Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-09-28Bitstream added on 2014-06-13T19:12:49Z : No. of bitstreams: 1 carvalho_m_me_botib.pdf: 857762 bytes, checksum: 6884bf144951c5e915d6a1c0a0ca3e5c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O gene que codifica a TCTP (Translationally Controlled Tumour Protein) está presente em todos os eucariontes e o seu produto está envolvido em diferentes processos celulares. Embora bem caracterizada em mamíferos, poucos são os trabalhos disponíveis na literatura relacionados à análise da TCTP em plantas. No presente trabalho, a expressão do gene que codifica a TCTP em tomateiros foi analisada em situações de estresse biótico e abiótico. No estresse abiótico, as plantas de tomate foram submetidas a dano mecânico nas folhas, e essas coletadas após 4, 8 e 12 horas. No estresse biótico, duas espécies virais foram inoculadas mecanicamente nas plantas de tomate, o Cucumber mosaic virus (CMV) e o Pepper Yellow Mosaic Virus (PepYMV), respectivamente, e as folhas sistemicamente inoculadas foram coletadas após 25 dias. Um aumento na expressão da TCTP foi constatado em resposta ao estresse biótico, sendo de 1,3x em relação ao controle não inoculado na infecção pelo CMV, e de 1,4x na infecção pelo PepYMV. No estresse mecânico, o pico de expressão ocorreu após 4 horas com um aumento de 3,4x em relação ao controle não tratado, com posterior redução nos demais tempos. Adicionalmente, plantas transgênicas de tabaco capazes de superexpressar a TCTP de tomate foram geradas a fim de determinar o papel dessa proteína na infecção pelo PepYMV. Quando as linhagens transgênicas geradas foram inoculadas com o PepYMV observou-se, aos 14 dias após a inoculação (DAI), um aumento na concentração viral (1,8x) em relação às plantas de tabaco não transformadas, sendo o mesmo verificado aos 21 DAI (1,6x). Essa diferença, entretanto, não foi mais observada aos 28 DAI. Esses dados confirmam a relação funcional da TCTP com a resposta de defesa das plantas aos estresses bióticos e abióticos / Not available

Orientador: Douglas Silva Domingues / Resumo: O café é uma das commodities agrícolas tropicais mais comercializadas no mundo. Coffea arabica é a principal espécie utilizada para a produção comercial de café. A espécie é originária da Etiópia. Ela é única espécie alotetraploide do gênero (2n = 4x = 44) e se reproduz predominantemente por autofecundação. As cultivares comerciais de C. arabica possuem baixa diversidade genética, o que indica a necessidade de introgressão de alelos de germoplasma para o melhoramento dessas cultivares. Acessos do centro de origem da espécie possuem maior diversidade que as cultivares comerciais e podem ser utilizados para a identificação de novos alelos. O conteúdo de macronutrientes em grãos do cafeeiro tem impacto direto na qualidade do produto. No entanto, a base molecular da composição mineral de grãos de cafeeiro ainda é pouco conhecida. Com isso, o objetivo desse trabalho foi identificar marcadores SNP possivelmente associados com a composição de macronutrientes em grãos de C. arabica. Para alcance deste objetivo, foram comparados três métodos de imputação de genótipos, bem como foi realizado o mapeamento associativo em estudo de associação genômica ampla (GWAS). Foi utilizado um painel de 110 genótipos de C. arabica, composto por genótipos elite do programa de melhoramento do Instituto Agronômico do Paraná (3), cultivares comerciais (11) e acessos selvagens (96). Foram realizadas análises da composição de cinco macronutrientes (N, P, K, Ca e Mg) em grãos de cafeeiro coletados de 70 e 1... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Coffee is one of the most traded tropical commodities in the world. Coffea arabica is the main species used for commercial production. The species is originally from Ethiopia. In the Coffea genus, C. arabica is the only allotetraploid species (2n = 4x = 44) and it reproduces predominantly by self-fertilization. The commercial cultivars of C. arabica have a narrow genetic base that indicates the need for the introgression of new alleles from germplasm into coffee breeding programs. Wild accessions of C. arabica, from Ethiopia, have higher genetic diversity and can be used to identify new alleles. The macronutrient composition of the coffee grains has a direct impact on grain quality. However, the molecular basis for the mineral composition in coffee grains still poorly understood. Thus, the aim of this work was to perform mapping association analyses using the genome-wide association study (GWAS) technique to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with macronutrient content in coffee grains from C. arabica. We also tested three imputation methods (haplotype missing allele imputation - Beagle, K-nearest neighbors, and Random Forest) in the genotypic data, and mapped it to two C. arabica reference genomes from the cultivar Caturra red and the spontaneous dihaploid Et39. We used a panel of 110 C. arabica genotypes, including elite landraces from the IAPAR coffee breeding program (3), commercial cultivars (11) and wild accessions (96). Analysis of the compositi... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor