Worldwide research of bottlenose dolphins (Tursiops truncatus) has led to varied definitions and terminology regarding ways to group dolphins for study and management. An understanding of the demographic history and population structure of bottlenose dolphins residing within the Indian River Lagoon Estuary System (IRLES), Florida, is needed to help define the IRLES dolphin population: ecotype, population, or community. Using mitochondrial DNA sequencing and microsatellite genotyping, this study detected: (1) genetic differentiation between estuarine and coastal individuals (FstmtDNA=0.414, Fstmsat=0.057; p<0.05; K=2), (2) genetic differentiation between the Indian River Lagoon (IRL) and Mosquito Lagoon (ML) (FstmtDNA=0.0201, Fstmsat=0.0234; p<0.09), and (3) minute undefined sub-structure within the IRLES (FstmtDNA=-0.00 -0.0379, Fstmsat=0.00 - vii 0.0445; p>0.1). Additionally, within ML this study detected non-mixing cohabitation of two potential ecotypes, estuarine and coastal. These findings raise many questions regarding how dolphins are presently categorized and managed which are critical to population assessments including abundance, vital rates, and health. / by Sarah E. Rodgers. / Thesis (M.S.)--Florida Atlantic University, 2013. / Includes bibliography. / Mode of access: World Wide Web. / System requirements: Adobe Reader.

The unique coral reef at St. Lucie Reef (Stuart, FL) persists despite environmental variability from extensive freshwater discharges, summer upwelling, and thermal instability. By examining the symbiotic zooxanthellae, or Symbiodinium, that reside in corals, we can gain insight to coral physiology impacted by local stressors. Two scleractinian corals, Montastraea cavernosa and Pseudodiploria clivosa were sampled over 1.5 years, including both wet and dry seasons. Zooxanthellae were isolated and quantitatively characterized using standard measurements and molecular techniques. Both coral species varied in zooxanthellae biomass, where Pseudodiploria clivosa had Higher cell densities and chlorophyll concentrations than Montastraea cavernosa. Over time, these parameters varied, but were not significantly altered by fresh water discharge events. Symbiodinium diversity and abundance were identified by ITS2 region amplification and next-generation sequencing .Novel associations between Symbiodinium and each coral explained the observed physiological differences. The symbioses remained stable throughout and could indicate local adaptation for St. Lucie Reef corals. / Includes bibliography. / Thesis (M.S.)--Florida Atlantic University, 2014. / FAU Electronic Theses and Dissertations Collection

O Estuário de Caravelas, localizado na costa nordeste brasileira (extremo sul da Bahia) é considerado uma zona relativamente não impactada, com importante papel econômico e ecológico, devido a presença de fragmentos de Mata Atlântica, manguezais e sua localização próxima ao Complexo recifal de Abrolhos, o maior e mais importante do Oceano Atlântico Sul. No entanto, especialmente no último século, este estuário tem sido sujeito a impactos naturais e antrópicos que podem ter contribuído com mudanças neste sistema. Portanto, este estudo, baseado em uma abordagem \"multiproxy\", como análise de metais traço, elementos maiores, mineralogia, parâmetros descritivos da composição da matéria orgânica como COT, NT, razão Corg/Ntotal, &#948;13C, teve o objetivo de avaliar registro deposicional natural e antropogênico, do último século em 3 testemunhos datados por 210Pb e 137Cs. As taxas de sedimentação obtidas através do modelo CRS foram de 1,07 &#177; 0,13 cm ano-1 para o testemunho T2 (estuário médio), 0,65 &#177; 0,06 cm ano-1 para o testemunho T5 e 0,85 &#177; 0,09 cm ano-1 (desembocadura). O testemunho localizado no estuário médio (T2) apresentou uma maior influência terrígena com contribuição de plantas C3 para a matéria orgânica (- 26,50 < &#948;13C < -24,39; 21,38 < Corg/Ntotal < 37,67) e teores maiores do argilomineral caulinita, enquanto os testemunhos T5 e T8, localizados próximo a desembocadura do estuário, apresentaram uma maior influência marinha (- 26,48 < &#948;13C < -23,24; 4,18 < Corg/Ntotal < 21,34). Além disso, uma mudança significativa nos \"proxies\" orgânicos e inorgânicos, no início da década de 1960, mostrou a influência da abertura natural de um canal (Boca do Tomba) na hidrodinâmica e na distribuição dos sedimentos. A distribuição de elementos maiores e metais traço não apresentou um enriquecimento significativo e foi associada ao aporte litogênico, indicando o papel do Grupo Barreiras como uma importante fonte de material terrígeno para o estuário de Caravelas. / The Caravelas estuary, located on the Brazilian northeast coast (extreme South of Bahia) is considered a relatively unimpacted zone, with an important economic and ecological role, due to the presence of fragments of Atlantic Forest and mangroves, and its location next to the Abrolhos Bank, the largest and most important reefs of the south Atlantic Ocean. However, especially in the last century, this estuary has been subject to natural and anthropogenic impacts that may have contributed to changes in this system. Therefore, this study, based on a multiproxy approach, such as analysis of trace metals, major elements, mineralogy, parameters describing the composition of organic matter such as TOC, TN, Corg/Ntotal ratio, &#948;13C, had the main goal of evaluating the natural and anthropogenic depositional record, of the last century, in 3 sediment cores dated by 210Pb and 137Cs. The sedimentation rates obtained through CRS model were 1,07 &#177; 0,13 cm y-1 for sediment core T2 (middle estuary), 0,65 &#177; 0,06 cm y-1 for the T5 and 0,85 &#177; 0,09 cm y-1 for T8 (estuary mouth). The sediment core T2 showed a greater terrigenous influence with C3 plant contribution to the organic matter (- 26,50 < &#948;13C < -24,39; 21,38 < Corg/Ntotal < 37,67) and higher contents of kaolinite, meanwhile sediment cores T5 and T8, located at the mouth of the estuary, had a greater marine influence (- 26,48 < &#948;13C < -23,24; 4,18 < Corg/Ntotal < 21,34) and higher contents of calcite and aragonite. Furthermore, a significant change in the organic and inorganic proxies in the early 1960s showed the influence of the natural opening of an inlet (Boca do Tomba) on hydrodynamics and sediment deposition. Finally, the distribution of major and trace elements did not present a significant enrichment and was associated to lithogenic contribution, indicating the role of the Barreiras Group as an important source of terrigenous material to the Caravelas estuary.

Os sistemas estuarinos são ambientes de transição entre o continente e o oceano, onde atividades humanas são intensivamente desenvolvidas. O Sistema Estuarino de Santos e São Vicente, localizado na porção central do Litoral do Estado de São Paulo, tem se destacado como um dos principais pólos econômicos do Brasil, devido ao complexo petroquímico e siderúrgico, ao Porto de Santos e à aptidão turística da região. O rápido e intenso desenvolvimento, a partir da década de 40, resultou na degradação do ecossistema local devido à introdução de esgotos e efluentes não-tratados, bem como ao aporte atmosférico de substâncias nocivas. O objetivo principal deste trabalho foi determinar as concentrações de hidrocarbonetos marcadores geoquímicos em sedimentos de testemunhos, para traçar o histórico da contribuição destes compostos ao longo dos últimos 100 anos, relacionando os resultados com a ocupação urbano-industrial da região. Paralelamente, procurou-se determinar a origem da matéria orgânica sedimentar (C, N e S) assim como verificar a existência de correlação estatística entre os hidrocarbonetos e a susceptibilidade magnética, ou seja, indicadores de poluição de natureza distinta. Quatro testemunhos foram coletados em áreas de mangue e próximas à fontes pontuais de poluição, como o lixão do Alemoa, o terminal petrolífero do Alemoa e próximo ao acesso do Pólo Industrial de Cubatão. A identificação e quantificação dos hidrocarbonetos foram feitas por um cromatográfo a gás acoplado a um detector de ionização de chama (GC-FID) para os hidrocarbonetos alifáticos e a um espectrômetro de massa (GC-MS) para os hidrocarbonetos policíclicos aromáticos (PAHs). A análise granulométrica mostrou o predomínio de sedimentos lamosos nos sedimentos mais recentes, devido a progradação das áreas de mangue e às atividades antrópicas como o escorregamento de morros adjacentes e a dragagem de canais. A aumento no teor do nitrogênio (Ntot.) nas secções próximas ao topo dos testemunhos é proveniente das indústrias de fertilizantes e do lançamento de esgotos não-tratados. Embora tenha ocorrido um aumento na concentração de n-alcanos de fontes antrópicas ao longo dos últimos anos, a introdução biogênica aparece como um importante componente no total dos n-alcanos, sendo atribuída à contribuição dos múltiplos rios que deságuam no estuário e do mangue adjacente. A distribuição da concentração dos hidrocarbonetos alifáticos, em particular a mistura complexa não resolvida, foi relacionada com o desenvolvimento do Pólo Industrial de Cubatão e do Porto de Santos, à deposição de resíduos sólidos no morro do Alemoa e à adoção de medidas de controle de poluição por parte das indústrias da região. Em relação aos PAHs, foi possível estabelecer as principais fontes (petrogênica ou pirolítica) destes compostos ao longo dos testemunhos. O predomínio de PAHs de maior peso molecular (4 – 6 anéis), indicou contribuição antrópica da queima de biomassa, carvão, óleo bruto e combustíveis fósseis. A correlação estatística entre hidrocarbonetos e susceptibilidade magnética mostrou a aplicabilidade deste parâmetro na avaliação preliminar do histórico da poluição de sedimentos marinhos. O aporte de metais magnéticos, caracterizado pela susceptibilidade magnética, foi associado a diferentes fontes antrópicas de hidrocarbonetos e aos principais eventos históricos relacionados com o desenvolvimento urbano-industrial da Baixada Santista. / Estuarine areas are environments between land and ocean, where human activities are intensively developed. The Santos and São Vicente Estuary, located on the central portion of the coast of São Paulo state, has one of the most important industrial areas of Brazil. The increasing of urbanization and industrialization near the margins of Estuary, in the 50’s, has been responsible for the degradation of the mangrove, for the discharge of sewage, and consequently, it affects the input of organic matter and sedimentary deposition. The main objective of this work was to determine the concentration of hydrocarbons biomarkers in sediment cores in order to investigate the input of these substances in the last 100 years, and to find a relation with the urban and industrial occupation in this area. The organic matter origins (C, N and S) are also studied. A possible statistical correlation between two different pollution indicators (hydrocarbons and magnetic susceptibility) was investigated. Four sediments cores are collected in mangrove areas and near polluted places, as Alemoa garbage disposal, Alemoa petroliferous terminal and Cubatão industrial complex. Hydrocarbons concentrations were determined by gas chromatograph with flame ionization detector (GC-FID) for aliphatic compounds and by gas chromatograph coupled with mass spectrometer for polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs). The grain-size analyses showed that in the recent sediments, mud was predominant. It was associated with the mangrove progradation and anthropogenic activities such as settlement, garbage disposal and sweep activities. High nitrogen concentrations were found in the sediments near the top of the cores and it was associated with inputs from untreated sewage and industries. Although a large anthropogenic input of n-alkanes was detected in the recent sediments, the biogenic contribution by rivers and direct input from mangrove vegetation is an important in the total n-alkanes. The distribution of aliphatic hydrocarbons in the cores, meanly concerning “Unresolved Complex Mixture", was associated with the formation and development of Cubatão industrial complex and the Santos harbour, waste disposal in Alemoa hill and with the preservation program, that results in the improvement of waste treatment and decrease of organic pollutants input in this area. The PAHs analyses indicated multiplies sources of these compounds (petrogenic and pyrolitic). The predominance of higher molecular weight compounds (4 – 6 aromatic rings) showed anthropogenic contribution from biomass, coal, oil and fossil fuels combustion. Statistical correlation of magnetic susceptibility with hydrocarbons indicated that the input of magnetic metals could be associated with several sources of hydrocarbons, related with the urban and industrial development of Santos and São Vicente Estuary.

O Sistema Estuarino de Santos e São Vicente, localizado na porção central do litoral do Estado de São Paulo, abriga o mais importante complexo industrial costeiro do País, o Complexo Industrial de Cubatão, e o maior porto brasileiro, o Porto de Santos. Os objetivos deste trabalho foram o estudo do histórico da contaminação da área por metais pesados e a avaliação da aplicabilidade da suscetibilidade magnética na detecção de anomalias geoquímicas. Foram estudados três testemunhos próximos a fontes pontuais de poluição. A taxa de sedimentação foi determinada pelo método do 137Cs, a suscetibilidade magnética foi medida por um perfilador Bartington MS2C e o teor de metais foi analisado em ICP-OES. Os teores de Pb, Cu, Cr e Zn apresentaram uma tendência de aumento em direção ao topo dos testemunhos, mas os maiores teores não ocorrem na superfície, e sim a alguns centímetros de profundidade. A correlação entre os teores de Pb, Cu, Cr e Zn e a suscetibilidade magnética indicou a aplicabilidade desta na avaliação preliminar da qualidade dos sedimentos. O aporte desses metais pode ser associado a diversas fontes antrópicas relacionadas ao desenvolvimento urbano-industrial da região, como atividades industriais e portuárias e disposição irregular de resíduos sólidos e esgoto. / The Santos and São Vicente Estuary, located in the central portion of the coast of São Paulo state, has the most important industrial area of Brazilian coast, the Cubatão industrial complex, and the largest Brazilian harbour, the Santos harbour. The aims of this work were the study of the contamination history of the area by heavy metals and the applicability of magnetic susceptibility to detect geochemical anomalies. Three sediment cores were collected near polluted sites. The sedimentation rate was determined by 137Cs method, magnetic susceptibility was measured by a Bartington MS2C sensor and metal contents was analyzed by ICP-OES. Pb, Cu, Cr and Zn contents presented high values near the top of the cores. The highest values don?t occur in the surface, but in some centimeters of depth. The correlation between Pb, Cu, and Zn contents and magnetic susceptibility shows the applicability of magnetic susceptibility in the preliminary evaluation of sediment quality. The input of these metals can be associated to different anthropic sources, linked to urban and industrial development of the area: industrial and harbour activities and irregular waste and sewage disposal.

O Estuário de Caravelas, localizado na costa nordeste brasileira (extremo sul da Bahia) é considerado uma zona relativamente não impactada, com importante papel econômico e ecológico, devido a presença de fragmentos de Mata Atlântica, manguezais e sua localização próxima ao Complexo recifal de Abrolhos, o maior e mais importante do Oceano Atlântico Sul. No entanto, especialmente no último século, este estuário tem sido sujeito a impactos naturais e antrópicos que podem ter contribuído com mudanças neste sistema. Portanto, este estudo, baseado em uma abordagem \"multiproxy\", como análise de metais traço, elementos maiores, mineralogia, parâmetros descritivos da composição da matéria orgânica como COT, NT, razão Corg/Ntotal, &#948;13C, teve o objetivo de avaliar registro deposicional natural e antropogênico, do último século em 3 testemunhos datados por 210Pb e 137Cs. As taxas de sedimentação obtidas através do modelo CRS foram de 1,07 &#177; 0,13 cm ano-1 para o testemunho T2 (estuário médio), 0,65 &#177; 0,06 cm ano-1 para o testemunho T5 e 0,85 &#177; 0,09 cm ano-1 (desembocadura). O testemunho localizado no estuário médio (T2) apresentou uma maior influência terrígena com contribuição de plantas C3 para a matéria orgânica (- 26,50 < &#948;13C < -24,39; 21,38 < Corg/Ntotal < 37,67) e teores maiores do argilomineral caulinita, enquanto os testemunhos T5 e T8, localizados próximo a desembocadura do estuário, apresentaram uma maior influência marinha (- 26,48 < &#948;13C < -23,24; 4,18 < Corg/Ntotal < 21,34). Além disso, uma mudança significativa nos \"proxies\" orgânicos e inorgânicos, no início da década de 1960, mostrou a influência da abertura natural de um canal (Boca do Tomba) na hidrodinâmica e na distribuição dos sedimentos. A distribuição de elementos maiores e metais traço não apresentou um enriquecimento significativo e foi associada ao aporte litogênico, indicando o papel do Grupo Barreiras como uma importante fonte de material terrígeno para o estuário de Caravelas. / The Caravelas estuary, located on the Brazilian northeast coast (extreme South of Bahia) is considered a relatively unimpacted zone, with an important economic and ecological role, due to the presence of fragments of Atlantic Forest and mangroves, and its location next to the Abrolhos Bank, the largest and most important reefs of the south Atlantic Ocean. However, especially in the last century, this estuary has been subject to natural and anthropogenic impacts that may have contributed to changes in this system. Therefore, this study, based on a multiproxy approach, such as analysis of trace metals, major elements, mineralogy, parameters describing the composition of organic matter such as TOC, TN, Corg/Ntotal ratio, &#948;13C, had the main goal of evaluating the natural and anthropogenic depositional record, of the last century, in 3 sediment cores dated by 210Pb and 137Cs. The sedimentation rates obtained through CRS model were 1,07 &#177; 0,13 cm y-1 for sediment core T2 (middle estuary), 0,65 &#177; 0,06 cm y-1 for the T5 and 0,85 &#177; 0,09 cm y-1 for T8 (estuary mouth). The sediment core T2 showed a greater terrigenous influence with C3 plant contribution to the organic matter (- 26,50 < &#948;13C < -24,39; 21,38 < Corg/Ntotal < 37,67) and higher contents of kaolinite, meanwhile sediment cores T5 and T8, located at the mouth of the estuary, had a greater marine influence (- 26,48 < &#948;13C < -23,24; 4,18 < Corg/Ntotal < 21,34) and higher contents of calcite and aragonite. Furthermore, a significant change in the organic and inorganic proxies in the early 1960s showed the influence of the natural opening of an inlet (Boca do Tomba) on hydrodynamics and sediment deposition. Finally, the distribution of major and trace elements did not present a significant enrichment and was associated to lithogenic contribution, indicating the role of the Barreiras Group as an important source of terrigenous material to the Caravelas estuary.

L’objectif de ce travail est de reconstituer les changements de la dynamique hydrosédimentaire de la Loire en fonction des variations climatiques globales et régionales depuis l’Holocène Moyen (~7 ka), dans un contexte de ralentissement et de stabilisation de la remontée du niveau marin. Le rôle des aménagements anthropiques de l’estuaire interne depuis le début du XXème siècle, a été également considéré. Dans cet objectif, les séquences sédimentaires étudiées ont été prélevées le long d’un continuum terre-mer entre l’estuaire interne de la Loire et la partie septentrionale du Golfe de Gascogne, en passant par les paléovallées incisées présentes à l’embouchure actuelle.L’emboitement des dimensions temporelle et spatiale fait l’unicité de ce travail de recherche à l’échelle de la Loire mais également sa complexité. Afin de déconvoluer les différents signaux enregistrés, nous avons entrepris une approche analytique combinant des données sédimentologiques, micro-paléontologiques (foraminifères benthiques) et géochimiques, le tout dans un cadre chronologique contraint par des datations 14Cet 210Pb/137Cs. Nos résultats montrent que le ralentissement de la montée des eaux a joué un rôle majeur dans le façonnement du paysage estuarien et par conséquence, dans la chenalisation du flux terrigène vers le large. Ce flux terrigène est également modulé à plus grande échelle par les forçages climatiques internes et externes (e.g., Oscillation Nord Atlantique, forçage solaire) affectant à la fois le bassin versant, l’occurrence des tempêtes au large ainsi que la circulation océanique de surface. Enfin, la partie la plus récente de nos archives sédimentaires estuariennes enregistre l’impact des aménagements humains qui ont profondément modifié la morphologie de l’estuaire interne depuis le début du XXème siècle. / The aim of this work is to reconstruct changes in the hydro-sedimentary dynamics of the Loire River according to global and regional climatic variations since the Middle Holocene (~ 7 ka), in a general context of slowing down of sea-level rise. The impact of the recent human settlements undertaken in the internal Loire estuary since the beginning of the 20th century is also considered. To achieve this objective, the studied sedimentary sequences were collected along a land-sea continuum from the internal estuary, to the incised paleovalleys off the present-day river mouth, until the northern part of the Bay of Biscay (South Brittany). The imbrication of both temporal and spatial dimensions makes the originality of this research on the scale of the Loire River, but also its complexity. In order to deconvolute the various recorded signals, we used a multiproxy approach combining sedimentological, micropaleontological (benthic foraminifera) and geochemical analyses, within a chronological framework constrained by 14C and 210Pb/137Cs dating. Our results show that the Middle to Late Holocene slowing down of sea-level rise plays a major role in shaping the estuarine landscape and in the channelization of the terrigenous flow towards the ocean. At the same time, this terrigenous flow is modulated on a larger scale by internal and external climatic forcing (e.g., North Atlantic Oscillation, solar forcing) controlling humidity over the Loire River catchment area, the occurrence of storms and ocean surface circulation. The most recent parts of our estuarine sedimentary sequences record the impact of human settlements since the beginning of the 20th century modifying significantly the morphology of the inner estuary and the location of the main river channel.

O modelo numérico Delft3D-Flow foi utilizado nos estudos da distribuição e variabilidade de propriedades termohalinas, e da circulação tridimensional do sistema estuarino dos rios Caravelas e Peruípe-SERCP. Os resultados do modelo foram validados quantitativamente usando dados experimentais de marés de quadratura e de sizígia de correntes e salinidades em quatro estações fixas (duas em cada um dos estuários de Caravelas e Nova Viçosa). No processamento foram aplicadas inicialmente condições iniciais homogêneas da salinidade, densidade e dos coeficientes cinemáticos de viscosidade e difusividade vertical, e após quatro semanas de simulação foram extraídos resultados de diferentes condições. Esses resultados foram utilizados como condições iniciais mais realistas, tendo o campo espacial variado das propriedades termohalinas, e dos parâmetros físicos. Essas novas condições iniciais permitiram pular o tempo transiente otimizando assim as simulações subsequentes. A validação das simulações foi feita com base nas medições da campanha de verão, por causa do atraso do período chuvoso a vazão do rio Peruípe foi bem representativa para condições de inverno e, portanto, seria redundante usar as forçantes dos rios com valores tão próximos na validação, além da necessidade da demanda de um tempo muito maior nas analise comparativas dos resultados. Durante o verão (janeiro de 2008), os dados de vazão do rio Peruípe obtidos na Agência Nacional de Águas (ANA) levaram a estimativa da descarga fluvial de ~ 20 m3.s-1, com a extrapolação de ~ 4 m3.s-1 para vazão conjunta dos dois principais afluentes do canal estuarino do rio Caravelas (rios Cúpido e Jaburuna). As oscilações da maré foram simuladas satisfatoriamente para as quatro estações de controle utilizadas na validação, com valores médios do parâmetro Skill superiores a 0,97. As amplitudes da maré calculadas numericamente foram de aproximadamente 1,3 m e 2,5 m na quadratura e sizígia, respectivamente. Os resultados numéricos das simulações das velocidades foram melhores em condições de sizígia com valores médios do parâmetro Skill entre 0,77 e 0,93, enquanto que na quadratura esse parâmetro variou entre 0,38 a 0,65. Para a estrutura de salinidade durante as condições de maré de sizígia, melhores resultados no SERCP do skill e, portanto abrangendo as quatro estações de controle, foram confirmados pelos parâmetros Skill médios superiores a 0,83. Na maré de quadratura os correspondentes valores médios também foram relativamente altos, variando entre 0,73-0,85. Entretanto, houve dificuldades em simular adequadamente a alta estratificação (vertical e longitudinal) do estuário de Nova Vicosa, podendo-se atribuir esse fato à maior vazão do rio Peruípe, que é muito maior do que a do rio de Caravelas. Com os resultados da estrutura de salinidade a intrusão da massa de Água Tropical (AT) foi adequadamente representada nos quilômetros iniciais do canal estuarino do rio Caravelas, e na parte interna da desembocadura na região de Nova Viçosa. Movimentos bidirecionais foram observados nos resultados das simulações na preamar e baixamar, na região de desembocadura dos estuários da Caravelas e Nova Viçosa, movimentos estes forçados pela componente baroclínica da força de gradiente de pressão. Vale ressaltar que o efeito baroclínico ficou mais visível nos instantes da baixamar. Na preamar para a maior parte destas duas regiões verificou-se apenas um pequeno desvio no sentido das correntes entre superfície (Z = -0,1) e fundo (Z = -0,9) e em geral inferior a 30 graus. Usando os traçadores lagrangeanos virtuais lançados ao longo dos canais estuarinos das entradas norte (Caravelas) e sul (Nova Viçosa) do SERCP foi obtido como resultado um tempo de residência relativamente pequeno e comparável ao estuário tropical do rio Curimataú. No trecho analisado no canal estuarino do rio Caravelas, a ~ 3 km e ~ 12 km distantes da Boca do Tomba o tempo de residência médio foi ~ 4,2 dias e ~10,3 dias, respectivamente. Já no estuário de Nova Viçosa, ou canal estuarino do rio Peruípe, apenas o trecho inicial de 5 km foi considerado para o lançamento dos traçadores, e os tempos de residência de ~ 1,5 dias e 2,5 dias foram estimados para as posições de ~2,5 km e 5,0 km distantes da desembocadura. O modelo analítico proposto e usado no cálculo de tempo de residência teve resultados comparáveis aos obtidos pelas simulações pelo método lagrangeano do Delft-3D Flow. Diferentemente, o modelo LOICZ apresentou valores bem diferentes do tempo de residência para os seis estuários analisados (Caravelas, Nova Viçosa, Curimataú, Hudson, Conwy and Mersey), em geral bem inferiores aos do modelo proposto, indicando assim uma possível estimativa maior do fluxo difusivo na formulação do modelo LOICZ. / The numerical model Delft-Flow was used to study the spatial distribution and variability of the termohaline properties, and the tridimensional circulation in the estuarine system of the rivers Caravelas and Peruípe. The model results were validated quantitatively using field data of tidal oscilation and currents, and salinity measurements during neap and spring tides at four mooring stations, two in each estuary. In the data processing homogeneous conditions were used initially for the fields of salinity, density and the vertical kinematic coeficients of viscosity and diffusivity, then after four weeks of running simulation those fields were saved with spatially varied conditions. Those results were used for a more realistic initial condition, thus having a varied field of the termohaline properties, and of the physical parameters. The new initial conditions allowed avoiding the transient time and thus optimizing the following simulations. The model evaluation was done based on measurements undertaken during the summer season, because of the delay in the raining season, the Peruípe river discharge was low and more representative of dry season condition, for those reasons we just used the measurement taken in the January 2008. In the summer the measurements of the Peruíbe river discharge taken from the Agência Nacional de Águas (ANA), and the river flow of was estimated at ~ 20 m3.s-1, with the extrapolation of ~ 4 m3.s-1 for the unified flow from the rivers Cúpido and Jaburuna, with contribute to the flow in the Caravelas estuary. Tidal oscillation at neap and spring tides were well simulated for the 4 controling sites used to the validation, and with the mean skill values over 0.97. The tidal amplitudes were numerical calculated and nearly between 1.3 and 2.5 meters at neap and spring tides, respectively. The numerical results of the velocities were better simulated in spring tides with the mean skill values in the range of 0.77 and 0.93, while at neap tides this parameter varied between 0.38 and 0.65. For the salinity structure at spring tides good results in the estuarine system were achieved, hence comprising all the controling station for validation, with all mean skill values over 0.83. At neap tides the corresponding mean skill values were relatively high, varing in the range of 0.73-0.85. In addition, there were difficulties in simulation adequately the highly vertical and longitudinal stratification of the Nova Vicosa estuary. That was caused by the stronger river inflow of the Peruípe River, which is much higher than the inflow by Caravelas River. The intrusion of the Tropical Water mass (TW) was properly simulated given the right distribution of the salinity along the first quilometers of the estuarine channel of Caravelas, and the internal part of the Nova Viçosa estuarine mouth. Bidirectional movements were observed from the model outputs at the high and low tides, at the region near the mouth of both, Caravelas and Nova Viçosa estuary. Those moviments are forced by the baroclinic component of the pressure gradient. Is worth to mention the the baroclinic effect was better observed at the low tides of these regions. At high tide most of areas showed only a small change in the current direction between surface (Z = -0.1) and bottom (Z = -0.9) and usually smaller than 30 degrees. The virtual lagrangian drifters released along the estuarine channels of Caravelas (north) and Nova Viçosa (south) have shown a residence time relatively short, and comparable to the Curimataú tropical estuary. In the released location between 3 and 12 km of distance from the Caravelas mouth, the residence time was in the range of 4.2 and 10.3 days. Differently, at the Nova Viçosa estuary, only the first 5 km were studied and the residence time of 1.5 and 2.5 days was estimated for the respectives positions of 2.5 and 5.0 km away from the mouth. The analytical model proposed and used to calculate the residence time leaded to results comparable to the results from the numerical simulation using the Lagrangian method of the Delft-3D Flow. Differently, the LOICZ model has shown results really different of the residence time for all the six estuaries (Caravelas, Nova Viçosa, Curimataú, Hudson, Conwy and Mersey), and in general much smaller then the results from the proposed formula, thus indicating a possible overestimation of the diffusive flux assumed in the LOICZ formulation.

Manguezais são formados por grupos de árvores e arbustos que se desenvolvem na zona de intermarés de regiões tropicais. Este ecossistema ao se estabelecer na interface do ambiente marinho e continental, apresenta sua formação relacionada com as flutuações relativas do nível do mar quaternário, através do preenchimento dos vales dos rios, margens de lagunas e baías com sedimentos tanto de origem continental como marinha. O conhecimento da distribuição de partículas e dos minerais constituintes da assembléia mineralógica dos solos em ambiente de planícies estuarinas, auxilia na compreensão de processos de sedimentação e geoquímica dentro dos estuários. O trabalho foi realizado nos manguezais distribuídos ao longo do litoral do Estado de São Paulo, e objetivou-se caracterizar os ambientes de sedimentação de acordo com a granulometria e o processo de evolução quaternária, determinar qualitativamente e semiquantitativamente a assembléia mineralógica e estudar em detalhe os tipos de esmectitas presentes nesses solos. Para tanto foram coletadas amostras de solos de 14 manguezais nas camadas de 0-20 e 60-80cm e de sedimento em suspensão do Rio Ribeira de Iguape, além de amostras de diferentes profundidades para datações. Determinaram-se as frações, argila, silte, areia total e 5 frações da areia, foram realizadas datações 14C por cintilação líquida e AMS na fração humina da matéria orgânica e por termoluminescência em grãos de quartzo. As análises mineralógicas foram realizadas na fração silte e argila e no sedimento em suspensão através de DRX, IV, MET, MEV com microanálise, ATD e ATG, realizou-se também o teste de Greene- Kelly para identificar o tipo de esmectitas presentes nesses solos. De acordo com os resultados obtidos, concluiu-se que os solos dos manguezais do Estado de São Paulo podem apresentar diferentes texturas desde arenosa até muito argilosa, freqüentemente contêm altos teores de silte e todos têm idade holocênica, oscilando entre 410 anos A.P. e 3.700 anos; a distribuição de partículas está relacionada à morfologia atual do estuário e à natureza dos sedimentos costeiros adjacentes; a assembléia mineralógica da fração fina dos solos é constituída de pirita, nontronita, caulinita, illita, gibbsita, quartzo, feldspato, e localmente ocorrem goethita, vermiculita, biotita, halloysita e anatásio; os minerais alóctones são de origem continental e marinha; a distinção entre os cenários geomorfológicos ao longo do litoral condiciona a distribuição de minerais, e ainda foi inferido que ocorre neoformação de esmectita e de caulinita, e que o processo de oxidação de matéria orgânica nesses solos pode estar utilizando o Fe3+ da nontronita como receptor de elétrons. / Mangroves are formed by groups of trees and shrubs that develop in the intertidal zone of tropical regions. This ecosystem to establish in the interface of both marine and continental environment, present its formation related to the sea-level fluctuations during the quaternary period, where the terrigenous and marine sediments are deposited in rivers valleys, edges of lagoons and bays. The knowledge of both particle distribution and minerals constituent of soils in estuarines areas, can aid to understand the processes of sedimentation and geochemistry in this site. This study was carried out with mangroves distributed along the São Paulo State coast, and aims to characterize the sedimentary environments in accordance with grain size and process of quaternary evolution, to determine qualitatively and semiquantitatively the mineralogical assemblage and to identify the smectites types in these soils. Samples were collected from 14 mangroves soils at the layers 0-20 and 60-80cm, and also was collected sediment in suspension of the Ribeira de Iguape River, and samples of different depths for dating. The clay, silt and total sand sizes and 5 sand fractions were determined, radiocarbon dating were carried out by liquid scintillation counting and accelerator mass spectrometry in humin fraction of the soil organic matter and by thermoluminescence of quartz grains. The mineralogical analyses were carried out by XRD, FTIR, TEM, SEM, DTA and GTA in silt and clay sizes and in the sediment in suspension, also was made the Greene-Kelly test to identify the smectites type. According to the results we concluded that the mangroves soils from São Paulo State have different textures varying from sandy up to very clay, also occuring high silt contents. All the mangroves are holocenic, with ages varying from 410 yr B.P. to 3,700 yr; the particle distribution is related to the current geomorphological setting of the estuary and the origin of coastal sediments. The mineralogical assemblage is constituted of pyrite, nontronite, kaolinite, illite, biotite, gibbsite, quartz, feldspars, and locally occurs goethite, vermiculite, halloysite and anatase; the aloctones minerals are from both the terrigenous and marine origin; the difference between geomorphological settings along the coastal plain rules mineral distribution, and still it was inferred the neoformation of esmectita and kaolinite and that the process of organic matter mineralization in these soils may be using Fe3+ from nontronite as an electron acceptor.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-07T13:28:04Z No. of bitstreams: 1 Ana Paula Oliveira Lucas.pdf: 968479 bytes, checksum: ff02eaef612f94f456a4b1f20ad010f4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T13:28:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Paula Oliveira Lucas.pdf: 968479 bytes, checksum: ff02eaef612f94f456a4b1f20ad010f4 (MD5) Previous issue date: 2006-02-17 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The present work aimed at characterizing the seasonal variation of the zooplankton in the estuaries of the Botafogo and Siriji rivers, northern coast of Pernambuco. The collections were accomplished respectively in May/December 2004, months that included within rainy and dry seasons. Zooplankton samples were collected with net of 300 Qm and 68 Qm mesh size nets, coupled with a flowmeter, to measure the amount of filtered water. In the estuary of the Siriji river, the haulings were accomplished at the surface and above the bottom. Average density logaritmized values in the rainy season varied from 8.24 to 9.35 ind.m-3 in the surface, and 8.71 to 9.47 ind.m-3 at the bottom. In the dry season, these values floated between 7.90 and 9.44 ind.m-3 at the surface, and 4.16 to 9.72 ind.m-3 at the bottom. In the estuary of the Botafogo river, average densities in the rainy season varied from 7.32 to 8.86 ind.m-3 for the macrozooplankton (300 Qm) and, 3.35 to 12.59 ind.m-3 for the microzooplankton (68 Qm). In the dry season, these values floated of 6.14 and 8.40 ind.m-3 for the macrozooplankton and 3.35 to 9.43 ind.m-3 for the microzooplankton. Microzooplankton densities were, most of the time, superior to macrozooplâncton ones, indicating a greater contribution of small individuals (Copepoda nauplii, copepodits and adult). The association analysis showed a total separation of samples collected with different nets (300 and 68 Qm). The most outstanding organisms in the two studied estuaries were Oikopleura dioica, Oikopleura spp., Acartia lilljeborgi, Grapsidae/Ocypodidae/Majidae (zoeae I), Pseudodiaptomus acutus, Oithona oswaldocruzi, Oithona spp. and Copepoda nauplii. Both estuaries presented low species diversity and evenness, thus suggesting signs of environmental disturbances on the structure of the zooplankton community. / O presente trabalho visou caracterizar a variação sazonal do zooplâncton dos estuários dos rios Botafogo e Siriji, litoral norte de Pernambuco. As coletas foram realizadas em maio e novembro/dezembro de 2004, meses que estão incluídos dentro dos períodos chuvoso e seco, respectivamente. As amostras de zooplâncton foram coletadas com rede de 300μm e 68μm de abertura de malha, com fluxômetro acoplado, para medir a quantidade de água filtrada. No estuário do rio Siriji, os arrastos foram realizados na superfície e fundo. Sendo assim, os valores logaritmizados da densidade média na estação chuvosa variaram de 8,24 a 9,35 ind.m-3 na superfície e, 8,71 a 9,47 ind.m-3 no fundo. Na estação seca, estes valores flutuaram entre 7,90 e 9,44 ind.m-3 na superfície e, 4,16 a 9,72 ind.m-3 no fundo. No estuário do rio Botafogo, os valores de densidade média do zooplâncton na estação chuvosa variaram de 7,32 a 8,86 ind.m-3 para o macrozooplâncton (300 μm) e, 3,35 a 12,59 ind.m-3 para o microzooplâcton (68 μm). Na estação seca, estes valores flutuaram de 6,14 e 8,40 ind.m-3 para o macrozooplâncton e 3,35 a 9,43 ind.m-3 para o microzooplâncton. A densidade das amostras de microzooplâncton foi, na maioria das vezes, superior à de macrozooplâncton, indicando uma maior contribuição de pequenos indivíduos(náuplios de Copepoda, copepoditos e espécies adultas). Na análise de associação foi observada a separação total das amostras coletadas com redes distintas (300 e 68 Qm). Os organismos que mais se destacaram nos dois estuários estudados foram Oikopleura dioica, Oikopleura spp., Acartia lilljeborgi, Grapsidae/Ocypodidae/Majidae (zoea I), Pseudodiaptomus acutus, Oithona oswaldocruzi, Oithona spp. e náuplios de Copepoda. Ambos os estuários, apresentaram baixo índice de diversidade e equitabilidade em algumas amostras sugerindo sinais de perturbações ambientais sobre a estrutura da comunidade zooplanctônica.