habitat foi investigado por meio de simulações usando o algoritmo MAXENT. Um total de 3.325 ocorrências e 102 variáveis ambientais foram obtidas, e posteriormente organizadas por categorias climática, edáfica e geofísica. A resolução espacial escolhida foi de 30 arc-segundo (~1km). A multi-colinearidade entre as variáveis foi reduzida por meio da estatística multivariada associada ao conhecimento de especialistas, e as tendências nas ocorrência foram tratadas através da filtragem espacial. O melhor modelo foi selecionado usando métricas quantitativas e examinações visuais. As variáveis biofísicas mais importantes encontradas foram altitude (m), solos com fragmentos grosseiros (<2mm) e argila (%). Por fim, o modelo indicou que 2.3 million km2 i.e., 32% da região amazônica é apropriado para B. excelsa crescer. No capítulo 2, os fatores que afetam a conservação e o plantio da espécie foram discutidos com comunidades, gestores e pesquisadores locais, totalizando 203 participantes. As técnicas de discussão em grupo focal, entrevistas individuais e questionários foram utilizadas para a coleta das informações. Os dados foram categorizados e as opiniões entre os diferentes grupos comparadas utilizando análises quali-quantitativas. Concluiu-se que atualmente existem 36 problemas responsáveis pela vulnerabilidade da espécie, dos quais 72% encontram-se no contexto ambiental e político. O desmatamento foi a principal forçante apontada, seguida pela desvalorização do fruto, falhas na fiscalização e falta de organização nas comunidades. Para os três grupos, as principais soluções foram voltadas para o contexto político. Os resultados obtidos nesse estudo contribuiem para aumentar o conhecimento ecológico da espécie, para demostrar a complexidade do uso sustentável na Amazônia, e orientar tomadores de decisão na seleção de áreas prioritárias para conservação e potenciais para o plantio.
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Combining species distribution modelling and environmental perceptions to support sustainable strategies for Amazon-nut (Bertholletia excelsa Bonpl.) planting and conservation / Combinando a modelagem de distribuição de espécies e percepções ambientais para fundamentar estratégias sustentáveis de plantio e conservação da Castanha-da-Amazônia (Bertholletia excelsa Bonpl.)

Tourne, Daiana Carolina Monteiro 30 November 2018 (has links)
The amazon ecosystems have been compromised by historical forms of occupation and land-use causing habitat loss and forest fragmentation. These anthropogenic disturbances associated to climate changes have direct consequences on the distribution of species and their in situ persistence. Currently, 76 of 14.003 plants taxonomically identified in the Amazon have been listed by the Brasilian Ministry of the Environment as threatened species, though we believe this number to be much bigger in the reality. Among them, Amazon-nut (Bertholletia excelsa), a native tree species, national and internationally known for its cultural, social-economic and nutritional value has been classified as vulnerable. For developping of public policy turned to its management and conservation is fundamental to know the percentage of habitat available, as well as the nature and scale of threats to this environments. Species distribution modelling is an increasingly important tool for predicting habitat suitability and for understanding species environmental tolerances, but has been rarely used in Brazil, especially for Amazonian species. This study aimed to model the potential distribution of B. excelsa in the Amazon biome and to know the factors that control its distribution. To enhance our analysis, case studies were carried out with stakeholders aiming to know their perceptions about the main threats to the species and potential solutions.This research project was based on two hypotheses: (i) There is a suitable habitat to Amazon-nut which require different objectives for conservation and planting; (ii) If the local people are aware of the species vulnerability, they are able to point out the factors that cause this condition. In the chapter 1, habitat was investigated using MAXENT algoritm. We collected 3,325 Amazon-nut records and organized one hundred-and-two environmental variables into climatic, edaphic and geophysical categories at a spatial resolution of 30 arcs-second (~1km). Multi-colinearity between variables was dealt with multivariate statistics associated to expert\'s knowledge, and presence data biased with the spatial filtering. The best model was selected adopting quantitative metrics and visual examination. The most importante biophysic variables we identified were: altitude (m), coarse soil fragments (<2mm) and clay (%). Finaly, the best model indicated 2.3 million km2 i.e., 32% of the Amazon basin has potential for B. excelsa to grow. In the chapter 2, the factors that affect Amazon-nut conservation and planting were discussed with local communities, public managers and researchers, totalyzing 203 participants. Focus groups, individual interviews and questionaire techniques were used to gather information. Data were categorized and the perceptions among stakeholders compared using quali-quantitative analyses. We found that there are currently 36 problems responsible for the species vulnerability and 72% of them belong to environmental and political contexts. Deforestation was the main problem mentioned, followed by fruit depreciation, control failures and lack of organization in the communities. For three groups of stakeholders, the main solutions were related to political context. The results obtained in this study contribute to increase ecological knowledge on the species, to demonstrate the complexity of sustainable use in the Amazon and to guide decisions makers in the selection of priority areas for conservation and potential planting. / Os ecossistemas amazônicos vêm sendo impactados ao longo dos anos por diversos processos de uso e ocupação do território, os quais têm resultado em perdas de habitats e na fragmentação da paisagem nativa. Essas perturbações antrópicas, associadas às mudanças climáticas, têm consequências diretas sobre a distribuição e persistência das espécies in situ. Das 14.003 plantas da Amazônia reconhecidas taxonomicamente, somente 76 estão atualmente listadas pelo Ministério do Meio Ambiente brasileiro como espécies ameaçadas, embora acredita-se que esse número seja muito maior. Entre elas, a Castanha-da-Amazônia (Bertholletia excelsa), uma espécie de árvore nativa, reconhecida nacional e internacionalmente pela sua importância cultural, socioeconômica e nutricional, encontra-se classificada como vulnerável. Para nortear políticas públicas na conservação e no plantio dessa espécie, um profundo entendimento sobre o habitat disponível para ela, bem como a origem e escala das ameaças à esse ambiente, é necessário. A modelagem de distribuição de espécies é uma ferramenta que oferece predições espaciais robustas sobre a adequabilidade de habitat e tolerância das espécies, mas tem sido pouco utilizada no Brasil, sobretudo para espécies Amazônicas. Nesse contexto, esse estudo objetivou modelar a distribuição potencial da B. excelsa no bioma Amazônia, bem como conhecer os fatores que controlam sua distribuição. Para aprofundar essas análises, estudos de caso foram realizados com o objetivo de conhecer a percepção de atores sociais envolvidos com a espécie sobre as principais ameaças e potenciais soluções. Essa tese baseou-se em duas hipóteses: (i) existem áreas com maior adequabilidade para a ocorrência da Castanha-da-Amazônia que demandam diferentes objetivos, para conservação e para o plantio; (ii) se a população local é conciente da vulnerabilidade da espécie, ela pode indicar os fatores que geram essa condição. No capítulo 1, o habitat foi investigado por meio de simulações usando o algoritmo MAXENT. Um total de 3.325 ocorrências e 102 variáveis ambientais foram obtidas, e posteriormente organizadas por categorias climática, edáfica e geofísica. A resolução espacial escolhida foi de 30 arc-segundo (~1km). A multi-colinearidade entre as variáveis foi reduzida por meio da estatística multivariada associada ao conhecimento de especialistas, e as tendências nas ocorrência foram tratadas através da filtragem espacial. O melhor modelo foi selecionado usando métricas quantitativas e examinações visuais. As variáveis biofísicas mais importantes encontradas foram altitude (m), solos com fragmentos grosseiros (<2mm) e argila (%). Por fim, o modelo indicou que 2.3 million km2 i.e., 32% da região amazônica é apropriado para B. excelsa crescer. No capítulo 2, os fatores que afetam a conservação e o plantio da espécie foram discutidos com comunidades, gestores e pesquisadores locais, totalizando 203 participantes. As técnicas de discussão em grupo focal, entrevistas individuais e questionários foram utilizadas para a coleta das informações. Os dados foram categorizados e as opiniões entre os diferentes grupos comparadas utilizando análises quali-quantitativas. Concluiu-se que atualmente existem 36 problemas responsáveis pela vulnerabilidade da espécie, dos quais 72% encontram-se no contexto ambiental e político. O desmatamento foi a principal forçante apontada, seguida pela desvalorização do fruto, falhas na fiscalização e falta de organização nas comunidades. Para os três grupos, as principais soluções foram voltadas para o contexto político. Os resultados obtidos nesse estudo contribuiem para aumentar o conhecimento ecológico da espécie, para demostrar a complexidade do uso sustentável na Amazônia, e orientar tomadores de decisão na seleção de áreas prioritárias para conservação e potenciais para o plantio.

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