Orientador: Fabio Porto-Foresti / Resumo: The billfish are oceanic pelagic species often caught by the tuna fleet and with great interest of sport fishing. This group of fish has specific legislation prohibiting the marketing and export of two species, Kajuikia albida e Makaira nigricans, in Brazil. DNA barcode is a universal system of molecular identification based on a sequence of mitochondrial DNA cytochrome oxidase subunit I (COI) of about 650 base pairs, serving as an identifying genomic mark in each species. This system has been used successfully to identify mischaracterized samples illegally marketed, like sample materials from sharks and other endangered species of organisms. The Barcode DNA technique was used to identify billfish marketed in the second largest fishing warehouse in Latin America, the CEAGESP-SP and the international airport of São Paulo, Brazil. 302 samples of billfish were collected during three inspection actions carried out by IBAMA, the executing agency of the national environmental policy. After DNA sequencing procedures it was possible to identify 72 samples (91.14%) by CEAGESP at the level of species, being 21 (29.17%) identified as Xiphias gladius, 44 (61.1%) as Istiophorus platypterus and 7 (8.33%) as Kajikia albida, this latter species determined as a market prohibited in Brazil and considered vulnerable in the list of endangered species of the IUCN and in the official list of species of endangered Fauna - Fish and Aquatic Invertebrates. At the International Airport of Guarulhos it ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Submitted by CARLOS EGBERTO RODRIGUES JÚNIOR null (egberto_ibama@hotmail.com) on 2017-09-27T13:42:52Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Carlos Egberto Rodrigues Junior repositorio.pdf: 4590386 bytes, checksum: 2cd3b020266ae2b4f501ad0d4b2ba74a (MD5) / Rejected by Monique Sasaki (sayumi_sasaki@hotmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido está sem a ficha catalográfica. A versão submetida por você é considerada a versão final da dissertação/tese, portanto não poderá ocorrer qualquer alteração em seu conteúdo após a aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-09-28T14:11:18Z (GMT) / Submitted by CARLOS EGBERTO RODRIGUES JÚNIOR null (egberto_ibama@hotmail.com) on 2017-11-01T11:03:15Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Carlos Egberto Rodrigues Junior repositorio.pdf: 4606348 bytes, checksum: c20c3df76e489701ead450f3ca92dcad (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-11-13T15:03:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rodriguesjunior_cer_me_bot.pdf: 4606348 bytes, checksum: c20c3df76e489701ead450f3ca92dcad (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-13T15:03:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rodriguesjunior_cer_me_bot.pdf: 4606348 bytes, checksum: c20c3df76e489701ead450f3ca92dcad (MD5) Previous issue date: 2016-12-15 / The billfish are oceanic pelagic species often caught by the tuna fleet and with great interest of sport fishing. This group of fish has specific legislation prohibiting the marketing and export of two species, Kajuikia albida e Makaira nigricans, in Brazil. DNA barcode is a universal system of molecular identification based on a sequence of mitochondrial DNA cytochrome oxidase subunit I (COI) of about 650 base pairs, serving as an identifying genomic mark in each species. This system has been used successfully to identify mischaracterized samples illegally marketed, like sample materials from sharks and other endangered species of organisms. The Barcode DNA technique was used to identify billfish marketed in the second largest fishing warehouse in Latin America, the CEAGESP-SP and the international airport of São Paulo, Brazil. 302 samples of billfish were collected during three inspection actions carried out by IBAMA, the executing agency of the national environmental policy. After DNA sequencing procedures it was possible to identify 72 samples (91.14%) by CEAGESP at the level of species, being 21 (29.17%) identified as Xiphias gladius, 44 (61.1%) as Istiophorus platypterus and 7 (8.33%) as Kajikia albida, this latter species determined as a market prohibited in Brazil and considered vulnerable in the list of endangered species of the IUCN and in the official list of species of endangered Fauna - Fish and Aquatic Invertebrates. At the International Airport of Guarulhos it was possible to identify 223 samples (100%), all identified as Xiphias gladius as declared by the exporter and indicated by its NCM (Mercosur Common Nomenclature). Molecular analysis has proven to be an excellent tool to identify billfish in Brazil in different centers such as Guarulhos International Airport and CEAGESP, SP. The identification of the white marlin being illegally traded in CEAGESP demonstrates the ineffectiveness of the current monitoring techniques used and emphasize the need for adopting better public policies for the conservation of the species. / Os peixes de bico são espécies pelágicas oceânicas frequentemente capturadas pela frota atuneira e com grande interesse da pesca esportiva. Este grupo de peixes possui legislação específica que proíbe a comercialização e exportação de duas espécies, Kajikia albida e Makaira nigricans desse grupo no Brasil. O DNA Barcode é um sistema universal de identificação molecular baseado em uma sequência de DNA mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (COI) de aproximadamente 650 pares de base, servindo como código de barras de DNA de cada espécie. Este sistema tem sido utilizado com êxito para identificar amostras que são comercializadas descaracterizadas e de forma ilegal, como tubarões e outras espécies ameaçadas de extinção. A técnica de DNA Barcode foi utilizada para a identificação de peixes de bico comercializados no segundo maior entreposto pesqueiro da América Latina, CEAGESP, SP e no Aeroporto Internacional de Guarulhos, atualmente o maior volume brasileiro de exportações de peixes de bico no País. Foram coletadas 302 amostras de peixes de bico durante vistorias realizadas pelo IBAMA, 223 no aeroporto e 79 no CEAGESP, órgão executor da política nacional do meio ambiente. Após sequenciamento do DNA foi possível à identificação das espécies de 70 amostras (88,60%) coletadas no CEAGESP, sendo 21 (30%) identificadas como Xiphias gladius, 43 (61,42%) como Istiophorus platypterus e seis (8,57%) como Kajikia albida, esta última de comércio proibido no Brasil, e considerada vulnerável pela lista de espécies em perigo da IUCN e pela Lista Nacional Oficial de Espécies da Fauna Ameaçadas de Extinção - Peixes e Invertebrados Aquáticos. No Aeroporto Internacional de Guarulhos foi possível à identificação de 223 amostras (100%), sendo todas identificadas como Xiphias gladius conforme declarado pelo exportador e indicado pelo seu NCM (Nomenclatura Comum do Mercosul). A análise molecular demonstrou ser uma importante ferramenta na identificação de peixes de bico comercializados no Brasil em diferentes centros como o Aeroporto Internacional de Guarulhos e CEAGESP, SP. A identificação de agulhões branco sendo ilegalmente comercializados na CEAGESP demonstra a ineficácia das técnicas de fiscalização utilizadas e enfatizam a necessidade melhores políticas públicas para a conservação da espécie.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-05-09T13:31:41Z No. of bitstreams: 1 Erika Fialho Morais Xavier.pdf: 2058672 bytes, checksum: c940d090f0c0320e8f1d36bc1e912cf9 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-09T13:31:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Erika Fialho Morais Xavier.pdf: 2058672 bytes, checksum: c940d090f0c0320e8f1d36bc1e912cf9 (MD5) Previous issue date: 2018-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Tuna and tuna-like species represent a great attraction for companies and fishers in general, due to their meat quality, their high commercial value and their extensive distribution in the oceans. Appropriate management is fundamental to the survival of some species, and to the sustainability of fi sheries. In this way, knowledge about abundance estimates and population biomass variations is paramount for sheries management. Dynamic models of biomass are essential techniques for calculating the estimates. This study proposed the use of Bayesian analysis for the models of Fox, Schaefer and Pella-Tomlinson. Initially, the objective was to evaluate the accuracy and precision of the information acquired about the parameters of the models. For this, catch and catch per unit effort data of the South Atlantic sword sh (Xiphias gladius) were used. It was concluded that there was no progress on precision and accuracy, taking as true "values" for the parameters the estimates of the last report of The International Commission for the Conservation of Atlantic Tunas (ICCAT). Sequentially, the objective was to evaluate the dynamic model of the biomass of Pella and Tomlinson, considering the variation and the fixation of the shape parameter in a scalar value. In this case, were used catch and catch per unit effort data of bigeye tuna (Thunnus obesus) of Atlantic. It was concluded that the model of Pella and Tomlinson with estimation of the shape parameter through of a prior distribution is more susceptible to in influences of non informative data and with discrepant points, and produces estimates more imprecise than when the form parameter is set as a scalar value, in the models of Schaefer and Fox. / Espécies de atuns e afins representam um grande atrativo para empresas e pescadores em geral, em virtude da qualidade da carne, do alto valor comercial e da ampla distribuição nos oceanos. Uma gestão adequada é fundamental para a sobrevivência de algumas espécies e para a sustentabilidade da pesca, e o conhecimento sobre estimativas de abundância e variações da biomassa das populações é primordial para a gestão de pesca. Os modelos dinâmicos de biomassa são importantes técnicas para o cálculo destas estimativas. Este estudo propôs o uso da análise bayesiana para os modelos de Fox, Schaefer e Pella-Tomlinson. Inicialmente, objetivou-se avaliar a acurácia e a precisão da informação adquirida ao longo dos anos sobre os parâmetros dos modelos. Para isto, utilizaram-se dados de captura e captura por unidade de esforço do espadarte (Xiphias gladius) do Atlântico Sul. Concluiu-se que não houve avanço quanto à precisão e acurácia, tomando como valores "verdadeiros" para os parâmetros as estimativas do último relatatório da International Commission for the Conservation of Atlantic Tunas (ICCAT). Sequencialmente, objetivou-se avaliar o modelo dinâmico de biomassa de Pella e Tomlinson, considerando a variação e a fixação do parâmetro de forma em um valor escalar. Neste caso, utilizaram-se dados de captura por unidade de esforço e captura da albacora bandolim (Thunnus obesus) do Atlântico. Concluiu-se que o modelo de Pella e Tomlinson com estimação do parâmetro de forma por meio de uma priori é mais susceptível às Influências de dados pouco informativos e com pontos discrepantes e produz estimativas mais imprecisas do que quando se fi xa o parâmetro de forma em um valor escalar, nos modelos de Schaefer e Fox.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-07T12:40:31Z No. of bitstreams: 1 Ana Lia Camposa Quaggio.pdf: 1430515 bytes, checksum: 68e33f51877fa5eba2d7e0997b3e6520 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T12:40:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Lia Camposa Quaggio.pdf: 1430515 bytes, checksum: 68e33f51877fa5eba2d7e0997b3e6520 (MD5) Previous issue date: 2010-02-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Since the 50’s, Xiphias gladius (Linnaeus, 1758) has been captured along the Brazilian coast by surface longliners. This is the second most important target species for the tuna fleet based in Itajaí, Santa Catarina State, after the blue-shark, Prionace glauca (Linnaeus, 1758). The study was based on data from sea observers, log books and carcass ladings of Xiphias gladius, Linnaeus, 1758) from the pelagic longline fleet based in Itajaí, which operated in the southwest Atlantic. Covariance models were fit to the catches (weight, kg) of swordfish and the effects used were: (1) the years 1997, 1998, 2001, 2002 e 2007 (2) lunar phases and (3) seasons. The covariate was fishing effort (hooks). The highest moon catches occurred on the first quarter moon and during wintertime. The Mantel-Haenszel procedure was used to test the hook selectivity and showed that the type “J” hook (J 9/0 10º offset), traditionally used by the fleet, have 1.2 more chances of catching Xiphias gladius than the “circle” hook (18/0 10º offset), used as an optinal device to reduce sea turtle bycatch. The M-H test showed that the J hook has 1,2 more chances of catching Xiphias gladius than the circle hook. The conversion of individual carcass weights (kg) to total length (cm) for the years 2000 to 2002 showed that 66% of the catches were sub-adults. / O espadarte, Xiphias gladius (Linnaeus, 1758), vem sendo capturado na costa brasileira desde os anos 50 pelo espinhel-de-superfície. Esta é a segunda mais importante espécie-alvo da frota atuneira sediada em Itajaí (SC), ficando atrás apenas do tubarão-azul, Prionace glauca (Linnaeus, 1758). No presente estudo foram analisados os dados obtidos para esta espécie através de observadores, mapas de bordo e fichas de desembarque de carcaças de X. gladius para a frota de espinhel-de-superfície sediada em Itajaí (SC) e atuante no Atlântico sudoeste. Foram elaborados modelos de análise de covariância (ANCOVA) e aplicados aos dados de captura (peso em kg) do espadarte, tendo como efeitos: (1) os anos de 1997, 1998, 2001, 2002 e 2007 (2) as fases lunares e (3) as épocas do ano. A covariável foi o esforço de pesca (n° de anzóis). As maiores médias de captura ocorreram durante as fases de lua crescente e no inverno. O procedimento estatístico de Mantel-Haenszel teste foi utilizado para comparar as capturas do espadarte no anzol tipo “Jota” (9/0 10º offset) comumente utilizado pela frota espinheleira com o anzol tipo “circular” (18/0 10ºoffset), este último oferecido como alternativa mitigadora à captura de tartarugas marinhas. O teste M-H indicou que o anzol “Jota” apresentou 1,2 mais chances de capturar Xiphias gladius que no “circular”. A conversão dos pesos individuais das carcaças (kg) em comprimentos totais (cm), referentes aos anos de 2000 a 2002, indicou que 66% das capturas foram de sub-adultos, ao longo de todo o ano.